Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5FDJ6

Protein Details
Accession C5FDJ6    Localization Confidence Low Confidence Score 7.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
6-25PSEVKSGKRKTQPGQTTPNAHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) cyto_nucl 11.5, nucl 10.5, cyto 9.5, pero 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000547  Clathrin_H-chain/VPS_repeat  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR045111  Vps41/Vps8  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0006623  P:protein targeting to vacuole  
GO:0016192  P:vesicle-mediated transport  
Pfam View protein in Pfam  
PF00637  Clathrin  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50236  CHCR  
Amino Acid Sequences MEAAGPSEVKSGKRKTQPGQTTPNAIDRDTPKDEVMDEESEEEEEEDNDEGEEEDDDVEDEEPRLKYAPITSVLSPLYRNKDATSTFMTAGNKMIIGTHNGNIHIYSVPFFQRLRVYHAHSASIDSISVSPFPPPAPSKADFTPIVQTAGSGASISESPNGSKIQQHITIPPTPSNSIYIATSSMDGNVCVASLVDPKDVTLRNFGRPVSAVALSPDYKSDRTYVSGGKSGNLVLTIGGRVGASSNATLGSASPAGWFGSLGLGGNNGKDRVLHSGEGAISCIKWSRSGKYVAWVNEEGIKIMRSHLHLEQTEAEHAWERFGHTDRPRSQAWDEMAGVWKPRVVWIDEDSLESDNASAMQVSEGVSQSQRLKKHDPEKLLVGWGGTIWIIKVSRGDQSKGVGKKRIASAEITTKLRTDCIISGLSLYTQNLLLVLSYIIPEDDEPGTPSKQAGPARGIRRRQNGLQPELRLIDIDTEEELSGDILTVRNYENLSASDYHLDTLPLSRIASTTQRGALESITAGFIDATLYPKRLFSSGTSSRSMTSSADRGSSFQVTGIVDSTGLLHGGKYNKEIELAATLGVRVFVHSPYDCIIAVKRGFEDRLAWLDSHERSSKLEQEKRRIGELWLKQLVGQGEWEKAGNICSKVLQTTTAWDHWICVFARTGKFDEITPHVPIDIDPPLPSFVYELILGHYVSRDRVRFNELIELWPPSLFETDSVTAAIQDQLVSTEEGTEDWRNLLNCLAKLFLVGGHYREALRCYIRLQDGDAVMNLIREYHLLDSVSEDIPGFILLRVPKNRIKSTPVSELEEATSEPIKLLVREAANGIVRPETVVSQLQEADLGIFLYFYLRALWRGDFMTKEGGKPAIRTRGHHRTAAEAGKLVADEGRVLIDGFANTAVELFASYDRPLLMEFLQSSTSYSYDTACTICESRNFTPELIYLLSKTGQTKRALQLILSSLKDISHAISFAKTQDDPDLWDDLLSYSMDKPEYIRTLLTEASTAIDPIKLVRKIPSGLEIEGLREGLTRMIREHDIQASISLGVAKVLAGEVAIRMDALRKAQRQGMKFDIRHDEGTAAEGADDQDNVIQAETTGETIEEKQERVTKAIPPGRCAGCKKAFVEQETETIIVFACGHIYHLSHLHGQPTPHEQEAPQEQLLSSPRLHHQPSTVQSSALSRAVGLKVTNARLLRDKIGSGCKICAESLNDSSH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.61
2 0.65
3 0.73
4 0.79
5 0.79
6 0.81
7 0.77
8 0.75
9 0.69
10 0.69
11 0.6
12 0.5
13 0.48
14 0.43
15 0.45
16 0.43
17 0.42
18 0.35
19 0.35
20 0.35
21 0.32
22 0.32
23 0.26
24 0.22
25 0.21
26 0.2
27 0.19
28 0.19
29 0.16
30 0.12
31 0.1
32 0.11
33 0.1
34 0.09
35 0.09
36 0.09
37 0.08
38 0.08
39 0.08
40 0.08
41 0.07
42 0.07
43 0.08
44 0.08
45 0.08
46 0.09
47 0.09
48 0.13
49 0.13
50 0.14
51 0.15
52 0.15
53 0.16
54 0.19
55 0.23
56 0.23
57 0.27
58 0.27
59 0.29
60 0.31
61 0.3
62 0.3
63 0.31
64 0.35
65 0.34
66 0.35
67 0.33
68 0.38
69 0.38
70 0.4
71 0.39
72 0.35
73 0.32
74 0.35
75 0.35
76 0.29
77 0.3
78 0.25
79 0.19
80 0.16
81 0.16
82 0.13
83 0.18
84 0.2
85 0.21
86 0.23
87 0.23
88 0.24
89 0.23
90 0.23
91 0.18
92 0.16
93 0.14
94 0.15
95 0.17
96 0.19
97 0.19
98 0.21
99 0.27
100 0.28
101 0.34
102 0.37
103 0.42
104 0.47
105 0.48
106 0.48
107 0.41
108 0.42
109 0.36
110 0.31
111 0.24
112 0.17
113 0.16
114 0.14
115 0.14
116 0.12
117 0.11
118 0.12
119 0.12
120 0.17
121 0.2
122 0.23
123 0.28
124 0.3
125 0.34
126 0.35
127 0.4
128 0.35
129 0.34
130 0.36
131 0.31
132 0.3
133 0.24
134 0.22
135 0.18
136 0.17
137 0.15
138 0.09
139 0.07
140 0.07
141 0.08
142 0.09
143 0.1
144 0.1
145 0.11
146 0.14
147 0.16
148 0.16
149 0.19
150 0.22
151 0.26
152 0.29
153 0.31
154 0.34
155 0.37
156 0.41
157 0.4
158 0.39
159 0.37
160 0.35
161 0.34
162 0.31
163 0.28
164 0.24
165 0.21
166 0.19
167 0.16
168 0.15
169 0.14
170 0.12
171 0.12
172 0.11
173 0.1
174 0.1
175 0.09
176 0.08
177 0.07
178 0.07
179 0.06
180 0.1
181 0.12
182 0.12
183 0.12
184 0.13
185 0.19
186 0.21
187 0.21
188 0.27
189 0.28
190 0.32
191 0.35
192 0.35
193 0.32
194 0.31
195 0.32
196 0.26
197 0.24
198 0.19
199 0.18
200 0.22
201 0.2
202 0.19
203 0.2
204 0.19
205 0.19
206 0.2
207 0.2
208 0.19
209 0.21
210 0.24
211 0.26
212 0.26
213 0.3
214 0.29
215 0.27
216 0.26
217 0.23
218 0.2
219 0.16
220 0.12
221 0.08
222 0.08
223 0.08
224 0.07
225 0.07
226 0.06
227 0.06
228 0.06
229 0.07
230 0.07
231 0.07
232 0.07
233 0.07
234 0.07
235 0.07
236 0.07
237 0.08
238 0.08
239 0.08
240 0.08
241 0.08
242 0.08
243 0.08
244 0.08
245 0.06
246 0.06
247 0.06
248 0.06
249 0.05
250 0.07
251 0.08
252 0.09
253 0.11
254 0.11
255 0.1
256 0.11
257 0.12
258 0.16
259 0.19
260 0.18
261 0.17
262 0.19
263 0.2
264 0.2
265 0.19
266 0.13
267 0.1
268 0.1
269 0.12
270 0.1
271 0.16
272 0.19
273 0.22
274 0.26
275 0.32
276 0.32
277 0.38
278 0.43
279 0.39
280 0.41
281 0.38
282 0.34
283 0.33
284 0.32
285 0.25
286 0.2
287 0.19
288 0.14
289 0.15
290 0.17
291 0.14
292 0.18
293 0.2
294 0.26
295 0.25
296 0.27
297 0.28
298 0.27
299 0.26
300 0.23
301 0.21
302 0.18
303 0.18
304 0.16
305 0.14
306 0.14
307 0.16
308 0.18
309 0.25
310 0.27
311 0.36
312 0.39
313 0.43
314 0.42
315 0.43
316 0.42
317 0.41
318 0.38
319 0.32
320 0.29
321 0.26
322 0.28
323 0.24
324 0.24
325 0.18
326 0.16
327 0.12
328 0.15
329 0.15
330 0.14
331 0.16
332 0.18
333 0.23
334 0.22
335 0.23
336 0.22
337 0.2
338 0.18
339 0.15
340 0.12
341 0.07
342 0.07
343 0.06
344 0.05
345 0.04
346 0.04
347 0.05
348 0.06
349 0.07
350 0.07
351 0.08
352 0.08
353 0.11
354 0.17
355 0.22
356 0.25
357 0.29
358 0.35
359 0.43
360 0.52
361 0.55
362 0.55
363 0.53
364 0.53
365 0.49
366 0.44
367 0.36
368 0.27
369 0.2
370 0.15
371 0.11
372 0.07
373 0.06
374 0.04
375 0.06
376 0.06
377 0.06
378 0.08
379 0.09
380 0.15
381 0.18
382 0.19
383 0.19
384 0.23
385 0.29
386 0.34
387 0.38
388 0.38
389 0.37
390 0.4
391 0.43
392 0.42
393 0.37
394 0.33
395 0.31
396 0.33
397 0.37
398 0.34
399 0.3
400 0.28
401 0.26
402 0.25
403 0.22
404 0.16
405 0.12
406 0.13
407 0.13
408 0.12
409 0.12
410 0.12
411 0.12
412 0.1
413 0.1
414 0.08
415 0.07
416 0.07
417 0.06
418 0.06
419 0.05
420 0.05
421 0.05
422 0.04
423 0.04
424 0.04
425 0.04
426 0.04
427 0.04
428 0.06
429 0.07
430 0.07
431 0.08
432 0.11
433 0.11
434 0.11
435 0.12
436 0.11
437 0.17
438 0.19
439 0.2
440 0.22
441 0.29
442 0.37
443 0.44
444 0.49
445 0.5
446 0.56
447 0.57
448 0.57
449 0.58
450 0.57
451 0.56
452 0.55
453 0.49
454 0.43
455 0.4
456 0.35
457 0.27
458 0.2
459 0.15
460 0.1
461 0.1
462 0.08
463 0.07
464 0.07
465 0.07
466 0.07
467 0.05
468 0.05
469 0.04
470 0.04
471 0.04
472 0.04
473 0.05
474 0.06
475 0.07
476 0.08
477 0.08
478 0.09
479 0.09
480 0.11
481 0.11
482 0.11
483 0.12
484 0.12
485 0.12
486 0.11
487 0.1
488 0.08
489 0.09
490 0.09
491 0.08
492 0.08
493 0.07
494 0.07
495 0.09
496 0.13
497 0.13
498 0.13
499 0.15
500 0.15
501 0.15
502 0.16
503 0.14
504 0.11
505 0.09
506 0.08
507 0.06
508 0.05
509 0.05
510 0.04
511 0.04
512 0.04
513 0.04
514 0.07
515 0.07
516 0.09
517 0.09
518 0.1
519 0.11
520 0.11
521 0.12
522 0.11
523 0.19
524 0.24
525 0.28
526 0.29
527 0.29
528 0.29
529 0.28
530 0.27
531 0.2
532 0.15
533 0.14
534 0.13
535 0.14
536 0.14
537 0.14
538 0.15
539 0.15
540 0.13
541 0.1
542 0.11
543 0.1
544 0.1
545 0.09
546 0.07
547 0.06
548 0.06
549 0.06
550 0.04
551 0.05
552 0.04
553 0.04
554 0.06
555 0.09
556 0.09
557 0.11
558 0.12
559 0.12
560 0.12
561 0.12
562 0.1
563 0.09
564 0.09
565 0.07
566 0.06
567 0.06
568 0.05
569 0.06
570 0.05
571 0.04
572 0.05
573 0.05
574 0.07
575 0.07
576 0.08
577 0.09
578 0.1
579 0.09
580 0.09
581 0.09
582 0.11
583 0.12
584 0.12
585 0.11
586 0.12
587 0.12
588 0.12
589 0.13
590 0.1
591 0.12
592 0.13
593 0.12
594 0.11
595 0.15
596 0.15
597 0.16
598 0.16
599 0.14
600 0.15
601 0.17
602 0.24
603 0.28
604 0.35
605 0.37
606 0.44
607 0.5
608 0.49
609 0.49
610 0.43
611 0.37
612 0.39
613 0.36
614 0.35
615 0.3
616 0.29
617 0.27
618 0.28
619 0.26
620 0.18
621 0.16
622 0.11
623 0.1
624 0.1
625 0.1
626 0.08
627 0.08
628 0.09
629 0.1
630 0.1
631 0.09
632 0.1
633 0.1
634 0.11
635 0.11
636 0.11
637 0.08
638 0.11
639 0.13
640 0.13
641 0.14
642 0.13
643 0.14
644 0.12
645 0.15
646 0.12
647 0.1
648 0.11
649 0.14
650 0.15
651 0.17
652 0.18
653 0.16
654 0.17
655 0.16
656 0.18
657 0.19
658 0.2
659 0.18
660 0.17
661 0.15
662 0.15
663 0.14
664 0.14
665 0.12
666 0.1
667 0.09
668 0.1
669 0.11
670 0.1
671 0.1
672 0.08
673 0.07
674 0.07
675 0.07
676 0.07
677 0.07
678 0.08
679 0.08
680 0.07
681 0.07
682 0.07
683 0.09
684 0.12
685 0.12
686 0.13
687 0.15
688 0.2
689 0.2
690 0.21
691 0.26
692 0.23
693 0.24
694 0.23
695 0.23
696 0.17
697 0.16
698 0.15
699 0.09
700 0.1
701 0.08
702 0.08
703 0.1
704 0.1
705 0.1
706 0.11
707 0.1
708 0.09
709 0.09
710 0.09
711 0.06
712 0.05
713 0.05
714 0.05
715 0.06
716 0.06
717 0.06
718 0.06
719 0.06
720 0.06
721 0.09
722 0.08
723 0.08
724 0.08
725 0.1
726 0.1
727 0.11
728 0.13
729 0.13
730 0.13
731 0.14
732 0.13
733 0.11
734 0.11
735 0.11
736 0.09
737 0.08
738 0.09
739 0.09
740 0.1
741 0.11
742 0.11
743 0.11
744 0.12
745 0.13
746 0.14
747 0.13
748 0.13
749 0.17
750 0.19
751 0.19
752 0.19
753 0.19
754 0.18
755 0.18
756 0.17
757 0.13
758 0.11
759 0.11
760 0.09
761 0.06
762 0.05
763 0.05
764 0.06
765 0.06
766 0.07
767 0.07
768 0.08
769 0.09
770 0.11
771 0.11
772 0.1
773 0.09
774 0.08
775 0.08
776 0.08
777 0.07
778 0.04
779 0.07
780 0.09
781 0.15
782 0.18
783 0.22
784 0.27
785 0.33
786 0.37
787 0.37
788 0.42
789 0.42
790 0.46
791 0.5
792 0.48
793 0.46
794 0.43
795 0.41
796 0.35
797 0.29
798 0.23
799 0.16
800 0.14
801 0.09
802 0.08
803 0.09
804 0.09
805 0.09
806 0.1
807 0.12
808 0.12
809 0.12
810 0.13
811 0.15
812 0.15
813 0.15
814 0.15
815 0.11
816 0.11
817 0.1
818 0.1
819 0.08
820 0.09
821 0.11
822 0.11
823 0.11
824 0.12
825 0.11
826 0.11
827 0.1
828 0.08
829 0.06
830 0.06
831 0.04
832 0.04
833 0.04
834 0.04
835 0.04
836 0.04
837 0.06
838 0.06
839 0.08
840 0.1
841 0.11
842 0.12
843 0.13
844 0.15
845 0.14
846 0.15
847 0.21
848 0.2
849 0.21
850 0.21
851 0.23
852 0.23
853 0.25
854 0.29
855 0.31
856 0.32
857 0.35
858 0.43
859 0.49
860 0.52
861 0.52
862 0.47
863 0.43
864 0.47
865 0.47
866 0.38
867 0.28
868 0.25
869 0.22
870 0.21
871 0.16
872 0.11
873 0.07
874 0.06
875 0.06
876 0.06
877 0.05
878 0.06
879 0.06
880 0.06
881 0.06
882 0.06
883 0.06
884 0.06
885 0.05
886 0.05
887 0.05
888 0.04
889 0.04
890 0.05
891 0.06
892 0.07
893 0.07
894 0.08
895 0.08
896 0.09
897 0.09
898 0.1
899 0.09
900 0.1
901 0.11
902 0.11
903 0.13
904 0.12
905 0.13
906 0.13
907 0.12
908 0.11
909 0.11
910 0.11
911 0.11
912 0.12
913 0.11
914 0.1
915 0.12
916 0.12
917 0.14
918 0.17
919 0.23
920 0.24
921 0.27
922 0.28
923 0.26
924 0.27
925 0.25
926 0.24
927 0.19
928 0.17
929 0.14
930 0.14
931 0.15
932 0.15
933 0.18
934 0.21
935 0.25
936 0.28
937 0.34
938 0.37
939 0.42
940 0.41
941 0.37
942 0.35
943 0.34
944 0.36
945 0.29
946 0.26
947 0.2
948 0.19
949 0.2
950 0.17
951 0.13
952 0.1
953 0.1
954 0.1
955 0.11
956 0.12
957 0.12
958 0.16
959 0.14
960 0.15
961 0.18
962 0.17
963 0.19
964 0.21
965 0.22
966 0.18
967 0.17
968 0.16
969 0.13
970 0.14
971 0.11
972 0.1
973 0.08
974 0.11
975 0.11
976 0.11
977 0.12
978 0.17
979 0.19
980 0.2
981 0.19
982 0.19
983 0.21
984 0.21
985 0.2
986 0.15
987 0.12
988 0.13
989 0.13
990 0.11
991 0.09
992 0.09
993 0.08
994 0.11
995 0.18
996 0.18
997 0.19
998 0.24
999 0.27
1000 0.29
1001 0.31
1002 0.34
1003 0.29
1004 0.28
1005 0.3
1006 0.26
1007 0.23
1008 0.22
1009 0.2
1010 0.14
1011 0.11
1012 0.11
1013 0.12
1014 0.14
1015 0.13
1016 0.14
1017 0.18
1018 0.2
1019 0.22
1020 0.25
1021 0.24
1022 0.23
1023 0.23
1024 0.22
1025 0.19
1026 0.17
1027 0.15
1028 0.12
1029 0.09
1030 0.07
1031 0.07
1032 0.06
1033 0.05
1034 0.05
1035 0.04
1036 0.04
1037 0.04
1038 0.04
1039 0.05
1040 0.05
1041 0.05
1042 0.05
1043 0.08
1044 0.1
1045 0.16
1046 0.23
1047 0.26
1048 0.3
1049 0.36
1050 0.43
1051 0.43
1052 0.48
1053 0.52
1054 0.54
1055 0.52
1056 0.55
1057 0.57
1058 0.54
1059 0.53
1060 0.47
1061 0.39
1062 0.29
1063 0.3
1064 0.24
1065 0.15
1066 0.11
1067 0.1
1068 0.1
1069 0.1
1070 0.1
1071 0.08
1072 0.08
1073 0.09
1074 0.09
1075 0.08
1076 0.07
1077 0.06
1078 0.08
1079 0.08
1080 0.08
1081 0.07
1082 0.07
1083 0.09
1084 0.1
1085 0.17
1086 0.17
1087 0.17
1088 0.21
1089 0.27
1090 0.29
1091 0.31
1092 0.33
1093 0.32
1094 0.4
1095 0.47
1096 0.45
1097 0.42
1098 0.48
1099 0.49
1100 0.53
1101 0.52
1102 0.51
1103 0.52
1104 0.56
1105 0.54
1106 0.56
1107 0.56
1108 0.52
1109 0.53
1110 0.46
1111 0.41
1112 0.38
1113 0.36
1114 0.27
1115 0.21
1116 0.18
1117 0.13
1118 0.11
1119 0.08
1120 0.07
1121 0.07
1122 0.08
1123 0.1
1124 0.1
1125 0.12
1126 0.15
1127 0.18
1128 0.22
1129 0.24
1130 0.27
1131 0.28
1132 0.29
1133 0.31
1134 0.35
1135 0.37
1136 0.33
1137 0.33
1138 0.29
1139 0.34
1140 0.4
1141 0.41
1142 0.34
1143 0.31
1144 0.29
1145 0.31
1146 0.35
1147 0.3
1148 0.24
1149 0.23
1150 0.28
1151 0.34
1152 0.38
1153 0.36
1154 0.38
1155 0.43
1156 0.48
1157 0.52
1158 0.48
1159 0.4
1160 0.39
1161 0.39
1162 0.38
1163 0.31
1164 0.25
1165 0.17
1166 0.2
1167 0.21
1168 0.22
1169 0.19
1170 0.21
1171 0.26
1172 0.28
1173 0.34
1174 0.31
1175 0.34
1176 0.39
1177 0.43
1178 0.42
1179 0.39
1180 0.39
1181 0.39
1182 0.46
1183 0.48
1184 0.43
1185 0.41
1186 0.39
1187 0.38
1188 0.36
1189 0.35
1190 0.31
1191 0.31