Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5FGY4

Protein Details
Accession C5FGY4    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1064-1084HNYPHHQYRNQNQNNNNNFTQHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 18, mito 4, cyto 2, plas 1, pero 1, vacu 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045117  ATXN2-like  
IPR009604  LsmAD_domain  
IPR025852  SM_dom_ATX  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF06741  LsmAD  
PF14438  SM-ATX  
Amino Acid Sequences MASAVNSLPSNGAGATPLNSSVSPNTMASRAAGRPSSGVKGADVSRRQSGSPVDGGQRRPSSQKAWTQNINPATQKPSSPYPQQNGTASRKSAMSPSPASNKESSTPDQHAHDRLIFLLTAAIGSNVFLTMKDGEKFTGIFSGSTLESNETIIILKMARHPPSDSEAASTQSNGVSQTKSPYLGSGPDHQLMIYVQDITCLDIPSLSTSGVAAKEQNGPSSGFRTDTDISGNQPGRERQLQRWEPSGTDATIEWAPESENTGAGWDQFETNARLFGATSSYDENIYTTRIDRSDPSYKHKEAEAARIAREIESSNTDNVHMREERGHVQHDDIDEEAKYSGVRRDASAVAPLPSGQPNKYMPPARRPPTGQPTVPGAPVDPAIISAQVARPDSQTKAPSQPKETPAAPSSKGPQEKAPTAPTAPTAPKSTEALKSVASNGAIDAERKVAAAGSSQASSTSSAPRTGGENAASNVETEVLDHFRRFANDEKMKLQERRRNQASYDRTIKLNELMKFSKNFKLGTPVPKDLVPILAKDPSKQEEIIERAKKQHEEKNAAVPTKPTAATPTASNAASAETKPASRNAGASRYEGGNGLPGAIPDRQGSYGRGRQVYPPMGPHAGRQLQHPGGHPGRAGPGLLSHRLVEIQQQRKGSNIGPVPTPLPAQDARVQPTGPTGDQGPSNGPPKAAHTPTSSSASTKFNVRAMEFKPNPAASTFTPAGTSGGPSATAAVNARPQSVPRATSPTAFFGSNKPLPASERPLIVNSFNPVKRMKKEITEAGSKDYAFNGGIPPAYRTAPTWDVSPINEKKTYADMFKPPVTTASASPQSRSSNTQMPHQQQLPYHLPHTGHNLPPNSGPPTHLIPPQQPHAAPMHYDDHHRMQMSASSSQVFPSPRLQHSTPMAYQHSVGPHNQMAMGHGVPPYYPQPGHVRHYPNGPQFSNPPNGGAPMMAHQASNGPYMNMPPQSITPYNPPMQMFSPNPGHVYPQHVPPMQTHSGYPSPSRGAPMMMHQGSQQGPPPQPMMAMNGQPGQSYYPPQQPNHMPPIRPGHHQQHPHFASSPHQAHNYPHHQYRNQNQNNNNNFTQIPHGPPPPMQPQAGPPPTAAPGSHPTEAPEEVK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.11
3 0.11
4 0.12
5 0.13
6 0.13
7 0.16
8 0.16
9 0.18
10 0.19
11 0.19
12 0.2
13 0.2
14 0.2
15 0.2
16 0.23
17 0.23
18 0.25
19 0.25
20 0.24
21 0.26
22 0.29
23 0.32
24 0.3
25 0.28
26 0.24
27 0.27
28 0.31
29 0.36
30 0.38
31 0.38
32 0.41
33 0.42
34 0.41
35 0.41
36 0.4
37 0.36
38 0.36
39 0.36
40 0.37
41 0.41
42 0.45
43 0.49
44 0.5
45 0.48
46 0.49
47 0.5
48 0.48
49 0.5
50 0.56
51 0.57
52 0.6
53 0.65
54 0.63
55 0.66
56 0.65
57 0.62
58 0.57
59 0.51
60 0.48
61 0.43
62 0.41
63 0.38
64 0.41
65 0.42
66 0.48
67 0.54
68 0.55
69 0.59
70 0.62
71 0.63
72 0.63
73 0.64
74 0.61
75 0.53
76 0.49
77 0.43
78 0.4
79 0.4
80 0.35
