Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5FDK5

Protein Details
Accession C5FDK5    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-28MPREKKKRGRRAEKSQSKRKREDEDVLDBasic
175-200VTSEMENPKNKKKRDRLTTNESNRDMHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
3-21REKKKRGRRAEKSQSKRKR
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 10.5, mito 5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011989  ARM-like  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR001313  Pumilio_RNA-bd_rpt  
IPR002129  PyrdxlP-dep_de-COase  
IPR015424  PyrdxlP-dep_Trfase  
IPR015421  PyrdxlP-dep_Trfase_major  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0016830  F:carbon-carbon lyase activity  
GO:0030170  F:pyridoxal phosphate binding  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0019752  P:carboxylic acid metabolic process  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF00282  Pyridoxal_deC  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50302  PUM  
Amino Acid Sequences MPREKKKRGRRAEKSQSKRKREDEDVLDSPKRQRTADEQNETTTGDDYIPLDIHGHGGEQIQERVDDTPFYGLLDTEEQEYFSKASQTLELNSFEDDDDKRLFIENVYAEASGKELKIACSQSCSRLMEKLIAMSTSTQVKSLFEKFSGHFLHLVQHRFASHCCECLFIRAAPMVTSEMENPKNKKKRDRLTTNESNRDMEQDESLNQKPAVELFLGVISELQGNWGYLLTEPFASHTIRLLLLILAGEPLADQSNARVLASRKKENVGSITATTQSELSIRESRQVPTEFNDTLRRMIVDLSAGLNSTYLQALATHPVGSPVLQVILSIELGCMGKEKIKDKNSVFRRLIPDDTLETKDEGLNFLNSLFYDPVGSRLLETIVRVAPGKFFKTFYKVIIRERIGSLARNEIASYVVIKVLERVSKEDLQSAIESILPEVPSLIQRSRLNVIKTIIDRSIVRGADTASLAKALESAYGDDGVARLKTILGVDADDPVAEEAMKPKSGVSAQHLHGSLLAQSMLQASGSLANMIQSSFLAAPNETIMQIAKNPTASRALQEALKCSRSNTHFRRQFLPRFYGQMCELSLDSSGSHVADALWDATTDLIFIKQRLAQELATSESTLRDSFLGRAVWRNWSMDLYKKKRGEWMSKAKGRDSSVSASTADSSAGPAKSKLDLARARYAAAAEQKEKPDSREQGHRGKKQVMSAPSSLLKAQMERPEEVRKVLNSVQERVVGFVEQADRASLVPGQKDNESQPKILDFKKPEELKEVFKEGLTTSGQGHDGLVRIVDDLLKYSVNTWQQGFLDKLYSSPNAPGLAAELLLGALNANVHVYQSAPALTVVEKLTTRRFAELFGLTGPNAGGISVQGGSASNTTAIVVARNTLFPDTKKNGTGDHRFVLFTSAHGHYSIEKAAQMIGLGSNAVCSVPVDREGRMIPQMLDEEIQKAKDAGKTPLFVNATAGTTVLGTFDPFSEIAEICRKHKLWFHIDGAWGGAFIFSNRQKHKLEGSHLADSIAINPHKMLGVPLTCSFLLGADMTQFHGSNTLPAGYLFHNDVSDGSEVWDLGDLTLQCGRRGDALKMFLNWNYIGSAGYEERIDSASDVAVHLCNLISESPDLILLSENPPPCFQICFFYAPFKQMVHGSGKLVDGRTLDEAERGKLNGEITSMIADDLIQQGFMVDYAPPAAAQVEGDGKYLRCVVNLHTKKETVERLVEPLVNDQKTL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.95
2 0.95
3 0.94
4 0.93
5 0.92
6 0.9
7 0.87
8 0.84
9 0.83
10 0.8
11 0.78
12 0.74
13 0.71
14 0.66
15 0.6
16 0.59
17 0.56
18 0.51
19 0.43
20 0.42
21 0.44
22 0.52
23 0.59
24 0.61
25 0.56
26 0.56
27 0.57
28 0.53
29 0.45
30 0.34
31 0.24
32 0.16
33 0.15
34 0.12
35 0.13
36 0.12
37 0.12
38 0.12
39 0.11
40 0.12
41 0.11
42 0.11
43 0.1
