Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4S4LUC4

Protein Details
Accession A0A4S4LUC4    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
188-210GKSDHSRSRSRSRSRSRSSSRSAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
193-224SRSRSRSRSRSRSSSRSASRSPGWRTPSRGRS
Subcellular Location(s) nucl 14, mito 6, cyto 6, cyto_mito 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005037  PRP38  
Gene Ontology GO:0071011  C:precatalytic spliceosome  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF03371  PRP38  
Amino Acid Sequences MANTTVRGALAIHGQNPQFLVETVIRNRIYESSYWKEHCFALTAESLIDRAIELRFIGGVYGNQRPTEFLSLLLKLLQIQPEKEILLEYLQADEFKYMRALAAMYIRMTFRATDVYELLEPLLKDFRKLRYRNMTGYNITYIDEFVDQLLNEERVCDIILPRIAKRQILEELGELGPRKSRLLDAMEGKSDHSRSRSRSRSRSRSSSRSASRSPGWRTPSRGRSLSRTLPGRGRDLILAHLRAQNFHIVRVAAVSLLIGWTLSQMSHDQFPPVSHEWAL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.24
3 0.24
4 0.24
5 0.18
6 0.16
7 0.18
8 0.17
9 0.22
10 0.24
11 0.31
12 0.31
13 0.29
14 0.31
15 0.29
16 0.28
17 0.25
18 0.3
19 0.3
20 0.36
21 0.39
22 0.39
23 0.39
24 0.37
25 0.35
26 0.3
27 0.23
28 0.2
29 0.18
30 0.17
31 0.15
32 0.14
33 0.13
34 0.1
35 0.1
36 0.06
37 0.06
38 0.06
39 0.06
40 0.06
41 0.06
42 0.06
43 0.06
44 0.07
45 0.06
46 0.08
47 0.11
48 0.16
49 0.17
50 0.17
51 0.17
52 0.19
53 0.21
54 0.23
55 0.2
56 0.17
57 0.19
58 0.19
59 0.19
60 0.18
61 0.15
62 0.12
63 0.14
64 0.17
65 0.16
66 0.16
67 0.17
68 0.18
69 0.18
70 0.17
71 0.15
72 0.11
73 0.1
74 0.1
75 0.09
76 0.08
77 0.08
78 0.08
79 0.08
80 0.09
81 0.08
82 0.07
83 0.08
84 0.07
85 0.07
86 0.07
87 0.07
88 0.07
89 0.09
90 0.09
91 0.09
92 0.1
93 0.1
94 0.1
95 0.1
96 0.09
97 0.08
98 0.1
99 0.1
100 0.1
101 0.1
102 0.11
103 0.11
104 0.11
105 0.1
106 0.09
107 0.08
108 0.08
109 0.13
110 0.11
111 0.13
112 0.16
113 0.24
114 0.32
115 0.34
116 0.41
117 0.46
118 0.5
119 0.53
120 0.56
121 0.52
122 0.44
123 0.43
124 0.36
125 0.26
126 0.23
127 0.18
128 0.12
129 0.09
130 0.07
131 0.06
132 0.05
133 0.05
134 0.05
135 0.06
136 0.07
137 0.07
138 0.07
139 0.07
140 0.07
141 0.06
142 0.07
143 0.06
144 0.05
145 0.08
146 0.11
147 0.12
148 0.13
149 0.18
150 0.19
151 0.2
152 0.2
153 0.21
154 0.21
155 0.21
156 0.21
157 0.15
158 0.17
159 0.16
160 0.17
161 0.14
162 0.12
163 0.12
164 0.12
165 0.13
166 0.1
167 0.11
168 0.14
169 0.17
170 0.21
171 0.24
172 0.25
173 0.27
174 0.26
175 0.27
176 0.26
177 0.24
178 0.21
179 0.21
180 0.25
181 0.29
182 0.39
183 0.48
184 0.54
185 0.63
186 0.72
187 0.78
188 0.81
189 0.85
190 0.83
191 0.82
192 0.8
193 0.79
194 0.75
195 0.72
196 0.66
197 0.61
198 0.59
199 0.58
200 0.58
201 0.55
202 0.55
203 0.53
204 0.58
205 0.62
206 0.64
207 0.63
208 0.63
209 0.6
210 0.6
211 0.63
212 0.62
213 0.6
214 0.57
215 0.54
216 0.54
217 0.54
218 0.51
219 0.45
220 0.4
221 0.34
222 0.3
223 0.32
224 0.3
225 0.29
226 0.27
227 0.29
228 0.28
229 0.27
230 0.28
231 0.3
232 0.25
233 0.25
234 0.25
235 0.21
236 0.21
237 0.21
238 0.19
239 0.11
240 0.1
241 0.09
242 0.06
243 0.06
244 0.05
245 0.04
246 0.04
247 0.04
248 0.05
249 0.05
250 0.07
251 0.1
252 0.12
253 0.17
254 0.18
255 0.2
256 0.21
257 0.22
258 0.27
259 0.28