81 0.34
82 0.32
83 0.37
84 0.44
85 0.46
86 0.49
87 0.45
88 0.44
89 0.42
90 0.43
91 0.41
92 0.39
93 0.41
94 0.4
95 0.43
96 0.45
97 0.44
98 0.42
99 0.4
100 0.34
101 0.3
102 0.28
103 0.22
104 0.17
105 0.15
106 0.11
107 0.09
108 0.08
109 0.07
110 0.06
111 0.06
112 0.06
113 0.06
114 0.06
115 0.05
116 0.08
117 0.1
118 0.13
119 0.14
120 0.15
121 0.16
122 0.17
123 0.17
124 0.16
125 0.17
126 0.15
127 0.13
128 0.13
129 0.15
130 0.14
131 0.14
132 0.14
133 0.12
134 0.12
135 0.12
136 0.12
137 0.1
138 0.1
139 0.09
140 0.09
141 0.08
142 0.1
143 0.17
144 0.23
145 0.26
146 0.28
147 0.3
148 0.32
149 0.37
150 0.39
151 0.32
152 0.29
153 0.28
154 0.28
155 0.26
156 0.24
157 0.19
158 0.16
159 0.16
160 0.14
161 0.15
162 0.14
163 0.15
164 0.2
165 0.21
166 0.22
167 0.22
168 0.21
169 0.2
170 0.22
171 0.24
172 0.26
173 0.29
174 0.28
175 0.28
176 0.26
177 0.25
178 0.21
179 0.2
180 0.14
181 0.11
182 0.09
183 0.11
184 0.11
185 0.12
186 0.14
187 0.13
188 0.12
189 0.1
190 0.11
191 0.12
192 0.13
193 0.11
194 0.09
195 0.09
196 0.11
197 0.12
198 0.12
199 0.11
200 0.12
201 0.19
202 0.2
203 0.21
204 0.2
205 0.22
206 0.22
207 0.25
208 0.24
209 0.19
210 0.18
211 0.23
212 0.22
213 0.21
214 0.24
215 0.21
216 0.22
217 0.29
218 0.3
219 0.26
220 0.29
221 0.3
222 0.32
223 0.39
224 0.41
225 0.41
226 0.5
227 0.55
228 0.54
229 0.58
230 0.54
231 0.46
232 0.46
233 0.41
234 0.3
235 0.25
236 0.21
237 0.18
238 0.17
239 0.16
240 0.12
241 0.1
242 0.1
243 0.09
244 0.13
245 0.1
246 0.1
247 0.09
248 0.11
249 0.11
250 0.1
251 0.11
252 0.08
253 0.08
254 0.08
255 0.11
256 0.12
257 0.12
258 0.13
259 0.12
260 0.12
261 0.11
262 0.11
263 0.11
264 0.09
265 0.11
266 0.12
267 0.12
268 0.13
269 0.12
270 0.13
271 0.11
272 0.12
273 0.11
274 0.11
275 0.13
276 0.13
277 0.15
278 0.16
279 0.22
280 0.31
281 0.33
282 0.4
283 0.45
284 0.46
285 0.46
286 0.45
287 0.45
288 0.38
289 0.44
290 0.44
291 0.38
292 0.37
293 0.37
294 0.36
295 0.29
296 0.28
297 0.2
298 0.14
299 0.17
300 0.18
301 0.17
302 0.17
303 0.18
304 0.2
305 0.19
306 0.22
307 0.18
308 0.18
309 0.2
310 0.23
311 0.27
312 0.27
313 0.29
314 0.25
315 0.25
316 0.26
317 0.24
318 0.22
319 0.17
320 0.15
321 0.12
322 0.12
323 0.11
324 0.08
325 0.08
326 0.08
327 0.11
328 0.14
329 0.14
330 0.14
331 0.18
332 0.19
333 0.2
334 0.22
335 0.2
336 0.17
337 0.16
338 0.16
