Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A545VLH0

Protein Details
Accession A0A545VLH0    Localization Confidence High Confidence Score 22.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
7-37PEPVSPKMDKKAKKTHKSEKKRSREEDADADBasic
54-115SQNRGDVADKKEKKKKKSKHDGQGDAERGEKKKSKKQHTDGETKAERKKRKSKTARDDDDAIBasic
384-411QEAQALKTRRGNRTNRRLERRRAPEFSMHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
13-31KMDKKAKKTHKSEKKRSRE
41-47RKHKKSK
62-106DKKEKKKKKSKHDGQGDAERGEKKKSKKQHTDGETKAERKKRKSK
395-404NRTNRRLERR
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 12.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036898  RNA_pol_Rpb7-like_N_sf  
IPR041178  RPA43_OB  
IPR045113  Rpb7-like  
Gene Ontology GO:0000428  C:DNA-directed RNA polymerase complex  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF17875  RPA43_OB  
Amino Acid Sequences MPAATLPEPVSPKMDKKAKKTHKSEKKRSREEDADADQEQRKHKKSKSVSVDASQNRGDVADKKEKKKKKSKHDGQGDAERGEKKKSKKQHTDGETKAERKKRKSKTARDDDDAIDTDAEAALAQSQLESESAQQAADAMDIDDEPAINSISDIYQPPDIPANPQFPFFSQTVSLYEPIYPVGWAQPVTNCEFHYLRHLQNKYVPSLRGVLMKYKNVTLGDEPSRVGAASNDEEVTTLKSQREYGVGFGWITADVDLFVPSRGAWMEGSVNLQTEGHIGVVCFGKFNASIEARRLPPSWKWVSNEDPEAEGMEETASIVAPDEHGVVHQIHSTGFWVDTNGDKVKGKIRFRIRNFDVGVSGETTYLSLEGTMLDKTSEKTLVQQEAQALKTRRGNRTNRRLERRRAPEFSMTRFFSDEEKKAHEEREATRAAERAAAAETETAAAAPLADGTKIVFDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.49
2 0.51
3 0.57
4 0.68
5 0.74
6 0.8
7 0.85
8 0.87
9 0.89
10 0.93
11 0.94
12 0.94
13 0.94
14 0.94
15 0.91
16 0.89
17 0.85
18 0.81
19 0.78
20 0.72
21 0.66
22 0.57
23 0.55
24 0.5
25 0.47
26 0.49
27 0.49
28 0.51
29 0.55
30 0.6
31 0.65
32 0.7
33 0.76
34 0.77
35 0.78
36 0.76
37 0.72
38 0.76
39 0.69
40 0.65
41 0.55
42 0.45
43 0.35
44 0.3
45 0.27
46 0.24
47 0.28
48 0.34
49 0.41
50 0.5
51 0.6
52 0.68
53 0.76
54 0.81
55 0.84
56 0.85
57 0.88
58 0.89
59 0.9
60 0.93
61 0.91
62 0.88
63 0.87
64 0.8
65 0.69
66 0.63
67 0.57
68 0.48
69 0.46
70 0.45
71 0.43
72 0.48
73 0.57
74 0.64
75 0.7
76 0.77
77 0.8
78 0.82
79 0.85
80 0.79
81 0.79
82 0.75
83 0.7
84 0.69
85 0.68
86 0.67
87 0.67
88 0.74
89 0.74
90 0.78
91 0.83
92 0.86
93 0.89
94 0.92
95 0.89
96 0.84
97 0.78
98 0.68
99 0.61
100 0.51
101 0.4
102 0.29
103 0.21
104 0.16
105 0.12
106 0.1
107 0.06
108 0.04
109 0.04
110 0.04
111 0.04
112 0.04
113 0.04
114 0.04
115 0.05
116 0.05
117 0.06
118 0.08
119 0.08
120 0.08
121 0.08
122 0.08
123 0.07
124 0.07
125 0.06
126 0.04
127 0.05
128 0.05
129 0.05
130 0.05
131 0.04
132 0.04
133 0.05
134 0.05
135 0.04
136 0.04
137 0.05
138 0.05
139 0.07
140 0.07
141 0.08
142 0.1
143 0.1
144 0.11
145 0.14
146 0.14
147 0.16
148 0.19
149 0.23
150 0.22
151 0.23
152 0.23
153 0.21
154 0.24
155 0.2
156 0.18
157 0.14
158 0.14
159 0.15
160 0.16
161 0.16
162 0.13
163 0.13
164 0.12
165 0.11
166 0.1
167 0.08
168 0.07
169 0.07
170 0.07
171 0.08
172 0.08
173 0.1
174 0.12
175 0.15
176 0.16
177 0.15
178 0.17
179 0.17
180 0.17
181 0.22
182 0.24
183 0.26
184 0.33
185 0.34
186 0.32
187 0.37
188 0.39
189 0.35
190 0.35
191 0.31
192 0.24
193 0.25
194 0.24
195 0.23
196 0.22
197 0.25
198 0.24
199 0.26
200 0.25
201 0.24
202 0.25
203 0.21
204 0.21
205 0.16
206 0.18
207 0.18
208 0.18
209 0.17
210 0.15
211 0.15
212 0.13
213 0.12
214 0.08
215 0.08
216 0.08
217 0.08
218 0.08
219 0.08
220 0.08
221 0.09
222 0.1
223 0.09
224 0.1
225 0.1
226 0.11
227 0.12
228 0.12
229 0.14
230 0.12
231 0.12
232 0.11
233 0.11
234 0.1
235 0.1
236 0.09
237 0.07
238 0.07
239 0.05
240 0.04
241 0.04
242 0.04
243 0.05
244 0.05
245 0.05
246 0.05
247 0.05
248 0.06
249 0.05
250 0.06
251 0.05
252 0.06
253 0.07
254 0.07
255 0.09
256 0.08
257 0.09
258 0.08
259 0.08
260 0.07
261 0.07
262 0.07
263 0.05
264 0.05
265 0.05
266 0.06
267 0.08
268 0.08
269 0.07
270 0.07
271 0.08
272 0.08
273 0.09
274 0.12
275 0.13
276 0.14
277 0.17
278 0.22
279 0.22
280 0.25
281 0.25
282 0.23
283 0.24
284 0.31
285 0.34
286 0.35
287 0.36
288 0.38
289 0.43
290 0.44
291 0.44
292 0.37
293 0.31
294 0.27
295 0.25
296 0.2
297 0.14
298 0.1
299 0.07
300 0.06
301 0.05
302 0.05
303 0.04
304 0.03
305 0.04
306 0.04
307 0.04
308 0.05
309 0.05
310 0.05
311 0.05
312 0.07
313 0.07
314 0.08
315 0.09
316 0.09
317 0.09
318 0.09
319 0.1
320 0.09
321 0.09
322 0.08
323 0.08
324 0.09
325 0.1
326 0.14
327 0.15
328 0.17
329 0.17
330 0.19
331 0.25
332 0.32
333 0.35
334 0.39
335 0.48
336 0.56
337 0.61
338 0.7
339 0.66
340 0.67
341 0.64
342 0.57
343 0.48
344 0.4
345 0.35
346 0.26
347 0.22
348 0.14
349 0.12
350 0.1
351 0.09
352 0.07
353 0.06
354 0.05
355 0.04
356 0.05
357 0.06
358 0.06
359 0.06
360 0.07
361 0.08
362 0.1
363 0.12
364 0.14
365 0.13
366 0.19
367 0.25
368 0.29
369 0.29
370 0.3
371 0.33
372 0.35
373 0.36
374 0.39
375 0.35
376 0.35
377 0.42
378 0.48
379 0.52
380 0.57
381 0.66
382 0.69
383 0.78
384 0.84
385 0.87
386 0.9
387 0.9
388 0.91
389 0.91
390 0.9
391 0.88
392 0.82
393 0.77
394 0.76
395 0.72
396 0.69
397 0.66
398 0.59
399 0.52
400 0.47
401 0.43
402 0.4
403 0.42
404 0.4
405 0.37
406 0.4
407 0.43
408 0.44
409 0.46
410 0.44
411 0.42
412 0.4
413 0.43
414 0.41
415 0.38
416 0.37
417 0.37
418 0.33
419 0.3
420 0.26
421 0.2
422 0.18
423 0.17
424 0.15
425 0.14
426 0.13
427 0.1
428 0.1
429 0.09
430 0.07
431 0.07
432 0.06
433 0.05
434 0.07
435 0.07
436 0.07
437 0.07
438 0.07