FuNGI

C5DMY2

Protein Details

Accession

C5DMY2

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
86-114	VYDARGRRTNTREQRYKRKLEEERHRLVE	Basic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 22.5, cyto_nucl 13.5, cyto 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR045071 BBP-like IPR004087 KH_dom IPR004088 KH_dom_type_1 IPR036612 KH_dom_type_1_sf IPR032570 SF1-HH IPR047086 SF1-HH_sf IPR001878 Znf_CCHC IPR036875 Znf_CCHC_sf
Gene Ontology	GO:0005681 C:spliceosomal complex GO:0045131 F:pre-mRNA branch point binding GO:0008270 F:zinc ion binding GO:0000398 P:mRNA splicing, via spliceosome
KEGG	lth:KLTH0G12584g -
Pfam	View protein in Pfam PF00013 KH_1 PF16275 SF1-HH
PROSITE	View protein in PROSITE PS50084 KH_TYPE_1 PS50158 ZF_CCHC
CDD	cd02395 KH-I_BBP

Amino Acid Sequences

MAMNRKDWESRGRAEVPRDALWGPSAKNSRSNPHNILPTRITGALTQEQIVAYQVMFRIQEITSKLRMNVLNPPAKRSRSPSPPPVYDARGRRTNTREQRYKRKLEEERHRLVEIALKMIPHFVAPDDYKRPTKFQDKYYIPIQKYPEINFMGLLLGPRGNTLRKLQEESGCKIAIRGQGSVKEGKNASELPKGAMNFEEPLHCIISAESEEKIQKGIKACEGVVIRAVTSPEGQNELKRGQLRELAELNGTLREDSRPCPICGLRGHKRFECPNRTTFSQQIVCQRCYQPGHATRDCTFSRPDRGYQRDVSSPAMIYQRNADIGSKRAYRQDDDDDDDESMNPWKRRNQGLNDRNTDFEQTPVSSSYRSRQYRDSHSIDNAEHEYEKSRVPYQGPPGLNNFTSPQNSLSRSPPKHELQGPHKFSNGSSDTAAAFASDRAIPPKEHTVSEDAANSANADQSGASVGDITVPQDDATNNGSEVTFAPPGMYTAPIVNAPPGLNTLAPPAQLFDNVEGDNDRPLAGPPGLTGPPGL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.55
2	0.58
3	0.54
4	0.49
5	0.48
6	0.41
7	0.34
8	0.32
9	0.31
10	0.25
11	0.29
12	0.33
13	0.33
14	0.41
15	0.44
16	0.5
17	0.53
18	0.61
19	0.59
20	0.59
21	0.67
22	0.61
23	0.63
24	0.57
25	0.52
26	0.47
27	0.41
28	0.35
29	0.27
30	0.3
31	0.28
32	0.26
33	0.24
34	0.22
35	0.2
36	0.19
37	0.19
38	0.14
39	0.09
40	0.1
41	0.1
42	0.11
43	0.12
44	0.12
45	0.13
46	0.13
47	0.17
48	0.19
49	0.24
50	0.26
51	0.28
52	0.29
53	0.32
54	0.34
55	0.32
56	0.37
57	0.41
58	0.45
59	0.43
60	0.49
61	0.5
62	0.53
63	0.54
64	0.52
65	0.53
66	0.55
67	0.63
68	0.67
69	0.68
70	0.67
71	0.68
72	0.66
73	0.62
74	0.6
75	0.58
76	0.55
77	0.55
78	0.54
79	0.57
80	0.58
81	0.64
82	0.66
83	0.7
84	0.73
85	0.74
86	0.83
87	0.84
88	0.88
89	0.84
90	0.84
91	0.83
92	0.83
93	0.85
94	0.83
95	0.81
96	0.75
97	0.68
98	0.58
99	0.49
100	0.45
101	0.35
102	0.29
103	0.22
104	0.18
105	0.17
106	0.18
107	0.17
108	0.11
109	0.1
110	0.08
111	0.12
112	0.14
113	0.2
114	0.24
115	0.29
116	0.35
117	0.37
118	0.4
119	0.42
120	0.5
121	0.5
122	0.51
123	0.57
124	0.55
125	0.57
126	0.62
127	0.63
128	0.54
129	0.54
130	0.51
131	0.46
132	0.46
133	0.44
134	0.42
135	0.35
136	0.34
137	0.29
138	0.25
139	0.2
140	0.16
141	0.14
142	0.08
143	0.07
144	0.07
145	0.08
146	0.09
147	0.1
148	0.13
149	0.17
150	0.23
151	0.25
152	0.3
153	0.33
154	0.37
155	0.41
156	0.41
157	0.41
158	0.34
159	0.31
160	0.27
161	0.27
162	0.25
163	0.22
164	0.21
165	0.2
166	0.23
167	0.25
168	0.31
169	0.27
170	0.27
171	0.26
172	0.24
173	0.25
174	0.24
175	0.25
176	0.23
177	0.23
178	0.2
179	0.23
180	0.22
181	0.2
182	0.18
183	0.16
184	0.13
185	0.13
186	0.12
187	0.1
188	0.11
189	0.11
