Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5FLP0

Protein Details
Accession C5FLP0    Localization Confidence High Confidence Score 17.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
579-615SRERSFDRYDRRERRRSRSRSPRPRNARYRSPSPRDKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
514-517QRRS
570-574RGPRR
579-612SRERSFDRYDRRERRRSRSRSPRPRNARYRSPSP
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 14, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036621  Anticodon-bd_dom_sf  
IPR034167  Nab3_RRM  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12342  RRM_Nab3p  
Amino Acid Sequences MASEPPEEALHFRGKTLTPESPRPLHIAEPSNIPLLQNQMDAAYHDTSSLESIPDVKEPTLNPALVGQGVQPADGQLANHAYSLLQSELGQMSSTGADITGSFPGSNTKTGGILSENESIFTSATSRDEVLTSSLSSSVPDPDPDPNPDLNPDTAPPLARIAATEEDNTTAQPVSNHLLGRPDALDVYQAAPGPSLASYDYQQPEACAQPATAGYSIATAAHNSGDINSDISQSSLLNAAVSYQSLLDSNVPSSYITTSTAATTSSAAHPAAEPINQPTQNTLGDVPMSNLPVSYLSALPPRPPAHESETIQPSQEKGHDASSKEISQNDKSNSKPQSGYPPAVDPDIPAPPSNPETLQQTPLKSHSRKVSGSSRKRDSYDEYIEKNDLQDDTPWGPEIQKKYDDFLRDERIYVTEAHWDRFPAGSRLFIGNLPTERVTKRDLFHIFHMHGKLAQISIKQAYGFIQFLEPDSCRKALEAQQGATLRGRKIHLEISKPQRGPRNSGPTEPSGRNQRRSRSPEYERNREPLRGGRSAADRYDRGQGRLSISDFREKDQHRYRDRTSPSPSPRGPRRDSYHSRERSFDRYDRRERRRSRSRSPRPRNARYRSPSPRDKGYDSESDLPIPRRDPRNVPEVQVIILENADNEFVYRVENAFRDRGLRCDVLILSPRIRLSAVVRRQVMEGVLAIVRISKVNQYSGKIPLQIFDRTGGMGNVRFNEYSELDLSLAAEVVVHARNSQKPNLMQLQPQLLPVALPPQPIQQPLPAQSEQAAIANLLSTLDSSTLHSLLNSLNQQQQLQAQQQQQTRQFQSQPLPTTAPPLNSTNLAALLGNLTRPSNANPPPIPTTTQSAQFAPPPNPIPHPSTNLASLLSKGPGNDAQLPQPQANMQVQQIMEQLMKWKQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.32
3 0.37
4 0.41
5 0.4
6 0.49
7 0.55
8 0.55
9 0.56
10 0.54
11 0.5
12 0.45
13 0.46
14 0.44
15 0.39
16 0.41
17 0.41
18 0.39
19 0.37
20 0.33
21 0.27
22 0.26
23 0.25
24 0.2
25 0.18
26 0.16
27 0.16
28 0.17
29 0.2
30 0.16
31 0.14
32 0.14
33 0.14
34 0.13
35 0.15
36 0.14
37 0.11
38 0.09
39 0.12
40 0.13
41 0.16
42 0.18
43 0.17
44 0.2
45 0.2
46 0.27
47 0.29
48 0.28
49 0.25
50 0.24
51 0.24
52 0.21
53 0.21
54 0.14
55 0.14
56 0.14
57 0.14
58 0.12
59 0.11
60 0.12
61 0.13
62 0.12
63 0.1
64 0.13
65 0.13
66 0.13
67 0.13
68 0.12
69 0.12
70 0.14
71 0.12
72 0.09
73 0.09
74 0.12
75 0.13
76 0.13
77 0.12
78 0.1
79 0.1
80 0.1
81 0.1
82 0.07
83 0.06
84 0.06
85 0.06
86 0.08
87 0.08
88 0.09
89 0.09
90 0.09
91 0.15
92 0.17
93 0.18
94 0.18
95 0.17
96 0.17
97 0.18
98 0.19
