Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4S4M6D5

Protein Details
Accession A0A4S4M6D5    Localization Confidence High Confidence Score 15.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
164-183QEMRCPKTGKIERRKCAKPEBasic
707-728SAGPDSPSRKPREPRRESKEAMHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
716-721KPREPR
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 13.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039771  Csl4  
IPR019495  EXOSC1_C  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
IPR006964  NUDE_dom  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0000178  C:exosome (RNase complex)  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006396  P:RNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF10447  EXOSC1  
PF04880  NUDE_C  
CDD cd05791  S1_CSL4  
Amino Acid Sequences MASDCLLPGQPIRLPRGPLPQLGGGIYSKDGHVRASLVGIPHHDASTLAISHVRPHPPAPNSTVLGSVTRLSPQQAMVSITIVDGVPLPAGEEFTGVIRVQDVRATEKDKVKIGDCFRGGDVVKGLVISLGDARSYYLTTARNDLGVIFATSEAGATMEPVSWQEMRCPKTGKIERRKCAKPEEWSAATSTQLYRSPKETCLSPLEPRFSLRSGLCFLSPGTMTAVLSATDALRKENMMASLDDQLNYASSTDWKSKYYEVAEMLSETRNELDDFHQSSKELEEELERELQRTEKAQQNLKVKVERAESERDEWKSKFVSLQTTHNKTTTSLQREIDTLRQDHQKIKVQLRELEMGNDDLERTERAISSSLADVETKYSRALEEKILLEHELLDKANMEEECQRFKDELRDANAEISVLKDQIQTIQARASNVTLNSEASSSRSTFLQNGPQKSDDDLLHTQLPSDLQLSDLSPESNSPSPTTATPRPLTSPLNKDAGQSALLRKAGFASRAKLSTTQASPFSSRSTTVPSLSSPTRAPPRTALTRPSPRTPMSPISSNTVNSIPTIVSKNRGVQMVSEMRARVKNLEQKIHTRVPRLRMGSTSTRPPSGSATSILSSKPPSIVSSATSSNSSLQPRTSDERIRPSILSRRGEESAEKKQTPRRDSTGWVLIMEDSPTPLKSKEKEARKMTSATSATNVPSYRPYVSAGPDSPSRKPREPRRESKEAMSRSTMLSFKRPTSQTSTSTEGRSSVGTTATISSLATPVSRPTTPTSIPVPSSGLYSGTGTKHSTGPGSGTYSSNGLKRSSLEFSTTGSPTVFNHLSDSVYHHRERPTSVPAPPRVSLEKSSPSAYRSPSIYRSPPNLLSSNLTVRASPRLPPGNMTSLSQSRIAKPNFGASGRRSSGEDSDLEAILGGFDRNRMRSSTLAASTNRRV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.36
2 0.41
3 0.5
4 0.49
5 0.49
6 0.49
7 0.45
8 0.41
9 0.37
10 0.34
11 0.24
12 0.22
13 0.2
14 0.17
15 0.15
16 0.17
17 0.17
18 0.16
19 0.17
20 0.17
21 0.16
22 0.18
23 0.19
24 0.17
25 0.19
26 0.2
27 0.22
28 0.22
29 0.22
30 0.19
31 0.17
32 0.18
33 0.2
34 0.17
35 0.14
36 0.16
37 0.17
38 0.22
39 0.29
40 0.3
41 0.29
42 0.32
43 0.4
44 0.41
45 0.46
46 0.45
47 0.45
48 0.43
49 0.41
50 0.4
51 0.32
52 0.29
53 0.26
54 0.22
55 0.17
56 0.17
57 0.17
58 0.17
59 0.18
60 0.18
61 0.19
62 0.19
63 0.21
64 0.19
65 0.19
66 0.17
67 0.15
68 0.14
69 0.11
70 0.09
71 0.07
72 0.07
73 0.06
74 0.06
75 0.07
76 0.06
77 0.07
78 0.07
79 0.07
80 0.07
81 0.08
82 0.1
83 0.09
84 0.09
85 0.1
86 0.11
87 0.11
88 0.13
89 0.14
90 0.17
91 0.22
92 0.26
93 0.32
94 0.37
95 0.41
96 0.43
97 0.45
98 0.43
99 0.46
100 0.47
101 0.49
102 0.43
103 0.42
104 0.37
105 0.4
106 0.37
107 0.31
108 0.27
109 0.19
110 0.18
111 0.15
112 0.15
113 0.1
114 0.09
115 0.07
116 0.08
117 0.08
118 0.07
119 0.08
120 0.09
121 0.09
122 0.1
123 0.1
124 0.13
125 0.16
126 0.18
127 0.22
128 0.22
129 0.21
130 0.21
131 0.2
132 0.17
133 0.14
134 0.13
135 0.09
136 0.08
137 0.08
138 0.08
139 0.07
140 0.06
141 0.05
142 0.05
143 0.05
144 0.05
145 0.05
146 0.06
147 0.07
148 0.1
149 0.11
150 0.12
151 0.18
152 0.25
153 0.29
154 0.33
155 0.37
156 0.37
157 0.46
158 0.55
159 0.59
160 0.63
161 0.7
162 0.74
163 0.79
164 0.83
165 0.78
166 0.79
167 0.75
168 0.72
169 0.7
170 0.7
171 0.63
172 0.57
173 0.53
174 0.44
175 0.38
176 0.32
177 0.24
178 0.19
179 0.22
180 0.24
181 0.24
182 0.27
183 0.3
184 0.31
185 0.33
186 0.31
187 0.3
188 0.35
189 0.36
190 0.39
191 0.41
192 0.42
193 0.41
194 0.41
195 0.4
196 0.34
197 0.34
198 0.28
199 0.26
200 0.24
201 0.25
202 0.23
203 0.2
204 0.19
205 0.17
206 0.16
207 0.14
208 0.13
209 0.12
210 0.12
211 0.11
212 0.12
213 0.09
214 0.09
215 0.09
216 0.07
217 0.09
218 0.09
219 0.1
220 0.1
221 0.1
222 0.11
223 0.13
224 0.14
225 0.13
226 0.14
227 0.14
228 0.19
229 0.19
230 0.18
231 0.16
232 0.15
233 0.13
234 0.13
235 0.11
236 0.07
237 0.08
238 0.11
239 0.17
240 0.18
241 0.19
242 0.21
243 0.22
244 0.27
245 0.27
246 0.27
247 0.23
248 0.23
249 0.22
250 0.2
251 0.2
252 0.17
253 0.15
254 0.12
255 0.1
256 0.1
257 0.1
258 0.1
259 0.11
260 0.16
261 0.19
262 0.21
263 0.21
264 0.2
265 0.21
266 0.2
267 0.19
268 0.14
269 0.11
270 0.11
271 0.11
272 0.13
273 0.18
274 0.17
275 0.17
276 0.17
277 0.18
278 0.17
279 0.19
280 0.23
281 0.24
282 0.29
283 0.35
284 0.41
285 0.47
286 0.51
287 0.53
288 0.52
289 0.46
290 0.46
291 0.43
292 0.39
293 0.35
294 0.36
295 0.34
296 0.34
297 0.38
298 0.36
299 0.37
300 0.35
301 0.34
302 0.29
303 0.28
304 0.27
305 0.23
306 0.29
307 0.27
308 0.36
309 0.41
310 0.45
311 0.46
312 0.44
313 0.42
314 0.35
315 0.4
316 0.39
317 0.37
318 0.36
319 0.35
320 0.35
321 0.36
322 0.37
323 0.34
324 0.29
325 0.24
326 0.23
327 0.28
328 0.29
329 0.32
330 0.36
331 0.4
332 0.43
333 0.48
334 0.49
335 0.47
336 0.49
337 0.48
338 0.45
339 0.37
340 0.32
341 0.26
342 0.22
343 0.19
344 0.14
345 0.11
346 0.08
347 0.08
348 0.07
349 0.07
350 0.07
351 0.07
352 0.08
353 0.1
354 0.1
355 0.1
356 0.1
357 0.1
358 0.1
359 0.1
360 0.09
361 0.1
362 0.11
363 0.1
364 0.09
365 0.09
366 0.09
367 0.11
368 0.13
369 0.12
370 0.14
371 0.14
372 0.15
373 0.15
374 0.15
375 0.13
376 0.12
377 0.11
378 0.09
379 0.08
380 0.07
381 0.07
382 0.07
383 0.09
384 0.08
385 0.09
386 0.13
387 0.15
388 0.18
389 0.18
390 0.2
391 0.18
392 0.19
393 0.24
394 0.23
395 0.27
396 0.28
397 0.29
398 0.29
399 0.29
400 0.28
401 0.21
402 0.16
403 0.13
404 0.09
405 0.07
406 0.07
407 0.06
408 0.06
409 0.08
410 0.11
411 0.11
412 0.11
413 0.13
414 0.14
415 0.14
416 0.14
417 0.14
418 0.13
419 0.12
420 0.13
421 0.11
422 0.1
423 0.1
424 0.1
425 0.09
426 0.09
427 0.1
428 0.09
429 0.09
430 0.1
431 0.1
432 0.12
433 0.14
434 0.21
435 0.25
436 0.26
437 0.28
438 0.29
439 0.28
440 0.28
441 0.29
442 0.2
443 0.2
444 0.19
445 0.18
446 0.18
447 0.17
448 0.16
449 0.14
450 0.14
451 0.09
452 0.08
453 0.06
454 0.06
455 0.06
456 0.06
457 0.07
458 0.07
459 0.07
460 0.06
461 0.06
462 0.09
463 0.1
464 0.1
465 0.1
466 0.11
467 0.12
468 0.13
469 0.19
470 0.19
471 0.22
472 0.23
473 0.23
474 0.24
475 0.26
476 0.29
477 0.28
478 0.3
479 0.28
480 0.31
481 0.3
482 0.28
483 0.26
484 0.24
485 0.2
486 0.16
487 0.15
488 0.14
489 0.15
490 0.14
491 0.13
492 0.14
493 0.14
494 0.16
495 0.16
496 0.16
497 0.17
498 0.18
499 0.19
500 0.2
501 0.2
502 0.2
503 0.2
504 0.2
505 0.19
506 0.2
507 0.21
508 0.2
509 0.2
510 0.17
511 0.16
512 0.15
513 0.19
514 0.19
515 0.18
516 0.18
517 0.17
518 0.2
519 0.2
520 0.21
521 0.16
522 0.19
523 0.26
524 0.26
525 0.27
526 0.27
527 0.32
528 0.37
529 0.39
530 0.39
531 0.39
532 0.48
533 0.5
534 0.51
535 0.49
536 0.44
537 0.44
538 0.44
539 0.41
540 0.35
541 0.36
542 0.33
543 0.33
544 0.33
545 0.3
546 0.28
547 0.22
548 0.19
549 0.15
550 0.14
551 0.1
552 0.1
553 0.14
554 0.13
555 0.15
556 0.17
557 0.2
558 0.21
559 0.23
560 0.21
561 0.18
562 0.23
563 0.24
564 0.24
565 0.22
566 0.2
567 0.21
568 0.23
569 0.23
570 0.2
571 0.22
572 0.28
573 0.31
574 0.37
575 0.38
576 0.41
577 0.47
578 0.52
579 0.48
580 0.48
581 0.48
582 0.47
583 0.51
584 0.48
585 0.43
586 0.38
587 0.4
588 0.41
589 0.39
590 0.42
591 0.37
592 0.36
593 0.35
594 0.34
595 0.32
596 0.27
597 0.25
598 0.19
599 0.19
600 0.18
601 0.19
602 0.18
603 0.16
604 0.15
605 0.14
606 0.13
607 0.12
608 0.12
609 0.13
610 0.14
611 0.14
612 0.16
613 0.17
614 0.17
615 0.17
616 0.17
617 0.17
618 0.2
619 0.21
620 0.19
621 0.18
622 0.19
623 0.22
624 0.27
625 0.3
626 0.32
627 0.34
628 0.41
629 0.44
630 0.44
631 0.4
632 0.4
633 0.44
634 0.45
635 0.45
636 0.39
637 0.39
638 0.39
639 0.39
640 0.39
641 0.36
642 0.38
643 0.42
644 0.41
645 0.41
646 0.46
647 0.53
648 0.54
649 0.55
650 0.51
651 0.47
652 0.5
653 0.52
654 0.52
655 0.44
656 0.38
657 0.32
658 0.27
659 0.24
660 0.2
661 0.14
662 0.09
663 0.09
664 0.09
665 0.1
666 0.12
667 0.17
668 0.18
669 0.29
670 0.36
671 0.45
672 0.54
673 0.59
674 0.63
675 0.62
676 0.62
677 0.53
678 0.53
679 0.45
680 0.36
681 0.31
682 0.27
683 0.24
684 0.25
685 0.24
686 0.17
687 0.19
688 0.2
689 0.2
690 0.19
691 0.21
692 0.2
693 0.22
694 0.26
695 0.24
696 0.24
697 0.29
698 0.32
699 0.35
700 0.41
701 0.45
702 0.48
703 0.57
704 0.65
705 0.7
706 0.76
707 0.81
708 0.82
709 0.84
710 0.79
711 0.79
712 0.77
713 0.7
714 0.64
715 0.56
716 0.49
717 0.41
718 0.41
719 0.36
720 0.29
721 0.32
722 0.31
723 0.3
724 0.37
725 0.37
726 0.37
727 0.43
728 0.46
729 0.43
730 0.45
731 0.48
732 0.43
733 0.43
734 0.39
735 0.32
736 0.28
737 0.24
738 0.2
739 0.16
740 0.13
741 0.12
742 0.12
743 0.12
744 0.11
745 0.11
746 0.09
747 0.09
748 0.08
749 0.08
750 0.08
751 0.08
752 0.1
753 0.15
754 0.15
755 0.17
756 0.21
757 0.27
758 0.27
759 0.31
760 0.32
761 0.31
762 0.32
763 0.31
764 0.29
765 0.23
766 0.24
767 0.2
768 0.17
769 0.14
770 0.15
771 0.17
772 0.15
773 0.18
774 0.17
775 0.19
776 0.19
777 0.2
778 0.2
779 0.17
780 0.18
781 0.18
782 0.21
783 0.21
784 0.2
785 0.2
786 0.22
787 0.23
788 0.24
789 0.23
790 0.21
791 0.2
792 0.22
793 0.25
794 0.26
795 0.26
796 0.26
797 0.25
798 0.26
799 0.3
800 0.28
801 0.25
802 0.21
803 0.2
804 0.17
805 0.24
806 0.22
807 0.18
808 0.2
809 0.2
810 0.2
811 0.2
812 0.26
813 0.26
814 0.3
815 0.32
816 0.34
817 0.38
818 0.39
819 0.43
820 0.42
821 0.43
822 0.43
823 0.48
824 0.52
825 0.54
826 0.57
827 0.53
828 0.53
829 0.5
830 0.49
831 0.46
832 0.44
833 0.44
834 0.41
835 0.44
836 0.41
837 0.39
838 0.4
839 0.4
840 0.37
841 0.34
842 0.37
843 0.39
844 0.45
845 0.48
846 0.5
847 0.52
848 0.55
849 0.56
850 0.55
851 0.52
852 0.47
853 0.44
854 0.42
855 0.42
856 0.39
857 0.34
858 0.3
859 0.3
860 0.35
861 0.32
862 0.31
863 0.34
864 0.38
865 0.38
866 0.41
867 0.45
868 0.44
869 0.44
870 0.42
871 0.4
872 0.36
873 0.37
874 0.39
875 0.36
876 0.35
877 0.43
878 0.43
879 0.41
880 0.4
881 0.45
882 0.45
883 0.45
884 0.45
885 0.4
886 0.47
887 0.44
888 0.44
889 0.39
890 0.37
891 0.38
892 0.35
893 0.32
894 0.26
895 0.26
896 0.25
897 0.22
898 0.19
899 0.15
900 0.12
901 0.12
902 0.09
903 0.06
904 0.11
905 0.16
906 0.19
907 0.21
908 0.23
909 0.26
910 0.28
911 0.33
912 0.36
913 0.37
914 0.4
915 0.42