Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4S4M1B4

Protein Details
Accession A0A4S4M1B4    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
36-59PSTSHRRSPSPHRAAKPPKPFHFAHydrophilic
505-525NERWRLGKGGRREERKRAAYABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
41-64RRSPSPHRAAKPPKPFHFAKHPQR
511-521GKGGRREERKR
Subcellular Location(s) cyto 10.5, mito 10, cyto_nucl 8.5, nucl 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020103  PsdUridine_synth_cat_dom_sf  
IPR001406  PsdUridine_synth_TruA  
IPR020097  PsdUridine_synth_TruA_a/b_dom  
IPR020095  PsdUridine_synth_TruA_C  
IPR020094  TruA/RsuA/RluB/E/F_N  
Gene Ontology GO:0009982  F:pseudouridine synthase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0001522  P:pseudouridine synthesis  
GO:0008033  P:tRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF01416  PseudoU_synth_1  
Amino Acid Sequences MSPSPSALTPTLLTPDYESWTKEQLIARLTQLESHPSTSHRRSPSPHRAAKPPKPFHFAKHPQRKIALKFTYAGWEYNGLAWQNGPTPLPTVEGALFDMLAKTKLVDEEGGLEGCGWERCGRTDKGVSAAGQVVSLWVRSAVVDERQGVEGGLQTESEEDGVGKVSVEEKVSGTEREETAEVPDNEGFESLGLSSRASSSAPTPTHALKRKTELRYIWMLNRLLPPSIRVLAWSPVAPTFSARFNCRFRHYKYFFSAATLDVDAMCKGAERLVGEHDFRNMCKLDPTKQITNFKRRVLRADISPVSGSADAGIYVFDLVGSAFLYHQVRHIMAVLFLVGTGLERPSLVTALLNTDKANPYPPFAEGDEVPSLVECKPEYQMADGLPLMLWDCGYAEEDLDWRTDLDTKEEREKDATETTLNLYHQLDSIHTRSLISTTLDEHFLSSAGRFHAPPPNPFPLASLSQLAGSGAGILNVPLGGGTFRRLTKYVPVLERNRLDSIEVANERWRLGKGGRREERKRAAYADAGDDGDE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.22
3 0.24
4 0.25
5 0.26
6 0.25
7 0.29
8 0.29
9 0.31
10 0.32
11 0.31
12 0.32
13 0.33
14 0.32
15 0.32
16 0.32
17 0.3
18 0.28
19 0.3
20 0.29
21 0.31
22 0.3
23 0.29
24 0.38
25 0.41
26 0.48
27 0.48
28 0.52
29 0.55
30 0.65
31 0.72
32 0.74
33 0.76
34 0.73
35 0.77
36 0.82
37 0.85
38 0.85
39 0.84
40 0.8
41 0.78
42 0.75
43 0.71
44 0.72
45 0.72
46 0.73
47 0.74
48 0.74
49 0.73
50 0.78
51 0.79
52 0.75
53 0.75
54 0.68
55 0.6
56 0.54
57 0.49
58 0.49
59 0.42
60 0.36
61 0.27
62 0.24
63 0.22
64 0.22
65 0.23
66 0.16
67 0.15
68 0.14
69 0.14
70 0.14
71 0.15
72 0.14
73 0.12
74 0.15
75 0.15
76 0.17
77 0.16
78 0.15
79 0.14
80 0.14
81 0.14
82 0.12
83 0.11
84 0.09
85 0.09
86 0.08
87 0.08
88 0.07
89 0.07
90 0.08
91 0.09
92 0.1
93 0.1
94 0.09
95 0.12
96 0.13
97 0.13
98 0.11
99 0.11
100 0.09
101 0.1
102 0.1
103 0.08
104 0.09
105 0.1
106 0.13
107 0.19
108 0.21
109 0.25
110 0.29
111 0.29
112 0.31
113 0.33
114 0.3
115 0.26
116 0.27
117 0.21
118 0.17
119 0.15
120 0.12
121 0.1
122 0.09
123 0.07
124 0.05
125 0.05
126 0.05
127 0.07
128 0.09
129 0.11
130 0.13
131 0.14
132 0.15
133 0.16
134 0.16
135 0.14
136 0.12
137 0.12
138 0.11
139 0.1
140 0.08
141 0.07
142 0.08
143 0.08
144 0.07
145 0.06
146 0.05
147 0.05
148 0.06
149 0.06
150 0.05
151 0.05
152 0.06
153 0.07
154 0.08
155 0.09
156 0.08
157 0.11
158 0.13
159 0.13
160 0.14
161 0.15
162 0.15
163 0.16
164 0.16
165 0.14
166 0.15
167 0.22
168 0.2
169 0.19
170 0.2
171 0.18
172 0.18
173 0.17
174 0.14
175 0.07
176 0.07
177 0.05
178 0.06
179 0.06
180 0.06
181 0.06
182 0.06
183 0.07
184 0.07
185 0.08
186 0.08
187 0.15
188 0.15
189 0.16
190 0.18
191 0.21
192 0.29
193 0.36
194 0.38
195 0.35
196 0.42
197 0.49
198 0.51
199 0.54
200 0.47
201 0.44
202 0.46
203 0.45
204 0.41
205 0.38
206 0.35
207 0.31
208 0.32
209 0.29
210 0.23
211 0.21
212 0.19
213 0.16
214 0.16
215 0.14
216 0.12
217 0.12
218 0.13
219 0.14
220 0.13
221 0.11
222 0.11
223 0.12
224 0.11
225 0.1
226 0.1
227 0.13
228 0.15
229 0.17
230 0.22
231 0.26
232 0.3
233 0.35
234 0.4
235 0.41
236 0.5
237 0.51
238 0.51
239 0.5
240 0.51
241 0.44
242 0.4
243 0.36
244 0.25
245 0.23
246 0.17
247 0.13
248 0.09
249 0.09
250 0.07
251 0.06
252 0.05
253 0.04
254 0.04
255 0.04
256 0.05
257 0.05
258 0.06
259 0.09
260 0.11
261 0.12
262 0.13
263 0.15
264 0.15
265 0.14
266 0.17
267 0.14
268 0.13
269 0.17
270 0.19
271 0.21
272 0.28
273 0.34
274 0.36
275 0.42
276 0.51
277 0.53
278 0.61
279 0.61
280 0.58
281 0.6
282 0.55
283 0.55
284 0.52
285 0.48
286 0.4
287 0.43
288 0.38
289 0.32
290 0.31
291 0.26
292 0.21
293 0.18
294 0.15
295 0.08
296 0.07
297 0.05
298 0.05
299 0.05
300 0.03
301 0.03
302 0.03
303 0.03
304 0.03
305 0.02
306 0.03
307 0.03
308 0.03
309 0.03
310 0.06
311 0.07
312 0.08
313 0.09
314 0.11
315 0.11
316 0.11
317 0.13
318 0.1
319 0.09
320 0.09
321 0.08
322 0.06
323 0.06
324 0.05
325 0.03
326 0.03
327 0.03
328 0.04
329 0.04
330 0.04
331 0.04
332 0.05
333 0.05
334 0.05
335 0.05
336 0.05
337 0.1
338 0.11
339 0.12
340 0.11
341 0.14
342 0.15
343 0.15
344 0.21
345 0.17
346 0.18
347 0.18
348 0.19
349 0.19
350 0.19
351 0.2
352 0.15
353 0.18
354 0.17
355 0.15
356 0.14
357 0.11
358 0.12
359 0.1
360 0.12
361 0.08
362 0.09
363 0.1
364 0.12
365 0.13
366 0.13
367 0.15
368 0.14
369 0.16
370 0.14
371 0.13
372 0.11
373 0.1
374 0.09
375 0.07
376 0.06
377 0.04
378 0.05
379 0.05
380 0.06
381 0.06
382 0.06
383 0.07
384 0.08
385 0.09
386 0.09
387 0.09
388 0.08
389 0.08
390 0.12
391 0.13
392 0.18
393 0.22
394 0.25
395 0.34
396 0.35
397 0.36
398 0.35
399 0.36
400 0.34
401 0.32
402 0.3
403 0.21
404 0.21
405 0.21
406 0.22
407 0.21
408 0.2
409 0.18
410 0.17
411 0.17
412 0.16
413 0.16
414 0.17
415 0.19
416 0.18
417 0.18
418 0.17
419 0.17
420 0.18
421 0.18
422 0.15
423 0.14
424 0.14
425 0.16
426 0.17
427 0.17
428 0.16
429 0.14
430 0.13
431 0.12
432 0.1
433 0.11
434 0.12
435 0.14
436 0.14
437 0.17
438 0.26
439 0.29
440 0.34
441 0.39
442 0.43
443 0.42
444 0.42
445 0.4
446 0.36
447 0.35
448 0.32
449 0.27
450 0.21
451 0.19
452 0.19
453 0.17
454 0.12
455 0.09
456 0.08
457 0.06
458 0.06
459 0.05
460 0.05
461 0.05
462 0.05
463 0.05
464 0.04
465 0.04
466 0.05
467 0.06
468 0.08
469 0.13
470 0.15
471 0.19
472 0.2
473 0.22
474 0.3
475 0.37
476 0.43
477 0.46
478 0.54
479 0.56
480 0.64
481 0.66
482 0.61
483 0.56
484 0.49
485 0.42
486 0.36
487 0.33
488 0.33
489 0.3
490 0.27
491 0.3
492 0.3
493 0.3
494 0.3
495 0.28
496 0.24
497 0.28
498 0.34
499 0.39
500 0.49
501 0.58
502 0.66
503 0.73
504 0.79
505 0.83
506 0.81
507 0.76
508 0.69
509 0.65
510 0.6
511 0.56
512 0.5
513 0.42