99 0.15
100 0.16
101 0.18
102 0.22
103 0.21
104 0.21
105 0.21
106 0.2
107 0.18
108 0.16
109 0.14
110 0.09
111 0.11
112 0.12
113 0.12
114 0.12
115 0.13
116 0.13
117 0.14
118 0.14
119 0.13
120 0.12
121 0.13
122 0.12
123 0.12
124 0.12
125 0.14
126 0.14
127 0.15
128 0.16
129 0.2
130 0.24
131 0.27
132 0.3
133 0.28
134 0.28
135 0.3
136 0.31
137 0.27
138 0.26
139 0.23
140 0.22
141 0.21
142 0.21
143 0.18
144 0.17
145 0.17
146 0.15
147 0.14
148 0.15
149 0.17
150 0.17
151 0.17
152 0.16
153 0.18
154 0.18
155 0.17
156 0.14
157 0.12
158 0.11
159 0.1
160 0.12
161 0.14
162 0.17
163 0.17
164 0.16
165 0.2
166 0.19
167 0.21
168 0.18
169 0.16
170 0.13
171 0.13
172 0.13
173 0.1
174 0.11
175 0.11
176 0.11
177 0.1
178 0.1
179 0.1
180 0.1
181 0.09
182 0.08
183 0.07
184 0.08
185 0.09
186 0.16
187 0.18
188 0.19
189 0.19
190 0.19
191 0.21
192 0.21
193 0.21
194 0.15
195 0.13
196 0.13
197 0.13
198 0.15
199 0.13
200 0.11
201 0.1
202 0.1
203 0.1
204 0.09
205 0.09
206 0.07
207 0.07
208 0.07
209 0.07
210 0.07
211 0.07
212 0.08
213 0.08
214 0.1
215 0.1
216 0.11
217 0.1
218 0.11
219 0.11
220 0.09
221 0.09
222 0.08
223 0.08
224 0.07
225 0.07
226 0.07
227 0.07
228 0.07
229 0.07
230 0.05
231 0.06
232 0.06
233 0.07
234 0.08
235 0.08
236 0.09
237 0.09
238 0.09
239 0.09
240 0.1
241 0.1
242 0.09
243 0.1
244 0.11
245 0.11
246 0.11
247 0.11
248 0.11
249 0.1
250 0.1
251 0.1
252 0.1
253 0.11
254 0.11
255 0.11
256 0.1
257 0.12
258 0.12
259 0.12
260 0.12
261 0.13
262 0.2
263 0.2
264 0.2
265 0.2
266 0.21
267 0.2
268 0.21
269 0.18
270 0.12
271 0.12
272 0.12
273 0.12
274 0.11
275 0.12
276 0.1
277 0.1
278 0.09
279 0.09
280 0.09
281 0.09
282 0.08
283 0.08
284 0.12
285 0.13
286 0.14
287 0.19
288 0.2
289 0.22
290 0.23
291 0.26
292 0.28
293 0.34
294 0.35
295 0.36
296 0.39
297 0.36
298 0.36
299 0.32
300 0.27
301 0.22
302 0.22
303 0.17
304 0.14
305 0.2
306 0.23
307 0.24
308 0.26
309 0.28
310 0.28
311 0.27
312 0.29
313 0.27
314 0.27
315 0.32
316 0.33
317 0.34
318 0.34
319 0.4
320 0.4
321 0.39
322 0.37
323 0.33
324 0.39
325 0.39
326 0.39
327 0.33
328 0.32
329 0.3
330 0.29
331 0.27
332 0.17
333 0.15
334 0.15
335 0.14
336 0.12
337 0.12
338 0.13
339 0.15
340 0.15
341 0.14
342 0.13
343 0.18
344 0.19
345 0.24
346 0.24
347 0.23
348 0.24
349 0.28
350 0.35
351 0.31
352 0.35
353 0.36
354 0.39
355 0.39
356 0.43
357 0.48
358 0.51
359 0.58
360 0.62
361 0.62
362 0.6
363 0.61
364 0.58
365 0.54
366 0.5
367 0.49
368 0.45
369 0.4
370 0.39
371 0.38
372 0.35
373 0.29
374 0.23
375 0.15
376 0.11
377 0.1
378 0.12
379 0.12
380 0.12
381 0.12
382 0.11
383 0.12
384 0.15
385 0.17
386 0.18
387 0.21
388 0.21
389 0.23
390 0.27
391 0.28
392 0.28
393 0.29
394 0.32
395 0.28
396 0.29
397 0.27
398 0.24
399 0.22
400 0.2
401 0.16
402 0.16
403 0.17
404 0.17
405 0.17
406 0.16
407 0.16
408 0.16
409 0.17
410 0.13
411 0.13
412 0.12
413 0.13
414 0.14
415 0.14
416 0.13
417 0.13
418 0.12
419 0.12
420 0.12
421 0.12
422 0.13
423 0.13
424 0.14
425 0.16
426 0.18
427 0.18
428 0.24
429 0.26
430 0.26
431 0.29
432 0.31
433 0.29
434 0.29
435 0.29
436 0.22
437 0.19
438 0.17
439 0.15
440 0.11
441 0.11
442 0.08
443 0.09
444 0.1
445 0.1
446 0.09
447 0.09
448 0.09
449 0.1
450 0.09
451 0.08
452 0.08
453 0.07
454 0.08
455 0.1
456 0.09
457 0.09
458 0.11
459 0.11
460 0.11
461 0.11
462 0.14
463 0.17
464 0.25
465 0.26
466 0.24
467 0.28
468 0.28
469 0.29
470 0.28
471 0.25
472 0.17
473 0.18
474 0.18
475 0.15
476 0.17
477 0.22
478 0.24
479 0.26
480 0.33
481 0.39
482 0.46
483 0.46
484 0.47
485 0.49
486 0.47
487 0.5
488 0.5
489 0.52
490 0.47
491 0.49
492 0.48
493 0.44
494 0.47
495 0.41
496 0.37
497 0.37
498 0.41
499 0.47
500 0.49
501 0.52
502 0.56
503 0.62
504 0.66
505 0.65
506 0.67
507 0.69
508 0.72
509 0.74
510 0.67
511 0.66
512 0.6
513 0.52
514 0.46
515 0.43
516 0.4
517 0.34
518 0.32
519 0.29
520 0.3
521 0.31
522 0.31
523 0.28
524 0.23
525 0.23
526 0.3
527 0.28
528 0.26
529 0.27
530 0.27
531 0.26
532 0.27
533 0.27
534 0.24
535 0.24
536 0.3
537 0.28
538 0.27
539 0.32
540 0.32
541 0.4
542 0.44
543 0.52
544 0.52
545 0.58
546 0.6
547 0.62
548 0.65
549 0.63
550 0.6
551 0.61
552 0.6
553 0.61
554 0.61
555 0.61
556 0.64
557 0.65
558 0.63
559 0.61
560 0.61
561 0.63
562 0.67
563 0.67
564 0.69
565 0.68
566 0.65
567 0.62
568 0.59
569 0.56
570 0.54
571 0.53
572 0.52
573 0.53
574 0.62
575 0.68
576 0.73
577 0.77
578 0.79
579 0.83
580 0.84
581 0.84
582 0.84
583 0.85
584 0.88
585 0.89
586 0.91
587 0.91
588 0.9
589 0.92
590 0.92
591 0.88
592 0.87
593 0.83
594 0.83
595 0.82
596 0.81
597 0.79
598 0.74
599 0.74
600 0.68
601 0.64
602 0.58
603 0.53
604 0.49
605 0.44
606 0.44
607 0.37
608 0.34
609 0.34
610 0.32
611 0.29
612 0.27
613 0.3
614 0.31
615 0.35
616 0.39
617 0.39
618 0.44
619 0.44
620 0.44
621 0.41
622 0.36
