Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5FP86

Protein Details
Accession C5FP86    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
42-72LTLASSPQPIRRKRKRVEKWAWNKRENHLRRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
51-67IRRKRKRVEKWAWNKRE
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto_nucl 14.5, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009057  Homeobox-like_sf  
IPR039601  Rrn5  
IPR001005  SANT/Myb  
Gene Ontology GO:0000500  C:RNA polymerase I upstream activating factor complex  
GO:0042790  P:nucleolar large rRNA transcription by RNA polymerase I  
CDD cd00167  SANT  
Amino Acid Sequences MSSSSYEPQDNAPNSHNEVDKPRSVVYDSSDACPSSHQLQHLTLASSPQPIRRKRKRVEKWAWNKRENHLRRANAQPIASYQELLDDTIDTITKEPSHGAAIHASQLGIVTWSAEEKINLFSALARKGKSAVSEIASIVGTKSRIEVQQYLMEIQQALQEQQMTEKNVRGITFSDIHAAAEISEECCLALEKVANSLSVREEQAHNISGRRKYKDMWLVDSNAATYLEEKINTKDISDVDPNAHHMLATAQLFNISNWINLSRNVFMNFGGHRIEDNWTRICFHEETPAMTCDSFTDFYTLAVSLTRRLVQSSIFFALSRLRAMDERGLDRNRVVRKDDVYAALGTLKIRRNSREFWIHAARRCSLDVREYVSKGSFKTTLLSYDEVERRLSASHLELPEPQQTEEDHEDHEEQESPEQDADMPSEANPELYLAGDSSSSFEDSQTDVSMEDTLFPESEEEFLSDEEERYAVTIDREASQEEEKRLWKILNQTPNSEAPPNVDIKMESDGEGVSTAPGLRSKPAAKRKTIQELQDWRNQILPMAEWELFGPKTFAIDEEIYGNHTKRRKKSDDGLE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.4
2 0.43
3 0.42
4 0.37
5 0.41
6 0.44
7 0.44
8 0.42
9 0.39
10 0.37
11 0.37
12 0.36
13 0.33
14 0.36
15 0.34
16 0.33
17 0.35
18 0.33
19 0.3
20 0.3
21 0.28
22 0.26
23 0.27
24 0.27
25 0.28
26 0.29
27 0.34
28 0.35
29 0.33
30 0.27
31 0.27
32 0.25
33 0.28
34 0.29
35 0.32
36 0.38
37 0.46
38 0.57
39 0.64
40 0.74
41 0.77
42 0.86
43 0.89
44 0.92
45 0.93
46 0.93
47 0.94
48 0.94
49 0.94
50 0.91
51 0.86
52 0.83
53 0.83
54 0.78
55 0.77
56 0.76
57 0.71
58 0.69
59 0.73
60 0.71
61 0.65
62 0.59
63 0.5
64 0.43
65 0.43
66 0.37
67 0.29
68 0.21
69 0.19
70 0.19
71 0.18
72 0.16
73 0.1
74 0.1
75 0.11
76 0.11
77 0.09
78 0.09
79 0.1
80 0.11
81 0.11
82 0.11
83 0.12
84 0.14
85 0.14
86 0.15
87 0.16
88 0.16
89 0.18
90 0.17
91 0.16
92 0.13
93 0.12
94 0.11
95 0.08
96 0.07
97 0.06
98 0.05
99 0.06
100 0.07
101 0.08
102 0.08
103 0.09
104 0.11
105 0.11
106 0.11
107 0.1
108 0.12
109 0.16
110 0.22
111 0.24
112 0.23
113 0.23
114 0.25
115 0.26
116 0.25
117 0.25
118 0.22
119 0.21
120 0.21
121 0.21
122 0.2
123 0.19
124 0.17
125 0.13
126 0.12
127 0.1
128 0.09
129 0.1
130 0.12
131 0.14
132 0.18
133 0.2
134 0.21
135 0.24
136 0.25
137 0.25
138 0.22
139 0.21
140 0.17
141 0.15
142 0.14
143 0.11
144 0.1
145 0.1
146 0.1
147 0.1
148 0.14
149 0.17
150 0.18
151 0.19
152 0.21
153 0.22
154 0.23
155 0.24
156 0.21
157 0.19
158 0.2
159 0.2
160 0.18
161 0.18
162 0.16
163 0.16
164 0.15
165 0.13
166 0.09
167 0.08
168 0.08
169 0.06
170 0.06
171 0.06
172 0.05
173 0.06
174 0.06
175 0.05
176 0.06
177 0.07
178 0.07
179 0.1
180 0.11
181 0.11
182 0.11
183 0.12
184 0.12
185 0.13
186 0.13
187 0.13
188 0.14
189 0.15
190 0.17
191 0.19
192 0.18
193 0.2
194 0.25
195 0.3
196 0.35
197 0.37
198 0.36
199 0.35
200 0.42
201 0.47
202 0.44
203 0.43
204 0.4
205 0.39
206 0.38
207 0.37
208 0.29
209 0.21
210 0.18
211 0.12
212 0.1
213 0.09
214 0.09
215 0.1
216 0.11
217 0.11
218 0.16
219 0.16
220 0.15
221 0.15
222 0.15
223 0.18
224 0.19
225 0.18
226 0.15
227 0.16
228 0.18
229 0.16
230 0.15
231 0.11
232 0.09
233 0.09
234 0.1
235 0.1
236 0.08
237 0.07
238 0.08
239 0.09
240 0.08
241 0.11
242 0.08
243 0.08
244 0.08
245 0.1
246 0.1
247 0.11
248 0.13
249 0.12
250 0.13
251 0.14
252 0.14
253 0.13
254 0.14
255 0.13
256 0.12
257 0.12
258 0.1
259 0.09
260 0.1
261 0.13
262 0.13
263 0.15
264 0.16
265 0.16
266 0.17
267 0.17
268 0.2
269 0.18
270 0.16
271 0.2
272 0.18
273 0.2
274 0.2
275 0.21
276 0.18
277 0.16
278 0.15
279 0.09
280 0.11
281 0.11
282 0.09
283 0.1
284 0.09
285 0.1
286 0.1
287 0.1
288 0.07
289 0.07
290 0.07
291 0.07
292 0.08
293 0.1
294 0.09
295 0.1
296 0.1
297 0.11
298 0.12
299 0.13
300 0.14
301 0.12
302 0.12
303 0.12
304 0.14
305 0.13
306 0.12
307 0.1
308 0.1
309 0.1
310 0.11
311 0.14
312 0.14
313 0.16
314 0.21
315 0.22
316 0.22
317 0.23
318 0.27
319 0.28
320 0.29
321 0.29
322 0.27
323 0.28
324 0.3
325 0.31
326 0.26
327 0.23
328 0.21
329 0.18
330 0.15
331 0.13
332 0.11
333 0.14
334 0.16
335 0.19
336 0.22
337 0.27
338 0.31
339 0.33
340 0.39
341 0.43
342 0.4
343 0.42
344 0.49
345 0.49
346 0.49
347 0.49
348 0.44
349 0.38
350 0.38
351 0.33
352 0.25
353 0.24
354 0.22
355 0.24
356 0.26
357 0.25
358 0.25
359 0.25
360 0.25
361 0.22
362 0.23
363 0.19
364 0.15
365 0.17
366 0.16
367 0.17
368 0.18
369 0.19
370 0.17
371 0.22
372 0.24
373 0.23
374 0.23
375 0.19
376 0.18
377 0.17
378 0.17
379 0.12
380 0.12
381 0.16
382 0.17
383 0.18
384 0.19
385 0.21
386 0.25
387 0.25
388 0.22
389 0.18
390 0.18
391 0.22
392 0.25
393 0.23
394 0.19
395 0.2
396 0.21
397 0.2
398 0.21
399 0.17
400 0.14
401 0.15
402 0.15
403 0.14
404 0.13
405 0.13
406 0.13
407 0.11
408 0.11
409 0.1
410 0.09
411 0.08
412 0.1
413 0.1
414 0.1
415 0.09
416 0.08
417 0.07
418 0.07
419 0.08
420 0.05
421 0.06
422 0.06
423 0.06
424 0.07
425 0.08
426 0.09
427 0.09
428 0.09
429 0.1
430 0.11
431 0.12
432 0.11
433 0.11
434 0.09
435 0.1
436 0.11
437 0.09
438 0.09
439 0.09
440 0.09
441 0.09
442 0.09
443 0.1
444 0.09
445 0.1
446 0.09
447 0.09
448 0.09
449 0.09
450 0.11
451 0.1
452 0.1
453 0.1
454 0.09
455 0.08
456 0.08
457 0.09
458 0.08
459 0.09
460 0.11
461 0.11
462 0.13
463 0.14
464 0.15
465 0.17
466 0.21
467 0.25
468 0.25
469 0.29
470 0.3
471 0.31
472 0.33
473 0.31
474 0.3
475 0.35
476 0.4
477 0.45
478 0.46
479 0.47
480 0.48
481 0.51
482 0.5
483 0.43
484 0.35
485 0.29
486 0.3
487 0.29
488 0.26
489 0.23
490 0.2
491 0.19
492 0.23
493 0.19
494 0.17
495 0.15
496 0.14
497 0.13
498 0.13
499 0.11
500 0.07
501 0.07
502 0.07
503 0.08
504 0.1
505 0.11
506 0.13
507 0.19
508 0.25
509 0.35
510 0.45
511 0.51
512 0.56
513 0.63
514 0.7
515 0.75
516 0.75
517 0.71
518 0.7
519 0.73
520 0.71
521 0.71
522 0.65
523 0.55
524 0.52
525 0.47
526 0.38
527 0.3
528 0.26
529 0.22
530 0.23
531 0.23
532 0.19
533 0.2
534 0.22
535 0.2
536 0.19
537 0.17
538 0.12
539 0.14
540 0.14
541 0.14
542 0.15
543 0.16
544 0.16
545 0.17
546 0.18
547 0.19
548 0.23
549 0.24
550 0.25
551 0.31
552 0.39
553 0.46
554 0.56
555 0.61
556 0.66