FuNGI

C5FF33

Protein Details

Accession

C5FF33

Localization Confidence

Low

Confidence Score

6.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
96-123	SSIKSDIQRWKGQRKKRNDEADQKNDEK	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

cyto 9.5, cyto_nucl 7, mito 5, nucl 3.5, E.R. 3, golg 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR014801 Mediator_Med5_fun
Gene Ontology	GO:0016592 C:mediator complex GO:0003712 F:transcription coregulator activity GO:0006357 P:regulation of transcription by RNA polymerase II
Pfam	View protein in Pfam PF08689 Med5

Amino Acid Sequences

MVTLPNLLSGVPKPEWRKLLQQCVIQRINSDEFQELARVMLRRYPIANKDLVDIILESRAVTDFDWDPLIPDYVDAVHKLAHIDISNILLSLLTHSSIKSDIQRWKGQRKKRNDEADQKNDEKEALGSVIAKGPATLLTDYGIIQNVITAVTTGYAPKTALGFMNTCSAIAEWILTLVSWNTHAGSERGEGGGGQLLSSPDVVSIFVAVGFLFGALAGTETGANALSFQNADTFKHQRMKLAQALTAYAPLCAEISIPLRNRLDQLQKEFNLFAKGEKSNQDHVMEEINVSTLEFESRVVDIPPLVGRPLIDDNVLINYLNNRYGGNHMALVEELITASFDVLSNGMYRNEPQQTMFLFRAFLVNKLPPFLSDLAGSVVEPIPVELCITRALARVDPNTFPSFSEIFSTHGNSVLSDVRQEFLFSCALHKLIPESSIERLLGENPMQTLPNGGRFVKHDLVSQINNNPERAEQLINGIESMDGNARAIVEAISEVMHNMCLRKDTMTLKSICNSLSRKPQALDIMLLFKSPLAILQPLCALLDSWKWEEDQGESQPVYDEFGSVLLLVLAFKYKYDLSYQDLGVYNPDSFMCRLLEKGASSQKLEDLTEKQTQNLGAWITALFIAEGISDESMSSCSPQKFYLLVATLFSQSLSACEAGKLEFDTLKGGFEYLLEPFLLPSLVMALSWIGKHMWKSGTDLTTTLKLLSTLVKPSSISGEAQEIHHTVLSITARALGDELKTAKARHPSRTDIEPILQALEPYQSFQRAGTSNRAELEGWRSNSAPGGMVTGIRNTFSSLVLWSTDPEISMTPPSYTHRQLLAGLKHLGSVRVLAGILEELKLQSETGSGDLAIDIAATLICAPMREYFSLEQATYQSVGGGLKDSLPRCQVLNLRDALNLQRESLAKVIESEPHRAELIVRLARRVDTLTSIPQMPQTVDNIDVGNIMADMDLTGVEDDGQMQLDVTEQPKQQLQQQQNQITTGTGASPASLDAILDAAAAEAVTGPPAGNEATMGQPDMDTSIFDDMLNPADMGVGNPEFIDLDMEGMF

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.39
2	0.44
3	0.46
4	0.55
5	0.58
6	0.66
7	0.65
8	0.67
9	0.66
10	0.7
11	0.7
12	0.61
13	0.54
14	0.49
15	0.48
16	0.42
17	0.38
18	0.3
19	0.27
20	0.27
21	0.26
22	0.2
23	0.16
24	0.18
25	0.17
26	0.16
27	0.2
28	0.21
29	0.23
30	0.27
31	0.34
32	0.36
33	0.39
34	0.42
35	0.39
36	0.39
37	0.38
38	0.34
39	0.27
40	0.21
41	0.18
42	0.15
43	0.14
44	0.11
45	0.1
46	0.11
47	0.1
48	0.1
49	0.13
50	0.12
51	0.14
52	0.16
53	0.15
54	0.16
55	0.17
56	0.19
57	0.14
58	0.13
59	0.13
60	0.13
61	0.14
62	0.14
63	0.13
64	0.12
65	0.13
66	0.14
67	0.13
68	0.14
69	0.13
70	0.14
71	0.14
72	0.15
73	0.14
74	0.13
75	0.13
76	0.09
77	0.09
78	0.1
79	0.1
80	0.09
81	0.1
82	0.1
83	0.11
84	0.13
85	0.16
86	0.2
87	0.26
88	0.33
89	0.4
90	0.49
91	0.56
92	0.66
93	0.71
94	0.76
95	0.78
96	0.81
97	0.84
98	0.85
99	0.88
100	0.87
101	0.89
102	0.89
103	0.89
104	0.86
105	0.79
106	0.7
107	0.6
108	0.51
109	0.41
110	0.31
111	0.22
112	0.15
113	0.12
114	0.12
115	0.12
116	0.15
117	0.14
118	0.13
119	0.11
120	0.11
121	0.12
122	0.14
123	0.13
124	0.1
125	0.11
126	0.11
127	0.12
128	0.13
129	0.12
130	0.09
131	0.09
132	0.09
133	0.08
134	0.07
135	0.07
136	0.06
137	0.05
138	0.05
139	0.06
140	0.07
141	0.07
142	0.08
143	0.08
144	0.09
145	0.1
146	0.11
147	0.12
148	0.14
149	0.14
150	0.14
151	0.19
152	0.18
153	0.17
154	0.16
155	0.15
156	0.12
157	0.11
158	0.1
159	0.05
160	0.06
161	0.06
162	0.05
163	0.06
164	0.05
165	0.06
166	0.07
167	0.08
168	0.08
169	0.09
170	0.11
171	0.11
172	0.13
173	0.14
174	0.14
175	0.13
176	0.12
177	0.11
178	0.11
179	0.13
180	0.11
181	0.09
182	0.09
183	0.1
184	0.1
185	0.1
186	0.1
187	0.06
188	0.07
189	0.07
190	0.06
191	0.06
192	0.05
193	0.05
194	0.05
195	0.04
196	0.04
197	0.04
198	0.04
199	0.03
200	0.03
201	0.03
202	0.03
203	0.03
204	0.03
205	0.04
206	0.04
207	0.04
208	0.05
209	0.05
210	0.05
211	0.05
212	0.06
213	0.06
214	0.06
215	0.07
216	0.11
217	0.12
218	0.14
219	0.19
220	0.23
221	0.28
222	0.36
223	0.36
224	0.38
225	0.42
226	0.47
227	0.48
228	0.46
229	0.42
230	0.34
231	0.35
232	0.29
233	0.28
234	0.21
235	0.15
236	0.12
237	0.1
238	0.1
239	0.08
240	0.08
241	0.07
242	0.1
243	0.15
244	0.17
245	0.22
246	0.23
247	0.24
248	0.26
249	0.3
250	0.36
251	0.37
252	0.42
253	0.45
254	0.45
255	0.46
256	0.45
257	0.41
258	0.35
259	0.3
260	0.24
261	0.22
262	0.22
263	0.23
264	0.29
265	0.32
266	0.33
267	0.36
268	0.36
269	0.31
270	0.3
271	0.3
272	0.24
273	0.2
274	0.15
275	0.11
276	0.1
277	0.09
278	0.08
279	0.05
280	0.06
281	0.06
282	0.06
283	0.07
284	0.07
285	0.08
286	0.08
287	0.08
288	0.08
289	0.09
290	0.1
291	0.09
292	0.09
293	0.08
294	0.08
295	0.11
296	0.13
297	0.13
298	0.12
299	0.11
300	0.12
301	0.13
302	0.13
303	0.1
304	0.08
305	0.09
306	0.1
307	0.11
308	0.11
309	0.1
310	0.11
311	0.14
312	0.16
313	0.14
314	0.14
315	0.13
316	0.13
317	0.12
318	0.11
319	0.09
320	0.06
321	0.05
322	0.04
323	0.04
324	0.03
325	0.03
326	0.04
327	0.03
328	0.04
329	0.04
330	0.05
331	0.05
332	0.07
333	0.08
334	0.08
335	0.09
336	0.14
337	0.16
338	0.17
339	0.17
340	0.19
341	0.19
342	0.23
343	0.23
344	0.18
345	0.16
346	0.15
347	0.2
348	0.17
349	0.17
350	0.16
351	0.18
352	0.18
353	0.19
354	0.19
355	0.14
356	0.17
357	0.17
358	0.15
359	0.12
360	0.12
361	0.12
362	0.12
363	0.11
364	0.09
365	0.08
366	0.07
367	0.07
368	0.06
369	0.05
370	0.05
371	0.06
372	0.04
373	0.05
374	0.06
375	0.07
376	0.08
377	0.1
378	0.11
379	0.13
380	0.16
381	0.17
382	0.19
383	0.19
384	0.22
385	0.21
386	0.2
387	0.19
388	0.2
389	0.18
390	0.16
391	0.17
392	0.14
393	0.14
394	0.15
395	0.17
396	0.13
397	0.15
398	0.14
399	0.12
400	0.13
401	0.13
402	0.12
403	0.11
404	0.11
405	0.1
406	0.1
407	0.11
408	0.09
409	0.09
410	0.1
411	0.09
412	0.1
413	0.1
414	0.11
415	0.1
416	0.1
417	0.1
418	0.09
419	0.1
420	0.1
421	0.11
422	0.12
423	0.13
424	0.13
425	0.11
426	0.11
427	0.11
428	0.11
429	0.1
430	0.09
431	0.09
432	0.09
433	0.09
434	0.09
435	0.1
436	0.09
437	0.13
438	0.14
439	0.13
440	0.14
441	0.16
442	0.22
443	0.23
444	0.23
445	0.2
446	0.2
447	0.23
448	0.24
449	0.24
450	0.22
451	0.24
452	0.24
453	0.23
454	0.21
455	0.18
456	0.18
457	0.18
458	0.15
459	0.1
460	0.12
461	0.12
462	0.12
463	0.11
464	0.1
465	0.08
466	0.07
467	0.07
468	0.05
469	0.04
470	0.05
471	0.05
472	0.05
473	0.05
474	0.05
475	0.04
476	0.03
477	0.03
478	0.03
479	0.04
480	0.03
481	0.04
482	0.04
483	0.04
484	0.05
485	0.05
486	0.05
487	0.06
488	0.07
489	0.08
490	0.11
491	0.14
492	0.17
493	0.22
494	0.23
495	0.23
496	0.24
497	0.24
498	0.22
499	0.23
500	0.22
501	0.21
502	0.28
503	0.3
504	0.3
505	0.3
506	0.31
507	0.29
508	0.27
509	0.24
510	0.15
511	0.16
512	0.14
513	0.13
514	0.11
515	0.08
516	0.08
517	0.06
518	0.06
519	0.04
520	0.06
521	0.06
522	0.07
523	0.07
524	0.07
525	0.07
526	0.07
527	0.06
528	0.05
529	0.07
530	0.08
531	0.09
532	0.09
533	0.1
534	0.1
535	0.11
536	0.12
537	0.13
538	0.12
539	0.14
540	0.13
541	0.13
542	0.13
543	0.12
544	0.12
545	0.09
546	0.08
547	0.05
548	0.06
549	0.05
550	0.05
551	0.05
552	0.03
553	0.03
554	0.03
555	0.03
556	0.03
557	0.03
558	0.03
559	0.05
560	0.05
561	0.06
562	0.08
563	0.1
564	0.14
565	0.17
566	0.17
567	0.18
568	0.18
569	0.18
570	0.17
571	0.16
572	0.12
573	0.09
574	0.1
575	0.08
576	0.08
577	0.09
578	0.09
579	0.08
580	0.09
581	0.1
582	0.11
583	0.1
584	0.15
585	0.18
586	0.19
587	0.19
588	0.19
589	0.19
590	0.19
591	0.19
592	0.17
593	0.15
594	0.18
595	0.24
596	0.24
597	0.23
598	0.23
599	0.23
600	0.2
601	0.2
602	0.15
603	0.09
604	0.09
605	0.08
606	0.07
607	0.07
608	0.06
609	0.04
610	0.04
611	0.04
612	0.03
613	0.04
614	0.04
615	0.04
616	0.04
617	0.04
618	0.04
619	0.05
620	0.05
621	0.06
622	0.1
623	0.11
624	0.12
625	0.13
626	0.14
627	0.14
628	0.14
629	0.17
630	0.14
631	0.14
632	0.13
633	0.14
634	0.13
635	0.12
636	0.12
637	0.08
638	0.06
639	0.07
640	0.07
641	0.07
642	0.06
643	0.06
644	0.07
645	0.07
646	0.08
647	0.08
648	0.07
649	0.07
650	0.07
651	0.09
652	0.09
653	0.09
654	0.09
655	0.08
656	0.07
657	0.07
658	0.08
659	0.06
660	0.07
661	0.06
662	0.06
663	0.06
664	0.06
665	0.06
666	0.04
667	0.04
668	0.04
669	0.04
670	0.04
671	0.04
672	0.04
673	0.05
674	0.05
675	0.06
676	0.05
677	0.07
678	0.08
679	0.12
680	0.13
681	0.14
682	0.18
683	0.22
684	0.23
685	0.22
686	0.23
687	0.21
688	0.21
689	0.21
690	0.17
691	0.12
692	0.11
693	0.11
694	0.13
695	0.13
696	0.14
697	0.15
698	0.15
699	0.15
700	0.16
701	0.18
702	0.16
703	0.15
704	0.12
705	0.14
706	0.14
707	0.15
708	0.16
709	0.13
710	0.13
711	0.12
712	0.11
713	0.08
714	0.11
715	0.11
716	0.1
717	0.09
718	0.11
719	0.11
720	0.11
721	0.11
722	0.09
723	0.09
724	0.11
725	0.12
726	0.12
727	0.14
728	0.15
729	0.19
730	0.28
731	0.32
732	0.38
733	0.42
734	0.45
735	0.48
736	0.51
737	0.52
738	0.44
739	0.42
740	0.35
741	0.3
742	0.26
743	0.21
744	0.16
745	0.12
746	0.13
747	0.11
748	0.11
749	0.12
750	0.12
751	0.12
752	0.12
753	0.16
754	0.17
755	0.2
756	0.27
757	0.28
758	0.29
759	0.29
760	0.3
761	0.26
762	0.25
763	0.3
764	0.28
765	0.27
766	0.26
767	0.26
768	0.25
769	0.26
770	0.24
771	0.18
772	0.11
773	0.11
774	0.1
775	0.11
776	0.11
777	0.13
778	0.12
779	0.12
780	0.12
781	0.12
782	0.12
783	0.11
784	0.11
785	0.1
786	0.1
787	0.11
788	0.11
789	0.11
790	0.11
791	0.11
792	0.1
793	0.11
794	0.1
795	0.1
796	0.12
797	0.13
798	0.11
799	0.13
800	0.18
801	0.22
802	0.25
803	0.26
804	0.26
805	0.26
806	0.3
807	0.36
808	0.34
809	0.33
810	0.32
811	0.29
812	0.29
813	0.29
814	0.25
815	0.18
816	0.16
817	0.11
818	0.1
819	0.1
820	0.08
821	0.08
822	0.08
823	0.08
824	0.07
825	0.07
826	0.06
827	0.07
828	0.07
829	0.07
830	0.06
831	0.07
832	0.07
833	0.08
834	0.08
835	0.07
836	0.07
837	0.07
838	0.07
839	0.05
840	0.04
841	0.03
842	0.03
843	0.03
844	0.03
845	0.03
846	0.04
847	0.04
848	0.04
849	0.06
850	0.09
851	0.12
852	0.13
853	0.17
854	0.18
855	0.21
856	0.23
857	0.22
858	0.2
859	0.18
860	0.19
861	0.16
862	0.15
863	0.11
864	0.1
865	0.1
866	0.09
867	0.1
868	0.09
869	0.11
870	0.16
871	0.17
872	0.2
873	0.22
874	0.23
875	0.22
876	0.27
877	0.3
878	0.28
879	0.33
880	0.32
881	0.31
882	0.31
883	0.32
884	0.3
885	0.31
886	0.29
887	0.23
888	0.24
889	0.24
890	0.25
891	0.25
892	0.22
893	0.15
894	0.17
895	0.18
896	0.21
897	0.23
898	0.27
899	0.26
900	0.27
901	0.27
902	0.25
903	0.25
904	0.24
905	0.29
906	0.29
907	0.29
908	0.29
909	0.3
910	0.31
911	0.31
912	0.28
913	0.21
914	0.19
915	0.22
916	0.24
917	0.26
918	0.26
919	0.25
920	0.26
921	0.26
922	0.23
923	0.22
924	0.2
925	0.19
926	0.19
927	0.2
928	0.17
929	0.16
930	0.14
931	0.12
932	0.1
933	0.08
934	0.06
935	0.05
936	0.04
937	0.04
938	0.04
939	0.04
940	0.04
941	0.04
942	0.04
943	0.05
944	0.05
945	0.05
946	0.06
947	0.07
948	0.06
949	0.06
950	0.06
951	0.07
952	0.1
953	0.11
954	0.17
955	0.17
956	0.2
957	0.24
958	0.26
959	0.32
960	0.39
961	0.45
962	0.49
963	0.58
964	0.62
965	0.6
966	0.6
967	0.53
968	0.44
969	0.37
970	0.28
971	0.19
972	0.13
973	0.11
974	0.1
975	0.1
976	0.09
977	0.09
978	0.08
979	0.08
980	0.06
981	0.06
982	0.06
983	0.06
984	0.05
985	0.04
986	0.04
987	0.04
988	0.04
989	0.04
990	0.04
991	0.05
992	0.05
993	0.05
994	0.05
995	0.06
996	0.07
997	0.06
998	0.07
999	0.09
1000	0.11
1001	0.12
1002	0.13
1003	0.12
1004	0.11
1005	0.12
1006	0.13
1007	0.11
1008	0.09
1009	0.1
1010	0.12
1011	0.12
1012	0.12
1013	0.13
1014	0.12
1015	0.14
1016	0.15
1017	0.13
1018	0.1
1019	0.11
1020	0.11
1021	0.1
1022	0.14
1023	0.12
1024	0.11
1025	0.11
1026	0.11
1027	0.11
1028	0.11
1029	0.12
1030	0.08

C5FF33

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer