Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A545VDF6

Protein Details
Accession A0A545VDF6    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
7-28ASSIKRKRSAPAEKMTKRQRLPHydrophilic
246-266HKPEKKSHYLRQPNQHKRQGQBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
12-14RKR
Subcellular Location(s) plas 13, nucl 9, mito 2, cyto 2, cyto_mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005612  CCAAT-binding_factor  
IPR027193  Noc4  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0042254  P:ribosome biogenesis  
Pfam View protein in Pfam  
PF03914  CBF  
Amino Acid Sequences MAPTSQASSIKRKRSAPAEKMTKRQRLPSSEDEEDPNAAILLMEQGILESKKNYNDIAVLLKKATSFASGNPEAIFATVALCRIFMRLLAQGSLVSRKSLSEKDQVVVGWLRDQFGQFKDALLDLLSEDDVAATALTLCMRTLKAEGEYLRDKSDYAFPRDFLGKIVKNIIASENEDIRKLYIEEYAEQYDDIRYYTFAAVTSAIKDLSEDKGDLKSRLFESAFALLSVLDGVPESADELEDFYIHKPEKKSHYLRQPNQHKRQGQDAWLALMNLVETNDQRKRLLALISDVIAPWFSKPEMLSDFLTSSYDASGSIALLALSGVFYLIRERNLDYPSFYPKLYSLLNSQILHSKYRARFFRLLDTFLSSTHLPVALVASFLKRLARLSLNAPPSAVAFVIPWIYNMLKKHPLCTFMLHRETTDDEAKKELREHGMEDPFLADESDPMKTNAIDSSFWELVQMQSHYHPNVATIAKIVSEQFTKHSYNMEDFLDHSYASLLEAEMGKDVKKAPVVEFHIPKKVFLPQEGASGVPDNLMVKLWDFETVEAWWL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.7
2 0.76
3 0.75
4 0.77
5 0.79
6 0.79
7 0.84
8 0.86
9 0.85
10 0.79
11 0.79
12 0.77
13 0.73
14 0.74
15 0.73
16 0.72
17 0.66
18 0.64
19 0.58
20 0.52
21 0.45
22 0.37
23 0.28
24 0.2
25 0.15
26 0.12
27 0.08
28 0.08
29 0.06
30 0.06
31 0.06
32 0.06
33 0.09
34 0.1
35 0.11
36 0.12
37 0.16
38 0.2
39 0.22
40 0.22
41 0.21
42 0.22
43 0.23
44 0.28
45 0.28
46 0.26
47 0.24
48 0.25
49 0.23
50 0.23
51 0.21
52 0.17
53 0.15
54 0.16
55 0.24
56 0.25
57 0.26
58 0.25
59 0.24
60 0.2
61 0.2
62 0.17
63 0.08
64 0.08
65 0.08
66 0.09
67 0.08
68 0.09
69 0.09
70 0.09
71 0.1
72 0.09
73 0.1
74 0.13
75 0.14
76 0.15
77 0.15
78 0.15
79 0.16
80 0.21
81 0.19
82 0.16
83 0.15
84 0.16
85 0.2
86 0.24
87 0.28
88 0.3
89 0.32
90 0.32
91 0.34
92 0.32
93 0.31
94 0.28
95 0.24
96 0.2
97 0.19
98 0.19
99 0.18
100 0.19
101 0.2
102 0.19
103 0.2
104 0.16
105 0.16
106 0.16
107 0.15
108 0.14
109 0.1
110 0.09
111 0.07
112 0.08
113 0.07
114 0.06
115 0.05
116 0.05
117 0.05
118 0.04
119 0.04
120 0.03
121 0.03
122 0.04
123 0.04
124 0.04
125 0.04
126 0.06
127 0.07
128 0.08
129 0.09
130 0.11
131 0.12
132 0.16
133 0.17
134 0.21
135 0.25
136 0.25
137 0.26
138 0.24
139 0.23
140 0.21
141 0.28
142 0.27
143 0.3
144 0.31
145 0.29
146 0.32
147 0.34
148 0.32
149 0.26
150 0.29
151 0.24
152 0.24
153 0.27
154 0.25
155 0.24
156 0.24
157 0.24
158 0.18
159 0.18
160 0.19
161 0.2
162 0.19
163 0.2
164 0.19
165 0.17
166 0.17
167 0.15
168 0.14
169 0.12
170 0.12
171 0.13
172 0.16
173 0.17
174 0.16
175 0.15
176 0.15
177 0.12
178 0.11
179 0.1
180 0.07
181 0.07
182 0.08
183 0.09
184 0.08
185 0.08
186 0.08
187 0.09
188 0.09
189 0.1
190 0.09
191 0.08
192 0.08
193 0.08
194 0.09
195 0.1
196 0.11
197 0.1
198 0.11
199 0.16
200 0.18
201 0.18
202 0.17
203 0.19
204 0.18
205 0.22
206 0.21
207 0.17
208 0.17
209 0.18
210 0.18
211 0.14
212 0.13
213 0.09
214 0.09
215 0.08
216 0.06
217 0.03
218 0.03
219 0.03
220 0.03
221 0.03
222 0.03
223 0.03
224 0.03
225 0.03
226 0.04
227 0.04
228 0.04
229 0.05
230 0.05
231 0.1
232 0.1
233 0.14
234 0.15
235 0.21
236 0.27
237 0.36
238 0.42
239 0.46
240 0.56
241 0.63
242 0.68
243 0.73
244 0.78
245 0.79
246 0.82
247 0.82
248 0.75
249 0.66
250 0.68
251 0.6
252 0.52
253 0.46
254 0.37
255 0.3
256 0.27
257 0.25
258 0.16
259 0.13
260 0.1
261 0.05
262 0.05
263 0.05
264 0.04
265 0.09
266 0.12
267 0.13
268 0.13
269 0.14
270 0.15
271 0.16
272 0.18
273 0.13
274 0.13
275 0.13
276 0.13
277 0.13
278 0.11
279 0.09
280 0.08
281 0.07
282 0.05
283 0.05
284 0.05
285 0.06
286 0.06
287 0.09
288 0.11
289 0.13
290 0.14
291 0.14
292 0.14
293 0.13
294 0.14
295 0.11
296 0.09
297 0.07
298 0.06
299 0.05
300 0.05
301 0.05
302 0.04
303 0.04
304 0.04
305 0.03
306 0.03
307 0.03
308 0.03
309 0.02
310 0.02
311 0.02
312 0.02
313 0.02
314 0.05
315 0.07
316 0.08
317 0.09
318 0.11
319 0.15
320 0.17
321 0.17
322 0.17
323 0.18
324 0.23
325 0.24
326 0.22
327 0.19
328 0.18
329 0.2
330 0.19
331 0.18
332 0.15
333 0.19
334 0.24
335 0.23
336 0.24
337 0.26
338 0.27
339 0.27
340 0.26
341 0.29
342 0.28
343 0.36
344 0.38
345 0.39
346 0.44
347 0.44
348 0.52
349 0.47
350 0.45
351 0.38
352 0.39
353 0.33
354 0.27
355 0.28
356 0.18
357 0.15
358 0.14
359 0.13
360 0.09
361 0.08
362 0.09
363 0.06
364 0.07
365 0.07
366 0.07
367 0.07
368 0.08
369 0.09
370 0.08
371 0.09
372 0.12
373 0.15
374 0.16
375 0.2
376 0.26
377 0.28
378 0.28
379 0.27
380 0.23
381 0.21
382 0.2
383 0.15
384 0.09
385 0.06
386 0.07
387 0.08
388 0.08
389 0.08
390 0.09
391 0.1
392 0.13
393 0.14
394 0.19
395 0.26
396 0.27
397 0.31
398 0.32
399 0.34
400 0.33
401 0.38
402 0.39
403 0.39
404 0.44
405 0.4
406 0.38
407 0.37
408 0.37
409 0.36
410 0.36
411 0.3
412 0.25
413 0.29
414 0.3
415 0.3
416 0.3
417 0.3
418 0.28
419 0.28
420 0.3
421 0.33
422 0.35
423 0.33
424 0.31
425 0.27
426 0.22
427 0.2
428 0.18
429 0.1
430 0.08
431 0.1
432 0.11
433 0.11
434 0.12
435 0.13
436 0.13
437 0.14
438 0.15
439 0.15
440 0.14
441 0.16
442 0.22
443 0.21
444 0.21
445 0.21
446 0.19
447 0.18
448 0.21
449 0.19
450 0.14
451 0.17
452 0.22
453 0.22
454 0.23
455 0.21
456 0.19
457 0.23
458 0.22
459 0.19
460 0.16
461 0.15
462 0.14
463 0.15
464 0.15
465 0.12
466 0.13
467 0.14
468 0.16
469 0.21
470 0.23
471 0.23
472 0.27
473 0.27
474 0.28
475 0.3
476 0.28
477 0.24
478 0.23
479 0.26
480 0.23
481 0.19
482 0.16
483 0.14
484 0.12
485 0.12
486 0.11
487 0.07
488 0.08
489 0.09
490 0.09
491 0.11
492 0.12
493 0.12
494 0.13
495 0.15
496 0.17
497 0.2
498 0.22
499 0.22
500 0.3
501 0.37
502 0.44
503 0.49
504 0.51
505 0.56
506 0.54
507 0.52
508 0.46
509 0.47
510 0.42
511 0.38
512 0.39
513 0.31
514 0.36
515 0.36
516 0.33
517 0.27
518 0.26
519 0.23
520 0.16
521 0.16
522 0.12
523 0.11
524 0.12
525 0.11
526 0.1
527 0.12
528 0.12
529 0.14
530 0.15
531 0.15
532 0.16