Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5FJ48

Protein Details
Accession C5FJ48    Localization Confidence High Confidence Score 20.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
326-345SDSDFKPKPAPKPVRKHVGAHydrophilic
378-406LSVTRGKGFTKEKNKKKRGSYRGGPIDIGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
334-341PAPKPVRK
384-397KGFTKEKNKKKRGS
Subcellular Location(s) nucl 21, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007718  Srp40_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
Pfam View protein in Pfam  
PF05022  SRP40_C  
Amino Acid Sequences MAAGKKTTTAKAQKSSAQTTKEKAKATSASPALLACISQFLGDHGFTKTKAAFVAEQKGNTDIANSMQQTNLSEEEIPSLDVIYELWETKNSAAPGADKDAESSSDSDSDSVSSDASSDVSMQDAASSSSESEDSSDSESSDNEETSKPALKETEKQSLKRKLESDSSSSDSDSDSDSDSDSDDAPTAKKAKLEPSAKKAPEPEHDSSSEDSDSDSGSGSDSDADSDSLSSSDSDSDSESSSDSDSDSSLDDAAKKTKTPAKKEASILKKAVKTPLPESDSSDSSSDSSDSSDDDDDDDKAKSTVAEERKASSDSSATLAATSGQSDSDFKPKPAPKPVRKHVGARPTPLAAASELPHNHPSNAYVPYAYAERAHRDLSVTRGKGFTKEKNKKKRGSYRGGPIDIGPGNSYKFED
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.64
2 0.69
3 0.67
4 0.65
5 0.62
6 0.61
7 0.66
8 0.65
9 0.62
10 0.55
11 0.55
12 0.52
13 0.5
14 0.52
15 0.44
16 0.39
17 0.35
18 0.33
19 0.27
20 0.22
21 0.19
22 0.1
23 0.1
24 0.09
25 0.08
26 0.08
27 0.09
28 0.11
29 0.12
30 0.13
31 0.14
32 0.17
33 0.17
34 0.21
35 0.2
36 0.18
37 0.19
38 0.2
39 0.23
40 0.26
41 0.35
42 0.35
43 0.35
44 0.35
45 0.35
46 0.33
47 0.27
48 0.23
49 0.14
50 0.13
51 0.18
52 0.18
53 0.17
54 0.18
55 0.19
56 0.19
57 0.21
58 0.19
59 0.15
60 0.15
61 0.14
62 0.15
63 0.15
64 0.14
65 0.11
66 0.1
67 0.08
68 0.07
69 0.07
70 0.07
71 0.07
72 0.08
73 0.09
74 0.1
75 0.11
76 0.12
77 0.17
78 0.15
79 0.15
80 0.15
81 0.16
82 0.18
83 0.22
84 0.22
85 0.17
86 0.18
87 0.18
88 0.19
89 0.18
90 0.17
91 0.13
92 0.13
93 0.14
94 0.12
95 0.12
96 0.11
97 0.1
98 0.09
99 0.08
100 0.07
101 0.07
102 0.07
103 0.07
104 0.06
105 0.06
106 0.06
107 0.06
108 0.06
109 0.06
110 0.06
111 0.06
112 0.06
113 0.06
114 0.07
115 0.06
116 0.07
117 0.07
118 0.07
119 0.08
120 0.08
121 0.08
122 0.11
123 0.11
124 0.1
125 0.11
126 0.11
127 0.12
128 0.12
129 0.11
130 0.1
131 0.11
132 0.11
133 0.13
134 0.18
135 0.15
136 0.16
137 0.19
138 0.2
139 0.27
140 0.31
141 0.39
142 0.39
143 0.44
144 0.52
145 0.58
146 0.59
147 0.57
148 0.54
149 0.47
150 0.5
151 0.49
152 0.44
153 0.38
154 0.38
155 0.34
156 0.32
157 0.28
158 0.2
159 0.18
160 0.15
161 0.11
162 0.09
163 0.08
164 0.08
165 0.08
166 0.08
167 0.09
168 0.08
169 0.07
170 0.07
171 0.07
172 0.07
173 0.09
174 0.11
175 0.12
176 0.13
177 0.15
178 0.2
179 0.28
180 0.36
181 0.39
182 0.44
183 0.52
184 0.5
185 0.5
186 0.48
187 0.43
188 0.42
189 0.44
190 0.39
191 0.33
192 0.34
193 0.34
194 0.31
195 0.28
196 0.22
197 0.15
198 0.12
199 0.1
200 0.09
201 0.07
202 0.06
203 0.04
204 0.05
205 0.05
206 0.05
207 0.05
208 0.05
209 0.05
210 0.05
211 0.05
212 0.05
213 0.05
214 0.05
215 0.05
216 0.05
217 0.05
218 0.05
219 0.05
220 0.06
221 0.06
222 0.07
223 0.08
224 0.08
225 0.08
226 0.08
227 0.08
228 0.08
229 0.08
230 0.07
231 0.07
232 0.06
233 0.06
234 0.06
235 0.06
236 0.06
237 0.07
238 0.08
239 0.09
240 0.12
241 0.12
242 0.12
243 0.17
244 0.23
245 0.3
246 0.36
247 0.44
248 0.48
249 0.53
250 0.58
251 0.62
252 0.63
253 0.61
254 0.57
255 0.54
256 0.51
257 0.47
258 0.48
259 0.43
260 0.39
261 0.38
262 0.42
263 0.4
264 0.37
265 0.4
266 0.38
267 0.35
268 0.33
269 0.3
270 0.22
271 0.19
272 0.18
273 0.14
274 0.1
275 0.1
276 0.08
277 0.08
278 0.1
279 0.1
280 0.09
281 0.1
282 0.11
283 0.11
284 0.12
285 0.12
286 0.11
287 0.1
288 0.1
289 0.09
290 0.1
291 0.17
292 0.21
293 0.26
294 0.26
295 0.29
296 0.31
297 0.32
298 0.31
299 0.24
300 0.2
301 0.16
302 0.17
303 0.15
304 0.13
305 0.11
306 0.11
307 0.11
308 0.1
309 0.09
310 0.07
311 0.07
312 0.08
313 0.1
314 0.12
315 0.2
316 0.22
317 0.22
318 0.32
319 0.37
320 0.44
321 0.52
322 0.61
323 0.62
324 0.71
325 0.79
326 0.8
327 0.79
328 0.8
329 0.77
330 0.77
331 0.72
332 0.68
333 0.62
334 0.53
335 0.49
336 0.42
337 0.35
338 0.25
339 0.21
340 0.16
341 0.19
342 0.19
343 0.22
344 0.28
345 0.28
346 0.28
347 0.27
348 0.29
349 0.26
350 0.28
351 0.25
352 0.19
353 0.18
354 0.2
355 0.2
356 0.18
357 0.18
358 0.19
359 0.23
360 0.25
361 0.26
362 0.25
363 0.26
364 0.28
365 0.32
366 0.38
367 0.35
368 0.34
369 0.37
370 0.37
371 0.42
372 0.47
373 0.5
374 0.51
375 0.6
376 0.69
377 0.76
378 0.85
379 0.87
380 0.9
381 0.91
382 0.9
383 0.9
384 0.89
385 0.88
386 0.88
387 0.82
388 0.72
389 0.62
390 0.58
391 0.49
392 0.41
393 0.32
394 0.24
395 0.23