Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5FDP9

Protein Details
Accession C5FDP9    Localization Confidence High Confidence Score 20.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
3-30LREVSVSPRDHHRHRRRHHDHDHHSASIBasic
41-70RESSYDNRRQYRRSRREDNRSTHRRQRSSEHydrophilic
321-347EDGFKQMKEKQMRKKNERELRKEEILRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
285-288EKKR
330-352KQMRKKNERELRKEEILRARAEE
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 14.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR044688  SCI-1-like  
Amino Acid Sequences MSLREVSVSPRDHHRHRRRHHDHDHHSASIRADTRSRSPVRESSYDNRRQYRRSRREDNRSTHRRQRSSEALPVILPFGATALSKRDLPGYKAMFGTYLDIQKGIYIDELDERELRGRWKSFIGKWNRGELAEGWYDPATFKKAVEGAYNRDSPKASGHRAYGRRSSPTYMNDEKSSSSLNETHSRLDDGRLSIERDDDDEEDSYGPQAPVPHHQSLSRKSGPKIPTMADLTLKREDEQLDLEESRRVNRAARKQELNAHKSELRKIEDEIAPRAEPGSRERLLEKKREKSASNRAYAEARGGSPVDGVADADLMGGAEGEDGFKQMKEKQMRKKNERELRKEEILRARAEEREVRLRSYRRKEDETMDYLRAIAQERFG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.71
2 0.74
3 0.8
4 0.88
5 0.88
6 0.91
7 0.93
8 0.92
9 0.91
10 0.91
11 0.87
12 0.79
13 0.72
14 0.64
15 0.54
16 0.5
17 0.43
18 0.35
19 0.33
20 0.33
21 0.36
22 0.43
23 0.45
24 0.43
25 0.46
26 0.5
27 0.53
28 0.54
29 0.55
30 0.55
31 0.62
32 0.67
33 0.69
34 0.7
35 0.7
36 0.73
37 0.76
38 0.79
39 0.79
40 0.79
41 0.82
42 0.84
43 0.89
44 0.91
45 0.9
46 0.9
47 0.89
48 0.88
49 0.87
50 0.87
51 0.82
52 0.77
53 0.75
54 0.73
55 0.7
56 0.69
57 0.61
58 0.52
59 0.46
60 0.41
61 0.34
62 0.24
63 0.17
64 0.1
65 0.07
66 0.06
67 0.06
68 0.07
69 0.1
70 0.12
71 0.12
72 0.13
73 0.19
74 0.21
75 0.24
76 0.31
77 0.3
78 0.31
79 0.31
80 0.3
81 0.25
82 0.23
83 0.23
84 0.18
85 0.17
86 0.15
87 0.15
88 0.14
89 0.14
90 0.14
91 0.11
92 0.09
93 0.07
94 0.07
95 0.1
96 0.11
97 0.12
98 0.12
99 0.12
100 0.14
101 0.15
102 0.17
103 0.2
104 0.21
105 0.21
106 0.26
107 0.32
108 0.35
109 0.42
110 0.49
111 0.52
112 0.53
113 0.57
114 0.52
115 0.46
116 0.43
117 0.35
118 0.3
119 0.22
120 0.19
121 0.15
122 0.14
123 0.14
124 0.12
125 0.13
126 0.12
127 0.11
128 0.11
129 0.12
130 0.13
131 0.15
132 0.2
133 0.21
134 0.23
135 0.27
136 0.31
137 0.29
138 0.29
139 0.28
140 0.24
141 0.28
142 0.28
143 0.27
144 0.26
145 0.29
146 0.36
147 0.4
148 0.44
149 0.44
150 0.41
151 0.41
152 0.4
153 0.4
154 0.36
155 0.35
156 0.38
157 0.36
158 0.36
159 0.33
160 0.32
161 0.29
162 0.25
163 0.23
164 0.16
165 0.14
166 0.14
167 0.16
168 0.2
169 0.21
170 0.21
171 0.2
172 0.21
173 0.19
174 0.19
175 0.17
176 0.13
177 0.14
178 0.13
179 0.14
180 0.13
181 0.13
182 0.12
183 0.11
184 0.12
185 0.1
186 0.11
187 0.1
188 0.1
189 0.1
190 0.09
191 0.09
192 0.08
193 0.07
194 0.07
195 0.08
196 0.09
197 0.15
198 0.2
199 0.22
200 0.22
201 0.25
202 0.3
203 0.33
204 0.4
205 0.4
206 0.38
207 0.38
208 0.45
209 0.44
210 0.42
211 0.41
212 0.34
213 0.32
214 0.31
215 0.31
216 0.27
217 0.26
218 0.26
219 0.27
220 0.26
221 0.22
222 0.22
223 0.21
224 0.18
225 0.18
226 0.16
227 0.15
228 0.15
229 0.15
230 0.16
231 0.16
232 0.16
233 0.17
234 0.16
235 0.19
236 0.26
237 0.35
238 0.42
239 0.48
240 0.51
241 0.51
242 0.59
243 0.63
244 0.59
245 0.52
246 0.47
247 0.44
248 0.42
249 0.44
250 0.41
251 0.36
252 0.33
253 0.33
254 0.34
255 0.34
256 0.35
257 0.32
258 0.3
259 0.26
260 0.24
261 0.24
262 0.19
263 0.17
264 0.18
265 0.22
266 0.21
267 0.22
268 0.25
269 0.33
270 0.38
271 0.46
272 0.51
273 0.52
274 0.59
275 0.63
276 0.64
277 0.64
278 0.7
279 0.68
280 0.66
281 0.6
282 0.54
283 0.51
284 0.47
285 0.41
286 0.32
287 0.24
288 0.19
289 0.17
290 0.15
291 0.13
292 0.12
293 0.1
294 0.08
295 0.07
296 0.06
297 0.05
298 0.05
299 0.05
300 0.04
301 0.04
302 0.03
303 0.03
304 0.03
305 0.03
306 0.03
307 0.04
308 0.04
309 0.05
310 0.06
311 0.07
312 0.1
313 0.13
314 0.23
315 0.32
316 0.41
317 0.51
318 0.61
319 0.72
320 0.79
321 0.86
322 0.88
323 0.88
324 0.9
325 0.88
326 0.86
327 0.83
328 0.83
329 0.76
330 0.74
331 0.73
332 0.67
333 0.6
334 0.56
335 0.51
336 0.44
337 0.45
338 0.43
339 0.39
340 0.45
341 0.44
342 0.45
343 0.5
344 0.56
345 0.62
346 0.67
347 0.71
348 0.69
349 0.74
350 0.75
351 0.73
352 0.73
353 0.69
354 0.64
355 0.55
356 0.47
357 0.4
358 0.36
359 0.31
360 0.26