Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A545VCW7

Protein Details
Accession A0A545VCW7    Localization Confidence High Confidence Score 15.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-20MSPPAKKRRTRADDAREAAAHydrophilic
133-152ESEKWDKRLKKKAAHRDNNABasic
241-263NRAEAQSLKKRKERQAKNGDDGDHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 13.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013260  mRNA_splic_SYF2  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF08231  SYF2  
Amino Acid Sequences MSPPAKKRRTRADDAREAAAPDTTTEQPGEKAPSPTPEALEKPEQTTSATDGASKAQDRMARFKALQARAKNSSETNMKEVTRESQRLAEDPAQLTALRRRHDIAAHKLLKAETEDAGEDFERKRAWDWTVDESEKWDKRLKKKAAHRDNNAFQDYQAESNKVYKRQLKNLNVDLDAYTKQKLAAIEKAAAAGSLEIVETEDGEMIAVDKDGTFYATADSTSFTQNKPDKAAIDRLVADINRAEAQSLKKRKERQAKNGDDGDITYINEKNKQFNQKLARFYDKYTSDIRDSFERGTMI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.8
2 0.75
3 0.65
4 0.57
5 0.48
6 0.38
7 0.28
8 0.19
9 0.2
10 0.18
11 0.18
12 0.17
13 0.18
14 0.17
15 0.2
16 0.25
17 0.25
18 0.27
19 0.28
20 0.32
21 0.36
22 0.36
23 0.35
24 0.34
25 0.33
26 0.35
27 0.39
28 0.36
29 0.34
30 0.34
31 0.33
32 0.29
33 0.28
34 0.26
35 0.22
36 0.2
37 0.17
38 0.16
39 0.18
40 0.2
41 0.19
42 0.17
43 0.18
44 0.21
45 0.23
46 0.3
47 0.32
48 0.33
49 0.32
50 0.37
51 0.42
52 0.47
53 0.51
54 0.49
55 0.52
56 0.53
57 0.55
58 0.52
59 0.44
60 0.42
61 0.4
62 0.38
63 0.35
64 0.33
65 0.31
66 0.3
67 0.3
68 0.3
69 0.31
70 0.3
71 0.28
72 0.29
73 0.3
74 0.3
75 0.33
76 0.31
77 0.27
78 0.25
79 0.24
80 0.2
81 0.19
82 0.2
83 0.22
84 0.23
85 0.22
86 0.23
87 0.24
88 0.25
89 0.3
90 0.36
91 0.37
92 0.43
93 0.43
94 0.42
95 0.42
96 0.4
97 0.35
98 0.3
99 0.23
100 0.13
101 0.11
102 0.11
103 0.1
104 0.11
105 0.1
106 0.1
107 0.09
108 0.1
109 0.09
110 0.1
111 0.11
112 0.13
113 0.14
114 0.18
115 0.2
116 0.24
117 0.28
118 0.28
119 0.27
120 0.27
121 0.33
122 0.29
123 0.29
124 0.3
125 0.31
126 0.39
127 0.49
128 0.54
129 0.55
130 0.64
131 0.72
132 0.77
133 0.8
134 0.79
135 0.77
136 0.75
137 0.71
138 0.63
139 0.52
140 0.41
141 0.35
142 0.29
143 0.23
144 0.19
145 0.14
146 0.13
147 0.2
148 0.23
149 0.22
150 0.27
151 0.32
152 0.36
153 0.44
154 0.53
155 0.54
156 0.58
157 0.6
158 0.58
159 0.5
160 0.46
161 0.38
162 0.3
163 0.25
164 0.19
165 0.14
166 0.11
167 0.11
168 0.13
169 0.13
170 0.14
171 0.17
172 0.18
173 0.18
174 0.18
175 0.19
176 0.16
177 0.15
178 0.12
179 0.07
180 0.05
181 0.04
182 0.04
183 0.03
184 0.04
185 0.04
186 0.04
187 0.04
188 0.04
189 0.03
190 0.04
191 0.03
192 0.04
193 0.04
194 0.04
195 0.04
196 0.04
197 0.04
198 0.05
199 0.06
200 0.05
201 0.05
202 0.07
203 0.07
204 0.07
205 0.07
206 0.09
207 0.09
208 0.13
209 0.15
210 0.14
211 0.23
212 0.27
213 0.29
214 0.32
215 0.33
216 0.31
217 0.34
218 0.41
219 0.35
220 0.34
221 0.32
222 0.29
223 0.29
224 0.27
225 0.24
226 0.17
227 0.16
228 0.14
229 0.13
230 0.13
231 0.13
232 0.2
233 0.29
234 0.37
235 0.42
236 0.49
237 0.58
238 0.68
239 0.75
240 0.79
241 0.8
242 0.83
243 0.84
244 0.84
245 0.8
246 0.71
247 0.61
248 0.51
249 0.44
250 0.34
251 0.26
252 0.21
253 0.19
254 0.2
255 0.26
256 0.27
257 0.31
258 0.38
259 0.48
260 0.48
261 0.54
262 0.63
263 0.63
264 0.69
265 0.68
266 0.7
267 0.62
268 0.62
269 0.62
270 0.54
271 0.5
272 0.47
273 0.45
274 0.41
275 0.41
276 0.41
277 0.37
278 0.39
279 0.37