FuNGI

A0A4S4LHJ1

Protein Details

Accession

A0A4S4LHJ1

Localization Confidence

High

Confidence Score

19.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
3-26	DAPIIFKRTKSKHTQKAREGILDT	Hydrophilic
40-66	SPSTLATKLKNKAKQRTKPKSTLSFGG	Hydrophilic
453-480	AARRDRQSARHARRSRRQQSRRQGSQEV	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
242-254	GKKARKAEASKRR
458-469	RQSARHARRSRR

Subcellular Location(s)

nucl 15, cyto_nucl 10, mito 7, cyto 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012890 GCFC2-like
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0000398 P:mRNA splicing, via spliceosome
Pfam	View protein in Pfam PF15458 NTR2

Amino Acid Sequences

MSDAPIIFKRTKSKHTQKAREGILDTTQDTADVANNDEPSPSTLATKLKNKAKQRTKPKSTLSFGGEDEGEVEVFKVKKSRLSRKLTLGQHPPSPGGIPSNLDQATISTQPGGGPVYDQAYLSELKASTPSARAPRPPADDVYDVDVSMTELNAVEINNTLGGIETVIPSESSVLAAKEKRERLRVTESSGEDFISLSLTKRDEVYQGPHPESRLVREEDELGEGDDEFSEFTSAQERIALGKKARKAEASKRRDAMKELIADAEEVDEETEEWEQEQLRRGGLKAVESAAQKPLKQVYKPAPIPPLTPIPTLDPAVARITQVMTSLTQSHAQNTVSVAAIAAEQVQLDEREAELRELITKAELKRSWFAAFRDWVESVATFLDEKVFPLLEGLEEEHVSLLKERLDMINRRRRADDEDDLSSFLGSPPVAPHTEPEELDELGRIIAHSNPTAARRDRQSARHARRSRRQQSRRQGSQEVEEGYSTDSTLPPSDAADYQTALEKLLKKRDNVLSDVQAEEFKDPTLGIGKWFDEWRARFGDSYTGAWGGLGLVGAWEFWVRLELIGWSPFEDSRSLDSFSWYEAFYKYSRPRHPEGGLENEEADLGPDGDLVSAVISTTVIPRLATIIQGGGMDPYSAIDVRRIIDLAEEIEASVDRNSLKYQILLKAVYHCFQEAVTETDSLEKKHRALNNPRFDPEAIPSRRRFLSRQRKLLSNLLRWKKYAGELFGLGELSARLVQECMLPAAESGWEVGGEAIMRKVIV

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.71
2	0.8
3	0.86
4	0.85
5	0.88
6	0.85
7	0.8
8	0.72
9	0.64
10	0.58
11	0.51
12	0.42
13	0.35
14	0.28
15	0.22
16	0.19
17	0.17
18	0.15
19	0.13
20	0.15
21	0.17
22	0.18
23	0.18
24	0.19
25	0.19
26	0.19
27	0.21
28	0.18
29	0.17
30	0.19
31	0.25
32	0.31
33	0.39
34	0.45
35	0.51
36	0.59
37	0.67
38	0.74
39	0.8
40	0.83
41	0.86
42	0.88
43	0.89
44	0.9
45	0.9
46	0.88
47	0.83
48	0.8
49	0.73
50	0.65
51	0.56
52	0.49
53	0.39
54	0.3
55	0.25
56	0.18
57	0.14
58	0.1
59	0.09
60	0.11
61	0.11
62	0.13
63	0.17
64	0.18
65	0.27
66	0.37
67	0.47
68	0.53
69	0.62
70	0.67
71	0.71
72	0.79
73	0.79
74	0.78
75	0.76
76	0.71
77	0.67
78	0.62
79	0.53
80	0.46
81	0.39
82	0.32
83	0.26
84	0.22
85	0.2
86	0.19
87	0.25
88	0.23
89	0.22
90	0.21
91	0.19
92	0.21
93	0.19
94	0.19
95	0.12
96	0.12
97	0.12
98	0.13
99	0.13
100	0.09
101	0.09
102	0.1
103	0.12
104	0.12
105	0.12
106	0.11
107	0.12
108	0.13
109	0.12
110	0.14
111	0.12
112	0.12
113	0.13
114	0.14
115	0.15
116	0.16
117	0.22
118	0.26
119	0.3
120	0.35
121	0.4
122	0.46
123	0.5
124	0.51
125	0.48
126	0.45
127	0.43
128	0.4
129	0.39
130	0.32
131	0.25
132	0.22
133	0.19
134	0.14
135	0.12
136	0.1
137	0.05
138	0.05
139	0.05
140	0.06
141	0.06
142	0.06
143	0.06
144	0.07
145	0.06
146	0.06
147	0.06
148	0.05
149	0.05
150	0.05
151	0.05
152	0.05
153	0.06
154	0.06
155	0.06
156	0.06
157	0.07
158	0.06
159	0.07
160	0.08
161	0.08
162	0.12
163	0.15
164	0.19
165	0.26
166	0.33
167	0.38
168	0.44
169	0.46
170	0.48
171	0.55
172	0.54
173	0.52
174	0.52
175	0.49
176	0.44
177	0.42
178	0.36
179	0.26
180	0.23
181	0.17
182	0.12
183	0.1
184	0.08
185	0.1
186	0.11
187	0.11
188	0.13
189	0.14
190	0.15
191	0.17
192	0.21
193	0.27
194	0.31
195	0.34
196	0.34
197	0.34
198	0.36
199	0.34
200	0.34
201	0.31
202	0.29
203	0.27
204	0.27
205	0.27
206	0.23
207	0.24
208	0.19
209	0.14
210	0.11
211	0.1
212	0.09
213	0.07
214	0.06
215	0.05
216	0.05
217	0.05
218	0.05
219	0.05
220	0.08
221	0.08
222	0.08
223	0.1
224	0.1
225	0.12
226	0.16
227	0.2
228	0.21
229	0.26
230	0.31
231	0.34
232	0.36
233	0.39
234	0.42
235	0.49
236	0.55
237	0.58
238	0.6
239	0.59
240	0.62
241	0.58
242	0.55
243	0.49
244	0.44
245	0.38
246	0.32
247	0.28
248	0.23
249	0.21
250	0.17
251	0.13
252	0.07
253	0.05
254	0.05
255	0.04
256	0.04
257	0.05
258	0.05
259	0.04
260	0.05
261	0.06
262	0.07
263	0.08
264	0.13
265	0.13
266	0.14
267	0.15
268	0.15
269	0.18
270	0.18
271	0.18
272	0.14
273	0.14
274	0.17
275	0.17
276	0.18
277	0.21
278	0.21
279	0.2
280	0.21
281	0.27
282	0.27
283	0.27
284	0.32
285	0.34
286	0.42
287	0.44
288	0.46
289	0.45
290	0.41
291	0.42
292	0.38
293	0.36
294	0.29
295	0.28
296	0.25
297	0.22
298	0.23
299	0.23
300	0.2
301	0.14
302	0.13
303	0.14
304	0.14
305	0.11
306	0.09
307	0.09
308	0.09
309	0.09
310	0.08
311	0.07
312	0.08
313	0.09
314	0.09
315	0.13
316	0.13
317	0.14
318	0.15
319	0.15
320	0.14
321	0.14
322	0.14
323	0.1
324	0.09
325	0.08
326	0.06
327	0.05
328	0.05
329	0.04
330	0.03
331	0.03
332	0.03
333	0.04
334	0.04
335	0.04
336	0.05
337	0.04
338	0.06
339	0.07
340	0.07
341	0.06
342	0.06
343	0.07
344	0.07
345	0.07
346	0.07
347	0.1
348	0.11
349	0.17
350	0.18
351	0.19
352	0.21
353	0.23
354	0.24
355	0.23
356	0.24
357	0.22
358	0.22
359	0.21
360	0.22
361	0.2
362	0.18
363	0.16
364	0.14
365	0.11
366	0.09
367	0.08
368	0.05
369	0.05
370	0.06
371	0.06
372	0.06
373	0.06
374	0.06
375	0.05
376	0.06
377	0.06
378	0.04
379	0.05
380	0.05
381	0.05
382	0.05
383	0.05
384	0.05
385	0.05
386	0.05
387	0.05
388	0.06
389	0.06
390	0.06
391	0.07
392	0.09
393	0.13
394	0.19
395	0.28
396	0.36
397	0.39
398	0.41
399	0.42
400	0.42
401	0.43
402	0.44
403	0.4
404	0.35
405	0.34
406	0.33
407	0.32
408	0.29
409	0.23
410	0.16
411	0.11
412	0.08
413	0.05
414	0.05
415	0.05
416	0.08
417	0.08
418	0.08
419	0.09
420	0.13
421	0.15
422	0.15
423	0.16
424	0.15
425	0.15
426	0.15
427	0.14
428	0.09
429	0.07
430	0.07
431	0.05
432	0.05
433	0.06
434	0.07
435	0.07
436	0.08
437	0.1
438	0.12
439	0.17
440	0.19
441	0.21
442	0.23
443	0.31
444	0.35
445	0.39
446	0.47
447	0.53
448	0.6
449	0.67
450	0.71
451	0.73
452	0.77
453	0.83
454	0.83
455	0.84
456	0.84
457	0.84
458	0.87
459	0.89
460	0.88
461	0.83
462	0.77
463	0.68
464	0.62
465	0.55
466	0.46
467	0.36
468	0.27
469	0.21
470	0.17
471	0.15
472	0.12
473	0.09
474	0.07
475	0.08
476	0.08
477	0.08
478	0.07
479	0.08
480	0.09
481	0.09
482	0.11
483	0.11
484	0.1
485	0.1
486	0.13
487	0.12
488	0.12
489	0.14
490	0.18
491	0.22
492	0.31
493	0.34
494	0.32
495	0.4
496	0.46
497	0.46
498	0.44
499	0.43
500	0.37
501	0.35
502	0.35
503	0.28
504	0.23
505	0.2
506	0.17
507	0.14
508	0.1
509	0.09
510	0.08
511	0.08
512	0.11
513	0.1
514	0.11
515	0.12
516	0.13
517	0.14
518	0.15
519	0.17
520	0.2
521	0.21
522	0.23
523	0.24
524	0.24
525	0.23
526	0.23
527	0.27
528	0.22
529	0.22
530	0.2
531	0.17
532	0.16
533	0.15
534	0.14
535	0.08
536	0.06
537	0.05
538	0.03
539	0.03
540	0.03
541	0.03
542	0.03
543	0.03
544	0.03
545	0.03
546	0.05
547	0.05
548	0.05
549	0.06
550	0.07
551	0.09
552	0.1
553	0.11
554	0.1
555	0.11
556	0.12
557	0.13
558	0.13
559	0.12
560	0.15
561	0.17
562	0.19
563	0.18
564	0.2
565	0.19
566	0.2
567	0.2
568	0.16
569	0.15
570	0.13
571	0.15
572	0.14
573	0.22
574	0.29
575	0.37
576	0.44
577	0.49
578	0.54
579	0.59
580	0.61
581	0.59
582	0.55
583	0.55
584	0.51
585	0.45
586	0.4
587	0.33
588	0.3
589	0.23
590	0.18
591	0.1
592	0.07
593	0.06
594	0.05
595	0.05
596	0.05
597	0.05
598	0.05
599	0.04
600	0.03
601	0.03
602	0.03
603	0.04
604	0.04
605	0.06
606	0.07
607	0.08
608	0.08
609	0.08
610	0.1
611	0.11
612	0.11
613	0.1
614	0.09
615	0.09
616	0.09
617	0.09
618	0.07
619	0.07
620	0.07
621	0.06
622	0.06
623	0.07
624	0.07
625	0.08
626	0.09
627	0.11
628	0.12
629	0.13
630	0.13
631	0.12
632	0.12
633	0.13
634	0.11
635	0.11
636	0.1
637	0.08
638	0.09
639	0.09
640	0.09
641	0.08
642	0.08
643	0.08
644	0.09
645	0.11
646	0.13
647	0.14
648	0.17
649	0.21
650	0.25
651	0.28
652	0.28
653	0.28
654	0.33
655	0.35
656	0.34
657	0.3
658	0.26
659	0.23
660	0.21
661	0.22
662	0.17
663	0.17
664	0.17
665	0.16
666	0.16
667	0.22
668	0.24
669	0.23
670	0.27
671	0.27
672	0.28
673	0.35
674	0.42
675	0.45
676	0.55
677	0.64
678	0.68
679	0.7
680	0.7
681	0.67
682	0.61
683	0.54
684	0.48
685	0.48
686	0.44
687	0.46
688	0.46
689	0.49
690	0.52
691	0.53
692	0.54
693	0.55
694	0.6
695	0.63
696	0.71
697	0.7
698	0.73
699	0.74
700	0.77
701	0.75
702	0.74
703	0.74
704	0.73
705	0.71
706	0.65
707	0.62
708	0.57
709	0.55
710	0.51
711	0.45
712	0.39
713	0.37
714	0.37
715	0.35
716	0.31
717	0.23
718	0.17
719	0.13
720	0.11
721	0.1
722	0.09
723	0.09
724	0.09
725	0.1
726	0.11
727	0.13
728	0.13
729	0.12
730	0.12
731	0.12
732	0.12
733	0.12
734	0.1
735	0.09
736	0.08
737	0.07
738	0.07
739	0.07
740	0.07
741	0.07
742	0.08
743	0.08

A0A4S4LHJ1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer