FuNGI

A0A545W4P9

Protein Details

Accession

A0A545W4P9

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
14-36	ELSEPEPKRARKARLKQGSSVDP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
22-26	RARKA

Subcellular Location(s)

nucl 19.5, cyto_nucl 12.5, cyto 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR035426 Gemin2/Brr1
Gene Ontology	GO:0000387 P:spliceosomal snRNP assembly
Pfam	View protein in Pfam PF04938 SIP1

Amino Acid Sequences

MSSKRDYEDVDDTELSEPEPKRARKARLKQGSSVDPNSGQKYVFANYHNATTIPVGEESDFEDDGDAMAYLMSVRTQASGIPHVLAAPKLQIGPQLPRDMIKDGGSDVCEIDDEDDDRVDRSIYNTGISDSRGFYEDGAYIGRGDDWEGDSGDDWNETEDEDGKVSESVVQEAYFGAIMQQYHNLRAVLNQKPPADAAKRMTSSQATYAAAFGPGSTVIKTWPPLLRNTDPTPLQVSLMSKDTVIRILRIMLGGKFLRQGYPVPERTSRWIWALLARLPERGELNYSEIGWIRDLGRRAVLLGRSLSEMAALREELAEGGLGVNDAVDDSSSDEEVVAAEATGHEEDGASNAKASQTTDGQAAEYMVGKAGEVVEEEGPEDVAMDLESDSDEGEIREDREERHPEKNNNSLEEAKLALLARIEARASDDAEDDEEDNLDAIRERSRMNMRATLNMILTVAGEYYGQRDLLEFREPFVGM

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.29
2	0.24
3	0.24
4	0.22
5	0.25
6	0.34
7	0.36
8	0.44
9	0.53
10	0.63
11	0.66
12	0.76
13	0.8
14	0.82
15	0.84
16	0.81
17	0.81
18	0.8
19	0.76
20	0.69
21	0.62
22	0.56
23	0.55
24	0.52
25	0.45
26	0.35
27	0.3
28	0.3
29	0.29
30	0.28
31	0.26
32	0.29
33	0.29
34	0.31
35	0.29
36	0.26
37	0.25
38	0.21
39	0.2
40	0.15
41	0.14
42	0.13
43	0.12
44	0.13
45	0.14
46	0.16
47	0.15
48	0.13
49	0.13
50	0.11
51	0.11
52	0.11
53	0.08
54	0.05
55	0.04
56	0.04
57	0.04
58	0.04
59	0.04
60	0.05
61	0.05
62	0.06
63	0.06
64	0.08
65	0.11
66	0.14
67	0.15
68	0.15
69	0.15
70	0.15
71	0.16
72	0.15
73	0.13
74	0.11
75	0.11
76	0.11
77	0.12
78	0.15
79	0.17
80	0.22
81	0.26
82	0.29
83	0.28
84	0.3
85	0.32
86	0.3
87	0.29
88	0.24
89	0.2
90	0.18
91	0.19
92	0.18
93	0.16
94	0.13
95	0.11
96	0.1
97	0.09
98	0.09
99	0.09
100	0.09
101	0.09
102	0.09
103	0.09
104	0.1
105	0.1
106	0.09
107	0.08
108	0.1
109	0.13
110	0.13
111	0.14
112	0.14
113	0.15
114	0.15
115	0.16
116	0.16
117	0.13
118	0.13
119	0.14
120	0.14
121	0.12
122	0.13
123	0.12
124	0.11
125	0.11
126	0.1
127	0.08
128	0.08
129	0.08
130	0.06
131	0.07
132	0.07
133	0.07
134	0.08
135	0.08
136	0.08
137	0.09
138	0.09
139	0.09
140	0.08
141	0.07
142	0.07
143	0.06
144	0.06
145	0.07
146	0.07
147	0.08
148	0.08
149	0.08
150	0.08
151	0.08
152	0.08
153	0.1
154	0.09
155	0.1
156	0.1
157	0.09
158	0.09
159	0.09
160	0.09
161	0.06
162	0.05
163	0.05
164	0.05
165	0.06
166	0.06
167	0.11
168	0.12
169	0.13
170	0.15
171	0.14
172	0.13
173	0.17
174	0.23
175	0.24
176	0.28
177	0.32
178	0.31
179	0.31
180	0.32
181	0.32
182	0.28
183	0.26
184	0.25
185	0.26
186	0.27
187	0.27
188	0.28
189	0.25
190	0.23
191	0.22
192	0.2
193	0.15
194	0.14
195	0.14
196	0.12
197	0.11
198	0.1
199	0.08
200	0.05
201	0.05
202	0.05
203	0.05
204	0.05
205	0.05
206	0.07
207	0.08
208	0.11
209	0.13
210	0.14
211	0.18
212	0.24
213	0.26
214	0.3
215	0.32
216	0.33
217	0.3
218	0.3
219	0.3
220	0.23
221	0.21
222	0.17
223	0.15
224	0.13
225	0.14
226	0.13
227	0.1
228	0.1
229	0.1
230	0.13
231	0.12
232	0.11
233	0.1
234	0.1
235	0.1
236	0.1
237	0.11
238	0.07
239	0.1
240	0.1
241	0.1
242	0.12
243	0.12
244	0.12
245	0.12
246	0.13
247	0.15
248	0.22
249	0.25
250	0.26
251	0.28
252	0.29
253	0.34
254	0.35
255	0.32
256	0.26
257	0.24
258	0.21
259	0.21
260	0.22
261	0.2
262	0.22
263	0.2
264	0.2
265	0.19
266	0.2
267	0.18
268	0.16
269	0.16
270	0.12
271	0.14
272	0.14
273	0.13
274	0.13
275	0.13
276	0.13
277	0.11
278	0.11
279	0.1
280	0.12
281	0.13
282	0.13
283	0.13
284	0.12
285	0.13
286	0.15
287	0.15
288	0.14
289	0.13
290	0.13
291	0.13
292	0.13
293	0.12
294	0.1
295	0.1
296	0.09
297	0.09
298	0.08
299	0.07
300	0.07
301	0.07
302	0.06
303	0.05
304	0.04
305	0.03
306	0.04
307	0.03
308	0.03
309	0.03
310	0.03
311	0.02
312	0.03
313	0.03
314	0.03
315	0.03
316	0.04
317	0.05
318	0.06
319	0.06
320	0.06
321	0.06
322	0.06
323	0.06
324	0.05
325	0.04
326	0.04
327	0.04
328	0.05
329	0.05
330	0.05
331	0.05
332	0.05
333	0.05
334	0.07
335	0.09
336	0.08
337	0.08
338	0.08
339	0.09
340	0.1
341	0.11
342	0.12
343	0.12
344	0.13
345	0.15
346	0.14
347	0.14
348	0.14
349	0.13
350	0.11
351	0.1
352	0.09
353	0.08
354	0.07
355	0.07
356	0.07
357	0.06
358	0.06
359	0.06
360	0.07
361	0.07
362	0.07
363	0.08
364	0.07
365	0.07
366	0.07
367	0.07
368	0.05
369	0.04
370	0.04
371	0.05
372	0.04
373	0.05
374	0.05
375	0.05
376	0.05
377	0.05
378	0.05
379	0.05
380	0.07
381	0.08
382	0.09
383	0.13
384	0.14
385	0.17
386	0.25
387	0.34
388	0.36
389	0.44
390	0.52
391	0.56
392	0.62
393	0.68
394	0.65
395	0.6
396	0.6
397	0.53
398	0.45
399	0.39
400	0.33
401	0.24
402	0.22
403	0.18
404	0.15
405	0.12
406	0.13
407	0.12
408	0.12
409	0.12
410	0.1
411	0.13
412	0.14
413	0.15
414	0.15
415	0.15
416	0.15
417	0.16
418	0.17
419	0.14
420	0.13
421	0.12
422	0.11
423	0.1
424	0.09
425	0.08
426	0.08
427	0.09
428	0.12
429	0.13
430	0.14
431	0.22
432	0.3
433	0.36
434	0.4
435	0.46
436	0.45
437	0.49
438	0.52
439	0.47
440	0.4
441	0.34
442	0.29
443	0.21
444	0.19
445	0.13
446	0.1
447	0.07
448	0.07
449	0.06
450	0.09
451	0.1
452	0.1
453	0.1
454	0.11
455	0.13
456	0.16
457	0.24
458	0.21
459	0.22

A0A545W4P9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer