FuNGI

A0A545VC11

Protein Details

Accession

A0A545VC11

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
92-115	AAEERKARGRSRFRSKRSRGDTMG	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
55-111	RATRAPAVGRFRPKNVRRDEAERDSLARQEEKKASERAAEERKARGRSRFRSKRSRG

Subcellular Location(s)

nucl 14.5, mito 10, cyto_nucl 9

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007811 RPC4
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
Pfam	View protein in Pfam PF05132 RNA_pol_Rpc4

Amino Acid Sequences

MVRGRAPARGTRRGAASAGTERPATDAPAPAPTPTDATAASPSESTSARRGAATRATRAPAVGRFRPKNVRRDEAERDSLARQEEKKASERAAEERKARGRSRFRSKRSRGDTMGRGGFGRIISGASGPFSSGIGGSSRGGGWFGGGGGGIGGGGGFGGRGMKSDSKSLNFAQGRNIYREARINADKLHIMSPEEELDSEDEAMIAALSSKDSSKMPMGIFRKEHKEAEIIVATTAELEAKENATGEEESLWVDGESGALPPEDHPEEGVWGTDSKPLIKEEPGAEDSMDLDLEAVPKIEDKATAAPVKVKKTLPQDPEGKMIQSDLDLLARELGAVTVDGESAPELANKDGRLYLFQFPPLMPPLKETSTPQGPAKVKEEALAVSVGDIPASTDNTAVDLTGDNDEDNDDDDDDDDEETEEERAKAELKHGFKSQFLSQGGMIGRLNVRKSGKVELDWGGHVLEMSPAAGMNFLTTAVIVEESDEKPVVVGGGANAVARATGGDCVGMGKIMGRFTVAPVWSEEEDWNVAPEELESA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.49
2	0.42
3	0.4
4	0.37
5	0.36
6	0.33
7	0.29
8	0.27
9	0.29
10	0.27
11	0.25
12	0.21
13	0.22
14	0.21
15	0.27
16	0.27
17	0.25
18	0.26
19	0.24
20	0.24
21	0.22
22	0.22
23	0.16
24	0.18
25	0.21
26	0.2
27	0.2
28	0.17
29	0.16
30	0.17
31	0.18
32	0.18
33	0.19
34	0.21
35	0.21
36	0.23
37	0.24
38	0.27
39	0.35
40	0.37
41	0.39
42	0.41
43	0.42
44	0.41
45	0.41
46	0.4
47	0.38
48	0.4
49	0.42
50	0.47
51	0.49
52	0.56
53	0.65
54	0.68
55	0.71
56	0.71
57	0.71
58	0.67
59	0.71
60	0.73
61	0.7
62	0.68
63	0.6
64	0.55
65	0.49
66	0.46
67	0.41
68	0.38
69	0.32
70	0.34
71	0.38
72	0.39
73	0.43
74	0.44
75	0.42
76	0.41
77	0.42
78	0.43
79	0.47
80	0.48
81	0.46
82	0.51
83	0.56
84	0.58
85	0.6
86	0.61
87	0.63
88	0.67
89	0.75
90	0.77
91	0.79
92	0.83
93	0.86
94	0.87
95	0.85
96	0.84
97	0.78
98	0.76
99	0.73
100	0.7
101	0.64
102	0.54
103	0.46
104	0.38
105	0.33
106	0.25
107	0.19
108	0.11
109	0.09
110	0.08
111	0.09
112	0.08
113	0.07
114	0.07
115	0.07
116	0.07
117	0.07
118	0.07
119	0.06
120	0.06
121	0.07
122	0.08
123	0.08
124	0.08
125	0.08
126	0.08
127	0.09
128	0.08
129	0.07
130	0.06
131	0.05
132	0.05
133	0.04
134	0.04
135	0.03
136	0.03
137	0.03
138	0.02
139	0.02
140	0.02
141	0.02
142	0.02
143	0.02
144	0.02
145	0.03
146	0.03
147	0.04
148	0.08
149	0.12
150	0.13
151	0.19
152	0.22
153	0.23
154	0.27
155	0.27
156	0.33
157	0.32
158	0.31
159	0.33
160	0.37
161	0.37
162	0.37
163	0.4
164	0.32
165	0.32
166	0.36
167	0.31
168	0.3
169	0.31
170	0.28
171	0.26
172	0.27
173	0.26
174	0.22
175	0.22
176	0.17
177	0.15
178	0.14
179	0.14
180	0.13
181	0.12
182	0.11
183	0.1
184	0.1
185	0.1
186	0.09
187	0.07
188	0.06
189	0.06
190	0.05
191	0.04
192	0.03
193	0.03
194	0.03
195	0.03
196	0.04
197	0.04
198	0.06
199	0.06
200	0.08
201	0.1
202	0.13
203	0.13
204	0.2
205	0.23
206	0.26
207	0.29
208	0.31
209	0.37
210	0.37
211	0.37
212	0.31
213	0.3
214	0.26
215	0.26
216	0.23
217	0.17
218	0.14
219	0.13
220	0.11
221	0.09
222	0.08
223	0.05
224	0.04
225	0.04
226	0.05
227	0.05
228	0.05
229	0.05
230	0.06
231	0.07
232	0.07
233	0.06
234	0.06
235	0.06
236	0.06
237	0.06
238	0.06
239	0.04
240	0.04
241	0.04
242	0.04
243	0.04
244	0.04
245	0.04
246	0.04
247	0.04
248	0.04
249	0.07
250	0.08
251	0.08
252	0.08
253	0.08
254	0.09
255	0.09
256	0.09
257	0.06
258	0.06
259	0.06
260	0.09
261	0.09
262	0.09
263	0.1
264	0.11
265	0.12
266	0.12
267	0.14
268	0.12
269	0.16
270	0.16
271	0.15
272	0.14
273	0.13
274	0.12
275	0.1
276	0.09
277	0.05
278	0.04
279	0.04
280	0.05
281	0.05
282	0.04
283	0.04
284	0.05
285	0.05
286	0.05
287	0.05
288	0.06
289	0.08
290	0.12
291	0.13
292	0.13
293	0.19
294	0.22
295	0.25
296	0.29
297	0.27
298	0.3
299	0.36
300	0.43
301	0.41
302	0.44
303	0.47
304	0.44
305	0.48
306	0.43
307	0.35
308	0.28
309	0.24
310	0.18
311	0.12
312	0.11
313	0.07
314	0.07
315	0.06
316	0.06
317	0.06
318	0.06
319	0.05
320	0.05
321	0.04
322	0.04
323	0.03
324	0.04
325	0.04
326	0.04
327	0.04
328	0.04
329	0.04
330	0.04
331	0.05
332	0.05
333	0.06
334	0.07
335	0.09
336	0.09
337	0.1
338	0.11
339	0.11
340	0.13
341	0.16
342	0.2
343	0.19
344	0.2
345	0.2
346	0.18
347	0.21
348	0.22
349	0.21
350	0.17
351	0.18
352	0.21
353	0.22
354	0.24
355	0.24
356	0.27
357	0.29
358	0.32
359	0.3
360	0.35
361	0.35
362	0.37
363	0.38
364	0.34
365	0.3
366	0.28
367	0.28
368	0.2
369	0.19
370	0.16
371	0.12
372	0.09
373	0.09
374	0.08
375	0.06
376	0.06
377	0.05
378	0.06
379	0.08
380	0.07
381	0.07
382	0.07
383	0.08
384	0.08
385	0.07
386	0.07
387	0.06
388	0.07
389	0.08
390	0.09
391	0.07
392	0.08
393	0.08
394	0.08
395	0.09
396	0.08
397	0.08
398	0.08
399	0.08
400	0.09
401	0.09
402	0.09
403	0.07
404	0.07
405	0.07
406	0.07
407	0.08
408	0.08
409	0.08
410	0.08
411	0.09
412	0.11
413	0.11
414	0.16
415	0.23
416	0.25
417	0.3
418	0.34
419	0.36
420	0.35
421	0.39
422	0.37
423	0.37
424	0.34
425	0.32
426	0.27
427	0.3
428	0.28
429	0.26
430	0.23
431	0.17
432	0.2
433	0.21
434	0.23
435	0.24
436	0.26
437	0.28
438	0.31
439	0.36
440	0.36
441	0.34
442	0.37
443	0.35
444	0.36
445	0.32
446	0.3
447	0.22
448	0.18
449	0.17
450	0.13
451	0.09
452	0.07
453	0.06
454	0.05
455	0.05
456	0.05
457	0.06
458	0.05
459	0.05
460	0.05
461	0.05
462	0.05
463	0.05
464	0.05
465	0.06
466	0.06
467	0.05
468	0.07
469	0.11
470	0.11
471	0.13
472	0.13
473	0.12
474	0.12
475	0.12
476	0.11
477	0.07
478	0.07
479	0.05
480	0.08
481	0.08
482	0.08
483	0.08
484	0.08
485	0.07
486	0.07
487	0.07
488	0.05
489	0.06
490	0.06
491	0.06
492	0.07
493	0.08
494	0.08
495	0.07
496	0.07
497	0.08
498	0.11
499	0.11
500	0.12
501	0.13
502	0.13
503	0.15
504	0.22
505	0.19
506	0.18
507	0.2
508	0.25
509	0.24
510	0.26
511	0.24
512	0.21
513	0.23
514	0.22
515	0.21
516	0.17
517	0.17
518	0.15

A0A545VC11

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer