Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4S4LMD3

Protein Details
Accession A0A4S4LMD3    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
207-230STVTQPKKKGRPSKSDRLKKTRDAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
213-226KKKGRPSKSDRLKK
Subcellular Location(s) nucl 12, cyto 5, mito 4, extr 3, cyto_pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019188  SNAPC1  
Pfam View protein in Pfam  
PF09808  SNAPC1  
Amino Acid Sequences MSVAPSPSTSRGDLILQPSFFTSSLFVTPFRADLQRLTHLYVSQYAQSSQPFALFKQIWAEQGWTWIHLKVFDDRTREAFLRVACRLFVERLVETEAALHRVVALFALYTFYATQPRDSFPPLYVLHQVAIPIDTYASLLSLPTSLGPLLSSLAPYTVHILQKLLTTRAFHILPSSTLQPNNPRTLPREIFVPDDTPLPSASIPSTSTVTQPKKKGRPSKSDRLKKTRDAVTGLDRWLERTEHTYRIPTTTTDTDTVPADTTTTDSHKLASTHILLSNAPTTSRTTYQSHKSRLLDALLPLPTAPLTRANTAVLARLKHIDAVAAERGMEVGGEGGESTGLTRVERAVGELALPGRRGGILGLLEGGGLEVPFDDQRQQQQGGPETEGGDGDGTEVPMQVDQQGRS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.31
2 0.33
3 0.29
4 0.28
5 0.28
6 0.28
7 0.25
8 0.21
9 0.17
10 0.14
11 0.17
12 0.18
13 0.17
14 0.18
15 0.19
16 0.2
17 0.21
18 0.22
19 0.2
20 0.23
21 0.28
22 0.32
23 0.34
24 0.35
25 0.34
26 0.32
27 0.33
28 0.33
29 0.29
30 0.25
31 0.25
32 0.23
33 0.24
34 0.23
35 0.24
36 0.2
37 0.22
38 0.2
39 0.19
40 0.26
41 0.24
42 0.24
43 0.27
44 0.28
45 0.26
46 0.26
47 0.28
48 0.2
49 0.25
50 0.25
51 0.21
52 0.21
53 0.21
54 0.2
55 0.19
56 0.21
57 0.22
58 0.3
59 0.32
60 0.35
61 0.35
62 0.38
63 0.41
64 0.4
65 0.34
66 0.3
67 0.29
68 0.3
69 0.31
70 0.28
71 0.23
72 0.25
73 0.26
74 0.23
75 0.23
76 0.2
77 0.18
78 0.19
79 0.22
80 0.2
81 0.17
82 0.19
83 0.17
84 0.15
85 0.15
86 0.13
87 0.1
88 0.1
89 0.1
90 0.07
91 0.06
92 0.04
93 0.04
94 0.06
95 0.05
96 0.06
97 0.06
98 0.07
99 0.13
100 0.13
101 0.17
102 0.17
103 0.2
104 0.22
105 0.25
106 0.25
107 0.2
108 0.26
109 0.23
110 0.24
111 0.25
112 0.23
113 0.2
114 0.19
115 0.18
116 0.13
117 0.12
118 0.1
119 0.07
120 0.06
121 0.05
122 0.05
123 0.05
124 0.05
125 0.04
126 0.04
127 0.04
128 0.04
129 0.04
130 0.04
131 0.05
132 0.05
133 0.05
134 0.05
135 0.05
136 0.06
137 0.06
138 0.06
139 0.05
140 0.06
141 0.06
142 0.06
143 0.09
144 0.12
145 0.13
146 0.13
147 0.13
148 0.13
149 0.16
150 0.17
151 0.16
152 0.14
153 0.15
154 0.16
155 0.19
156 0.19
157 0.16
158 0.16
159 0.15
160 0.14
161 0.15
162 0.17
163 0.15
164 0.16
165 0.18
166 0.24
167 0.27
168 0.29
169 0.29
170 0.28
171 0.3
172 0.37
173 0.36
174 0.29
175 0.28
176 0.26
177 0.26
178 0.25
179 0.22
180 0.15
181 0.16
182 0.15
183 0.13
184 0.12
185 0.1
186 0.09
187 0.08
188 0.08
189 0.07
190 0.08
191 0.08
192 0.1
193 0.09
194 0.12
195 0.19
196 0.25
197 0.3
198 0.36
199 0.43
200 0.5
201 0.58
202 0.65
203 0.66
204 0.71
205 0.74
206 0.78
207 0.8
208 0.82
209 0.83
210 0.82
211 0.8
212 0.75
213 0.74
214 0.7
215 0.62
216 0.55
217 0.49
218 0.44
219 0.41
220 0.35
221 0.3
222 0.24
223 0.22
224 0.21
225 0.18
226 0.14
227 0.16
228 0.19
229 0.21
230 0.22
231 0.24
232 0.24
233 0.25
234 0.26
235 0.21
236 0.23
237 0.21
238 0.23
239 0.2
240 0.2
241 0.19
242 0.19
243 0.18
244 0.14
245 0.11
246 0.09
247 0.08
248 0.09
249 0.09
250 0.11
251 0.13
252 0.12
253 0.14
254 0.15
255 0.16
256 0.15
257 0.17
258 0.17
259 0.16
260 0.18
261 0.18
262 0.16
263 0.17
264 0.18
265 0.14
266 0.13
267 0.12
268 0.13
269 0.16
270 0.18
271 0.21
272 0.22
273 0.28
274 0.37
275 0.45
276 0.48
277 0.51
278 0.51
279 0.5
280 0.49
281 0.46
282 0.39
283 0.32
284 0.3
285 0.24
286 0.22
287 0.18
288 0.16
289 0.14
290 0.11
291 0.11
292 0.13
293 0.15
294 0.17
295 0.19
296 0.19
297 0.21
298 0.21
299 0.25
300 0.22
301 0.2
302 0.2
303 0.21
304 0.21
305 0.2
306 0.2
307 0.16
308 0.13
309 0.16
310 0.16
311 0.14
312 0.14
313 0.12
314 0.12
315 0.1
316 0.09
317 0.05
318 0.04
319 0.04
320 0.03
321 0.04
322 0.03
323 0.04
324 0.04
325 0.04
326 0.06
327 0.07
328 0.07
329 0.08
330 0.09
331 0.11
332 0.11
333 0.13
334 0.12
335 0.12
336 0.12
337 0.13
338 0.15
339 0.15
340 0.15
341 0.13
342 0.12
343 0.12
344 0.12
345 0.1
346 0.11
347 0.1
348 0.1
349 0.1
350 0.09
351 0.09
352 0.09
353 0.08
354 0.05
355 0.04
356 0.04
357 0.03
358 0.05
359 0.06
360 0.08
361 0.11
362 0.15
363 0.22
364 0.28
365 0.3
366 0.31
367 0.37
368 0.44
369 0.44
370 0.43
371 0.38
372 0.33
373 0.31
374 0.29
375 0.22
376 0.15
377 0.11
378 0.11
379 0.1
380 0.1
381 0.09
382 0.1
383 0.1
384 0.1
385 0.11
386 0.13