Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A545VM41

Protein Details
Accession A0A545VM41    Localization Confidence High Confidence Score 23.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-23MSDQRRGGRRPDHRRDWDAPDRRBasic
34-57GGRRSNYRSRSRERDDRDRSPDRRBasic
123-142RRGGRDRRRRSPSRSRSPARBasic
234-253GAVRKEKKTEYRQYMNRLGGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
6-58RGGRRPDHRRDWDAPDRRDDGPRGSGGGGGRRSNYRSRSRERDDRDRSPDRRQ
72-82RGFGRGSRGGR
123-147RRGGRDRRRRSPSRSRSPARGPRER
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013957  SNRNP27  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF08648  SNRNP27  
Amino Acid Sequences MSDQRRGGRRPDHRRDWDAPDRRDDGPRGSGGGGGRRSNYRSRSRERDDRDRSPDRRQHGSYRDHDAGAAGRGFGRGSRGGRGGGGGDGSSSSRRDGDYRSRRYDNDHRRRDYDDDDDGGYDRRGGRDRRRRSPSRSRSPARGPRERAENNNKSSHDDGIDGDRTNHRDPKPPSSKKPTTAAAAAAAAAVGKGGGDNDDNDDDDDDEMAAMQAMMGFGGFGTTKDKRVAGNNAGAVRKEKKTEYRQYMNRLGGFNRALSPTRD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.85
2 0.82
3 0.81
4 0.81
5 0.8
6 0.73
7 0.7
8 0.65
9 0.6
10 0.6
11 0.53
12 0.48
13 0.42
14 0.39
15 0.34
16 0.3
17 0.3
18 0.26
19 0.3
20 0.29
21 0.27
22 0.28
23 0.3
24 0.34
25 0.39
26 0.45
27 0.48
28 0.52
29 0.6
30 0.67
31 0.72
32 0.78
33 0.79
34 0.82
35 0.8
36 0.8
37 0.8
38 0.8
39 0.76
40 0.77
41 0.75
42 0.7
43 0.69
44 0.65
45 0.65
46 0.63
47 0.67
48 0.61
49 0.62
50 0.59
51 0.5
52 0.46
53 0.37
54 0.3
55 0.24
56 0.2
57 0.12
58 0.1
59 0.1
60 0.1
61 0.09
62 0.11
63 0.12
64 0.14
65 0.16
66 0.18
67 0.18
68 0.18
69 0.18
70 0.15
71 0.12
72 0.1
73 0.07
74 0.06
75 0.06
76 0.07
77 0.08
78 0.08
79 0.08
80 0.09
81 0.1
82 0.12
83 0.16
84 0.26
85 0.35
86 0.42
87 0.48
88 0.5
89 0.5
90 0.56
91 0.62
92 0.63
93 0.63
94 0.65
95 0.62
96 0.62
97 0.65
98 0.61
99 0.54
100 0.47
101 0.39
102 0.31
103 0.27
104 0.25
105 0.21
106 0.18
107 0.14
108 0.11
109 0.09
110 0.1
111 0.15
112 0.2
113 0.3
114 0.39
115 0.47
116 0.56
117 0.65
118 0.69
119 0.73
120 0.79
121 0.79
122 0.8
123 0.81
124 0.75
125 0.73
126 0.76
127 0.77
128 0.73
129 0.71
130 0.66
131 0.6
132 0.65
133 0.61
134 0.6
135 0.61
136 0.6
137 0.56
138 0.56
139 0.54
140 0.48
141 0.47
142 0.39
143 0.3
144 0.23
145 0.2
146 0.18
147 0.19
148 0.15
149 0.16
150 0.17
151 0.21
152 0.23
153 0.29
154 0.27
155 0.34
156 0.37
157 0.47
158 0.55
159 0.59
160 0.64
161 0.68
162 0.72
163 0.68
164 0.69
165 0.62
166 0.54
167 0.48
168 0.4
169 0.31
170 0.25
171 0.2
172 0.14
173 0.11
174 0.07
175 0.05
176 0.04
177 0.02
178 0.02
179 0.02
180 0.02
181 0.04
182 0.04
183 0.05
184 0.09
185 0.1
186 0.11
187 0.11
188 0.12
189 0.11
190 0.11
191 0.11
192 0.08
193 0.06
194 0.06
195 0.05
196 0.05
197 0.04
198 0.03
199 0.03
200 0.03
201 0.03
202 0.03
203 0.03
204 0.02
205 0.04
206 0.04
207 0.04
208 0.1
209 0.12
210 0.15
211 0.18
212 0.2
213 0.22
214 0.28
215 0.36
216 0.35
217 0.4
218 0.41
219 0.44
220 0.44
221 0.43
222 0.41
223 0.39
224 0.38
225 0.37
226 0.39
227 0.44
228 0.53
229 0.62
230 0.67
231 0.72
232 0.75
233 0.79
234 0.81
235 0.78
236 0.72
237 0.64
238 0.56
239 0.52
240 0.46
241 0.39
242 0.34
243 0.31