623 0.32
624 0.26
625 0.23
626 0.15
627 0.14
628 0.11
629 0.07
630 0.06
631 0.06
632 0.05
633 0.05
634 0.05
635 0.05
636 0.06
637 0.07
638 0.07
639 0.09
640 0.11
641 0.14
642 0.15
643 0.15
644 0.19
645 0.19
646 0.22
647 0.25
648 0.24
649 0.21
650 0.22
651 0.22
652 0.21
653 0.25
654 0.24
655 0.21
656 0.22
657 0.22
658 0.2
659 0.2
660 0.18
661 0.19
662 0.26
663 0.31
664 0.36
665 0.37
666 0.37
667 0.38
668 0.37
669 0.32
670 0.22
671 0.16
672 0.1
673 0.09
674 0.08
675 0.08
676 0.07
677 0.07
678 0.07
679 0.08
680 0.11
681 0.12
682 0.18
683 0.21
684 0.23
685 0.26
686 0.31
687 0.33
688 0.33
689 0.31
690 0.29
691 0.29
692 0.29
693 0.27
694 0.22
695 0.21
696 0.17
697 0.18
698 0.16
699 0.14
700 0.14
701 0.16
702 0.16
703 0.18
704 0.17
705 0.17
706 0.2
707 0.19
708 0.18
709 0.17
710 0.16
711 0.14
712 0.14
713 0.13
714 0.09
715 0.09
716 0.06
717 0.05
718 0.04
719 0.06
720 0.07
721 0.07
722 0.09
723 0.13
724 0.2
725 0.24
726 0.28
727 0.33
728 0.33
729 0.4
730 0.47
731 0.46
732 0.43
733 0.43
734 0.45
735 0.39
736 0.38
737 0.32
738 0.24
739 0.21
740 0.18
741 0.19
742 0.13
743 0.14
744 0.15
745 0.19
746 0.22
747 0.25
748 0.26
749 0.26
750 0.29
751 0.32
752 0.38
753 0.33
754 0.31
755 0.3
756 0.3
757 0.25
758 0.22
759 0.17
760 0.11
761 0.1
762 0.09
763 0.08
764 0.07
765 0.06
766 0.05
767 0.05
768 0.06
769 0.06
770 0.08
771 0.11
772 0.11
773 0.11
774 0.11
775 0.12
776 0.13
777 0.18
778 0.19
779 0.2
780 0.24
781 0.26
782 0.26
783 0.27
784 0.3
785 0.3
786 0.33
787 0.36
788 0.37
789 0.42
790 0.47
791 0.53
792 0.56
793 0.59
794 0.58
795 0.58
796 0.56
797 0.55
798 0.58
799 0.58
800 0.56
801 0.51
802 0.5
803 0.44
804 0.46
805 0.43
806 0.38
807 0.34
808 0.32
809 0.3
810 0.28
811 0.29
812 0.24
813 0.21
814 0.19
815 0.15
816 0.12
817 0.12
818 0.11
819 0.11
820 0.11
821 0.11
822 0.12
823 0.13
824 0.17
825 0.24
826 0.29
827 0.36
828 0.37
829 0.42
830 0.46
831 0.47
832 0.47
833 0.4
834 0.43
835 0.38
836 0.42
837 0.39
838 0.36
839 0.36
840 0.38
841 0.4
842 0.36
843 0.39
844 0.38
845 0.39
846 0.42
847 0.44
848 0.45
849 0.45
850 0.48
851 0.46
852 0.44
853 0.43
854 0.39
855 0.37
856 0.3
857 0.27
858 0.23
859 0.21
860 0.2
861 0.17
862 0.2
863 0.21
864 0.25
865 0.3
866 0.3
867 0.34
868 0.39
869 0.43
870 0.39
871 0.38
872 0.34
873 0.33
874 0.34
875 0.31
876 0.26
877 0.27
878 0.27
879 0.27
880 0.27
881 0.24
882 0.2
883 0.18