Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DMY1

Protein Details
Accession C5DMY1    Localization Confidence High Confidence Score 15.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
665-691VQTREAARKRLPKRRTLTKRENNVEVEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
672-679RKRLPKRR
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003107  HAT  
IPR045075  Syf1-like  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG lth:KLTH0G12562g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02184  HAT  
Amino Acid Sequences MPLGANIHSLLEFLYYFCVLWIYPLHFISTKVYSEGVELVKSKLNHMEPEPVQISADSLLRGAFDQKAPIKPTTKVEILDLEELKEYQRRKRSEFENVLKVKRHDIKQWARYAKFELDQRDMRRARSVFERALQINNAYVPLWIKYIDSELKARNVNHARNLLNRATNLLPRVGKLWLKYVIVEESLNNTDIVRQLFAKWCSLGPGKNAFDAYVDFEIRHGNFENVRKVYGRYVLAHPEISTWLKWVAFEKKHGDSDTTRQVLSLGLDTFSLYEISKDSDIASLVGAYAEWEATQQEYERSSALFDLASQRWPHNGDLERRRVQFEKMYGTSTNVNDSITSKRKREYEIALSNDPKDYDTWWIYLDLLQKHYPNQAIPGFHKSVTGNAPDGKVKNLSWERYIYLWLRCLTYFELDVSDLKETRRMYKRLIKEVIPHKSFTFAKVWVMYAKFELRQGDIMTARKILGQALGICPKNKIFKYYIELEIQLKEFDRVRKIYEQYIAFNALESDNWLAYAELEDNLGDEERARGIFHIALSDKVGLDTNERFKILEQLITFETNAGEYAKARQAYDALVQLSGYSPTTYIERAMFESTIPADNLSKDDQSQNMAEGDEDEPLDVTEANKRNSRSIFNKALDFYKEQGDKESRCAMLRALNSYEAVHGTVQTREAARKRLPKRRTLTKRENNVEVEYTDYEFPEDEEGEVGFSNNDKLLALAQKWKQGNT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.11
2 0.1
3 0.1
4 0.1
5 0.11
6 0.09
7 0.11
8 0.14
9 0.15
10 0.19
11 0.19
12 0.23
13 0.23
14 0.24
15 0.27
16 0.27
17 0.25
18 0.23
19 0.23
20 0.2
21 0.21
22 0.24
23 0.2
24 0.19
25 0.19
26 0.2
27 0.24
28 0.24
29 0.25
30 0.29
31 0.31
32 0.33
33 0.34
34 0.41
35 0.37
36 0.44
37 0.43
38 0.35
39 0.33
40 0.28
41 0.26
42 0.19
43 0.19
44 0.11
45 0.1
46 0.1
47 0.1
48 0.11
49 0.12
50 0.14
51 0.13
52 0.2
53 0.25
54 0.32
55 0.35
56 0.4
57 0.42
58 0.42
59 0.47
60 0.47
61 0.45
62 0.4
63 0.38
64 0.37
65 0.37
66 0.38
67 0.33
68 0.28
69 0.25
70 0.24
71 0.24
72 0.24
73 0.25
74 0.28
75 0.36
76 0.41
77 0.46
78 0.54
79 0.59
80 0.65
81 0.72
82 0.71
83 0.73
84 0.73
85 0.73
86 0.7
87 0.65
88 0.63
89 0.61
90 0.57
91 0.55
92 0.59
93 0.64
94 0.67
95 0.75
96 0.75
97 0.68
98 0.66
99 0.64
100 0.58
101 0.53
102 0.49
103 0.45
104 0.43
105 0.49
106 0.49
107 0.54
108 0.51
109 0.48
110 0.52
111 0.46
112 0.43
113 0.44
114 0.47
115 0.41
116 0.42
117 0.46
118 0.39
119 0.42
120 0.4
121 0.32
122 0.27
123 0.24
124 0.21
125 0.15
126 0.14
127 0.11
128 0.11
129 0.11
130 0.1
131 0.1
132 0.1
133 0.15
134 0.17
135 0.18
136 0.22
137 0.24
138 0.28
139 0.33
140 0.33
141 0.38
142 0.43
143 0.45
144 0.46
145 0.5
146 0.47
147 0.48
148 0.53
149 0.47
150 0.42
151 0.38
152 0.35
153 0.32
154 0.33
155 0.29
156 0.28
157 0.25
158 0.22
159 0.24
160 0.24
161 0.24
162 0.22
163 0.26
164 0.25
165 0.25
166 0.25
167 0.25
168 0.22
169 0.21
170 0.2
171 0.15
172 0.16
173 0.16
174 0.16
175 0.14
176 0.13
177 0.13
178 0.15
179 0.15
180 0.12
181 0.11
182 0.13
183 0.19
184 0.21
185 0.21
186 0.2
187 0.19
188 0.22
189 0.25
190 0.25
191 0.23
192 0.3
193 0.29
194 0.3
195 0.3
196 0.25
197 0.23
198 0.21
199 0.21
200 0.15
201 0.14
202 0.12
203 0.13
204 0.16
205 0.15
206 0.17
207 0.14
208 0.14
209 0.18
210 0.23
211 0.3
212 0.27
213 0.29
214 0.27
215 0.28
216 0.29
217 0.29
218 0.27
219 0.23
220 0.25
221 0.28
222 0.28
223 0.27
224 0.24
225 0.2
226 0.21
227 0.19
228 0.16
229 0.13
230 0.13
231 0.12
232 0.13
233 0.16
234 0.22
235 0.23
236 0.28
237 0.32
238 0.34
239 0.37
240 0.37
241 0.36
242 0.31
243 0.35
244 0.38
245 0.34
246 0.3
247 0.27
248 0.27
249 0.24
250 0.22
251 0.18
252 0.09
253 0.08
254 0.08
255 0.08
256 0.08
257 0.08
258 0.08
259 0.06
260 0.06
261 0.06
262 0.08
263 0.08
264 0.08
265 0.08
266 0.08
267 0.08
268 0.08
269 0.07
270 0.05
271 0.05
272 0.05
273 0.04
274 0.04
275 0.04
276 0.03
277 0.03
278 0.04
279 0.04
280 0.04
281 0.05
282 0.05
283 0.06
284 0.07
285 0.08
286 0.08
287 0.08
288 0.08
289 0.08
290 0.08
291 0.06
292 0.06
293 0.1
294 0.11
295 0.14
296 0.14
297 0.15
298 0.16
299 0.19
300 0.19
301 0.2
302 0.24
303 0.3
304 0.36
305 0.44
306 0.47
307 0.46
308 0.48
309 0.44
310 0.41
311 0.37
312 0.33
313 0.31
314 0.27
315 0.28
316 0.25
317 0.26
318 0.26
319 0.22
320 0.21
321 0.15
322 0.14
323 0.12
324 0.14
325 0.18
326 0.23
327 0.26
328 0.26
329 0.29
330 0.32
331 0.35
332 0.38
333 0.37
334 0.39
335 0.41
336 0.44
337 0.44
338 0.42
339 0.39
340 0.35
341 0.3
342 0.21
343 0.15
344 0.11
345 0.12
346 0.12
347 0.12
348 0.12
349 0.12
350 0.12
351 0.14
352 0.17
353 0.14
354 0.16
355 0.17
356 0.17
357 0.18
358 0.2
359 0.19
360 0.15
361 0.17
362 0.17
363 0.18
364 0.19
365 0.23
366 0.22
367 0.21
368 0.23
369 0.19
370 0.2
371 0.2
372 0.19
373 0.15
374 0.15
375 0.16
376 0.17
377 0.17
378 0.16
379 0.16
380 0.14
381 0.21
382 0.24
383 0.24
384 0.24
385 0.25
386 0.25
387 0.23
388 0.26
389 0.21
390 0.18
391 0.2
392 0.18
393 0.18
394 0.17
395 0.18
396 0.16
397 0.15
398 0.14
399 0.11
400 0.11
401 0.1
402 0.11
403 0.1
404 0.1
405 0.1
406 0.09
407 0.13
408 0.14
409 0.21
410 0.28
411 0.3
412 0.35
413 0.43
414 0.49
415 0.54
416 0.57
417 0.5
418 0.51
419 0.57
420 0.6
421 0.53
422 0.47
423 0.39
424 0.41
425 0.39
