Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5FS87

Protein Details
Accession C5FS87    Localization Confidence Low Confidence Score 8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
277-307VGPGSEFEKKPKKDKKRKNKNKLAGGKWTLDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
285-300KKPKKDKKRKNKNKLA
Subcellular Location(s) plas 20, E.R. 4, pero 1, golg 1, vacu 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007568  RTA1  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
Pfam View protein in Pfam  
PF04479  RTA1  
Amino Acid Sequences MASCDGIDFVNNDDLVWQYCPTFAPAVLFAVLFFLTTAAHVIQAFIFKKACKKTTSSQSYKPFSWVIIVGSAWETIAYALRAAGAKDIYQKGFGLPHHILIALAPLWINAYVYMVLGRMVHFFLPDQRCFGISARRLTVIFVCLDIIAFLTQGASTSLLNSDTPSSIKIGIDLYMGGIGLQELFILIFAGLAVRFQSKMAIVEQRECPRSSWRPLLYTVYATLALITVRIIYRLVEYSGGLHSAIATNENAFYILDASPMFLALLALNIFHPGRFLVGPGSEFEKKPKKDKKRKNKNKLAGGKWTLDDNGQGHFEELPLDERGHEYDQHYHSFEPPER
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.16
3 0.17
4 0.15
5 0.11
6 0.13
7 0.14
8 0.16
9 0.16
10 0.14
11 0.15
12 0.15
13 0.16
14 0.16
15 0.15
16 0.12
17 0.12
18 0.11
19 0.08
20 0.07
21 0.06
22 0.05
23 0.06
24 0.07
25 0.06
26 0.08
27 0.07
28 0.08
29 0.09
30 0.15
31 0.15
32 0.17
33 0.19
34 0.2
35 0.28
36 0.35
37 0.39
38 0.37
39 0.42
40 0.48
41 0.57
42 0.66
43 0.65
44 0.67
45 0.72
46 0.74
47 0.69
48 0.63
49 0.53
50 0.43
51 0.38
52 0.3
53 0.21
54 0.17
55 0.16
56 0.13
57 0.12
58 0.12
59 0.09
60 0.08
61 0.07
62 0.05
63 0.07
64 0.06
65 0.06
66 0.06
67 0.07
68 0.08
69 0.08
70 0.09
71 0.09
72 0.1
73 0.15
74 0.19
75 0.18
76 0.19
77 0.19
78 0.18
79 0.21
80 0.2
81 0.21
82 0.19
83 0.19
84 0.18
85 0.18
86 0.17
87 0.13
88 0.15
89 0.08
90 0.07
91 0.06
92 0.05
93 0.06
94 0.06
95 0.06
96 0.04
97 0.05
98 0.05
99 0.05
100 0.05
101 0.05
102 0.05
103 0.06
104 0.06
105 0.06
106 0.07
107 0.07
108 0.07
109 0.07
110 0.15
111 0.19
112 0.19
113 0.2
114 0.2
115 0.21
116 0.22
117 0.23
118 0.23
119 0.23
120 0.26
121 0.25
122 0.26
123 0.25
124 0.25
125 0.24
126 0.17
127 0.13
128 0.1
129 0.09
130 0.07
131 0.07
132 0.06
133 0.05
134 0.04
135 0.04
136 0.03
137 0.03
138 0.03
139 0.04
140 0.04
141 0.04
142 0.04
143 0.05
144 0.05
145 0.06
146 0.06
147 0.06
148 0.07
149 0.07
150 0.07
151 0.07
152 0.08
153 0.08
154 0.08
155 0.08
156 0.07
157 0.07
158 0.07
159 0.06
160 0.05
161 0.05
162 0.05
163 0.04
164 0.03
165 0.03
166 0.02
167 0.02
168 0.02
169 0.02
170 0.02
171 0.02
172 0.02
173 0.02
174 0.02
175 0.02
176 0.03
177 0.03
178 0.03
179 0.03
180 0.04
181 0.04
182 0.05
183 0.06
184 0.06
185 0.07
186 0.09
187 0.14
188 0.15
189 0.18
190 0.24
191 0.28
192 0.3
193 0.3
194 0.29
195 0.32
196 0.37
197 0.38
198 0.41
199 0.39
200 0.39
201 0.4
202 0.43
203 0.37
204 0.32
205 0.27
206 0.2
207 0.18
208 0.15
209 0.13
210 0.09
211 0.07
212 0.06
213 0.05
214 0.05
215 0.05
216 0.05
217 0.06
218 0.06
219 0.07
220 0.08
221 0.09
222 0.09
223 0.09
224 0.1
225 0.1
226 0.1
227 0.09
228 0.07
229 0.07
230 0.08
231 0.08
232 0.08
233 0.08
234 0.07
235 0.08
236 0.08
237 0.08
238 0.07
239 0.07
240 0.07
241 0.07
242 0.07
243 0.07
244 0.07
245 0.07
246 0.07
247 0.07
248 0.05
249 0.05
250 0.04
251 0.05
252 0.05
253 0.05
254 0.05
255 0.08
256 0.08
257 0.07
258 0.08
259 0.07
260 0.09
261 0.09
262 0.1
263 0.1
264 0.11
265 0.12
266 0.13
267 0.19
268 0.2
269 0.21
270 0.29
271 0.36
272 0.4
273 0.5
274 0.59
275 0.65
276 0.73
277 0.83
278 0.86
279 0.88
280 0.95
281 0.96
282 0.97
283 0.95
284 0.95
285 0.94
286 0.9
287 0.88
288 0.82
289 0.74
290 0.64
291 0.56
292 0.46
293 0.37
294 0.34
295 0.24
296 0.22
297 0.2
298 0.19
299 0.17
300 0.16
301 0.16
302 0.13
303 0.13
304 0.13
305 0.13
306 0.14
307 0.13
308 0.15
309 0.19
310 0.2
311 0.22
312 0.23
313 0.3
314 0.33
315 0.37
316 0.37
317 0.35
318 0.36