Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A545VFG9

Protein Details
Accession A0A545VFG9    Localization Confidence Medium Confidence Score 13
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
296-316REERERARQERERQREKEQEEAcidic
NLS Segment(s)
PositionSequence
269-311RKKKEEAERKEREEREAREQEERDRILREERERARQERERQRE
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 14, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019258  Mediator_Med4  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF10018  Med4  
Amino Acid Sequences MDKFIDGRFERLEKALAGLIDSVTKYHPSMALAEELMAADAELTMGLEQVQAHQNNHLRILELRQASASLDTQIHDTLASLASTRRDIVNTPTTKFPSSPNYPIAYEELLSYARRISKTTMPPATTINASVAPSGLQSPIVGESQSQAVTPAATTPAAGATPAAVATPANSTPLPTQSPAALNGAGVANGVITQQSSQQQQQGSASSGPSLLTSLPEPMAQYLNPLSGQVFFPWPQEDKIRSGSLAANQVLVEKGIDPRGYDPVAEEERKKKEEAERKEREEREAREQEERDRILREERERARQERERQREKEQEEWRRASVAAGTADAPGSAAPKGPEKKQFQFTNLDDLDDDDDDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.24
3 0.19
4 0.18
5 0.16
6 0.14
7 0.14
8 0.14
9 0.13
10 0.12
11 0.14
12 0.13
13 0.14
14 0.16
15 0.15
16 0.17
17 0.18
18 0.19
19 0.17
20 0.17
21 0.15
22 0.13
23 0.12
24 0.09
25 0.07
26 0.04
27 0.04
28 0.04
29 0.03
30 0.04
31 0.03
32 0.03
33 0.04
34 0.05
35 0.05
36 0.08
37 0.15
38 0.17
39 0.18
40 0.26
41 0.31
42 0.32
43 0.35
44 0.32
45 0.27
46 0.26
47 0.31
48 0.31
49 0.26
50 0.25
51 0.22
52 0.22
53 0.21
54 0.22
55 0.17
56 0.12
57 0.12
58 0.12
59 0.13
60 0.13
61 0.12
62 0.1
63 0.1
64 0.09
65 0.09
66 0.08
67 0.07
68 0.09
69 0.1
70 0.12
71 0.12
72 0.12
73 0.13
74 0.14
75 0.2
76 0.28
77 0.29
78 0.3
79 0.35
80 0.36
81 0.37
82 0.36
83 0.34
84 0.33
85 0.36
86 0.39
87 0.38
88 0.38
89 0.37
90 0.38
91 0.36
92 0.28
93 0.22
94 0.17
95 0.14
96 0.13
97 0.12
98 0.11
99 0.11
100 0.14
101 0.14
102 0.16
103 0.18
104 0.25
105 0.32
106 0.4
107 0.42
108 0.4
109 0.41
110 0.41
111 0.39
112 0.31
113 0.25
114 0.18
115 0.14
116 0.13
117 0.12
118 0.1
119 0.08
120 0.08
121 0.08
122 0.07
123 0.05
124 0.05
125 0.06
126 0.07
127 0.07
128 0.07
129 0.06
130 0.07
131 0.08
132 0.08
133 0.07
134 0.07
135 0.06
136 0.06
137 0.06
138 0.06
139 0.06
140 0.06
141 0.06
142 0.05
143 0.05
144 0.05
145 0.05
146 0.04
147 0.03
148 0.04
149 0.04
150 0.03
151 0.03
152 0.03
153 0.04
154 0.05
155 0.05
156 0.07
157 0.07
158 0.08
159 0.09
160 0.12
161 0.12
162 0.12
163 0.12
164 0.12
165 0.13
166 0.13
167 0.13
168 0.1
169 0.09
170 0.09
171 0.08
172 0.07
173 0.06
174 0.04
175 0.03
176 0.03
177 0.03
178 0.03
179 0.03
180 0.03
181 0.05
182 0.08
183 0.11
184 0.12
185 0.15
186 0.16
187 0.17
188 0.18
189 0.17
190 0.16
191 0.15
192 0.14
193 0.1
194 0.1
195 0.09
196 0.08
197 0.07
198 0.06
199 0.06
200 0.06
201 0.07
202 0.07
203 0.08
204 0.08
205 0.08
206 0.09
207 0.08
208 0.1
209 0.09
210 0.1
211 0.09
212 0.09
213 0.09
214 0.09
215 0.1
216 0.09
217 0.11
218 0.1
219 0.12
220 0.14
221 0.15
222 0.16
223 0.21
224 0.22
225 0.23
226 0.26
227 0.26
228 0.23
229 0.24
230 0.24
231 0.22
232 0.25
233 0.22
234 0.19
235 0.17
236 0.18
237 0.16
238 0.14
239 0.11
240 0.07
241 0.08
242 0.1
243 0.11
244 0.11
245 0.13
246 0.16
247 0.16
248 0.15
249 0.15
250 0.18
251 0.23
252 0.25
253 0.27
254 0.31
255 0.37
256 0.4
257 0.39
258 0.38
259 0.43
260 0.51
261 0.57
262 0.6
263 0.63
264 0.68
265 0.77
266 0.74
267 0.72
268 0.71
269 0.65
270 0.65
271 0.63
272 0.59
273 0.57
274 0.57
275 0.55
276 0.55
277 0.52
278 0.44
279 0.39
280 0.39
281 0.38
282 0.43
283 0.43
284 0.45
285 0.48
286 0.56
287 0.6
288 0.63
289 0.65
290 0.67
291 0.72
292 0.73
293 0.78
294 0.78
295 0.77
296 0.82
297 0.82
298 0.78
299 0.78
300 0.77
301 0.77
302 0.75
303 0.74
304 0.66
305 0.58
306 0.52
307 0.44
308 0.36
309 0.3
310 0.22
311 0.19
312 0.18
313 0.16
314 0.16
315 0.15
316 0.12
317 0.08
318 0.08
319 0.07
320 0.09
321 0.1
322 0.19
323 0.25
324 0.31
325 0.41
326 0.47
327 0.55
328 0.63
329 0.66
330 0.62
331 0.66
332 0.62
333 0.63
334 0.55
335 0.48
336 0.39
337 0.35
338 0.34