Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4S4M5M4

Protein Details
Accession A0A4S4M5M4    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-20MPSKRTVKGKKRAANPLLITHydrophilic
143-166DLLKTLRLLKRRRKQRNLQIQEVTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
153-155RRR
Subcellular Location(s) mito 22, cyto_nucl 3, nucl 2.5, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR031824  RNF220_mid  
Pfam View protein in Pfam  
PF15926  RNF220  
Amino Acid Sequences MPSKRTVKGKKRAANPLLITEMEMENEGAVASSSSSSLSPPPPPAKKRISFTSPLPPLCSDYFMTGKRAETRPCPVCAEAIPLRLLAQHSELETERVQALIDAVGDFEEWVDPYPGAFEDSTFSRRRSVIKSRPIASSSTSTDLLKTLRLLKRRRKQRNLQIQEVTRDSDADPISSRRRAASSPGGETCPVCLQSVQGDPDVVHAHVDACIAHASMQPSPSPPHDNVDGDVVVDDVQEEGDPWEEIQTPDGLSRLRLRVGAGESARRLGFTVRDRALADVEDEVDIDGDDEGMFGTVQFTEADVIAGDDTGRGEEAIVVVQKKRDAGMVVDMEREIAHAQSARDDKALIAALEAKVKFLIQQSVLGVGMHAAASAGYDV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.82
2 0.74
3 0.69
4 0.61
5 0.53
6 0.44
7 0.36
8 0.3
9 0.21
10 0.19
11 0.14
12 0.1
13 0.1
14 0.08
15 0.06
16 0.05
17 0.05
18 0.05
19 0.05
20 0.06
21 0.07
22 0.07
23 0.08
24 0.12
25 0.16
26 0.19
27 0.26
28 0.35
29 0.44
30 0.49
31 0.56
32 0.62
33 0.66
34 0.68
35 0.69
36 0.67
37 0.63
38 0.63
39 0.65
40 0.62
41 0.57
42 0.54
43 0.47
44 0.44
45 0.4
46 0.38
47 0.28
48 0.25
49 0.29
50 0.27
51 0.29
52 0.27
53 0.29
54 0.32
55 0.37
56 0.37
57 0.38
58 0.45
59 0.46
60 0.47
61 0.48
62 0.41
63 0.38
64 0.34
65 0.36
66 0.3
67 0.28
68 0.25
69 0.21
70 0.21
71 0.2
72 0.2
73 0.14
74 0.14
75 0.13
76 0.12
77 0.15
78 0.15
79 0.17
80 0.16
81 0.16
82 0.14
83 0.13
84 0.12
85 0.09
86 0.09
87 0.07
88 0.07
89 0.05
90 0.05
91 0.05
92 0.05
93 0.05
94 0.04
95 0.04
96 0.04
97 0.05
98 0.06
99 0.06
100 0.06
101 0.07
102 0.07
103 0.08
104 0.08
105 0.07
106 0.09
107 0.11
108 0.16
109 0.17
110 0.18
111 0.2
112 0.22
113 0.26
114 0.31
115 0.39
116 0.44
117 0.52
118 0.58
119 0.57
120 0.59
121 0.56
122 0.5
123 0.42
124 0.37
125 0.3
126 0.26
127 0.24
128 0.21
129 0.2
130 0.2
131 0.17
132 0.14
133 0.13
134 0.19
135 0.22
136 0.29
137 0.38
138 0.47
139 0.56
140 0.66
141 0.75
142 0.77
143 0.83
144 0.86
145 0.89
146 0.86
147 0.84
148 0.79
149 0.71
150 0.65
151 0.55
152 0.46
153 0.34
154 0.28
155 0.21
156 0.18
157 0.16
158 0.13
159 0.13
160 0.15
161 0.19
162 0.19
163 0.2
164 0.17
165 0.18
166 0.18
167 0.22
168 0.26
169 0.25
170 0.27
171 0.27
172 0.27
173 0.26
174 0.25
175 0.21
176 0.15
177 0.13
178 0.1
179 0.08
180 0.08
181 0.1
182 0.12
183 0.12
184 0.11
185 0.1
186 0.1
187 0.12
188 0.12
189 0.1
190 0.08
191 0.07
192 0.07
193 0.07
194 0.07
195 0.05
196 0.05
197 0.05
198 0.05
199 0.06
200 0.07
201 0.08
202 0.09
203 0.1
204 0.1
205 0.11
206 0.13
207 0.15
208 0.18
209 0.17
210 0.2
211 0.22
212 0.22
213 0.21
214 0.21
215 0.18
216 0.14
217 0.13
218 0.1
219 0.07
220 0.06
221 0.06
222 0.03
223 0.03
224 0.03
225 0.03
226 0.04
227 0.05
228 0.05
229 0.05
230 0.06
231 0.07
232 0.07
233 0.08
234 0.08
235 0.08
236 0.08
237 0.1
238 0.09
239 0.1
240 0.14
241 0.15
242 0.15
243 0.15
244 0.16
245 0.18
246 0.2
247 0.23
248 0.2
249 0.22
250 0.21
251 0.23
252 0.23
253 0.19
254 0.18
255 0.14
256 0.19
257 0.2
258 0.27
259 0.26
260 0.28
261 0.29
262 0.29
263 0.29
264 0.23
265 0.19
266 0.12
267 0.12
268 0.09
269 0.09
270 0.08
271 0.07
272 0.06
273 0.05
274 0.04
275 0.04
276 0.04
277 0.04
278 0.04
279 0.04
280 0.04
281 0.03
282 0.04
283 0.04
284 0.05
285 0.05
286 0.05
287 0.06
288 0.06
289 0.07
290 0.06
291 0.06
292 0.06
293 0.06
294 0.05
295 0.05
296 0.05
297 0.05
298 0.05
299 0.05
300 0.05
301 0.05
302 0.06
303 0.08
304 0.1
305 0.12
306 0.14
307 0.16
308 0.17
309 0.18
310 0.18
311 0.18
312 0.17
313 0.17
314 0.23
315 0.25
316 0.25
317 0.25
318 0.24
319 0.22
320 0.21
321 0.2
322 0.13
323 0.09
324 0.1
325 0.11
326 0.12
327 0.18
328 0.22
329 0.22
330 0.22
331 0.23
332 0.2
333 0.21
334 0.23
335 0.16
336 0.14
337 0.16
338 0.17
339 0.22
340 0.22
341 0.19
342 0.17
343 0.18
344 0.19
345 0.19
346 0.24
347 0.19
348 0.22
349 0.22
350 0.24
351 0.24
352 0.21
353 0.18
354 0.12
355 0.11
356 0.08
357 0.07
358 0.05
359 0.04