Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DF86

Protein Details
Accession C5DF86    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-20MPKIKIRKPREPEPNEPEPQBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
4-47IKIRKPREPEPNEPEPQLKKIKIKAKGGQDANKERAGGGLKVRL
Subcellular Location(s) nucl 25.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR037817  TAF7  
IPR006751  TAFII55_prot_cons_reg  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0006367  P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter  
KEGG lth:KLTH0D13090g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04658  TAFII55_N  
CDD cd08047  TAF7  
Amino Acid Sequences MPKIKIRKPREPEPNEPEPQLKKIKIKAKGGQDANKERAGGGLKVRLSRREDSPEQQKSTPGTMKLKINLGGKDKSESTASTTPKAPRFRIKPVRVPGEGYDSEASDIEDDPLIEEGIILRVLPDVQTEFVKSCIESGDFSGLSLKWKGERHAVVKINGLQYGAVLVNLPTVIEVNKSVDRKNLLKTFDVSQMLLCVRTIEHEEDVFSLVPPDTEDLVTKHFTEYKSEIRECKKTLYRGFNGGPLTDAEASNIDQIVRKGYDYKHGLTPPLYNVRNRRFRRRLTSQEIDYVEKTVELLLSQDAETEGFSYDLVDEDILAQRSTSNEEQRQNSSDNGLDLFGDDDHEDLEMELEQALQEDRQGADQIANTNQIPAVEETGDDVEQDNGDDDDEEDEDEEGEDEADEDVVPSTAKPAVDEERQHSELLRDELEELESTLQQNRQKLEKATNPLLKSRFIESIKKLEKEVELKRKQVKSNQEPSSSHPESLAPNDEEGDEEEEEEDDEEVEDDDDDEDEEDAAAAPSNTPGRKAGANEELDQDDMDMMMLFGGEGDE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.83
2 0.77
3 0.72
4 0.7
5 0.63
6 0.62
7 0.6
8 0.58
9 0.57
10 0.61
11 0.66
12 0.67
13 0.72
14 0.72
15 0.74
16 0.77
17 0.77
18 0.76
19 0.77
20 0.77
21 0.72
22 0.67
23 0.57
24 0.47
25 0.43
26 0.39
27 0.33
28 0.29
29 0.3
30 0.31
31 0.37
32 0.41
33 0.44
34 0.46
35 0.47
36 0.49
37 0.51
38 0.54
39 0.56
40 0.64
41 0.66
42 0.65
43 0.62
44 0.6
45 0.54
46 0.56
47 0.52
48 0.49
49 0.46
50 0.47
51 0.51
52 0.51
53 0.51
54 0.49
55 0.49
56 0.48
57 0.48
58 0.46
59 0.42
60 0.42
61 0.39
62 0.35
63 0.32
64 0.27
65 0.28
66 0.31
67 0.32
68 0.31
69 0.36
70 0.41
71 0.46
72 0.52
73 0.5
74 0.53
75 0.57
76 0.65
77 0.7
78 0.72
79 0.74
80 0.76
81 0.79
82 0.7
83 0.67
84 0.58
85 0.55
86 0.47
87 0.41
88 0.33
89 0.25
90 0.25
91 0.21
92 0.19
93 0.12
94 0.12
95 0.09
96 0.09
97 0.08
98 0.08
99 0.08
100 0.08
101 0.07
102 0.06
103 0.06
104 0.06
105 0.06
106 0.05
107 0.05
108 0.05
109 0.06
110 0.06
111 0.07
112 0.07
113 0.08
114 0.1
115 0.11
116 0.11
117 0.12
118 0.13
119 0.12
120 0.11
121 0.11
122 0.12
123 0.11
124 0.12
125 0.14
126 0.13
127 0.13
128 0.15
129 0.14
130 0.16
131 0.16
132 0.16
133 0.17
134 0.2
135 0.22
136 0.27
137 0.33
138 0.33
139 0.41
140 0.44
141 0.41
142 0.43
143 0.44
144 0.39
145 0.33
146 0.3
147 0.21
148 0.16
149 0.16
150 0.12
151 0.08
152 0.06
153 0.05
154 0.06
155 0.06
156 0.05
157 0.04
158 0.04
159 0.05
160 0.05
161 0.06
162 0.09
163 0.14
164 0.16
165 0.17
166 0.2
167 0.24
168 0.27
169 0.33
170 0.35
171 0.33
172 0.34
173 0.35
174 0.35
175 0.36
176 0.34
177 0.27
178 0.21
179 0.21
180 0.2
181 0.17
182 0.14
183 0.09
184 0.07
185 0.09
186 0.11
187 0.11
188 0.12
189 0.11
190 0.12
191 0.12
192 0.14
193 0.12
194 0.09
195 0.08
196 0.07
197 0.07
198 0.07
199 0.08
200 0.07
201 0.07
202 0.08
