Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A545W8M8

Protein Details
Accession A0A545W8M8    Localization Confidence High Confidence Score 21.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
2-21APELRKRKQAPEPVKPVSKAHydrophilic
36-57ASPASAKKSKPVKPAPTPKSALHydrophilic
336-357EAKAKSPKVTKAKGSKVKKAKAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
6-74RKRKQAPEPVKPVSKAEKPAAKGKRKAVEEASPASAKKSKPVKPAPTPKSALKKAKAKEEAPKTNGKKK
243-262RRFKKVPWNKMAGQKLEKPR
270-284KVERENKKRADKSAK
337-357AKAKSPKVTKAKGSKVKKAKA
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto_nucl 13, cyto 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12307  RRM_NIFK_like  
Amino Acid Sequences MAPELRKRKQAPEPVKPVSKAEKPAAKGKRKAVEEASPASAKKSKPVKPAPTPKSALKKAKAKEEAPKTNGKKKTAEPVNEPAEEPAEEPAEEEDEDEDNDDAQVLATELDSGDEETDGVTLFEEGQDVGKIPGVSKAVREAASQAPSGETGVIYIGRVPHGFYEHEMRQYFSQFGPIARLRLSRNKKTGASKHFAFVEFEEQSTAEVVAKTMDNYLLFGHILKCQVVPKARVHEDLFKGANRRFKKVPWNKMAGQKLEKPRTESAWELKVERENKKRADKSAKLKALGYDFDGPEIKAVPAPGAPAPAEDSHAADAAAVEAAPVEEPKAEEPQAEAKAKSPKVTKAKGSKVKKAKA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.79
2 0.82
3 0.75
4 0.71
5 0.69
6 0.65
7 0.61
8 0.6
9 0.59
10 0.56
11 0.64
12 0.68
13 0.69
14 0.7
15 0.72
16 0.72
17 0.68
18 0.7
19 0.66
20 0.64
21 0.6
22 0.57
23 0.53
24 0.46
25 0.43
26 0.41
27 0.4
28 0.33
29 0.36
30 0.42
31 0.44
32 0.52
33 0.62
34 0.67
35 0.73
36 0.83
37 0.81
38 0.8
39 0.78
40 0.75
41 0.75
42 0.75
43 0.73
44 0.71
45 0.73
46 0.7
47 0.75
48 0.75
49 0.69
50 0.7
51 0.71
52 0.71
53 0.67
54 0.72
55 0.69
56 0.71
57 0.73
58 0.67
59 0.63
60 0.57
61 0.64
62 0.62
63 0.61
64 0.58
65 0.59
66 0.6
67 0.55
68 0.51
69 0.42
70 0.34
71 0.29
72 0.23
73 0.17
74 0.12
75 0.11
76 0.11
77 0.11
78 0.11
79 0.1
80 0.1
81 0.09
82 0.09
83 0.09
84 0.1
85 0.09
86 0.07
87 0.07
88 0.07
89 0.06
90 0.05
91 0.05
92 0.04
93 0.04
94 0.04
95 0.04
96 0.04
97 0.04
98 0.05
99 0.05
100 0.05
101 0.05
102 0.05
103 0.04
104 0.05
105 0.04
106 0.04
107 0.04
108 0.04
109 0.04
110 0.04
111 0.04
112 0.04
113 0.04
114 0.05
115 0.05
116 0.05
117 0.07
118 0.07
119 0.07
120 0.1
121 0.12
122 0.12
123 0.12
124 0.15
125 0.16
126 0.16
127 0.16
128 0.16
129 0.18
130 0.2
131 0.19
132 0.16
133 0.14
134 0.13
135 0.13
136 0.1
137 0.06
138 0.05
139 0.05
140 0.05
141 0.04
142 0.05
143 0.05
144 0.06
145 0.06
146 0.06
147 0.07
148 0.08
149 0.09
150 0.1
151 0.15
152 0.16
153 0.2
154 0.21
155 0.21
156 0.2
157 0.21
158 0.21
159 0.15
160 0.17
161 0.13
162 0.13
163 0.17
164 0.17
165 0.16
166 0.16
167 0.19
168 0.18
169 0.27
170 0.35
171 0.37
172 0.41
173 0.44
174 0.47
175 0.53
176 0.58
177 0.56
178 0.54
179 0.47
180 0.45
181 0.43
182 0.39
183 0.32
184 0.24
185 0.23
186 0.17
187 0.16
188 0.14
189 0.12
190 0.12
191 0.11
192 0.1
193 0.06
194 0.06
195 0.06
196 0.06
197 0.06
198 0.06
199 0.06
200 0.07
201 0.06
202 0.07
203 0.07
204 0.07
205 0.07
206 0.07
207 0.08
208 0.09
209 0.1
210 0.09
211 0.1
212 0.12
213 0.16
214 0.2
215 0.22
216 0.25
217 0.32
218 0.34
219 0.37
220 0.38
221 0.4
222 0.39
223 0.39
224 0.37
225 0.32
226 0.34
227 0.33
228 0.39
229 0.34
230 0.38
231 0.36
232 0.39
233 0.48
234 0.54
235 0.61
236 0.6
237 0.65
238 0.64
239 0.7
240 0.71
241 0.67
242 0.62
243 0.59
244 0.62
245 0.63
246 0.6
247 0.57
248 0.53
249 0.51
250 0.5
251 0.46
252 0.41
253 0.39
254 0.39
255 0.35
256 0.35
257 0.37
258 0.4
259 0.45
260 0.48
261 0.5
262 0.56
263 0.65
264 0.67
265 0.7
266 0.73
267 0.73
268 0.75
269 0.78
270 0.76
271 0.68
272 0.64
273 0.59
274 0.52
275 0.44
276 0.39
277 0.33
278 0.27
279 0.28
280 0.27
281 0.23
282 0.2
283 0.2
284 0.16
285 0.12
286 0.12
287 0.1
288 0.1
289 0.12
290 0.12
291 0.13
292 0.12
293 0.12
294 0.15
295 0.14
296 0.17
297 0.15
298 0.16
299 0.15
300 0.16
301 0.14
302 0.11
303 0.11
304 0.08
305 0.08
306 0.06
307 0.04
308 0.04
309 0.04
310 0.05
311 0.05
312 0.05
313 0.06
314 0.08
315 0.1
316 0.15
317 0.15
318 0.15
319 0.18
320 0.25
321 0.31
322 0.33
323 0.31
324 0.32
325 0.41
326 0.43
327 0.47
328 0.46
329 0.49
330 0.55
331 0.62
332 0.67
333 0.68
334 0.76
335 0.8
336 0.83
337 0.84