Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5FI82

Protein Details
Accession C5FI82    Localization Confidence High Confidence Score 17.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
383-410EDEAVRERERRRRERRQEDERKLRQSRMBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
225-240PKFKHKKIPRGPPSPP
329-365KEKAKKEEHLRQLAQKAREARAGASSSRHESRARSRS
388-408RERERRRRERRQEDERKLRQS
Subcellular Location(s) nucl 19.5, mito_nucl 11, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017862  SKI-int_prot_SKIP  
IPR004015  SKI-int_prot_SKIP_SNW-dom  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF02731  SKIP_SNW  
Amino Acid Sequences MASLSEGLFKSLPAPKYTGENEELPAHAQRRGPRVVGADAIDETQIVVKRAGPPPYGKRAGWRPRSLKDFGDGGAFPEIAVAQYPLDMGRKDAPNKSNALALQVDAEGKVKYDSIARQGHNENRIVHASFKDLIPLRQRVDMGEISLDRPSQEEVNAQMEKTKAALEKLVSGAVSAQKPKNVATGKRSEPTFVRYTPANQMGNANRKNDRIMKIVEKQVDPLEPPKFKHKKIPRGPPSPPPPVLHSPPRKLTAEDQEAWRIPPPVSNWKNPKGYTVPLDKRLAADGRGLQDVSINDKFAQFAEALFTADRHAREEVKQRAQMQQKLAEKEKAKKEEHLRQLAQKAREARAGASSSRHESRARSRSGSRNSSPYSSRSPSPNEEDEAVRERERRRRERRQEDERKLRQSRMGAERRVQVMAREQNRDISEKIALGLAKPTQSKETMYDSRLFNQTSGLESGFNEDQPYDKPLFAAQDAINSIYRPRAQMDDDDETAGGAEMDRINRGSRFEVLGRAKEGFKGTEDAEAREGPVEFEKDTADPFGIDGMIAEVTGGQSSVGQKRYGIQESESSQRESKRARVDDEDNEDRDRRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.28
3 0.35
4 0.38
5 0.39
6 0.36
7 0.35
8 0.35
9 0.34
10 0.34
11 0.29
12 0.31
13 0.28
14 0.28
15 0.3
16 0.33
17 0.38
18 0.42
19 0.41
20 0.39
21 0.42
22 0.4
23 0.39
24 0.33
25 0.28
26 0.24
27 0.23
28 0.19
29 0.15
30 0.12
31 0.13
32 0.14
33 0.13
34 0.13
35 0.16
36 0.23
37 0.29
38 0.34
39 0.34
40 0.4
41 0.47
42 0.55
43 0.58
44 0.52
45 0.55
46 0.6
47 0.67
48 0.69
49 0.71
50 0.69
51 0.71
52 0.77
53 0.72
54 0.64
55 0.58
56 0.5
57 0.4
58 0.37
59 0.29
60 0.25
61 0.23
62 0.21
63 0.16
64 0.14
65 0.13
66 0.09
67 0.09
68 0.08
69 0.06
70 0.06
71 0.06
72 0.07
73 0.1
74 0.1
75 0.13
76 0.19
77 0.25
78 0.3
79 0.38
80 0.41
81 0.42
82 0.45
83 0.43
84 0.41
85 0.34
86 0.33
87 0.26
88 0.22
89 0.19
90 0.17
91 0.16
92 0.12
93 0.13
94 0.09
95 0.09
96 0.1
97 0.09
98 0.09
99 0.13
100 0.15
101 0.22
102 0.29
103 0.29
104 0.34
105 0.41
106 0.47
107 0.48
108 0.49
109 0.43
110 0.39
111 0.41
112 0.37
113 0.33
114 0.27
115 0.26
116 0.23
117 0.21
118 0.24
119 0.22
120 0.26
121 0.3
122 0.34
123 0.32
124 0.34
125 0.34
126 0.29
127 0.32
128 0.28
129 0.22
130 0.2
131 0.19
132 0.16
133 0.17
134 0.16
135 0.12
136 0.12
137 0.13
138 0.11
139 0.11
140 0.12
141 0.14
142 0.19
143 0.2
144 0.19
145 0.19
146 0.19
147 0.18
148 0.17
149 0.17
150 0.13
151 0.13
152 0.16
153 0.14
154 0.16
155 0.17
156 0.17
157 0.14
158 0.12
159 0.13
160 0.14
161 0.16
162 0.19
163 0.19
164 0.21
165 0.22
166 0.23
167 0.28
168 0.3
169 0.32
170 0.34
171 0.41
172 0.43
173 0.47
174 0.46
175 0.42
176 0.38
177 0.38
178 0.36
179 0.29
180 0.27
181 0.24
182 0.27
183 0.3
184 0.35
185 0.3
186 0.26
187 0.31
188 0.35
189 0.43
190 0.43
191 0.41
192 0.37
193 0.37
194 0.41
195 0.42
196 0.4
197 0.35
198 0.35
199 0.38
200 0.41
201 0.45
202 0.44
203 0.38
204 0.36
205 0.34
206 0.31
207 0.26
208 0.25
209 0.26
210 0.25
211 0.26
212 0.35
213 0.4
214 0.41
215 0.5
216 0.55
217 0.6
218 0.67
219 0.76
220 0.75
221 0.77
222 0.79
223 0.78
224 0.76
225 0.72
226 0.65
227 0.56
228 0.52
229 0.49
230 0.5
231 0.5
232 0.5
233 0.48
234 0.48
235 0.51
236 0.46
237 0.43
238 0.43
239 0.41
240 0.4
241 0.37
242 0.34
243 0.34
244 0.33
245 0.32
246 0.28
247 0.21
248 0.15
249 0.16
250 0.18
251 0.26
252 0.29
253 0.36
254 0.41
255 0.46
256 0.52
257 0.49
258 0.49
259 0.42
260 0.4
261 0.38
262 0.41
263 0.38
264 0.38
265 0.39
266 0.35
267 0.33
268 0.33
269 0.29
270 0.2
271 0.18
272 0.14
273 0.14
274 0.15
275 0.14
276 0.11
277 0.13
278 0.12
279 0.15
280 0.13
281 0.12
282 0.12
283 0.12
284 0.13
285 0.11
286 0.11
287 0.06
288 0.06
289 0.07
290 0.07
291 0.07
292 0.07
293 0.07
294 0.07
295 0.09
296 0.1
297 0.1
298 0.11
299 0.12
300 0.16
301 0.25
302 0.31
303 0.34
304 0.38
305 0.38
306 0.44
307 0.49
308 0.5
309 0.44
310 0.44
311 0.43
312 0.44
313 0.45
314 0.44
315 0.41
316 0.44
317 0.49
318 0.49
319 0.46
320 0.49
321 0.54
322 0.57
323 0.62
324 0.62
325 0.56
326 0.54
327 0.59
328 0.58
329 0.51
330 0.46
331 0.42
332 0.36
333 0.37
334 0.33
335 0.27
336 0.25
337 0.25
338 0.22
339 0.2
340 0.21
341 0.22
342 0.23
343 0.24
344 0.22
345 0.24
346 0.33
347 0.38
348 0.39
349 0.4
350 0.44
351 0.5
352 0.57
353 0.61
354 0.54
355 0.53
356 0.52
357 0.51
358 0.48
359 0.42
360 0.41
361 0.36
362 0.36
363 0.34
364 0.36
365 0.37
366 0.41
367 0.39
368 0.34
369 0.33
370 0.31
371 0.3
372 0.29
373 0.27
374 0.23
375 0.26
376 0.29
377 0.36
378 0.45
379 0.53
380 0.59
381 0.68
382 0.77
383 0.83
384 0.88
385 0.91
386 0.92
387 0.92
388 0.93
389 0.89
390 0.88
391 0.81
392 0.74
393 0.68
394 0.61
395 0.58
396 0.57
397 0.57
398 0.52
399 0.52
400 0.54
401 0.51
402 0.48
403 0.4
404 0.32
405 0.32
406 0.36
407 0.37
408 0.36
409 0.35
410 0.38
411 0.4
412 0.41
413 0.33
414 0.27
415 0.23
416 0.19
417 0.19
418 0.16
419 0.14
420 0.12
421 0.14
422 0.13
423 0.15
424 0.16
425 0.17
426 0.18
427 0.2
428 0.21
429 0.22
430 0.28
431 0.29
432 0.31
433 0.35
434 0.34
435 0.37
436 0.39
437 0.36
438 0.28
439 0.26
440 0.24
441 0.21
442 0.21
443 0.18
444 0.14
445 0.13
446 0.18
447 0.16
448 0.16
449 0.14
450 0.12
451 0.13
452 0.14
453 0.18
454 0.15
455 0.14
456 0.15
457 0.16
458 0.18
459 0.17
460 0.2
461 0.16
462 0.18
463 0.19
464 0.2
465 0.19
466 0.17
467 0.17
468 0.18
469 0.19
470 0.17
471 0.19
472 0.2
473 0.22
474 0.26
475 0.32
476 0.32
477 0.32
478 0.31
479 0.29
480 0.25
481 0.23
482 0.18
483 0.11
484 0.06
485 0.07
486 0.08
487 0.09
488 0.1
489 0.11
490 0.14
491 0.15
492 0.18
493 0.19
494 0.2
495 0.23
496 0.23
497 0.31
498 0.33
499 0.35
500 0.35
501 0.35
502 0.33
503 0.33
504 0.34
505 0.26
506 0.24
507 0.23
508 0.21
509 0.27
510 0.27
511 0.26
512 0.27
513 0.25
514 0.24
515 0.22
516 0.22
517 0.16
518 0.18
519 0.18
520 0.15
521 0.16
522 0.17
523 0.16
524 0.17
525 0.17
526 0.14
527 0.11
528 0.11
529 0.11
530 0.09
531 0.09
532 0.07
533 0.07
534 0.06
535 0.06
536 0.06
537 0.05
538 0.05
539 0.05
540 0.05
541 0.04
542 0.06
543 0.12
544 0.18
545 0.21
546 0.21
547 0.22
548 0.27
549 0.34
550 0.38
551 0.35
552 0.32
553 0.35
554 0.39
555 0.46
556 0.44
557 0.41
558 0.4
559 0.42
560 0.46
561 0.45
562 0.5
563 0.52
564 0.55
565 0.56
566 0.6
567 0.62
568 0.64
569 0.67
570 0.66
571 0.58
572 0.58