339 0.14
340 0.17
341 0.18
342 0.15
343 0.18
344 0.2
345 0.23
346 0.29
347 0.34
348 0.33
349 0.41
350 0.5
351 0.51
352 0.54
353 0.55
354 0.57
355 0.6
356 0.63
357 0.53
358 0.46
359 0.47
360 0.43
361 0.4
362 0.31
363 0.22
364 0.17
365 0.16
366 0.14
367 0.08
368 0.07
369 0.07
370 0.07
371 0.06
372 0.06
373 0.08
374 0.1
375 0.11
376 0.11
377 0.13
378 0.15
379 0.17
380 0.21
381 0.22
382 0.22
383 0.31
384 0.37
385 0.4
386 0.43
387 0.48
388 0.46
389 0.49
390 0.46
391 0.41
392 0.37
393 0.37
394 0.32
395 0.28
396 0.29
397 0.31
398 0.33
399 0.3
400 0.33
401 0.34
402 0.35
403 0.37
404 0.35
405 0.3
406 0.28
407 0.27
408 0.23
409 0.22
410 0.21
411 0.2
412 0.19
413 0.18
414 0.19
415 0.21
416 0.22
417 0.22
418 0.22
419 0.21
420 0.19
421 0.19
422 0.18
423 0.18
424 0.15
425 0.12
426 0.09
427 0.1
428 0.1
429 0.09
430 0.09
431 0.08
432 0.08
433 0.08
434 0.08
435 0.06
436 0.06
437 0.06
438 0.07
439 0.07
440 0.08
441 0.08
442 0.08
443 0.08
444 0.1
445 0.1
446 0.13
447 0.13
448 0.13
449 0.14
450 0.14
451 0.16
452 0.16
453 0.16
454 0.13
455 0.14
456 0.13
457 0.14
458 0.14
459 0.12
460 0.1
461 0.09
462 0.08
463 0.06
464 0.07
465 0.09
466 0.09
467 0.09
468 0.1
469 0.1
470 0.11
471 0.13
472 0.18
473 0.25
474 0.28
475 0.31
476 0.32
477 0.36
478 0.4
479 0.44
480 0.47
481 0.44
482 0.47
483 0.54
484 0.57
485 0.54
486 0.52
487 0.55
488 0.52
489 0.52
490 0.51
491 0.43
492 0.4
493 0.38
494 0.36
495 0.32
496 0.32
497 0.27
498 0.25
499 0.25
500 0.27
501 0.29
502 0.31
503 0.32
504 0.28
505 0.27
506 0.23
507 0.28
508 0.3
509 0.36
510 0.38
511 0.34
512 0.33
513 0.32
514 0.32
515 0.25
516 0.25
517 0.17
518 0.13
519 0.13
520 0.16
521 0.16
522 0.17
523 0.19
524 0.17
525 0.19
526 0.18
527 0.17
528 0.17
529 0.21
530 0.28
531 0.29
532 0.28
533 0.31
534 0.33
535 0.36
536 0.37
537 0.38
538 0.37
539 0.4
540 0.41
541 0.45
542 0.46
543 0.42
544 0.38
545 0.33
546 0.27
547 0.23
548 0.22
549 0.13
550 0.12
551 0.13
552 0.13
553 0.13
554 0.14
555 0.14
556 0.13
557 0.13
558 0.11
559 0.11
560 0.11
561 0.1
562 0.1
563 0.08
564 0.09
565 0.1
566 0.11
567 0.12
568 0.12
569 0.15
570 0.15
571 0.2
572 0.2
573 0.2
574 0.2
575 0.19
576 0.19
577 0.16
578 0.14
579 0.1
580 0.09
581 0.08
582 0.07
583 0.06
584 0.08
585 0.08
586 0.09
587 0.07
588 0.09
589 0.09
590 0.1
591 0.13
592 0.17
593 0.21
594 0.24
595 0.25