426 0.34
427 0.28
428 0.2
429 0.2
430 0.2
431 0.2
432 0.18
433 0.18
434 0.16
435 0.15
436 0.16
437 0.15
438 0.16
439 0.16
440 0.14
441 0.15
442 0.15
443 0.16
444 0.17
445 0.18
446 0.17
447 0.16
448 0.16
449 0.15
450 0.14
451 0.12
452 0.1
453 0.09
454 0.1
455 0.12
456 0.18
457 0.18
458 0.19
459 0.19
460 0.21
461 0.27
462 0.26
463 0.28
464 0.25
465 0.28
466 0.32
467 0.36
468 0.37
469 0.31
470 0.33
471 0.29
472 0.28
473 0.25
474 0.2
475 0.16
476 0.15
477 0.16
478 0.19
479 0.22
480 0.22
481 0.26
482 0.31
483 0.33
484 0.35
485 0.38
486 0.36
487 0.33
488 0.33
489 0.32
490 0.25
491 0.23
492 0.19
493 0.14
494 0.12
495 0.11
496 0.1
497 0.07
498 0.07
499 0.07
500 0.07
501 0.06
502 0.07
503 0.07
504 0.06
505 0.06
506 0.06
507 0.06
508 0.07
509 0.07
510 0.06
511 0.05
512 0.06
513 0.06
514 0.07
515 0.07
516 0.07
517 0.08
518 0.1
519 0.1
520 0.13
521 0.12
522 0.13
523 0.14
524 0.14
525 0.13
526 0.12
527 0.13
528 0.1
529 0.13
530 0.16
531 0.21
532 0.22
533 0.22
534 0.22
535 0.21
536 0.28
537 0.26
538 0.25
539 0.2
540 0.22
541 0.23
542 0.24
543 0.23
544 0.16
545 0.15
546 0.11
547 0.11
548 0.09
549 0.08
550 0.07
551 0.11
552 0.16
553 0.17
554 0.17
555 0.17
556 0.18
557 0.19
558 0.21
559 0.21
560 0.16
561 0.15
562 0.15
563 0.14
564 0.14
565 0.13
566 0.11
567 0.08
568 0.07
569 0.08
570 0.1
571 0.11
572 0.12
573 0.12
574 0.13
575 0.15
576 0.17
577 0.16
578 0.14
579 0.16
580 0.15
581 0.16
582 0.15
583 0.14
584 0.13
585 0.13
586 0.16
587 0.17
588 0.16
589 0.17
590 0.19
591 0.19
592 0.21
593 0.21
594 0.2
595 0.18
596 0.17
597 0.15
598 0.15
599 0.14
600 0.12
601 0.11
602 0.09
603 0.09
604 0.09
605 0.09
606 0.07
607 0.08
608 0.15
609 0.21
610 0.24
611 0.29
612 0.31
613 0.37
614 0.4
615 0.48
616 0.45
617 0.49
618 0.54
619 0.53
620 0.55
621 0.51
622 0.51
623 0.47
624 0.44
625 0.38
626 0.37
627 0.37
628 0.33
629 0.38
630 0.41
631 0.39
632 0.41
633 0.45
634 0.39
635 0.37
636 0.38
637 0.32
638 0.32
639 0.33
640 0.33
641 0.29
642 0.29
643 0.28
644 0.27
645 0.27
646 0.21
647 0.19
648 0.15
649 0.14
650 0.14
651 0.15
652 0.15
653 0.17
654 0.19
655 0.25
656 0.3
657 0.36
658 0.42
659 0.51
660 0.6
661 0.67
662 0.73
663 0.75
664 0.79
665 0.83
666 0.86
667 0.86
668 0.88
669 0.88
670 0.91
671 0.88
672 0.86
673 0.79
674 0.72
675 0.64
676 0.53
677 0.47
678 0.38
679 0.33
680 0.27
681 0.23
682 0.2
683 0.17
684 0.17
685 0.15
686 0.14
687 0.12
688 0.12
689 0.12
690 0.11
691 0.11
692 0.11
693 0.09
694 0.09
695 0.1
696 0.1
697 0.1
698 0.09
699 0.1
700 0.13
701 0.19
702 0.21
703 0.28
704 0.31
705 0.39