203 0.08
204 0.11
205 0.12
206 0.12
207 0.12
208 0.15
209 0.15
210 0.18
211 0.21
212 0.25
213 0.3
214 0.32
215 0.37
216 0.39
217 0.43
218 0.41
219 0.44
220 0.43
221 0.44
222 0.49
223 0.51
224 0.49
225 0.49
226 0.49
227 0.45
228 0.4
229 0.33
230 0.27
231 0.19
232 0.18
233 0.14
234 0.13
235 0.09
236 0.09
237 0.09
238 0.09
239 0.09
240 0.07
241 0.07
242 0.07
243 0.09
244 0.09
245 0.09
246 0.12
247 0.12
248 0.2
249 0.22
250 0.24
251 0.26
252 0.26
253 0.27
254 0.25
255 0.26
256 0.22
257 0.27
258 0.26
259 0.25
260 0.32
261 0.39
262 0.49
263 0.51
264 0.58
265 0.59
266 0.63
267 0.69
268 0.7
269 0.71
270 0.69
271 0.71
272 0.61
273 0.59
274 0.55
275 0.48
276 0.39
277 0.31
278 0.22
279 0.16
280 0.14
281 0.08
282 0.06
283 0.04
284 0.05
285 0.04
286 0.05
287 0.05
288 0.05
289 0.05
290 0.05
291 0.05
292 0.05
293 0.05
294 0.04
295 0.04
296 0.04
297 0.04
298 0.05
299 0.05
300 0.04
301 0.04
302 0.04
303 0.06
304 0.07
305 0.07
306 0.06
307 0.07
308 0.08
309 0.12
310 0.15
311 0.19
312 0.24
313 0.29
314 0.32
315 0.35
316 0.37
317 0.34
318 0.31
319 0.27
320 0.22
321 0.18
322 0.15
323 0.13
324 0.1
325 0.08
326 0.08
327 0.06
328 0.06
329 0.05
330 0.05
331 0.05
332 0.05
333 0.05
334 0.04
335 0.05
336 0.04
337 0.04
338 0.04
339 0.04
340 0.04
341 0.04
342 0.05
343 0.04
344 0.04
345 0.05
346 0.06
347 0.07
348 0.08
349 0.07
350 0.09
351 0.1
352 0.12
353 0.12
354 0.14
355 0.13
356 0.12
357 0.12
358 0.11
359 0.11
360 0.1
361 0.1
362 0.08
363 0.08
364 0.09
365 0.1
366 0.1
367 0.08
368 0.08
369 0.07
370 0.07
371 0.07
372 0.07
373 0.05
374 0.06
375 0.06
376 0.06
377 0.06
378 0.07
379 0.06
380 0.06
381 0.06
382 0.06
383 0.06
384 0.06
385 0.05
386 0.05
387 0.05
388 0.05
389 0.05
390 0.05
391 0.04
392 0.04
393 0.05
394 0.05
395 0.05
396 0.04
397 0.06
398 0.08
399 0.08
400 0.08
401 0.12
402 0.17
403 0.22
404 0.25
405 0.28
406 0.34
407 0.35
408 0.35
409 0.32
410 0.29
411 0.28
412 0.27
413 0.23
414 0.16
415 0.16
416 0.16
417 0.16
418 0.15
419 0.11
420 0.1
421 0.1
422 0.11
423 0.13
424 0.18
425 0.2
426 0.24
427 0.26
428 0.3
429 0.35
430 0.38
431 0.43
432 0.46
433 0.51
434 0.56
435 0.59
436 0.56
437 0.58
438 0.56
439 0.51
440 0.46
441 0.42
442 0.4
443 0.37
444 0.43
445 0.4
446 0.49
447 0.52
448 0.51
449 0.48
450 0.44
451 0.46
452 0.47
453 0.53
454 0.53
455 0.52
456 0.58
457 0.67
458 0.7
459 0.72
460 0.71
461 0.73
462 0.72
463 0.76
464 0.76
465 0.74
466 0.69
467 0.68
468 0.7
469 0.61
470 0.51
471 0.42
472 0.37
473 0.33
474 0.35
475 0.35
476 0.26
477 0.24
478 0.25
479 0.24
480 0.23
481 0.21
482 0.21
483 0.14
484 0.14
485 0.13
486 0.13
487 0.13
488 0.12
489 0.1
490 0.07
491 0.07
492 0.07
493 0.07
494 0.07
495 0.07
496 0.07
497 0.07
498 0.07
499 0.07
500 0.07
501 0.07
502 0.07
503 0.07
504 0.07
505 0.07
506 0.07
507 0.07
508 0.07
509 0.07
510 0.1
511 0.16
512 0.16
513 0.18
514 0.2
515 0.22
516 0.26
517 0.29
518 0.33
519 0.35
520 0.38
521 0.38
522 0.4
523 0.39
524 0.35
525 0.32
526 0.25
527 0.17
528 0.13
529 0.11
530 0.07
531 0.06
532 0.05
533 0.05
534 0.04