596 0.25
597 0.26
598 0.31
599 0.31
600 0.26
601 0.24
602 0.23
603 0.24
604 0.24
605 0.22
606 0.23
607 0.24
608 0.23
609 0.23
610 0.27
611 0.27
612 0.29
613 0.29
614 0.29
615 0.27
616 0.27
617 0.25
618 0.19
619 0.18
620 0.17
621 0.15
622 0.08
623 0.11
624 0.12
625 0.14
626 0.14
627 0.12
628 0.12
629 0.12
630 0.13
631 0.16
632 0.22
633 0.27
634 0.3
635 0.32
636 0.32
637 0.33
638 0.35
639 0.29
640 0.27
641 0.24
642 0.21
643 0.2
644 0.21
645 0.2
646 0.19
647 0.18
648 0.12
649 0.12
650 0.11
651 0.14
652 0.18
653 0.2
654 0.23
655 0.24
656 0.24
657 0.21
658 0.23
659 0.22
660 0.16
661 0.14
662 0.12
663 0.12
664 0.12
665 0.13
666 0.13
667 0.14
668 0.17
669 0.17
670 0.16
671 0.15
672 0.2
673 0.26
674 0.25
675 0.25
676 0.25
677 0.27
678 0.29
679 0.33
680 0.29
681 0.23
682 0.24
683 0.24
684 0.22
685 0.23
686 0.22
687 0.21
688 0.22
689 0.22
690 0.25
691 0.24
692 0.34
693 0.31
694 0.31
695 0.32
696 0.3
697 0.3
698 0.25
699 0.26
700 0.16
701 0.22
702 0.21
703 0.17
704 0.17
705 0.17
706 0.17
707 0.14
708 0.14
709 0.08
710 0.07
711 0.07
712 0.07
713 0.08
714 0.06
715 0.07
716 0.07
717 0.08
718 0.12
719 0.12
720 0.14
721 0.13
722 0.14
723 0.19
724 0.21
725 0.22
726 0.2
727 0.27
728 0.26
729 0.29
730 0.3
731 0.27
732 0.26
733 0.25
734 0.24
735 0.19
736 0.26
737 0.25
738 0.24
739 0.22
740 0.21
741 0.24
742 0.27
743 0.31
744 0.26
745 0.26
746 0.26
747 0.27
748 0.28
749 0.25
750 0.22
751 0.18
752 0.24
753 0.22
754 0.24
755 0.27
756 0.31
757 0.34
758 0.39
759 0.39
760 0.38
761 0.43
762 0.46
763 0.47
764 0.48
765 0.45
766 0.42
767 0.41
768 0.36
769 0.31
770 0.24
771 0.2
772 0.14
773 0.13
774 0.1
775 0.09
776 0.1
777 0.1
778 0.11
779 0.11
780 0.12
781 0.12
782 0.12
783 0.17
784 0.2
785 0.2
786 0.2
787 0.21
788 0.21
789 0.22
790 0.3
791 0.28
792 0.29
793 0.3
794 0.29
795 0.28
796 0.32
797 0.33
798 0.28
799 0.29
800 0.3
801 0.34
802 0.36
803 0.35
804 0.3
805 0.29
806 0.28
807 0.24
808 0.21
809 0.23
810 0.28
811 0.28
812 0.29
813 0.31
814 0.32
815 0.32
816 0.36
817 0.33
818 0.32
819 0.33
820 0.4
821 0.44
822 0.45
823 0.49
824 0.47
825 0.46
826 0.4
827 0.46
828 0.44
829 0.39
830 0.35
831 0.33
832 0.31
833 0.29
834 0.36
835 0.34
836 0.32
837 0.35
838 0.36
839 0.34
840 0.35
841 0.37
842 0.33
843 0.28
844 0.26
845 0.23
846 0.26
847 0.28
848 0.3
849 0.29
850 0.31
851 0.35
852 0.38
853 0.39
854 0.34
855 0.33
856 0.33
857 0.31
858 0.26
859 0.25
860 0.26
861 0.23
862 0.27
863 0.29
864 0.3
865 0.33
866 0.32
867 0.29
868 0.24
869 0.27
870 0.27
871 0.25
872 0.21
873 0.19
874 0.18
875 0.19
876 0.21
877 0.18
878 0.17
879 0.24
880 0.29
881 0.3
882 0.37
883 0.38
884 0.4
885 0.43
886 0.47
887 0.41
888 0.4
889 0.4
890 0.34
891 0.34
892 0.31
893 0.3
894 0.27
895 0.26
896 0.25
897 0.23
898 0.23
899 0.23
900 0.19
901 0.17
902 0.17
903 0.17
904 0.13
905 0.13
906 0.12
907 0.11
908 0.14
909 0.15
910 0.16
911 0.16
912 0.17
913 0.25
914 0.31
915 0.36
916 0.42
917 0.46
918 0.44
919 0.53
920 0.57
921 0.57
922 0.58
923 0.54
924 0.49
925 0.48
926 0.51
927 0.5
928 0.42
929 0.36
930 0.3
931 0.3
932 0.27
933 0.23
934 0.18
935 0.14
936 0.17
937 0.15
938 0.14
939 0.13
940 0.15
941 0.16
942 0.18
943 0.16
944 0.13
945 0.13
946 0.16
947 0.21
948 0.19
949 0.19
950 0.17
951 0.19
952 0.24
953 0.25
954 0.26
955 0.29
956 0.33
957 0.36
958 0.38
959 0.37
960 0.34
961 0.34
962 0.38
963 0.33
964 0.33
965 0.36
966 0.33
967 0.35
968 0.32
969 0.34
970 0.29
971 0.36
972 0.32
973 0.33
974 0.39
975 0.39
976 0.4
977 0.39
978 0.44
979 0.4
980 0.38
981 0.32
982 0.31
983 0.33
984 0.34
985 0.34
986 0.3
987 0.3
988 0.3
989 0.32
990 0.27
991 0.25
992 0.24
993 0.27
994 0.33
995 0.3
996 0.29
997 0.26
998 0.3
999 0.29
1000 0.3
1001 0.3
1002 0.27
1003 0.28
1004 0.31
1005 0.32
1006 0.27
1007 0.28
1008 0.26
1009 0.27
1010 0.25
1011 0.25
1012 0.25
1013 0.26
1014 0.26
1015 0.25
1016 0.25
1017 0.23
1018 0.21
1019 0.23
1020 0.26
1021 0.32
1022 0.38
1023 0.39
1024 0.46
1025 0.5
1026 0.56
1027 0.61
1028 0.62
1029 0.54
1030 0.55
1031 0.64
1032 0.6
1033 0.58
1034 0.58
1035 0.57
1036 0.6
1037 0.68
1038 0.66
1039 0.66
1040 0.65
1041 0.64
1042 0.58
1043 0.5
1044 0.47
1045 0.48
1046 0.49
1047 0.42
1048 0.44
1049 0.42
1050 0.45
1051 0.53
1052 0.56
1053 0.53
1054 0.56
1055 0.6
1056 0.61
1057 0.68
1058 0.73
1059 0.74
1060 0.75
1061 0.76
1062 0.77
1063 0.79
1064 0.82
1065 0.8
1066 0.71
1067 0.63
1068 0.54
1069 0.47
1070 0.46
1071 0.39
1072 0.37
1073 0.36
1074 0.39
1075 0.38
1076 0.4
1077 0.45
1078 0.46
1079 0.46
1080 0.41
1081 0.37
1082 0.41
1083 0.49
1084 0.51
1085 0.45
1086 0.38
1087 0.36
1088 0.37
1089 0.37
1090 0.3
1091 0.24
1092 0.27
1093 0.32
1094 0.33
1095 0.3
1096 0.3
1097 0.32