FuNGI

A0A4S4LIR4

Protein Details

Accession

A0A4S4LIR4

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
153-173	KNSSQWQKTKLRKNSSQVNDT	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
420-426	GKGKKRK

Subcellular Location(s)

mito 14.5, cyto_mito 10.833, cyto_nucl 6.333, cyto 6, nucl 5.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR005824 KOW IPR005100 NGN-domain IPR036735 NGN_dom_sf IPR014722 Rib_L2_dom2 IPR039659 SPT5 IPR008991 Translation_prot_SH3-like_sf
Gene Ontology	GO:0032784 P:regulation of DNA-templated transcription elongation GO:0006357 P:regulation of transcription by RNA polymerase II
Pfam	View protein in Pfam PF03439 Spt5-NGN

Amino Acid Sequences

MPRAVVSHRHIQCYFHPLLYHARFSPERLLIPPVLSVRTVFLPETDRQLASAVGNHVEPGSTLIPKPNGEVTRLNRDGYNLKSILNWAEDMYELIMASIHGLASQYLRVENTFSKQDNMKLTLVRAKAEEIYPILKNYEDGWVVDDFLRIFLKNSSQWQKTKLRKNSSQVNDTYTWDSSRTRPHLLIRPKELPKLNPQTFMQRSDPKEVIRFIDIEAEEVQEDEESEHEDVEDELRSFFNDDEVNDGQSDQDEESILGPMYDSLAVVDKHQFLEELAERYRRRWPSPPVLIPAIIPQIFLTPSVDDCPICSDSMVRSVFARPSFVGLVFVEAPSQAAVLHALRNFSDVYLQLKIMPVDERVALLNLSNQDPLVTIGSWVIIRHSLYKSDWAYVLEDVPATGEVEVAVVPRIPLDRERYGGKGKKRKVSPLSSVADSQPPAHPFTFNDIAAVFGSSAIRTKGDEFIFRCQTFKNGLLHKHFAMTTVSAVEGVPTTSLQDLEPFLKAKLPIDLRALADASRDASLKRIVIDDRVRITSGEQAGLVGEVLDVRGEVASILPRSDDDGNAFEIVLGVPMANFERFFKAGDHVQVKTGVDAGRKGLIAVVELPTMTFIEANTNFHVHVRCDAVDWYEPQLSLAHKLELPATIHSECDPKDPWEGKEVVITKGEYKGYRGLVKAVHLEDAWVELEAGQRIVVLDKWSLSPSSLSASNNPNFVPLSVPCNWGDNITSEWPSASTAGLAESSASQEQNTDGDPAWDPSSRTPPRDVEVETEPEDPGSTWLLSSVMASTLNTKSVMLLIQGTKKSGFERGKHEGALVRTVLRDRQKISPGNNEVVVTVGSGNRGGGTQLSVPVCYLRAMSGSRRSTVVVKEGQHTGIVCTMFRAGANNFWVLHTDEQPLQVLQEPSDNLAVVRKLI

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.47
2	0.39
3	0.36
4	0.32
5	0.41
6	0.42
7	0.42
8	0.35
9	0.39
10	0.38
11	0.41
12	0.46
13	0.4
14	0.38
15	0.35
16	0.39
17	0.34
18	0.34
19	0.34
20	0.28
21	0.26
22	0.24
23	0.22
24	0.2
25	0.2
26	0.21
27	0.17
28	0.17
29	0.2
30	0.22
31	0.28
32	0.29
33	0.27
34	0.25
35	0.26
36	0.25
37	0.21
38	0.23
39	0.18
40	0.17
41	0.17
42	0.16
43	0.15
44	0.14
45	0.13
46	0.13
47	0.13
48	0.14
49	0.15
50	0.21
51	0.24
52	0.25
53	0.28
54	0.31
55	0.31
56	0.33
57	0.4
58	0.4
59	0.47
60	0.49
61	0.48
62	0.41
63	0.43
64	0.44
65	0.4
66	0.41
67	0.32
68	0.3
69	0.29
70	0.31
71	0.3
72	0.26
73	0.23
74	0.15
75	0.15
76	0.15
77	0.15
78	0.13
79	0.1
80	0.08
81	0.07
82	0.07
83	0.06
84	0.06
85	0.06
86	0.05
87	0.05
88	0.05
89	0.06
90	0.07
91	0.09
92	0.09
93	0.1
94	0.11
95	0.12
96	0.15
97	0.17
98	0.21
99	0.26
100	0.26
101	0.29
102	0.32
103	0.36
104	0.39
105	0.4
106	0.39
107	0.34
108	0.36
109	0.39
110	0.37
111	0.34
112	0.29
113	0.27
114	0.26
115	0.25
116	0.24
117	0.19
118	0.22
119	0.21
120	0.21
121	0.2
122	0.18
123	0.18
124	0.16
125	0.19
126	0.16
127	0.15
128	0.16
129	0.15
130	0.17
131	0.16
132	0.16
133	0.12
134	0.12
135	0.13
136	0.11
137	0.12
138	0.13
139	0.17
140	0.19
141	0.28
142	0.35
143	0.41
144	0.44
145	0.5
146	0.58
147	0.63
148	0.71
149	0.72
150	0.73
151	0.75
152	0.8
153	0.82
154	0.8
155	0.78
156	0.7
157	0.66
158	0.58
159	0.52
160	0.48
161	0.39
162	0.32
163	0.27
164	0.27
165	0.25
166	0.32
167	0.34
168	0.35
169	0.37
170	0.43
171	0.5
172	0.57
173	0.61
174	0.59
175	0.64
176	0.63
177	0.67
178	0.64
179	0.59
180	0.6
181	0.63
182	0.58
183	0.54
184	0.52
185	0.54
186	0.53
187	0.54
188	0.51
189	0.48
190	0.49
191	0.51
192	0.52
193	0.45
194	0.46
195	0.42
196	0.38
197	0.32
198	0.29
199	0.22
200	0.26
201	0.23
202	0.21
203	0.19
204	0.17
205	0.15
206	0.14
207	0.14
208	0.07
209	0.07
210	0.06
211	0.06
212	0.07
213	0.08
214	0.07
215	0.07
216	0.08
217	0.08
218	0.09
219	0.1
220	0.08
221	0.08
222	0.08
223	0.09
224	0.1
225	0.09
226	0.11
227	0.1
228	0.1
229	0.15
230	0.16
231	0.16
232	0.15
233	0.15
234	0.13
235	0.12
236	0.13
237	0.08
238	0.07
239	0.06
240	0.07
241	0.07
242	0.08
243	0.08
244	0.06
245	0.06
246	0.05
247	0.06
248	0.06
249	0.05
250	0.04
251	0.07
252	0.08
253	0.09
254	0.12
255	0.12
256	0.13
257	0.13
258	0.13
259	0.1
260	0.15
261	0.16
262	0.17
263	0.18
264	0.25
265	0.25
266	0.27
267	0.35
268	0.35
269	0.37
270	0.42
271	0.49
272	0.52
273	0.6
274	0.63
275	0.59
276	0.56
277	0.52
278	0.44
279	0.37
280	0.31
281	0.22
282	0.18
283	0.13
284	0.12
285	0.12
286	0.12
287	0.11
288	0.08
289	0.08
290	0.1
291	0.11
292	0.1
293	0.1
294	0.13
295	0.13
296	0.13
297	0.12
298	0.11
299	0.11
300	0.18
301	0.18
302	0.14
303	0.14
304	0.16
305	0.2
306	0.19
307	0.2
308	0.14
309	0.16
310	0.16
311	0.15
312	0.15
313	0.11
314	0.13
315	0.12
316	0.11
317	0.09
318	0.08
319	0.08
320	0.06
321	0.06
322	0.04
323	0.04
324	0.05
325	0.05
326	0.08
327	0.09
328	0.09
329	0.09
330	0.11
331	0.11
332	0.1
333	0.1
334	0.09
335	0.11
336	0.11
337	0.11
338	0.11
339	0.12
340	0.12
341	0.11
342	0.11
343	0.09
344	0.1
345	0.1
346	0.09
347	0.09
348	0.09
349	0.08
350	0.07
351	0.09
352	0.09
353	0.1
354	0.09
355	0.09
356	0.08
357	0.09
358	0.09
359	0.08
360	0.07
361	0.06
362	0.06
363	0.07
364	0.07
365	0.07
366	0.06
367	0.06
368	0.07
369	0.1
370	0.11
371	0.13
372	0.13
373	0.19
374	0.19
375	0.19
376	0.2
377	0.17
378	0.17
379	0.16
380	0.15
381	0.1
382	0.09
383	0.07
384	0.07
385	0.06
386	0.05
387	0.04
388	0.04
389	0.03
390	0.04
391	0.04
392	0.04
393	0.04
394	0.03
395	0.03
396	0.04
397	0.05
398	0.05
399	0.08
400	0.13
401	0.15
402	0.17
403	0.19
404	0.22
405	0.29
406	0.34
407	0.4
408	0.44
409	0.48
410	0.54
411	0.56
412	0.62
413	0.61
414	0.62
415	0.6
416	0.59
417	0.55
418	0.49
419	0.47
420	0.39
421	0.33
422	0.27
423	0.22
424	0.17
425	0.16
426	0.17
427	0.16
428	0.16
429	0.14
430	0.19
431	0.21
432	0.18
433	0.17
434	0.14
435	0.14
436	0.14
437	0.13
438	0.07
439	0.05
440	0.05
441	0.04
442	0.05
443	0.05
444	0.05
445	0.06
446	0.07
447	0.11
448	0.12
449	0.16
450	0.17
451	0.22
452	0.27
453	0.27
454	0.27
455	0.22
456	0.24
457	0.23
458	0.25
459	0.25
460	0.24
461	0.29
462	0.32
463	0.35
464	0.32
465	0.31
466	0.27
467	0.23
468	0.19
469	0.15
470	0.11
471	0.09
472	0.08
473	0.07
474	0.07
475	0.06
476	0.05
477	0.04
478	0.04
479	0.04
480	0.04
481	0.04
482	0.05
483	0.05
484	0.06
485	0.07
486	0.08
487	0.09
488	0.09
489	0.09
490	0.11
491	0.11
492	0.11
493	0.15
494	0.15
495	0.16
496	0.18
497	0.2
498	0.18
499	0.19
500	0.19
501	0.13
502	0.12
503	0.1
504	0.09
505	0.08
506	0.08
507	0.07
508	0.08
509	0.1
510	0.1
511	0.11
512	0.12
513	0.11
514	0.17
515	0.2
516	0.21
517	0.22
518	0.23
519	0.22
520	0.2
521	0.21
522	0.19
523	0.17
524	0.14
525	0.12
526	0.11
527	0.1
528	0.1
529	0.09
530	0.04
531	0.03
532	0.03
533	0.03
534	0.03
535	0.02
536	0.03
537	0.03
538	0.02
539	0.03
540	0.03
541	0.05
542	0.06
543	0.06
544	0.06
545	0.06
546	0.09
547	0.1
548	0.1
549	0.1
550	0.11
551	0.12
552	0.12
553	0.12
554	0.09
555	0.08
556	0.07
557	0.06
558	0.04
559	0.03
560	0.03
561	0.04
562	0.05
563	0.05
564	0.05
565	0.07
566	0.09
567	0.1
568	0.11
569	0.12
570	0.14
571	0.16
572	0.22
573	0.24
574	0.21
575	0.22
576	0.23
577	0.22
578	0.19
579	0.19
580	0.15
581	0.13
582	0.14
583	0.13
584	0.13
585	0.13
586	0.13
587	0.11
588	0.09
589	0.09
590	0.09
591	0.09
592	0.07
593	0.07
594	0.07
595	0.06
596	0.07
597	0.06
598	0.05
599	0.04
600	0.1
601	0.11
602	0.14
603	0.14
604	0.15
605	0.15
606	0.17
607	0.19
608	0.14
609	0.15
610	0.16
611	0.15
612	0.15
613	0.16
614	0.16
615	0.16
616	0.17
617	0.17
618	0.16
619	0.16
620	0.15
621	0.16
622	0.15
623	0.17
624	0.17
625	0.16
626	0.15
627	0.16
628	0.16
629	0.17
630	0.17
631	0.14
632	0.17
633	0.15
634	0.16
635	0.16
636	0.19
637	0.17
638	0.19
639	0.2
640	0.18
641	0.25
642	0.28
643	0.28
644	0.3
645	0.3
646	0.27
647	0.31
648	0.31
649	0.25
650	0.24
651	0.24
652	0.2
653	0.23
654	0.25
655	0.2
656	0.2
657	0.23
658	0.24
659	0.27
660	0.26
661	0.25
662	0.24
663	0.25
664	0.27
665	0.23
666	0.21
667	0.18
668	0.17
669	0.15
670	0.14
671	0.12
672	0.08
673	0.07
674	0.06
675	0.08
676	0.09
677	0.09
678	0.07
679	0.07
680	0.07
681	0.08
682	0.09
683	0.09
684	0.09
685	0.1
686	0.11
687	0.12
688	0.13
689	0.12
690	0.12
691	0.11
692	0.13
693	0.16
694	0.16
695	0.19
696	0.26
697	0.27
698	0.28
699	0.27
700	0.26
701	0.23
702	0.22
703	0.2
704	0.14
705	0.18
706	0.19
707	0.21
708	0.2
709	0.23
710	0.23
711	0.21
712	0.2
713	0.17
714	0.18
715	0.19
716	0.19
717	0.17
718	0.17
719	0.16
720	0.16
721	0.14
722	0.11
723	0.08
724	0.07
725	0.07
726	0.07
727	0.07
728	0.06
729	0.06
730	0.09
731	0.1
732	0.1
733	0.09
734	0.1
735	0.11
736	0.11
737	0.12
738	0.11
739	0.1
740	0.12
741	0.13
742	0.15
743	0.17
744	0.17
745	0.18
746	0.2
747	0.31
748	0.33
749	0.35
750	0.38
751	0.39
752	0.4
753	0.43
754	0.4
755	0.34
756	0.34
757	0.36
758	0.33
759	0.31
760	0.28
761	0.24
762	0.23
763	0.18
764	0.15
765	0.13
766	0.1
767	0.09
768	0.09
769	0.1
770	0.09
771	0.09
772	0.08
773	0.07
774	0.07
775	0.08
776	0.11
777	0.12
778	0.14
779	0.14
780	0.13
781	0.12
782	0.13
783	0.13
784	0.11
785	0.13
786	0.16
787	0.22
788	0.23
789	0.24
790	0.24
791	0.25
792	0.26
793	0.31
794	0.35
795	0.34
796	0.41
797	0.47
798	0.5
799	0.49
800	0.49
801	0.45
802	0.4
803	0.39
804	0.32
805	0.26
806	0.24
807	0.26
808	0.31
809	0.33
810	0.36
811	0.35
812	0.42
813	0.49
814	0.53
815	0.57
816	0.6
817	0.58
818	0.57
819	0.55
820	0.48
821	0.39
822	0.33
823	0.28
824	0.18
825	0.14
826	0.1
827	0.09
828	0.09
829	0.09
830	0.08
831	0.09
832	0.08
833	0.08
834	0.1
835	0.11
836	0.16
837	0.16
838	0.16
839	0.17
840	0.17
841	0.17
842	0.16
843	0.15
844	0.1
845	0.13
846	0.16
847	0.22
848	0.3
849	0.33
850	0.34
851	0.35
852	0.36
853	0.37
854	0.38
855	0.39
856	0.35
857	0.35
858	0.37
859	0.39
860	0.38
861	0.35
862	0.32
863	0.26
864	0.24
865	0.22
866	0.18
867	0.17
868	0.17
869	0.15
870	0.15
871	0.18
872	0.15
873	0.19
874	0.22
875	0.23
876	0.22
877	0.22
878	0.24
879	0.23
880	0.25
881	0.23
882	0.25
883	0.24
884	0.25
885	0.26
886	0.24
887	0.22
888	0.24
889	0.23
890	0.2
891	0.23
892	0.22
893	0.22
894	0.24
895	0.22
896	0.17
897	0.2

A0A4S4LIR4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer