Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A545VIX5

Protein Details
Accession A0A545VIX5    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
34-66LTTYRIDKKKCDEQKPSCYRCSRLSRKCDYFTSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
223-232KRRALKKNKK
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto_nucl 14.5, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR018608  Gti1/Pac2  
IPR036864  Zn2-C6_fun-type_DNA-bd_sf  
IPR001138  Zn2Cys6_DnaBD  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0000981  F:DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF09729  Gti1_Pac2  
CDD cd00067  GAL4  
Amino Acid Sequences MFVTNGGQGHQEGAGKSGQRNQETAVVIQAGRSLTTYRIDKKKCDEQKPSCYRCSRLSRKCDYFTSPQPEPIDHEPRNSADDNTDADNTDGEADNNSSSAIHSNSVFTRKLQENPAVQYANNALFSENQSASLTPTFQGHIASTLDALVLFESCLKGMLPRVPRRPHDRERQDLIKSGSIFIYEEHSSGIKRWTDGVSWSPSRILGNFLIYRELEKSFAPDEKRRALKKNKKSSQGIAKSEQASHPNMPYISAGFVQYSTSEDQERSLIGSLVDSYPFKNDGLVKKTISICFQGVAHHMVSYYNVDDIASGKFETPTESIMTRTVTPRPELLLSQNFRTPVDGVEYAVAEHTGAVPAQYAFDQGSIGNSNGVLPRAMLHGNLRTAISNTQQGHQGSSPAAFLQQPPDTHNGYPGPVTNSAFQAAMLQQMSYPANPVGNYTLDPNRGDRFVSAAVNPEFPRNMPQASSSRLASLYDASGHRSDIGMPFGSSGTEARPMASNSYLALQAYYMTQQHQGAAPSTQASPFPMSRGLRSESNAIPADDSVNHSYSLNGTAWNFEPPIPGHLS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.21
3 0.23
4 0.29
5 0.34
6 0.34
7 0.35
8 0.36
9 0.39
10 0.38
11 0.36
12 0.32
13 0.27
14 0.24
15 0.23
16 0.23
17 0.16
18 0.14
19 0.15
20 0.13
21 0.13
22 0.2
23 0.26
24 0.33
25 0.42
26 0.47
27 0.53
28 0.6
29 0.68
30 0.72
31 0.75
32 0.77
33 0.77
34 0.84
35 0.88
36 0.86
37 0.84
38 0.8
39 0.75
40 0.73
41 0.75
42 0.74
43 0.73
44 0.77
45 0.78
46 0.8
47 0.8
48 0.76
49 0.72
50 0.69
51 0.68
52 0.67
53 0.59
54 0.57
55 0.54
56 0.5
57 0.49
58 0.49
59 0.49
60 0.43
61 0.44
62 0.41
63 0.41
64 0.45
65 0.4
66 0.33
67 0.25
68 0.26
69 0.25
70 0.24
71 0.23
72 0.19
73 0.17
74 0.16
75 0.15
76 0.14
77 0.12
78 0.1
79 0.1
80 0.11
81 0.1
82 0.1
83 0.1
84 0.08
85 0.08
86 0.11
87 0.11
88 0.11
89 0.11
90 0.14
91 0.17
92 0.22
93 0.22
94 0.2
95 0.26
96 0.29
97 0.33
98 0.36
99 0.39
100 0.4
101 0.43
102 0.48
103 0.42
104 0.38
105 0.35
106 0.32
107 0.28
108 0.24
109 0.2
110 0.15
111 0.15
112 0.18
113 0.21
114 0.18
115 0.17
116 0.16
117 0.16
118 0.18
119 0.17
120 0.16
121 0.11
122 0.13
123 0.12
124 0.12
125 0.13
126 0.11
127 0.12
128 0.12
129 0.11
130 0.1
131 0.09
132 0.09
133 0.07
134 0.07
135 0.05
136 0.04
137 0.04
138 0.05
139 0.05
140 0.05
141 0.06
142 0.05
143 0.06
144 0.09
145 0.16
146 0.24
147 0.32
148 0.42
149 0.48
150 0.55
151 0.63
152 0.69
153 0.72
154 0.74
155 0.74
156 0.73
157 0.74
158 0.74
159 0.67
160 0.63
161 0.57
162 0.5
163 0.42
164 0.35
165 0.28
166 0.21
167 0.19
168 0.14
169 0.16
170 0.12
171 0.11
172 0.11
173 0.12
174 0.11
175 0.12
176 0.17
177 0.14
178 0.14
179 0.16
180 0.16
181 0.16
182 0.19
183 0.21
184 0.23
185 0.23
186 0.23
187 0.21
188 0.21
189 0.21
190 0.19
191 0.18
192 0.12
193 0.16
194 0.16
195 0.16
196 0.17
197 0.16
198 0.17
199 0.16
200 0.16
201 0.12
202 0.11
203 0.13
204 0.13
205 0.17
206 0.21
207 0.24
208 0.29
209 0.35
210 0.42
211 0.44
212 0.52
213 0.59
214 0.65
215 0.7
216 0.77
217 0.77
218 0.78
219 0.78
220 0.76
221 0.75
222 0.74
223 0.68
224 0.6
225 0.57
226 0.49
227 0.46
228 0.41
229 0.34
230 0.28
231 0.25
232 0.22
233 0.19
234 0.18
235 0.17
236 0.15
237 0.12
238 0.1
239 0.09
240 0.09
241 0.07
242 0.07
243 0.07
244 0.07
245 0.08
246 0.08
247 0.09
248 0.09
249 0.09
250 0.1
251 0.1
252 0.1
253 0.08
254 0.08
255 0.07
256 0.06
257 0.06
258 0.06
259 0.06
260 0.07
261 0.07
262 0.06
263 0.07
264 0.08
265 0.08
266 0.09
267 0.13
268 0.17
269 0.21
270 0.23
271 0.22
272 0.24
273 0.27
274 0.26
275 0.24
276 0.21
277 0.17
278 0.15
279 0.15
280 0.13
281 0.12
282 0.13
283 0.12
284 0.1
285 0.09
286 0.09
287 0.09
288 0.09
289 0.08
290 0.06
291 0.06
292 0.05
293 0.06
294 0.07
295 0.06
296 0.06
297 0.06
298 0.06
299 0.07
300 0.07
301 0.09
302 0.09
303 0.1
304 0.1
305 0.11
306 0.11
307 0.12
308 0.13
309 0.12
310 0.14
311 0.16
312 0.16
313 0.17
314 0.17
315 0.17
316 0.17
317 0.17
318 0.2
319 0.24
320 0.24
321 0.25
322 0.26
323 0.25
324 0.24
325 0.24
326 0.2
327 0.13
328 0.15
329 0.13
330 0.12
331 0.12
332 0.12
333 0.1
334 0.1
335 0.09
336 0.05
337 0.04
338 0.04
339 0.04
340 0.04
341 0.04
342 0.04
343 0.04
344 0.05
345 0.05
346 0.06
347 0.05
348 0.06
349 0.06
350 0.05
351 0.07
352 0.08
353 0.08
354 0.07
355 0.07
356 0.08
357 0.09
358 0.09
359 0.07
360 0.06
361 0.07
362 0.09
363 0.09
364 0.09
365 0.11
366 0.13
367 0.14
368 0.15
369 0.15
370 0.13
371 0.14
372 0.15
373 0.15
374 0.19
375 0.19
376 0.2
377 0.24
378 0.24
379 0.25
380 0.24
381 0.23
382 0.17
383 0.17
384 0.16
385 0.11
386 0.11
387 0.09
388 0.1
389 0.13
390 0.16
391 0.16
392 0.18
393 0.22
394 0.24
395 0.24
396 0.27
397 0.23
398 0.21
399 0.21
400 0.21
401 0.2
402 0.2
403 0.22
404 0.19
405 0.19
406 0.19
407 0.18
408 0.16
409 0.14
410 0.11
411 0.13
412 0.12
413 0.1
414 0.09
415 0.12
416 0.13
417 0.11
418 0.13
419 0.11
420 0.12
421 0.12
422 0.13
423 0.13
424 0.13
425 0.14
426 0.16
427 0.19
428 0.21
429 0.22
430 0.24
431 0.24
432 0.24
433 0.24
434 0.2
435 0.2
436 0.19
437 0.2
438 0.17
439 0.21
440 0.22
441 0.25
442 0.26
443 0.25
444 0.23
445 0.22
446 0.26
447 0.23
448 0.23
449 0.2
450 0.24
451 0.26
452 0.29
453 0.32
454 0.27
455 0.26
456 0.25
457 0.25
458 0.21
459 0.18
460 0.15
461 0.16
462 0.16
463 0.18
464 0.18
465 0.18
466 0.17
467 0.16
468 0.17
469 0.15
470 0.17
471 0.15
472 0.14
473 0.14
474 0.14
475 0.14
476 0.13
477 0.11
478 0.1
479 0.14
480 0.14
481 0.14
482 0.17
483 0.18
484 0.2
485 0.21
486 0.2
487 0.16
488 0.18
489 0.17
490 0.14
491 0.13
492 0.1
493 0.09
494 0.1
495 0.12
496 0.11
497 0.12
498 0.16
499 0.16
500 0.18
501 0.2
502 0.21
503 0.2
504 0.2
505 0.19
506 0.18
507 0.18
508 0.18
509 0.16
510 0.18
511 0.21
512 0.2
513 0.21
514 0.27
515 0.28
516 0.3
517 0.35
518 0.36
519 0.35
520 0.37
521 0.41
522 0.34
523 0.39
524 0.38
525 0.33
526 0.3
527 0.26
528 0.26
529 0.22
530 0.25
531 0.22
532 0.21
533 0.22
534 0.2
535 0.21
536 0.2
537 0.22
538 0.17
539 0.16
540 0.16
541 0.19
542 0.2
543 0.22
544 0.22
545 0.19
546 0.23
547 0.21