FuNGI

A0A545VT57

Protein Details

Accession

A0A545VT57

Localization Confidence

High

Confidence Score

19.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
2-36	SAPPPKAANGPPKRKPNPLRPMRPRPRPTPSATAK	Hydrophilic
182-206	PVAKEVVPKKPKKQKEERTVFNRGP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
6-39	PKAANGPPKRKPNPLRPMRPRPRPTPSATAKPPG
188-200	VPKKPKKQKEERT
486-506	GKQKHGDKKGKSLKRAGSPAL
513-522	ESSRKKMKKT

Subcellular Location(s)

nucl 16, mito 8, cyto 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MSAPPPKAANGPPKRKPNPLRPMRPRPRPTPSATAKPPGQKPSSATIAAGPSRANAPNGNRQSLEELRKQYGGWSEPPPPYQYTDIPIMTTKKALLDGIRYHLMKLSSTKSDGKPIDPTDQDEFARPVTLHRRDARLPPPGRVVKEELPQRPPVDEQEKERLAQIKAEKEAQRAVNQAKIAPVAKEVVPKKPKKQKEERTVFNRGPRTAAAKKESDLRYEEALPWHLEDVDGKNVWVGSYVAALSESSVAFVIDQSVFRMVPLEKWYRFTAKPHFQAFTIDQAEEYMNRKVDVGRWVMKDEEKKTGQQDLAATRRMLYGSGMIKTESDTFKAASRAEKMEHDEIDMSGDEFQDDDEAPMFERNDDEDTKDSKDRIRREQLGANLFGDGDEGQVDQELQQQLKEELERQKFGKATRKALIKRDREDIYESDNSEDNPWSSSSDDDSSDEENEDQKEDEKKDGDNKDEKDDKGKPKVSGAQGSTTPQGKQKHGDKKGKSLKRAGSPALSESSGNESSRKKMKKTAVTAPGSRAGTPVPGAALKKKLGAGSTSDGEATAGEMSDGAGPRKKIKLVGSAKGTPTASRAGSPIPAGASPPPSSAGIEPWEILEKIPDGGISIVELIKPFQSRVGIKPGQMAKADWIKLVTRLCEYGPDKLLRKRK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.77
2	0.83
3	0.85
4	0.85
5	0.85
6	0.86
7	0.88
8	0.88
9	0.93
10	0.93
11	0.94
12	0.92
13	0.9
14	0.88
15	0.85
16	0.81
17	0.8
18	0.78
19	0.77
20	0.74
21	0.73
22	0.7
23	0.71
24	0.71
25	0.69
26	0.65
27	0.58
28	0.56
29	0.55
30	0.54
31	0.46
32	0.39
33	0.34
34	0.36
35	0.33
36	0.31
37	0.24
38	0.19
39	0.23
40	0.24
41	0.23
42	0.23
43	0.28
44	0.37
45	0.43
46	0.45
47	0.42
48	0.41
49	0.46
50	0.48
51	0.49
52	0.46
53	0.46
54	0.45
55	0.46
56	0.44
57	0.4
58	0.39
59	0.36
60	0.33
61	0.33
62	0.37
63	0.4
64	0.42
65	0.42
66	0.38
67	0.38
68	0.37
69	0.35
70	0.32
71	0.33
72	0.31
73	0.29
74	0.31
75	0.31
76	0.27
77	0.27
78	0.23
79	0.19
80	0.2
81	0.2
82	0.18
83	0.22
84	0.24
85	0.27
86	0.32
87	0.31
88	0.3
89	0.32
90	0.3
91	0.26
92	0.27
93	0.27
94	0.25
95	0.29
96	0.35
97	0.34
98	0.42
99	0.42
100	0.4
101	0.43
102	0.42
103	0.45
104	0.4
105	0.43
106	0.38
107	0.39
108	0.37
109	0.33
110	0.31
111	0.24
112	0.25
113	0.2
114	0.21
115	0.28
116	0.33
117	0.38
118	0.41
119	0.46
120	0.48
121	0.56
122	0.57
123	0.58
124	0.54
125	0.5
126	0.55
127	0.55
128	0.53
129	0.5
130	0.49
131	0.44
132	0.49
133	0.53
134	0.49
135	0.48
136	0.5
137	0.47
138	0.43
139	0.4
140	0.4
141	0.39
142	0.37
143	0.38
144	0.42
145	0.43
146	0.41
147	0.43
148	0.4
149	0.34
150	0.36
151	0.36
152	0.32
153	0.33
154	0.4
155	0.4
156	0.37
157	0.42
158	0.39
159	0.37
160	0.37
161	0.36
162	0.33
163	0.31
164	0.29
165	0.25
166	0.25
167	0.23
168	0.18
169	0.17
170	0.15
171	0.16
172	0.23
173	0.23
174	0.3
175	0.39
176	0.44
177	0.53
178	0.61
179	0.68
180	0.71
181	0.8
182	0.81
183	0.83
184	0.86
185	0.86
186	0.83
187	0.83
188	0.77
189	0.73
190	0.68
191	0.58
192	0.51
193	0.43
194	0.43
195	0.39
196	0.41
197	0.38
198	0.34
199	0.35
200	0.41
201	0.41
202	0.36
203	0.34
204	0.31
205	0.29
206	0.28
207	0.29
208	0.22
209	0.23
210	0.2
211	0.17
212	0.15
213	0.13
214	0.11
215	0.11
216	0.12
217	0.13
218	0.13
219	0.12
220	0.12
221	0.12
222	0.12
223	0.11
224	0.09
225	0.05
226	0.06
227	0.06
228	0.05
229	0.06
230	0.06
231	0.05
232	0.06
233	0.05
234	0.05
235	0.05
236	0.05
237	0.05
238	0.05
239	0.06
240	0.06
241	0.06
242	0.06
243	0.07
244	0.07
245	0.07
246	0.1
247	0.08
248	0.11
249	0.16
250	0.21
251	0.21
252	0.24
253	0.27
254	0.29
255	0.3
256	0.33
257	0.37
258	0.4
259	0.45
260	0.45
261	0.44
262	0.39
263	0.42
264	0.38
265	0.34
266	0.27
267	0.21
268	0.18
269	0.17
270	0.17
271	0.15
272	0.16
273	0.13
274	0.11
275	0.12
276	0.12
277	0.12
278	0.15
279	0.18
280	0.2
281	0.22
282	0.23
283	0.24
284	0.25
285	0.28
286	0.3
287	0.28
288	0.31
289	0.27
290	0.29
291	0.29
292	0.32
293	0.29
294	0.25
295	0.25
296	0.24
297	0.25
298	0.25
299	0.23
300	0.19
301	0.2
302	0.18
303	0.15
304	0.1
305	0.11
306	0.11
307	0.12
308	0.12
309	0.11
310	0.11
311	0.12
312	0.15
313	0.11
314	0.11
315	0.11
316	0.11
317	0.13
318	0.14
319	0.14
320	0.14
321	0.16
322	0.16
323	0.17
324	0.18
325	0.2
326	0.21
327	0.2
328	0.18
329	0.16
330	0.15
331	0.14
332	0.12
333	0.09
334	0.06
335	0.06
336	0.05
337	0.05
338	0.05
339	0.04
340	0.05
341	0.05
342	0.05
343	0.05
344	0.06
345	0.07
346	0.07
347	0.06
348	0.07
349	0.08
350	0.1
351	0.11
352	0.12
353	0.14
354	0.16
355	0.19
356	0.2
357	0.2
358	0.22
359	0.28
360	0.32
361	0.38
362	0.44
363	0.46
364	0.48
365	0.51
366	0.52
367	0.49
368	0.44
369	0.36
370	0.27
371	0.22
372	0.18
373	0.14
374	0.09
375	0.05
376	0.04
377	0.04
378	0.04
379	0.04
380	0.04
381	0.04
382	0.08
383	0.1
384	0.1
385	0.1
386	0.11
387	0.12
388	0.13
389	0.14
390	0.15
391	0.22
392	0.25
393	0.27
394	0.27
395	0.3
396	0.32
397	0.35
398	0.4
399	0.37
400	0.4
401	0.43
402	0.51
403	0.51
404	0.59
405	0.64
406	0.61
407	0.6
408	0.6
409	0.56
410	0.5
411	0.49
412	0.41
413	0.38
414	0.33
415	0.3
416	0.25
417	0.24
418	0.22
419	0.2
420	0.19
421	0.13
422	0.12
423	0.12
424	0.11
425	0.11
426	0.11
427	0.12
428	0.13
429	0.14
430	0.14
431	0.15
432	0.16
433	0.16
434	0.16
435	0.14
436	0.14
437	0.14
438	0.13
439	0.12
440	0.14
441	0.18
442	0.19
443	0.22
444	0.21
445	0.24
446	0.31
447	0.34
448	0.38
449	0.4
450	0.41
451	0.45
452	0.49
453	0.47
454	0.47
455	0.51
456	0.52
457	0.54
458	0.57
459	0.5
460	0.5
461	0.56
462	0.54
463	0.52
464	0.46
465	0.4
466	0.37
467	0.38
468	0.37
469	0.31
470	0.28
471	0.27
472	0.3
473	0.3
474	0.36
475	0.43
476	0.5
477	0.58
478	0.67
479	0.64
480	0.7
481	0.78
482	0.78
483	0.75
484	0.73
485	0.7
486	0.68
487	0.7
488	0.62
489	0.56
490	0.5
491	0.46
492	0.4
493	0.33
494	0.25
495	0.21
496	0.23
497	0.22
498	0.21
499	0.23
500	0.22
501	0.27
502	0.36
503	0.41
504	0.39
505	0.45
506	0.53
507	0.59
508	0.64
509	0.68
510	0.69
511	0.69
512	0.68
513	0.63
514	0.6
515	0.52
516	0.45
517	0.36
518	0.26
519	0.22
520	0.2
521	0.16
522	0.11
523	0.13
524	0.15
525	0.19
526	0.23
527	0.22
528	0.24
529	0.26
530	0.26
531	0.24
532	0.24
533	0.24
534	0.24
535	0.25
536	0.23
537	0.21
538	0.19
539	0.17
540	0.15
541	0.12
542	0.07
543	0.06
544	0.05
545	0.05
546	0.05
547	0.08
548	0.1
549	0.12
550	0.15
551	0.17
552	0.22
553	0.27
554	0.28
555	0.31
556	0.34
557	0.42
558	0.45
559	0.51
560	0.54
561	0.55
562	0.54
563	0.54
564	0.5
565	0.4
566	0.35
567	0.32
568	0.26
569	0.22
570	0.22
571	0.19
572	0.2
573	0.2
574	0.19
575	0.16
576	0.16
577	0.16
578	0.17
579	0.2
580	0.19
581	0.19
582	0.2
583	0.19
584	0.21
585	0.2
586	0.21
587	0.19
588	0.19
589	0.18
590	0.18
591	0.2
592	0.18
593	0.18
594	0.17
595	0.14
596	0.14
597	0.14
598	0.12
599	0.1
600	0.1
601	0.1
602	0.08
603	0.09
604	0.09
605	0.09
606	0.1
607	0.1
608	0.13
609	0.14
610	0.14
611	0.16
612	0.22
613	0.25
614	0.29
615	0.38
616	0.38
617	0.38
618	0.46
619	0.47
620	0.45
621	0.44
622	0.4
623	0.38
624	0.42
625	0.42
626	0.35
627	0.33
628	0.3
629	0.34
630	0.36
631	0.32
632	0.27
633	0.28
634	0.27
635	0.34
636	0.35
637	0.37
638	0.4
639	0.43
640	0.47

A0A545VT57

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer