Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5FIJ4

Protein Details
Accession C5FIJ4    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
31-51NAEGQPRKRGRPPKNGGPVTPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
11-26RGRGRPPKAGGPATPK
33-47EGQPRKRGRPPKNGG
62-80PRKRGRPPKNGIAAQTKPK
92-100VRKRGRPRK
114-121PPRGRPRK
133-143VKGTPGRGRGR
Subcellular Location(s) cyto 15, nucl 7, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017956  AT_hook_DNA-bd_motif  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
Amino Acid Sequences MADDAATAPARGRGRPPKAGGPATPKTVVLNAEGQPRKRGRPPKNGGPVTPKTVVLDADGQPRKRGRPPKNGIAAQTKPKTEATSPAPTDQVRKRGRPRKAEYVTGDAENAPAPPRGRPRKDDVTAARSNGAVKGTPGRGRGRPPANPLQKFVGSYAIECPIVSEEWPDKAESMDMSISTSDTDPCGLIASFTLGIVEGTMLLAATEEALDAFQSKVEHGSDHESDEDAECDEPPPKKIRSAPNDGALRLYFKWRGRDTTGSEIYDGSMDLGTIEFLDGKAIQFKGEGGFPAMGPDCKFTGTRYDNEATTVPLPWSTFSDKAAQEANEARW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.44
2 0.52
3 0.57
4 0.59
5 0.65
6 0.68
7 0.65
8 0.63
9 0.6
10 0.57
11 0.53
12 0.45
13 0.38
14 0.36
15 0.32
16 0.26
17 0.26
18 0.24
19 0.33
20 0.37
21 0.38
22 0.43
23 0.47
24 0.51
25 0.55
26 0.62
27 0.63
28 0.69
29 0.76
30 0.78
31 0.84
32 0.82
33 0.77
34 0.76
35 0.71
36 0.66
37 0.59
38 0.49
39 0.4
40 0.36
41 0.32
42 0.25
43 0.25
44 0.21
45 0.29
46 0.34
47 0.33
48 0.37
49 0.41
50 0.43
51 0.47
52 0.56
53 0.56
54 0.61
55 0.69
56 0.73
57 0.79
58 0.77
59 0.74
60 0.72
61 0.67
62 0.65
63 0.62
64 0.52
65 0.45
66 0.44
67 0.42
68 0.34
69 0.36
70 0.33
71 0.37
72 0.38
73 0.37
74 0.39
75 0.36
76 0.42
77 0.4
78 0.44
79 0.42
80 0.48
81 0.57
82 0.63
83 0.71
84 0.75
85 0.77
86 0.78
87 0.76
88 0.75
89 0.68
90 0.65
91 0.58
92 0.48
93 0.41
94 0.3
95 0.26
96 0.18
97 0.15
98 0.1
99 0.11
100 0.11
101 0.14
102 0.24
103 0.34
104 0.39
105 0.43
106 0.49
107 0.56
108 0.58
109 0.62
110 0.57
111 0.55
112 0.52
113 0.49
114 0.41
115 0.32
116 0.31
117 0.24
118 0.19
119 0.11
120 0.1
121 0.13
122 0.15
123 0.18
124 0.21
125 0.24
126 0.26
127 0.3
128 0.38
129 0.39
130 0.4
131 0.44
132 0.5
133 0.55
134 0.53
135 0.51
136 0.47
137 0.42
138 0.39
139 0.33
140 0.28
141 0.19
142 0.18
143 0.17
144 0.15
145 0.14
146 0.13
147 0.13
148 0.08
149 0.08
150 0.07
151 0.08
152 0.07
153 0.09
154 0.1
155 0.09
156 0.09
157 0.09
158 0.09
159 0.07
160 0.07
161 0.06
162 0.06
163 0.06
164 0.06
165 0.06
166 0.06
167 0.07
168 0.06
169 0.05
170 0.06
171 0.05
172 0.05
173 0.06
174 0.05
175 0.05
176 0.05
177 0.06
178 0.05
179 0.05
180 0.05
181 0.04
182 0.04
183 0.04
184 0.04
185 0.03
186 0.02
187 0.02
188 0.02
189 0.02
190 0.02
191 0.02
192 0.02
193 0.02
194 0.02
195 0.02
196 0.03
197 0.03
198 0.03
199 0.04
200 0.05
201 0.05
202 0.06
203 0.08
204 0.08
205 0.09
206 0.1
207 0.15
208 0.14
209 0.16
210 0.16
211 0.14
212 0.15
213 0.15
214 0.14
215 0.09
216 0.09
217 0.08
218 0.08
219 0.12
220 0.13
221 0.16
222 0.21
223 0.21
224 0.26
225 0.33
226 0.42
227 0.46
228 0.55
229 0.56
230 0.59
231 0.6
232 0.55
233 0.5
234 0.41
235 0.36
236 0.27
237 0.28
238 0.26
239 0.27
240 0.35
241 0.36
242 0.4
243 0.43
244 0.48
245 0.49
246 0.51
247 0.52
248 0.44
249 0.42
250 0.37
251 0.32
252 0.26
253 0.2
254 0.12
255 0.07
256 0.06
257 0.06
258 0.05
259 0.05
260 0.05
261 0.05
262 0.04
263 0.04
264 0.06
265 0.06
266 0.07
267 0.12
268 0.12
269 0.12
270 0.12
271 0.13
272 0.13
273 0.14
274 0.14
275 0.12
276 0.13
277 0.13
278 0.16
279 0.17
280 0.17
281 0.17
282 0.19
283 0.17
284 0.18
285 0.19
286 0.17
287 0.25
288 0.28
289 0.3
290 0.34
291 0.37
292 0.35
293 0.37
294 0.37
295 0.3
296 0.27
297 0.25
298 0.19
299 0.18
300 0.18
301 0.17
302 0.21
303 0.23
304 0.24
305 0.24
306 0.31
307 0.29
308 0.32
309 0.35
310 0.31
311 0.3