190	0.11
191	0.1
192	0.08
193	0.09
194	0.09
195	0.1
196	0.09
197	0.1
198	0.11
199	0.11
200	0.12
201	0.12
202	0.13
203	0.16
204	0.17
205	0.18
206	0.19
207	0.19
208	0.22
209	0.22
210	0.19
211	0.17
212	0.15
213	0.13
214	0.12
215	0.13
216	0.08
217	0.09
218	0.09
219	0.08
220	0.12
221	0.12
222	0.12
223	0.15
224	0.15
225	0.18
226	0.2
227	0.2
228	0.18
229	0.23
230	0.23
231	0.24
232	0.24
233	0.21
234	0.18
235	0.18
236	0.16
237	0.12
238	0.11
239	0.07
240	0.07
241	0.08
242	0.09
243	0.1
244	0.17
245	0.19
246	0.19
247	0.22
248	0.22
249	0.25
250	0.28
251	0.35
252	0.37
253	0.41
254	0.45
255	0.43
256	0.48
257	0.51
258	0.55
259	0.55
260	0.5
261	0.47
262	0.48
263	0.49
264	0.48
265	0.43
266	0.4
267	0.34
268	0.34
269	0.38
270	0.38
271	0.37
272	0.37
273	0.36
274	0.34
275	0.33
276	0.33
277	0.32
278	0.35
279	0.42
280	0.4
281	0.43
282	0.39
283	0.43
284	0.41
285	0.35
286	0.31
287	0.26
288	0.31
289	0.3
290	0.34
291	0.37
292	0.41
293	0.44
294	0.44
295	0.44
296	0.4
297	0.39
298	0.36
299	0.28
300	0.23
301	0.21
302	0.22
303	0.19
304	0.16
305	0.16
306	0.15
307	0.15
308	0.15
309	0.15
310	0.12
311	0.15
312	0.19
313	0.2
314	0.2
315	0.25
316	0.27
317	0.27
318	0.3
319	0.33
320	0.32
321	0.34
322	0.34
323	0.29
324	0.27
325	0.26
326	0.21
327	0.16
328	0.17
329	0.18
330	0.19
331	0.21
332	0.26
333	0.31
334	0.39
335	0.46
336	0.51
337	0.57
338	0.64
339	0.7
340	0.7
341	0.66
342	0.6
343	0.53
344	0.47
345	0.36
346	0.29
347	0.22
348	0.16
349	0.16
350	0.16
351	0.16
352	0.14
353	0.16
354	0.2
355	0.28
356	0.32
357	0.33
358	0.39
359	0.44
360	0.52
361	0.58
362	0.57
363	0.51
364	0.5
365	0.51
366	0.44
367	0.41
368	0.33
369	0.26
370	0.22
371	0.19
372	0.19
373	0.17
374	0.18
375	0.18
376	0.19
377	0.2
378	0.23
379	0.28
380	0.32
381	0.39
382	0.38
383	0.37
384	0.39
385	0.4
386	0.37
387	0.33
388	0.28
389	0.24
390	0.25
391	0.24
392	0.23
393	0.24
394	0.27
395	0.28
396	0.34
397	0.4
398	0.41
399	0.45
400	0.49
401	0.49
402	0.53
403	0.56
404	0.57
405	0.56
406	0.64
407	0.66
408	0.6
409	0.59
410	0.52
411	0.46
412	0.46
413	0.38
414	0.3
415	0.24
416	0.23
417	0.21
418	0.21
419	0.2
420	0.12
421	0.1
422	0.07
423	0.09
424	0.08
425	0.09
426	0.13
427	0.15
428	0.16
429	0.2
430	0.29
431	0.29
432	0.29
433	0.31
434	0.32
435	0.32
436	0.33
437	0.3
438	0.22
439	0.2
440	0.19
441	0.17
442	0.13
443	0.12
444	0.1
445	0.09
446	0.08
447	0.07
448	0.09
449	0.08
450	0.07
451	0.07
452	0.06
453	0.08
454	0.08
455	0.09
456	0.08
457	0.08
458	0.08
459	0.1
460	0.1
461	0.11
462	0.13
463	0.14
464	0.13
465	0.13
466	0.13
467	0.12
468	0.14
469	0.15
470	0.14
471	0.12
472	0.13
473	0.12
474	0.13
475	0.14
476	0.13
477	0.1
478	0.1
479	0.12
480	0.13
481	0.13
482	0.13
483	0.14
484	0.13
485	0.13
486	0.14
487	0.14
488	0.13
489	0.13
490	0.18
491	0.17
492	0.18
493	0.17
494	0.17
495	0.17
496	0.19
497	0.2
498	0.17
499	0.19
500	0.19
501	0.2
502	0.2
503	0.19
504	0.2
505	0.18
506	0.16
507	0.13
508	0.14
509	0.17
510	0.16
511	0.16
512	0.14
513	0.19
514	0.2

C5DMY2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer