Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A545VFN2

Protein Details
Accession A0A545VFN2    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
452-475EREWEEARLRRRQKRKDGTIETAAHydrophilic
493-514PESDKAMTKKEQKKNQALKAAEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
461-466RRRQKR
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 11.333, mito 6.5, cyto_mito 6.499, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007900  TAF4_C  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF05236  TAF4  
Amino Acid Sequences MAQPQSQVPPRAYSPPQPSPSPAGSQSAYALPPNKRAGAASQPGSPYPASPYAASPGAAGSPPLAAGSPTYAQTPPIQGGYNTPYANGQPTPVYNVAEARAAAAAAAAAAAAAQNANAATLSPMQQHQQIPGMMSPYTNATLTPGMHHGQQQMQQNVMGPPQRPAERPTKDYEYDVTDSLAGTGIDLRAEEQYMSELYSNAMDGSQDARTGFAVLPPTGANSFYGAGPASQPAETIKDQSQKDYEAQAAERAWTESAMRLAAQRTQEIANPFLLVAIMHRRADKIAREHHLGLNLELRNNTYAPGKLRYPEQFPSPSVNVKTQPGPDSTMVSTTGSFIPHDAYLVDQLALLSISTKQRLRELIEDANAVALNRQKTSHGDVPEEWTAAAAPMNKEVLEVVNAPNEEGRPETGDTSLKRSFDQANGEGNTKPAKLPKISSYMTITMRELARQEREWEEARLRRRQKRKDGTIETAASGSRSGSVAPGTPGTIAPESDKAMTKKEQKKNQALKAAEANSHANQNMTSSMFAGLGGKSGLFGKSKRKTYDWMNVGRGGSGVSTPTKSTGDGGKTMNGVVQAAPGNMALTTEGRNRLGTWREDKEKGKNIQLRDWITVLERDGREAQSLQQAYLHLDSSNPR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.52
2 0.57
3 0.6
4 0.58
5 0.59
6 0.57
7 0.56
8 0.52
9 0.46
10 0.41
11 0.36
12 0.34
13 0.32
14 0.29
15 0.26
16 0.25
17 0.3
18 0.28
19 0.34
20 0.37
21 0.37
22 0.35
23 0.35
24 0.36
25 0.38
26 0.42
27 0.38
28 0.38
29 0.38
30 0.38
31 0.39
32 0.34
33 0.26
34 0.24
35 0.26
36 0.24
37 0.23
38 0.24
39 0.25
40 0.26
41 0.26
42 0.2
43 0.16
44 0.16
45 0.15
46 0.13
47 0.09
48 0.08
49 0.08
50 0.08
51 0.07
52 0.06
53 0.07
54 0.1
55 0.11
56 0.12
57 0.14
58 0.14
59 0.16
60 0.18
61 0.21
62 0.19
63 0.2
64 0.2
65 0.18
66 0.22
67 0.25
68 0.28
69 0.25
70 0.24
71 0.23
72 0.23
73 0.27
74 0.23
75 0.2
76 0.17
77 0.18
78 0.23
79 0.23
80 0.23
81 0.2
82 0.22
83 0.21
84 0.2
85 0.19
86 0.14
87 0.12
88 0.1
89 0.09
90 0.07
91 0.06
92 0.04
93 0.04
94 0.03
95 0.02
96 0.02
97 0.02
98 0.02
99 0.03
100 0.02
101 0.03
102 0.03
103 0.04
104 0.04
105 0.04
106 0.06
107 0.08
108 0.09
109 0.11
110 0.13
111 0.14
112 0.2
113 0.21
114 0.22
115 0.25
116 0.24
117 0.23
118 0.23
119 0.23
120 0.18
121 0.17
122 0.16
123 0.13
124 0.14
125 0.12
126 0.11
127 0.11
128 0.13
129 0.14
130 0.15
131 0.16
132 0.15
133 0.17
134 0.2
135 0.2
136 0.22
137 0.27
138 0.33
139 0.31
140 0.31
141 0.3
142 0.3
143 0.28
144 0.28
145 0.26
146 0.19
147 0.21
148 0.25
149 0.28
150 0.28
151 0.31
152 0.37
153 0.39
154 0.42
155 0.46
156 0.47
157 0.45
158 0.45
159 0.43
160 0.38
161 0.35
162 0.32
163 0.26
164 0.19
165 0.17
166 0.15
167 0.14
168 0.08
169 0.06
170 0.06
171 0.06
172 0.06
173 0.06
174 0.06
175 0.06
176 0.07
177 0.07
178 0.06
179 0.07
180 0.07
181 0.08
182 0.07
183 0.07
184 0.07
185 0.07
186 0.07
187 0.06
188 0.06
189 0.05
190 0.05
191 0.07
192 0.07
193 0.08
194 0.08
195 0.08
196 0.08
197 0.1
198 0.09
199 0.09
200 0.11
201 0.1
202 0.11
203 0.11
204 0.12
205 0.11
206 0.11
207 0.1
208 0.09
209 0.09
210 0.08
211 0.09
212 0.08
213 0.07
214 0.08
215 0.08
216 0.08
217 0.07
218 0.07
219 0.08
220 0.12
221 0.12
222 0.15
223 0.18
224 0.24
225 0.24
226 0.27
227 0.28
228 0.26
229 0.27
230 0.26
231 0.23
232 0.17
233 0.17
234 0.17
235 0.15
236 0.14
237 0.13
238 0.12
239 0.1
240 0.09
241 0.09
242 0.08
243 0.08
244 0.08
245 0.08
246 0.09
247 0.09
248 0.12
249 0.13
250 0.12
251 0.13
252 0.14
253 0.17
254 0.17
255 0.17
256 0.14
257 0.13
258 0.12
259 0.11
260 0.1
261 0.06
262 0.06
263 0.09
264 0.11
265 0.12
266 0.12
267 0.13
268 0.14
269 0.18
270 0.21
271 0.23
272 0.27
273 0.3
274 0.33
275 0.35
276 0.35
277 0.36
278 0.32
279 0.26
280 0.26
281 0.22
282 0.2
283 0.18
284 0.17
285 0.14
286 0.14
287 0.14
288 0.1
289 0.11
290 0.13
291 0.16
292 0.16
293 0.16
294 0.2
295 0.22
296 0.24
297 0.24
298 0.26
299 0.25
300 0.25
301 0.29
302 0.26
303 0.27
304 0.24
305 0.25
306 0.23
307 0.22
308 0.24
309 0.21
310 0.21
311 0.19
312 0.21
313 0.19
314 0.19
315 0.17
316 0.16
317 0.15
318 0.13
319 0.12
320 0.1
321 0.1
322 0.09
323 0.08
324 0.08
325 0.08
326 0.07
327 0.08
328 0.06
329 0.06
330 0.06
331 0.07
332 0.06
333 0.05
334 0.05
335 0.05
336 0.05
337 0.04
338 0.04
339 0.06
340 0.07
341 0.1
342 0.12
343 0.13
344 0.16
345 0.18
346 0.21
347 0.22
348 0.25
349 0.25
350 0.24
351 0.24
352 0.21
353 0.19
354 0.16
355 0.12
356 0.09
357 0.1
358 0.1
359 0.1
360 0.11
361 0.12
362 0.14
363 0.21
364 0.25
365 0.24
366 0.25
367 0.25
368 0.3
369 0.29
370 0.27
371 0.2
372 0.15
373 0.13
374 0.1
375 0.11
376 0.08
377 0.07
378 0.08
379 0.09
380 0.09
381 0.09
382 0.09
383 0.08
384 0.07
385 0.08
386 0.08
387 0.1
388 0.1
389 0.1
390 0.11
391 0.1
392 0.1
393 0.09
394 0.1
395 0.09
396 0.1
397 0.11
398 0.12
399 0.16
400 0.16
401 0.22
402 0.24
403 0.22
404 0.22
405 0.24
406 0.25
407 0.24
408 0.29
409 0.25
410 0.28
411 0.29
412 0.3
413 0.27
414 0.26
415 0.25
416 0.2
417 0.19
418 0.18
419 0.2
420 0.21
421 0.24
422 0.28
423 0.33
424 0.33
425 0.34
426 0.34
427 0.34
428 0.33
429 0.32
430 0.28
431 0.24
432 0.24
433 0.23
434 0.21
435 0.2
436 0.22
437 0.22
438 0.25
439 0.24
440 0.28
441 0.29
442 0.3
443 0.33
444 0.35
445 0.4
446 0.46
447 0.53
448 0.59
449 0.67
450 0.74
451 0.78
452 0.83
453 0.86
454 0.88
455 0.86
456 0.83
457 0.79
458 0.7
459 0.6
460 0.5
461 0.39
462 0.29
463 0.22
464 0.15
465 0.09
466 0.08
467 0.07
468 0.07
469 0.08
470 0.09
471 0.1
472 0.1
473 0.1
474 0.1
475 0.1
476 0.12
477 0.12
478 0.12
479 0.13
480 0.14
481 0.15
482 0.17
483 0.21
484 0.2
485 0.23
486 0.3
487 0.38
488 0.47
489 0.55
490 0.62
491 0.67
492 0.77
493 0.82
494 0.84
495 0.82
496 0.73
497 0.68
498 0.66
499 0.59
500 0.5
501 0.42
502 0.38
503 0.31
504 0.32
505 0.28
506 0.21
507 0.19
508 0.18
509 0.17
510 0.14
511 0.13
512 0.11
513 0.11
514 0.11
515 0.11
516 0.11
517 0.09
518 0.09
519 0.08
520 0.07
521 0.07
522 0.08
523 0.1
524 0.12
525 0.15
526 0.25
527 0.33
528 0.42
529 0.46
530 0.48
531 0.52
532 0.58
533 0.65
534 0.63
535 0.62
536 0.58
537 0.58
538 0.54
539 0.48
540 0.4
541 0.3
542 0.22
543 0.15
544 0.13
545 0.12
546 0.13
547 0.13
548 0.16
549 0.17
550 0.17
551 0.19
552 0.23
553 0.24
554 0.27
555 0.28
556 0.27
557 0.27
558 0.27
559 0.26
560 0.2
561 0.17
562 0.12
563 0.14
564 0.12
565 0.12
566 0.12
567 0.11
568 0.11
569 0.1
570 0.1
571 0.08
572 0.08
573 0.12
574 0.16
575 0.2
576 0.21
577 0.22
578 0.23
579 0.29
580 0.34
581 0.38
582 0.41
583 0.46
584 0.51
585 0.58
586 0.63
587 0.65
588 0.69
589 0.68
590 0.7
591 0.68
592 0.66
593 0.67
594 0.69
595 0.63
596 0.57
597 0.52
598 0.43
599 0.4
600 0.37
601 0.32
602 0.31
603 0.27
604 0.28
605 0.31
606 0.31
607 0.31
608 0.3
609 0.31
610 0.32
611 0.32
612 0.29
613 0.27
614 0.27
615 0.27
616 0.28
617 0.25
618 0.16