44 0.11
45 0.15
46 0.17
47 0.18
48 0.18
49 0.18
50 0.19
51 0.19
52 0.19
53 0.16
54 0.14
55 0.15
56 0.14
57 0.14
58 0.13
59 0.11
60 0.13
61 0.15
62 0.15
63 0.15
64 0.15
65 0.16
66 0.16
67 0.18
68 0.16
69 0.14
70 0.16
71 0.15
72 0.16
73 0.19
74 0.21
75 0.23
76 0.26
77 0.27
78 0.25
79 0.25
80 0.24
81 0.2
82 0.21
83 0.18
84 0.19
85 0.18
86 0.17
87 0.17
88 0.18
89 0.19
90 0.16
91 0.2
92 0.17
93 0.18
94 0.19
95 0.19
96 0.17
97 0.16
98 0.17
99 0.14
100 0.13
101 0.13
102 0.13
103 0.16
104 0.21
105 0.25
106 0.25
107 0.29
108 0.31
109 0.34
110 0.39
111 0.4
112 0.36
113 0.36
114 0.37
115 0.35
116 0.34
117 0.32
118 0.27
119 0.24
120 0.23
121 0.19
122 0.2
123 0.21
124 0.21
125 0.19
126 0.19
127 0.2
128 0.24
129 0.28
130 0.28
131 0.23
132 0.27
133 0.27
134 0.34
135 0.34
136 0.31
137 0.27
138 0.25
139 0.31
140 0.32
141 0.35
142 0.28
143 0.29
144 0.28
145 0.29
146 0.3
147 0.31
148 0.27
149 0.27
150 0.26
151 0.27
152 0.26
153 0.29
154 0.31
155 0.23
156 0.24
157 0.23
158 0.23
159 0.2
160 0.21
161 0.18
162 0.15
163 0.16
164 0.16
165 0.21
166 0.26
167 0.33
168 0.37
169 0.46
170 0.54
171 0.61
172 0.68
173 0.72
174 0.77
175 0.81
176 0.86
177 0.85
178 0.86
179 0.89
180 0.88
181 0.87
182 0.78
183 0.7
184 0.6
185 0.54
186 0.45
187 0.36
188 0.28
189 0.21
190 0.21
191 0.23
192 0.24
193 0.25
194 0.23
195 0.22
196 0.2
197 0.19
198 0.18
199 0.13
200 0.12
201 0.09
202 0.1
203 0.1
204 0.09
205 0.08
206 0.07
207 0.07
208 0.06
209 0.07
210 0.06
211 0.07
212 0.07
213 0.07
214 0.07
215 0.07
216 0.09
217 0.08
218 0.08
219 0.08
220 0.1
221 0.12
222 0.12
223 0.12
224 0.13
225 0.13
226 0.12
227 0.13
228 0.11
229 0.09
230 0.09
231 0.08
232 0.07
233 0.05
234 0.05
235 0.04
236 0.04
237 0.05
238 0.05
239 0.05
240 0.05
241 0.06
242 0.11
243 0.11
244 0.11
245 0.14
246 0.16
247 0.25
248 0.32
249 0.39
250 0.37
251 0.41
252 0.43
253 0.43
254 0.44
255 0.39
256 0.35
257 0.29
258 0.28
259 0.26
260 0.24
261 0.21
262 0.17
263 0.14
264 0.12
265 0.12
266 0.15
267 0.18
268 0.19
269 0.24
270 0.26
271 0.27
272 0.32
273 0.33
274 0.3
275 0.29
276 0.34
277 0.29
278 0.29
279 0.35
280 0.3
281 0.29
282 0.28
283 0.25
284 0.2
285 0.19
286 0.17
287 0.11
288 0.1
289 0.1
290 0.09
291 0.09
292 0.08
293 0.08
294 0.07
295 0.07
296 0.06
297 0.05
298 0.05
299 0.06
300 0.07
301 0.1
302 0.1
303 0.1
304 0.1
305 0.11
306 0.11
307 0.11
308 0.1
309 0.08
310 0.08
311 0.07
312 0.07
313 0.06
314 0.07
315 0.07
316 0.06
317 0.05
318 0.06
319 0.06
320 0.06
321 0.07
322 0.07
323 0.1
324 0.14
325 0.19
326 0.26
327 0.31
328 0.39
329 0.42
330 0.51
331 0.55
332 0.61
333 0.59
334 0.57
335 0.59
336 0.55
337 0.53
338 0.45
339 0.4
340 0.34
341 0.35
342 0.31
343 0.25
344 0.22
345 0.2
346 0.2
347 0.17
348 0.15
349 0.13
350 0.11
351 0.1
352 0.1
353 0.09
354 0.08
355 0.1
356 0.09
357 0.08
358 0.08
359 0.08
360 0.11
361 0.12
362 0.12
363 0.1
364 0.1
365 0.11
366 0.11
367 0.11
368 0.11
369 0.1
370 0.11
371 0.11
372 0.11
373 0.14
374 0.17
375 0.19
376 0.18
377 0.2
378 0.21
379 0.26
380 0.28
381 0.28
382 0.34
383 0.35
384 0.39
385 0.45
386 0.44
387 0.41
388 0.4
389 0.4
390 0.31
391 0.31
392 0.27
393 0.23
394 0.21
395 0.19
396 0.18
397 0.15
398 0.14
399 0.12
400 0.11
401 0.07
402 0.07
403 0.07
404 0.07
405 0.09
406 0.1
407 0.12
408 0.12
409 0.15
410 0.19
411 0.22
412 0.23
413 0.23
414 0.22
415 0.21
416 0.2
417 0.18
418 0.14
419 0.11
420 0.11
421 0.09
422 0.1
423 0.08
424 0.08
425 0.07
426 0.08
427 0.09
428 0.11
429 0.12
430 0.16
431 0.17
432 0.2
433 0.25
434 0.29
435 0.28
436 0.29
437 0.3
438 0.28
439 0.28
440 0.28
441 0.24
442 0.21
443 0.2
444 0.2
445 0.23
446 0.19
447 0.18
448 0.16
449 0.16
450 0.16
451 0.16
452 0.13
453 0.08
454 0.08
455 0.08
456 0.07
457 0.07
458 0.05
459 0.06
460 0.06
461 0.06
462 0.07
463 0.07
464 0.07
465 0.06
466 0.06
467 0.06
468 0.06
469 0.05
470 0.05
471 0.04
472 0.05
473 0.05
474 0.06
475 0.06
476 0.07
477 0.07
478 0.07
479 0.07
480 0.07
481 0.07
482 0.05
483 0.05
484 0.04
485 0.04
486 0.06
487 0.08
488 0.08
489 0.08
490 0.08
491 0.1
492 0.12
493 0.14
494 0.15
495 0.2
496 0.21
497 0.25
498 0.25
499 0.24
500 0.22
501 0.21
502 0.16
503 0.11
504 0.1
505 0.05
506 0.05
507 0.05
508 0.05
509 0.05
510 0.04
511 0.04
512 0.05
513 0.05
514 0.05
515 0.04
516 0.05
517 0.05
518 0.05
519 0.05
520 0.04
521 0.05
522 0.05
523 0.06
524 0.06
525 0.06
526 0.06
527 0.07
528 0.07
529 0.06
530 0.06
531 0.05
532 0.05
533 0.07
534 0.08
535 0.08
536 0.09
537 0.09
538 0.11
539 0.14
540 0.14
541 0.14
542 0.14
543 0.15
544 0.16
545 0.16
546 0.19
547 0.18
548 0.21
549 0.2
550 0.18
551 0.24
552 0.25
553 0.35
554 0.37
555 0.45
556 0.48
557 0.5
558 0.56
559 0.57
560 0.6
561 0.54
562 0.52
563 0.43
564 0.42
565 0.4
566 0.35
567 0.29
568 0.24
569 0.19
570 0.15
571 0.14
572 0.1
573 0.1
574 0.08
575 0.07
576 0.06
577 0.06
578 0.05
579 0.05
580 0.04
581 0.04
582 0.04
583 0.04
584 0.04
585 0.04
586 0.04
587 0.04
588 0.04
589 0.04
590 0.04
591 0.03
592 0.04
593 0.05
594 0.05
595 0.07
596 0.09
597 0.09
598 0.11
599 0.13
600 0.12
601 0.12
602 0.13
603 0.13
604 0.11
605 0.11
606 0.09
607 0.08
608 0.09
609 0.08
610 0.08
611 0.06
612 0.07
613 0.07
614 0.1
615 0.1
616 0.1
617 0.14
618 0.14
619 0.17
620 0.18
621 0.18
622 0.16
623 0.17
624 0.17
625 0.21
626 0.3
627 0.32
628 0.39
629 0.4
630 0.41
631 0.46
632 0.51
633 0.52
634 0.51
635 0.56
636 0.58
637 0.6
638 0.61
