Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4S4LGM3

Protein Details
Accession A0A4S4LGM3    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
360-382SQDEHPRKKRKLAKEEPRAPKVKBasic
528-549DAVAGGKRRRKKGETEKKGFYABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
365-390PRKKRKLAKEEPRAPKVKPLPFPPLR
524-585KSKSDAVAGGKRRRKKGETEKKGFYAFQVHEKKRKELMDLKRKWEEDKAKVEKLKASRKFKP
Subcellular Location(s) cyto 19.5, cyto_nucl 13, nucl 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036291  NAD(P)-bd_dom_sf  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR040447  RRM_Rrp7  
IPR024326  RRP7_C  
IPR002347  SDR_fam  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00106  adh_short  
PF17799  RRM_Rrp7  
PF12923  RRP7  
CDD cd12950  RRP7_Rrp7p  
cd05233  SDR_c  
Amino Acid Sequences MSNEQFEIKSLFNVKDWVCVVSGGGTGIGLMITQAFANNGARVYILGRREEVLKRTADKYGSSLLHPNGKIIPVQCDITSKESIEQMVQHIEWKETHRGGEGDESAEALRDELFSEKIEDWELVYRTNVIGHFTTVGLIPLLAKAAKSKPTHTGTVINISSLYLCDHLLAQELRHKAVNVRVNSIAPGIFPSEMTRGSDDANKSEIEWSGFGEKKGIPAGRPGRDVDMAQAILMLACNQYAYGQASAFHLENVMGVEVLPVTYSSTSHHVLYIRPHAGSSKNSKGQGRELPDGRTLFIVNVPPDATERELVLLFKSCGTIEKVLFDSNSGPASDEQEEESGEEGSDGELDEDDEMDSDASQDEHPRKKRKLAKEEPRAPKVKPLPFPPLRTLRKTGRTAHVIFLDPSSLSRALALSKPQKSSAAPQARPWPTSRESPLGLAHYAALYDALRPPLDAVRAHADTYIESFDFMLAQKKRALQAESKYRKGEAIVDEEGFTLVTRGGAYGQAVGGGVAVASKKFLAKSKSDAVAGGKRRRKKGETEKKGFYAFQVHEKKRKELMDLKRKWEEDKAKVEKLKASRKFKPY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.31
3 0.31
4 0.28
5 0.24
6 0.23
7 0.21
8 0.17
9 0.17
10 0.11
11 0.1
12 0.08
13 0.07
14 0.07
15 0.06
16 0.04
17 0.04
18 0.03
19 0.04
20 0.04
21 0.05
22 0.05
23 0.07
24 0.09
25 0.11
26 0.11
27 0.11
28 0.11
29 0.11
30 0.13
31 0.16
32 0.18
33 0.19
34 0.2
35 0.22
36 0.27
37 0.32
38 0.33
39 0.33
40 0.34
41 0.37
42 0.38
43 0.42
44 0.38
45 0.35
46 0.34
47 0.36
48 0.33
49 0.32
50 0.35
51 0.34
52 0.4
53 0.38
54 0.37
55 0.32
56 0.31
57 0.32
58 0.27
59 0.29
60 0.23
61 0.25
62 0.24
63 0.25
64 0.26
65 0.28
66 0.28
67 0.24
68 0.23
69 0.23
70 0.24
71 0.22
72 0.2
73 0.18
74 0.2
75 0.19
76 0.21
77 0.2
78 0.21
79 0.22
80 0.25
81 0.3
82 0.28
83 0.29
84 0.28
85 0.27
86 0.27
87 0.29
88 0.26
89 0.2
90 0.18
91 0.18
92 0.15
93 0.15
94 0.13
95 0.08
96 0.07
97 0.06
98 0.07
99 0.08
100 0.09
101 0.09
102 0.12
103 0.13
104 0.13
105 0.14
106 0.13
107 0.13
108 0.17
109 0.17
110 0.15
111 0.15
112 0.15
113 0.14
114 0.16
115 0.15
116 0.13
117 0.13
118 0.13
119 0.13
120 0.13
121 0.13
122 0.11
123 0.11
124 0.08
125 0.07
126 0.06
127 0.05
128 0.07
129 0.06
130 0.06
131 0.1
132 0.13
133 0.21
134 0.23
135 0.26
136 0.33
137 0.37
138 0.4
139 0.39
140 0.41
141 0.35
142 0.41
143 0.38
144 0.3
145 0.25
146 0.22
147 0.2
148 0.15
149 0.14
150 0.07
151 0.07
152 0.07
153 0.07
154 0.07
155 0.11
156 0.11
157 0.11
158 0.16
159 0.17
160 0.18
161 0.19
162 0.2
163 0.18
164 0.25
165 0.31
166 0.27
167 0.3
168 0.3
169 0.29
170 0.29
171 0.27
172 0.2
173 0.13
174 0.12
175 0.1
176 0.08
177 0.08
178 0.09
179 0.1
180 0.11
181 0.12
182 0.13
183 0.12
184 0.13
185 0.18
186 0.17
187 0.17
188 0.18
189 0.17
190 0.16
191 0.16
192 0.16
193 0.13
194 0.12
195 0.11
196 0.15
197 0.17
198 0.16
199 0.17
200 0.16
201 0.17
202 0.21
203 0.21
204 0.15
205 0.23
206 0.3
207 0.3
208 0.33
209 0.32
210 0.3
211 0.31
212 0.3
213 0.23
214 0.19
215 0.15
216 0.13
217 0.12
218 0.09
219 0.07
220 0.07
221 0.06
222 0.03
223 0.03
224 0.03
225 0.03
226 0.03
227 0.05
228 0.06
229 0.07
230 0.07
231 0.07
232 0.08
233 0.1
234 0.1
235 0.09
236 0.08
237 0.07
238 0.07
239 0.07
240 0.06
241 0.04
242 0.04
243 0.04
244 0.03
245 0.03
246 0.03
247 0.03
248 0.03
249 0.04
250 0.04
251 0.06
252 0.09
253 0.11
254 0.11
255 0.13
256 0.13
257 0.15
258 0.18
259 0.22
260 0.2
261 0.19
262 0.19
263 0.19
264 0.2
265 0.23
266 0.26
267 0.27
268 0.3
269 0.34
270 0.36
271 0.36
272 0.39
273 0.4
274 0.38
275 0.37
276 0.34
277 0.33
278 0.34
279 0.33
280 0.28
281 0.23
282 0.18
283 0.13
284 0.12
285 0.13
286 0.09
287 0.09
288 0.09
289 0.09
290 0.09
291 0.1
292 0.1
293 0.08
294 0.08
295 0.08
296 0.08
297 0.08
298 0.08
299 0.08
300 0.08
301 0.07
302 0.08
303 0.07
304 0.08
305 0.1
306 0.12
307 0.11
308 0.13
309 0.13
310 0.14
311 0.14
312 0.13
313 0.11
314 0.1
315 0.11
316 0.09
317 0.09
318 0.09
319 0.12
320 0.12
321 0.11
322 0.11
323 0.11
324 0.11
325 0.1
326 0.1
327 0.07
328 0.06
329 0.06
330 0.05
331 0.04
332 0.04
333 0.04
334 0.04
335 0.03
336 0.04
337 0.04
338 0.04
339 0.04
340 0.04
341 0.04
342 0.04
343 0.04
344 0.04
345 0.04
346 0.05
347 0.05
348 0.1
349 0.16
350 0.24
351 0.33
352 0.41
353 0.45
354 0.54
355 0.62
356 0.68
357 0.73
358 0.76
359 0.79
360 0.82
361 0.88
362 0.88
363 0.86
364 0.79
365 0.68
366 0.66
367 0.64
368 0.6
369 0.55
370 0.52
371 0.54
372 0.56
373 0.6
374 0.58
375 0.6
376 0.58
377 0.57
378 0.58
379 0.56
380 0.59
381 0.6
382 0.59
383 0.56
384 0.57
385 0.54
386 0.51
387 0.46
388 0.39
389 0.34
390 0.28
391 0.22
392 0.16
393 0.14
394 0.14
395 0.12
396 0.1
397 0.1
398 0.1
399 0.11
400 0.13
401 0.2
402 0.25
403 0.29
404 0.31
405 0.32
406 0.34
407 0.33
408 0.38
409 0.41
410 0.43
411 0.4
412 0.43
413 0.52
414 0.53
415 0.53
416 0.49
417 0.45
418 0.38
419 0.43
420 0.43
421 0.37
422 0.35
423 0.36
424 0.36
425 0.32
426 0.29
427 0.23
428 0.18
429 0.14
430 0.12
431 0.1
432 0.08
433 0.06
434 0.07
435 0.09
436 0.1
437 0.1
438 0.1
439 0.12
440 0.13
441 0.16
442 0.15
443 0.16
444 0.21
445 0.22
446 0.23
447 0.22
448 0.2
449 0.18
450 0.19
451 0.18
452 0.11
453 0.11
454 0.1
455 0.09
456 0.1
457 0.1
458 0.17
459 0.16
460 0.19
461 0.22
462 0.25
463 0.29
464 0.33
465 0.36
466 0.35
467 0.43
468 0.52
469 0.56
470 0.59
471 0.56
472 0.52
473 0.49
474 0.44
475 0.41
476 0.33
477 0.32
478 0.29
479 0.28
480 0.27
481 0.26
482 0.25
483 0.19
484 0.15
485 0.09
486 0.06
487 0.06
488 0.05
489 0.06
490 0.06
491 0.07
492 0.08
493 0.08
494 0.08
495 0.08
496 0.07
497 0.07
498 0.06
499 0.05
500 0.04
501 0.04
502 0.05
503 0.05
504 0.06
505 0.06
506 0.09
507 0.12
508 0.18
509 0.23
510 0.26
511 0.33
512 0.4
513 0.43
514 0.42
515 0.42
516 0.41
517 0.45
518 0.5
519 0.53
520 0.54
521 0.58
522 0.66
523 0.73
524 0.72
525 0.75
526 0.77
527 0.79
528 0.82
529 0.83
530 0.82
531 0.77
532 0.76
533 0.65
534 0.56
535 0.54
536 0.45
537 0.46
538 0.49
539 0.52
540 0.57
541 0.61
542 0.65
543 0.64
544 0.65
545 0.63
546 0.62
547 0.66
548 0.68
549 0.71
550 0.73
551 0.74
552 0.73
553 0.68
554 0.69
555 0.67
556 0.65
557 0.68
558 0.68
559 0.68
560 0.71
561 0.71
562 0.68
563 0.68
564 0.7
565 0.69
566 0.71