Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5FZG7

Protein Details
Accession C5FZG7    Localization Confidence High Confidence Score 18.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
21-73DIAKTKKIKSGDKEKSKDKKKEKKDKKDKKDKKEKKEKKRKSKEENVKDEETKBasic
106-162NGAEKAEKSKKEKKEKKEKKNKKEKKEKKSKGEGEVDKKKEKKQKKKLAEQEEKKEEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
24-63KTKKIKSGDKEKSKDKKKEKKDKKDKKDKKEKKEKKRKSK
110-164KAEKSKKEKKEKKEKKNKKEKKEKKSKGEGEVDKKKEKKQKKKLAEQEEKKEEGK
281-290KKPARKIKVE
293-308AGGGGSKSEARKMKIL
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 13.5, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034228  Nop6_RRM  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12400  RRM_Nop6  
Amino Acid Sequences MGDKRKLDEVAVDENDEAVVDIAKTKKIKSGDKEKSKDKKKEKKDKKDKKDKKEKKEKKRKSKEENVKDEETKPDEEPELLEETVKANGMNGTADEDAMDVDGQQNGAEKAEKSKKEKKEKKEKKNKKEKKEKKSKGEGEVDKKKEKKQKKKLAEQEEKKEEGKEKANGAEEVAEPTAVQPETDTPAENGIEAAEGAVGDAEIDAAQKSQRFIVFISNLPYSATQESVAKHFEKLQPSSVRVPLERCGKKGRGFAFIEFSAFDRMKTCLKQYHGTMFEDGKKPARKIKVELTAGGGGSKSEARKMKILEKNQKLNEERARDAQEAKKAKAASATNGAAAADDQSHIHPSRRARVPV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.25
3 0.2
4 0.16
5 0.08
6 0.07
7 0.05
8 0.1
9 0.11
10 0.17
11 0.19
12 0.2
13 0.26
14 0.33
15 0.42
16 0.47
17 0.57
18 0.62
19 0.71
20 0.78
21 0.82
22 0.86
23 0.88
24 0.89
25 0.89
26 0.88
27 0.89
28 0.93
29 0.93
30 0.94
31 0.95
32 0.96
33 0.96
34 0.97
35 0.96
36 0.96
37 0.96
38 0.95
39 0.95
40 0.96
41 0.95
42 0.95
43 0.96
44 0.96
45 0.96
46 0.97
47 0.96
48 0.95
49 0.96
50 0.95
51 0.95
52 0.94
53 0.89
54 0.84
55 0.77
56 0.68
57 0.63
58 0.56
59 0.48
60 0.39
61 0.34
62 0.28
63 0.25
64 0.24
65 0.2
66 0.19
67 0.16
68 0.15
69 0.13
70 0.13
71 0.13
72 0.13
73 0.1
74 0.07
75 0.08
76 0.08
77 0.08
78 0.07
79 0.09
80 0.09
81 0.09
82 0.08
83 0.08
84 0.07
85 0.07
86 0.07
87 0.04
88 0.05
89 0.05
90 0.05
91 0.05
92 0.07
93 0.06
94 0.07
95 0.09
96 0.09
97 0.17
98 0.25
99 0.3
100 0.37
101 0.46
102 0.55
103 0.65
104 0.74
105 0.76
106 0.8
107 0.86
108 0.89
109 0.92
110 0.93
111 0.93
112 0.95
113 0.95
114 0.94
115 0.95
116 0.94
117 0.94
118 0.94
119 0.93
120 0.91
121 0.92
122 0.88
123 0.84
124 0.83
125 0.79
126 0.77
127 0.77
128 0.72
129 0.68
130 0.65
131 0.65
132 0.65
133 0.68
134 0.69
135 0.71
136 0.77
137 0.79
138 0.86
139 0.89
140 0.9
141 0.9
142 0.87
143 0.84
144 0.79
145 0.72
146 0.62
147 0.55
148 0.47
149 0.4
150 0.37
151 0.31
152 0.27
153 0.27
154 0.28
155 0.26
156 0.22
157 0.2
158 0.15
159 0.13
160 0.11
161 0.08
162 0.07
163 0.07
164 0.08
165 0.07
166 0.06
167 0.05
168 0.06
169 0.09
170 0.09
171 0.1
172 0.08
173 0.1
174 0.1
175 0.09
176 0.08
177 0.06
178 0.05
179 0.05
180 0.04
181 0.03
182 0.03
183 0.02
184 0.02
185 0.02
186 0.02
187 0.02
188 0.02
189 0.02
190 0.03
191 0.03
192 0.03
193 0.04
194 0.06
195 0.06
196 0.08
197 0.09
198 0.09
199 0.1
200 0.15
201 0.16
202 0.17
203 0.2
204 0.18
205 0.18
206 0.18
207 0.17
208 0.14
209 0.13
210 0.12
211 0.1
212 0.12
213 0.13
214 0.14
215 0.17
216 0.15
217 0.15
218 0.2
219 0.24
220 0.27
221 0.28
222 0.33
223 0.34
224 0.37
225 0.4
226 0.39
227 0.37
228 0.33
229 0.33
230 0.32
231 0.39
232 0.38
233 0.37
234 0.4
235 0.43
236 0.47
237 0.51
238 0.48
239 0.45
240 0.45
241 0.44
242 0.41
243 0.36
244 0.31
245 0.25
246 0.24
247 0.21
248 0.19
249 0.17
250 0.14
251 0.16
252 0.2
253 0.22
254 0.25
255 0.26
256 0.3
257 0.35
258 0.37
259 0.44
260 0.43
261 0.42
262 0.41
263 0.38
264 0.4
265 0.39
266 0.38
267 0.37
268 0.39
269 0.4
270 0.45
271 0.5
272 0.49
273 0.51
274 0.58
275 0.59
276 0.56
277 0.55
278 0.51
279 0.45
280 0.4
281 0.34
282 0.25
283 0.15
284 0.14
285 0.16
286 0.13
287 0.17
288 0.22
289 0.25
290 0.3
291 0.35
292 0.43
293 0.49
294 0.59
295 0.63
296 0.67
297 0.74
298 0.74
299 0.78
300 0.72
301 0.72
302 0.7
303 0.66
304 0.6
305 0.57
306 0.58
307 0.51
308 0.54
309 0.51
310 0.52
311 0.52
312 0.49
313 0.48
314 0.43
315 0.42
316 0.43
317 0.4
318 0.36
319 0.37
320 0.36
321 0.31
322 0.31
323 0.3
324 0.22
325 0.2
326 0.16
327 0.09
328 0.09
329 0.09
330 0.1
331 0.16
332 0.18
333 0.22
334 0.26
335 0.32
336 0.41