639 0.56
640 0.54
641 0.48
642 0.41
643 0.33
644 0.26
645 0.23
646 0.23
647 0.21
648 0.17
649 0.16
650 0.14
651 0.11
652 0.08
653 0.07
654 0.09
655 0.09
656 0.09
657 0.09
658 0.1
659 0.1
660 0.13
661 0.13
662 0.18
663 0.21
664 0.25
665 0.3
666 0.29
667 0.29
668 0.27
669 0.26
670 0.21
671 0.22
672 0.2
673 0.17
674 0.2
675 0.21
676 0.24
677 0.25
678 0.26
679 0.28
680 0.3
681 0.31
682 0.37
683 0.41
684 0.48
685 0.56
686 0.58
687 0.56
688 0.57
689 0.55
690 0.51
691 0.51
692 0.45
693 0.4
694 0.36
695 0.34
696 0.29
697 0.28
698 0.23
699 0.19
700 0.16
701 0.13
702 0.16
703 0.19
704 0.2
705 0.21
706 0.24
707 0.28
708 0.28
709 0.28
710 0.27
711 0.22
712 0.23
713 0.25
714 0.28
715 0.24
716 0.26
717 0.26
718 0.26
719 0.26
720 0.23
721 0.21
722 0.15
723 0.12
724 0.11
725 0.11
726 0.08
727 0.08
728 0.07
729 0.07
730 0.07
731 0.08
732 0.08
733 0.09
734 0.1
735 0.12
736 0.13
737 0.14
738 0.16
739 0.19
740 0.26
741 0.27
742 0.26
743 0.25
744 0.26
745 0.29
746 0.3
747 0.33
748 0.27
749 0.29
750 0.38
751 0.39
752 0.37
753 0.4
754 0.4
755 0.38
756 0.38
757 0.36
758 0.28
759 0.26
760 0.26
761 0.19
762 0.2
763 0.16
764 0.13
765 0.11
766 0.12
767 0.12
768 0.11
769 0.11
770 0.09
771 0.09
772 0.08
773 0.07
774 0.06
775 0.06
776 0.06
777 0.06
778 0.05
779 0.06
780 0.07
781 0.07
782 0.07
783 0.08
784 0.12
785 0.14
786 0.16
787 0.15
788 0.17
789 0.17
790 0.2
791 0.2
792 0.16
793 0.16
794 0.14
795 0.15
796 0.15
797 0.15
798 0.14
799 0.14
800 0.15
801 0.13
802 0.13
803 0.12
804 0.11
805 0.1
806 0.09
807 0.08
808 0.06
809 0.05
810 0.05
811 0.05
812 0.03
813 0.03
814 0.03
815 0.03
816 0.03
817 0.03
818 0.03
819 0.04
820 0.04
821 0.05
822 0.06
823 0.06
824 0.06
825 0.06
826 0.07
827 0.07
828 0.09
829 0.09
830 0.1
831 0.1
832 0.12
833 0.16
834 0.2
835 0.21
836 0.21
837 0.21
838 0.21
839 0.24
840 0.23
841 0.2
842 0.17
843 0.16
844 0.13
845 0.14
846 0.12
847 0.08
848 0.07
849 0.06
850 0.05
851 0.04
852 0.05
853 0.05
854 0.05
855 0.05
856 0.05
857 0.06
858 0.06
859 0.07
860 0.06
861 0.05
862 0.06
863 0.07
864 0.06
865 0.07
866 0.07
867 0.08
868 0.08
869 0.09
870 0.1
871 0.11
872 0.13
873 0.13
874 0.22
875 0.25
876 0.27
877 0.3
878 0.3
879 0.33
880 0.39
881 0.45
882 0.41
883 0.39
884 0.37
885 0.35
886 0.34
887 0.31
888 0.23
889 0.17
890 0.17
891 0.16
892 0.15
893 0.15
894 0.16
895 0.14
896 0.16
897 0.16
898 0.12
899 0.11
900 0.11
901 0.11
902 0.1
903 0.09
904 0.07
905 0.06
906 0.06
907 0.05
908 0.05
909 0.05
910 0.05
911 0.05
912 0.04
913 0.04
914 0.06
915 0.07
916 0.12
917 0.13
918 0.13
919 0.16
920 0.17
921 0.19
922 0.2
923 0.2
924 0.15
925 0.16
926 0.17
927 0.15
928 0.15
929 0.13
930 0.14
931 0.14
932 0.14
933 0.13
934 0.12
935 0.14
936 0.18
937 0.21
938 0.24
939 0.26
940 0.28
941 0.28
942 0.34
943 0.33
944 0.28
945 0.28
946 0.23
947 0.2
948 0.18
949 0.18
950 0.11
951 0.1
952 0.09
953 0.08
954 0.06
955 0.06
956 0.06
957 0.06
958 0.08
959 0.08
960 0.08
961 0.1
962 0.1
963 0.12
964 0.19
965 0.2
966 0.21
967 0.28
968 0.28
969 0.3
970 0.36
971 0.41
972 0.41
973 0.46
974 0.48
975 0.45
976 0.45
977 0.42
978 0.37
979 0.29
980 0.22
981 0.15
982 0.11
983 0.07
984 0.06
985 0.13
986 0.17
987 0.25
988 0.28
989 0.35
990 0.36
991 0.4
992 0.48
993 0.48
994 0.49
995 0.51
996 0.53
997 0.51
998 0.49
999 0.45
1000 0.38
1001 0.31
1002 0.27
1003 0.24
1004 0.18
1005 0.15
1006 0.15
1007 0.15
1008 0.15
1009 0.15
1010 0.14
1011 0.12
1012 0.14
1013 0.17
1014 0.18
1015 0.21
1016 0.2
1017 0.2
1018 0.19
1019 0.14
1020 0.13
1021 0.1
1022 0.1
1023 0.08
1024 0.08
1025 0.1
1026 0.11
1027 0.11
1028 0.1
1029 0.12
1030 0.12
1031 0.12
1032 0.13
1033 0.12
1034 0.11
1035 0.11
1036 0.13
1037 0.12
1038 0.14
1039 0.14
1040 0.14
1041 0.13
1042 0.13
1043 0.13
1044 0.13
1045 0.13
1046 0.11
1047 0.11
1048 0.11
1049 0.1
1050 0.1
1051 0.11
1052 0.09
1053 0.08
1054 0.11
1055 0.1
1056 0.11
1057 0.16
1058 0.17
1059 0.17
1060 0.18
1061 0.18
1062 0.21
1063 0.24
1064 0.27
1065 0.28
1066 0.33
1067 0.34
1068 0.36
1069 0.37
1070 0.32
1071 0.32
1072 0.28
1073 0.23
1074 0.18
1075 0.16
1076 0.13
1077 0.12
1078 0.14
1079 0.11
1080 0.12
1081 0.11
1082 0.11
1083 0.12
1084 0.12
1085 0.12
1086 0.09
1087 0.09
1088 0.09
1089 0.09
1090 0.1
1091 0.1
1092 0.1
1093 0.09
1094 0.09
1095 0.08
1096 0.07
1097 0.08
1098 0.08
1099 0.09
1100 0.09
1101 0.1
1102 0.1
1103 0.1
1104 0.1
1105 0.09
1106 0.1
1107 0.1
1108 0.12
1109 0.17
1110 0.19
1111 0.2
1112 0.21
1113 0.23
1114 0.23
1115 0.24
1116 0.23
1117 0.23
1118 0.23
1119 0.27
1120 0.27
1121 0.33
1122 0.33
1123 0.33
1124 0.34
1125 0.29
1126 0.29
1127 0.26
1128 0.29
1129 0.27
1130 0.28
1131 0.26
1132 0.26
1133 0.28
1134 0.29
1135 0.27
1136 0.26
1137 0.2
1138 0.21
1139 0.22
1140 0.22
1141 0.2
1142 0.22
1143 0.23
1144 0.23
1145 0.25
1146 0.22
1147 0.21
1148 0.21
1149 0.22
1150 0.18
1151 0.17
1152 0.15
1153 0.13
1154 0.14
1155 0.13
1156 0.11
1157 0.1
1158 0.08
1159 0.08
1160 0.1
1161 0.1
1162 0.08
1163 0.08
1164 0.08
1165 0.08
1166 0.08
1167 0.08
1168 0.05
1169 0.06
1170 0.07
1171 0.07
1172 0.07
1173 0.07
1174 0.08
1175 0.07
1176 0.07
1177 0.09
1178 0.13
1179 0.13
1180 0.15
1181 0.17
1182 0.17
1183 0.19
1184 0.23
1185 0.21
1186 0.18
1187 0.19
1188 0.23
1189 0.32
1190 0.39
1191 0.43
1192 0.44
1193 0.45
1194 0.47
1195 0.53
1196 0.54
1197 0.49
1198 0.48
1199 0.44
1200 0.44
1201 0.46
1202 0.45
1203 0.39
1204 0.41
1205 0.43