Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5FTP7

Protein Details
Accession C5FTP7    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
98-124IDGNDRKTKTNQSKKRKREEETVEECEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
111-114KKRK
266-273RRRRREEE
275-275R
280-280K
298-311EKRKERQGELLRRF
313-318EDKRRV
Subcellular Location(s) mito 9, plas 7, cyto_nucl 5, nucl 4.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR040447  RRM_Rrp7  
IPR040446  RRP7  
IPR024326  RRP7_C  
IPR031349  Tfb6  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF17799  RRM_Rrp7  
PF12923  RRP7  
PF17110  TFB6  
CDD cd12293  dRRM_Rrp7p  
Amino Acid Sequences MPSKTVSSIAGYSVLPVRLPARPSFDEAATHYLYIQAHAPREPDADSSRSLFVVNIPTTCTETHFRHLFGTQLGSGRVERVDFHYGKKQHPIAAPAPIDGNDRKTKTNQSKKRKREEETVEECEAQLDGMYLPPAWDRELRPSGSHAVVTFVDRPSMEASLKAVRKKAGKTSSSSSSSTSVIVWGEGLEDGQKVPALGRSRYSRHLGEGRYPGRSELLQRVNEYMGVLTRLEEAQEQAAARQGEVVDEDGFVTVARGPRQGQQQQRRRRREEELRALAEKQREKSRGLEDFYRFQMREKRKERQGELLRRFEEDKRRVEEMKSRRGKVVVSLSALLYLYLLLTVPAGVMIVSLPLLLLLLLLLLLLLLLLLLHDESAGGQRSTLCHYSACKMNGDSALPEQRQHPLRPGSSKETTLLNWVEAAVLRINRRHAKRFSRSFTETDAEETKDAEEDVPGYDSFGEVAVDVDRALDVLWVSNTPSIQVPYMISLAGLVNSYLRDFPWQARETFRLLDKLDAMFSALLAEASMTERVRIKSLVEGTRVTVFDVRDEEDDDDDVDVDAEVDAEVDAEVGRWKMAAARVYERTLSLV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.16
3 0.17
4 0.19
5 0.21
6 0.25
7 0.26
8 0.3
9 0.32
10 0.38
11 0.4
12 0.38
13 0.36
14 0.36
15 0.38
16 0.32
17 0.29
18 0.23
19 0.23
20 0.22
21 0.2
22 0.22
23 0.21
24 0.22
25 0.24
26 0.25
27 0.24
28 0.26
29 0.26
30 0.26
31 0.26
32 0.26
33 0.26
34 0.28
35 0.27
36 0.25
37 0.24
38 0.19
39 0.18
40 0.23
41 0.23
42 0.2
43 0.21
44 0.22
45 0.24
46 0.24
47 0.25
48 0.23
49 0.26
50 0.33
51 0.34
52 0.34
53 0.34
54 0.34
55 0.33
56 0.28
57 0.28
58 0.22
59 0.22
60 0.21
61 0.21
62 0.2
63 0.19
64 0.18
65 0.15
66 0.15
67 0.18
68 0.26
69 0.25
70 0.29
71 0.37
72 0.41
73 0.44
74 0.51
75 0.49
76 0.47
77 0.49
78 0.51
79 0.44
80 0.48
81 0.45
82 0.37
83 0.35
84 0.3
85 0.3
86 0.26
87 0.29
88 0.29
89 0.31
90 0.33
91 0.37
92 0.46
93 0.53
94 0.62
95 0.67
96 0.71
97 0.79
98 0.86
99 0.93
100 0.91
101 0.87
102 0.86
103 0.85
104 0.84
105 0.81
106 0.77
107 0.68
108 0.59
109 0.52
110 0.42
111 0.32
112 0.21
113 0.13
114 0.08
115 0.05
116 0.05
117 0.06
118 0.06
119 0.06
120 0.07
121 0.08
122 0.1
123 0.14
124 0.15
125 0.23
126 0.28
127 0.29
128 0.29
129 0.32
130 0.34
131 0.31
132 0.3
133 0.22
134 0.2
135 0.18
136 0.2
137 0.19
138 0.15
139 0.16
140 0.15
141 0.16
142 0.15
143 0.16
144 0.14
145 0.12
146 0.14
147 0.21
148 0.25
149 0.26
150 0.27
151 0.3
152 0.35
153 0.38
154 0.45
155 0.46
156 0.46
157 0.48
158 0.5
159 0.53
160 0.51
161 0.49
162 0.42
163 0.35
164 0.32
165 0.28
166 0.22
167 0.16
168 0.12
169 0.11
170 0.09
171 0.07
172 0.06
173 0.05
174 0.05
175 0.05
176 0.05
177 0.05
178 0.05
179 0.05
180 0.05
181 0.05
182 0.1
183 0.13
184 0.14
185 0.19
186 0.24
187 0.27
188 0.32
189 0.36
190 0.32
191 0.34
192 0.39
193 0.36
194 0.38
195 0.43
196 0.4
197 0.39
198 0.38
199 0.33
200 0.28
201 0.28
202 0.24
203 0.24
204 0.28
205 0.28
206 0.28
207 0.29
208 0.28
209 0.27
210 0.24
211 0.16
212 0.1
213 0.09
214 0.08
215 0.07
216 0.07
217 0.07
218 0.07
219 0.07
220 0.07
221 0.07
222 0.08
223 0.07
224 0.07
225 0.11
226 0.1
227 0.1
228 0.1
229 0.09
230 0.08
231 0.09
232 0.1
233 0.06
234 0.06
235 0.06
236 0.05
237 0.05
238 0.05
239 0.05
240 0.06
241 0.07
242 0.08
243 0.1
244 0.11
245 0.15
246 0.24
247 0.3
248 0.38
249 0.46
250 0.55
251 0.64
252 0.74
253 0.79
254 0.77
255 0.76
256 0.76
257 0.76
258 0.76
259 0.76
260 0.71
261 0.65
262 0.6
263 0.56
264 0.5
265 0.45
266 0.38
267 0.31
268 0.32
269 0.31
270 0.32
271 0.35
272 0.37
273 0.36
274 0.36
275 0.38
276 0.34
277 0.34
278 0.35
279 0.35
280 0.29
281 0.27
282 0.33
283 0.34
284 0.42
285 0.46
286 0.52
287 0.55
288 0.63
289 0.62
290 0.64
291 0.67
292 0.67
293 0.67
294 0.65
295 0.58
296 0.53
297 0.53
298 0.47
299 0.47
300 0.42
301 0.41
302 0.39
303 0.41
304 0.41
305 0.41
306 0.45
307 0.42
308 0.47
309 0.49
310 0.46
311 0.45
312 0.44
313 0.42
314 0.38
315 0.38
316 0.29
317 0.24
318 0.23
319 0.21
320 0.21
321 0.2
322 0.15
323 0.08
324 0.06
325 0.04
326 0.03
327 0.03
328 0.03
329 0.03
330 0.03
331 0.02
332 0.02
333 0.02
334 0.02
335 0.02
336 0.02
337 0.02
338 0.02
339 0.02
340 0.02
341 0.02
342 0.02
343 0.02
344 0.02
345 0.02
346 0.02
347 0.02
348 0.02
349 0.02
350 0.01
351 0.01
352 0.01
353 0.01
354 0.01
355 0.01
356 0.01
357 0.02
358 0.02
359 0.02
360 0.02
361 0.02
362 0.03
363 0.05
364 0.07
365 0.07
366 0.07
367 0.08
368 0.1
369 0.14
370 0.15
371 0.13
372 0.13
373 0.15
374 0.19
375 0.24
376 0.25
377 0.23
378 0.22
379 0.24
380 0.23
381 0.22
382 0.2
383 0.18
384 0.23
385 0.21
386 0.22
387 0.21
388 0.26
389 0.3
390 0.3
391 0.33
392 0.33
393 0.36
394 0.41
395 0.45
396 0.45
397 0.44
398 0.44
399 0.38
400 0.35
401 0.31
402 0.31
403 0.26
404 0.19
405 0.16
406 0.15
407 0.13
408 0.11
409 0.12
410 0.1
411 0.12
412 0.13
413 0.16
414 0.23
415 0.3
416 0.36
417 0.42
418 0.49
419 0.56
420 0.65
421 0.72
422 0.72
423 0.72
424 0.71
425 0.66
426 0.61
427 0.54
428 0.44
429 0.38
430 0.34
431 0.27
432 0.23
433 0.21
434 0.17
435 0.15
436 0.14
437 0.1
438 0.08
439 0.07
440 0.08
441 0.09
442 0.09
443 0.09
444 0.08
445 0.08
446 0.08
447 0.07
448 0.06
449 0.04
450 0.05
451 0.05
452 0.06
453 0.05
454 0.05
455 0.05
456 0.05
457 0.05
458 0.05
459 0.04
460 0.05
461 0.06
462 0.07
463 0.08
464 0.1
465 0.1
466 0.1
467 0.12
468 0.12
469 0.12
470 0.13
471 0.13
472 0.13
473 0.14
474 0.12
475 0.1
476 0.09
477 0.09
478 0.08
479 0.08
480 0.06
481 0.06
482 0.07
483 0.08
484 0.08
485 0.08
486 0.12
487 0.14
488 0.18
489 0.27
490 0.29
491 0.3
492 0.35
493 0.38
494 0.37
495 0.39
496 0.37
497 0.33
498 0.32
499 0.33
500 0.3
501 0.28
502 0.25
503 0.21
504 0.19
505 0.14
506 0.13
507 0.1
508 0.08
509 0.07
510 0.06
511 0.06
512 0.05
513 0.07
514 0.1
515 0.09
516 0.12
517 0.17
518 0.18
519 0.21
520 0.21
521 0.21
522 0.25
523 0.33
524 0.36
525 0.35
526 0.34
527 0.34
528 0.38
529 0.37
530 0.31
531 0.27
532 0.23
533 0.22
534 0.24
535 0.24
536 0.21
537 0.23
538 0.22
539 0.2
540 0.21
541 0.18
542 0.16
543 0.14
544 0.12
545 0.1
546 0.08
547 0.07
548 0.06
549 0.06
550 0.05
551 0.05
552 0.04
553 0.04
554 0.04
555 0.04
556 0.04
557 0.05
558 0.07
559 0.07
560 0.07
561 0.07
562 0.08
563 0.12
564 0.17
565 0.21
566 0.24
567 0.31
568 0.36
569 0.39
570 0.4