Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4S4LPW5

Protein Details
Accession A0A4S4LPW5    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
38-59PVTPQRIPRAHRHQHQLQNYFSHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto 5, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR018957  Znf_C3HC4_RING-type  
IPR000679  Znf_GATA  
IPR001841  Znf_RING  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
IPR017907  Znf_RING_CS  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0043565  F:sequence-specific DNA binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF00097  zf-C3HC4  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50114  GATA_ZN_FINGER_2  
PS50102  RRM  
PS00518  ZF_RING_1  
PS50089  ZF_RING_2  
Amino Acid Sequences MMTTTSKHSFYLPTVPASAPTTPAYIRSNKFNDDGPPPVTPQRIPRAHRHQHQLQNYFSHSPSTPASTLSTPYTPLSFRSAWSSDDSSALTTPVSVASAKRMGISLSPNVHITGYRNETGRADSPEDWRSRANENGIRVTSGENAHFVNDEGTYRCGLVRRDPAHISPFRCIYAAKSVPLMHALTCLLDPLFTVQSHCLALVLHHIDALLPPPFFTGPRRPRSQTLAHQGLPSVSAQMQAQPHTPGRRTLAALNTPPPLASNVNRIKMKGSFTDPAYPRRRQPFGQTPTELFDIDENDPYPMTFSPSQRLALPLALHDPFDGSGLSDLSFPRIPAPVFFPHNECSETPSKTGDSSCSVCGQTSSSLAVLDPCSHVLCSACLTSALNIVGEKDMECAVCKIGVADFHLRTSGMNGSTGSNGTRVPQTNGFKVTDVDGLLGQFNIFDIAETSTTINAGQRQASGRPGELPVLRIDNVPWDITPPAIASWLKHPVRRVHVLLDRKGKTLSHAFVEMVDEEAARLALRTAQNSVLGKGKRARGVTVTRSGQEELMKALFPSWQGRFDGTRPSLGGLNNEQVLATLEYGLISDSELKALLHLIQSPDVGVVLYVHCNQPHCSTACTFPSKQSHFLKVPSLPFHSLISILSKFPVDQDSRVFWSSTSRDTLYEITMTALQILVLRNTDKFNWSDPELLAQLFQTAVSCQAFTVEQTAKLTNLANTSQHIIFPRSPASSISGLSSHTPDPASQRHTNVPRAPVQAQHSQGLQHGPFDGLAREFGLDSHLVEALVHRLSGMH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.33
2 0.33
3 0.33
4 0.33
5 0.31
6 0.24
7 0.23
8 0.23
9 0.21
10 0.25
11 0.28
12 0.32
13 0.35
14 0.41
15 0.44
16 0.45
17 0.47
18 0.46
19 0.46
20 0.43
21 0.45
22 0.4
23 0.37
24 0.37
25 0.4
26 0.4
27 0.38
28 0.41
29 0.47
30 0.52
31 0.54
32 0.61
33 0.67
34 0.73
35 0.78
36 0.8
37 0.79
38 0.8
39 0.85
40 0.81
41 0.74
42 0.7
43 0.66
44 0.6
45 0.5
46 0.45
47 0.35
48 0.32
49 0.3
50 0.3
51 0.26
52 0.24
53 0.27
54 0.24
55 0.27
56 0.27
57 0.26
58 0.22
59 0.23
60 0.24
61 0.22
62 0.22
63 0.26
64 0.23
65 0.23
66 0.27
67 0.28
68 0.27
69 0.31
70 0.32
71 0.27
72 0.28
73 0.27
74 0.22
75 0.21
76 0.19
77 0.14
78 0.1
79 0.1
80 0.08
81 0.09
82 0.08
83 0.08
84 0.13
85 0.16
86 0.17
87 0.17
88 0.17
89 0.17
90 0.19
91 0.22
92 0.23
93 0.24
94 0.25
95 0.25
96 0.25
97 0.25
98 0.23
99 0.22
100 0.24
101 0.26
102 0.27
103 0.27
104 0.28
105 0.29
106 0.32
107 0.33
108 0.3
109 0.3
110 0.3
111 0.34
112 0.4
113 0.4
114 0.38
115 0.36
116 0.35
117 0.35
118 0.37
119 0.4
120 0.37
121 0.39
122 0.43
123 0.41
124 0.38
125 0.34
126 0.31
127 0.27
128 0.25
129 0.21
130 0.17
131 0.16
132 0.16
133 0.16
134 0.15
135 0.12
136 0.1
137 0.11
138 0.11
139 0.13
140 0.12
141 0.12
142 0.13
143 0.16
144 0.18
145 0.23
146 0.31
147 0.32
148 0.37
149 0.4
150 0.42
151 0.47
152 0.5
153 0.45
154 0.4
155 0.4
156 0.35
157 0.33
158 0.3
159 0.24
160 0.29
161 0.29
162 0.25
163 0.26
164 0.26
165 0.26
166 0.28
167 0.26
168 0.16
169 0.15
170 0.14
171 0.12
172 0.11
173 0.11
174 0.08
175 0.07
176 0.07
177 0.08
178 0.1
179 0.09
180 0.11
181 0.11
182 0.13
183 0.14
184 0.13
185 0.11
186 0.09
187 0.09
188 0.13
189 0.14
190 0.12
191 0.12
192 0.12
193 0.12
194 0.12
195 0.14
196 0.11
197 0.09
198 0.09
199 0.1
200 0.11
201 0.12
202 0.17
203 0.25
204 0.32
205 0.4
206 0.47
207 0.5
208 0.54
209 0.59
210 0.62
211 0.6
212 0.6
213 0.59
214 0.54
215 0.5
216 0.46
217 0.4
218 0.33
219 0.24
220 0.16
221 0.1
222 0.09
223 0.09
224 0.12
225 0.14
226 0.14
227 0.16
228 0.18
229 0.22
230 0.26
231 0.27
232 0.27
233 0.29
234 0.3
235 0.31
236 0.31
237 0.32
238 0.33
239 0.33
240 0.33
241 0.3
242 0.27
243 0.25
244 0.22
245 0.19
246 0.17
247 0.16
248 0.23
249 0.27
250 0.34
251 0.35
252 0.35
253 0.35
254 0.35
255 0.36
256 0.3
257 0.29
258 0.26
259 0.27
260 0.36
261 0.35
262 0.42
263 0.46
264 0.46
265 0.47
266 0.51
267 0.53
268 0.46
269 0.53
270 0.55
271 0.54
272 0.58
273 0.54
274 0.47
275 0.46
276 0.46
277 0.36
278 0.26
279 0.2
280 0.16
281 0.15
282 0.15
283 0.12
284 0.11
285 0.11
286 0.1
287 0.11
288 0.08
289 0.12
290 0.14
291 0.15
292 0.19
293 0.21
294 0.22
295 0.21
296 0.22
297 0.19
298 0.17
299 0.16
300 0.13
301 0.14
302 0.13
303 0.13
304 0.11
305 0.1
306 0.08
307 0.09
308 0.08
309 0.05
310 0.05
311 0.06
312 0.06
313 0.07
314 0.07
315 0.09
316 0.09
317 0.09
318 0.1
319 0.11
320 0.11
321 0.11
322 0.15
323 0.16
324 0.19
325 0.2
326 0.22
327 0.22
328 0.23
329 0.25
330 0.2
331 0.22
332 0.23
333 0.24
334 0.22
335 0.21
336 0.2
337 0.19
338 0.2
339 0.16
340 0.16
341 0.16
342 0.16
343 0.17
344 0.16
345 0.15
346 0.15
347 0.14
348 0.11
349 0.1
350 0.1
351 0.08
352 0.07
353 0.07
354 0.08
355 0.07
356 0.07
357 0.07
358 0.07
359 0.07
360 0.07
361 0.07
362 0.07
363 0.07
364 0.07
365 0.07
366 0.06
367 0.06
368 0.06
369 0.06
370 0.08
371 0.07
372 0.06
373 0.06
374 0.06
375 0.06
376 0.06
377 0.06
378 0.05
379 0.06
380 0.05
381 0.06
382 0.06
383 0.06
384 0.06
385 0.05
386 0.05
387 0.05
388 0.05
389 0.08
390 0.11
391 0.11
392 0.12
393 0.12
394 0.12
395 0.11
396 0.12
397 0.12
398 0.08
399 0.09
400 0.09
401 0.09
402 0.1
403 0.11
404 0.09
405 0.08
406 0.08
407 0.08
408 0.11
409 0.12
410 0.14
411 0.2
412 0.22
413 0.24
414 0.27
415 0.26
416 0.23
417 0.23
418 0.21
419 0.16
420 0.13
421 0.11
422 0.09
423 0.08
424 0.08
425 0.07
426 0.06
427 0.04
428 0.04
429 0.04
430 0.03
431 0.03
432 0.04
433 0.05
434 0.05
435 0.06
436 0.06
437 0.06
438 0.06
439 0.07
440 0.07
441 0.08
442 0.09
443 0.09
444 0.1
445 0.12
446 0.13
447 0.16
448 0.16
449 0.15
450 0.15
451 0.15
452 0.17
453 0.16
454 0.16
455 0.14
456 0.15
457 0.15
458 0.13
459 0.13
460 0.13
461 0.13
462 0.13
463 0.11
464 0.11
465 0.1
466 0.1
467 0.1
468 0.07
469 0.06
470 0.09
471 0.09
472 0.08
473 0.12
474 0.22
475 0.23
476 0.25
477 0.29
478 0.33
479 0.38
480 0.43
481 0.41
482 0.38
483 0.43
484 0.48
485 0.5
486 0.53
487 0.48
488 0.44
489 0.44
490 0.37
491 0.34
492 0.33
493 0.29
494 0.21
495 0.21
496 0.2
497 0.19
498 0.2
499 0.16
500 0.12
501 0.1
502 0.08
503 0.06
504 0.06
505 0.06
506 0.04
507 0.04
508 0.03
509 0.08
510 0.09
511 0.11
512 0.12
513 0.13
514 0.17
515 0.18
516 0.19
517 0.22
518 0.21
519 0.24
520 0.27
521 0.31
522 0.32
523 0.32
524 0.33
525 0.32
526 0.38
527 0.39
528 0.42
529 0.4
530 0.36
531 0.37
532 0.36
533 0.32
534 0.27
535 0.22
536 0.16
537 0.15
538 0.14
539 0.12
540 0.11
541 0.1
542 0.11
543 0.15
544 0.15
545 0.17
546 0.18
547 0.2
548 0.22
549 0.22
550 0.3
551 0.26
552 0.26
553 0.24
554 0.24
555 0.25
556 0.24
557 0.25
558 0.19
559 0.2
560 0.19
561 0.18
562 0.16
563 0.14
564 0.15
565 0.12
566 0.1
567 0.07
568 0.07
569 0.07
570 0.07
571 0.07
572 0.05
573 0.04
574 0.06
575 0.06
576 0.06
577 0.07
578 0.07
579 0.07
580 0.08
581 0.08
582 0.08
583 0.1
584 0.11
585 0.11
586 0.11
587 0.11
588 0.11
589 0.09
590 0.08
591 0.06
592 0.05
593 0.06
594 0.08
595 0.09
596 0.11
597 0.13
598 0.15
599 0.17
600 0.19
601 0.23
602 0.22
603 0.23
604 0.24
605 0.27
606 0.32
607 0.36
608 0.34
609 0.37
610 0.44
611 0.45
612 0.52
613 0.52
614 0.53
615 0.5
616 0.52
617 0.51
618 0.47
619 0.48
620 0.44
621 0.44
622 0.38
623 0.36
624 0.35
625 0.3
626 0.25
627 0.21
628 0.21
629 0.17
630 0.15
631 0.15
632 0.14
633 0.14
634 0.15
635 0.2
636 0.18
637 0.19
638 0.22
639 0.25
640 0.29
641 0.31
642 0.29
643 0.23
644 0.28
645 0.28
646 0.28
647 0.29
648 0.25
649 0.25
650 0.27
651 0.29
652 0.23
653 0.21
654 0.18
655 0.15
656 0.15
657 0.14
658 0.12
659 0.1
660 0.08
661 0.1
662 0.11
663 0.1
664 0.11
665 0.12
666 0.14
667 0.17
668 0.18
669 0.19
670 0.2
671 0.23
672 0.26
673 0.28
674 0.29
675 0.27
676 0.29
677 0.27
678 0.25
679 0.21
680 0.17
681 0.15
682 0.11
683 0.11
684 0.07
685 0.07
686 0.1
687 0.1
688 0.1
689 0.1
690 0.11
691 0.12
692 0.11
693 0.17
694 0.16
695 0.17
696 0.2
697 0.21
698 0.2
699 0.21
700 0.22
701 0.18
702 0.2
703 0.2
704 0.19
705 0.2
706 0.25
707 0.23
708 0.24
709 0.25
710 0.26
711 0.26
712 0.28
713 0.3
714 0.27
715 0.28
716 0.27
717 0.28
718 0.26
719 0.25
720 0.24
721 0.2
722 0.2
723 0.21
724 0.23
725 0.19
726 0.19
727 0.19
728 0.18
729 0.24
730 0.29
731 0.35
732 0.36
733 0.4
734 0.48
735 0.54
736 0.61
737 0.61
738 0.6
739 0.59
740 0.6
741 0.57
742 0.54
743 0.53
744 0.52
745 0.49
746 0.46
747 0.41
748 0.36
749 0.37
750 0.37
751 0.32
752 0.26
753 0.23
754 0.21
755 0.21
756 0.21
757 0.2
758 0.14
759 0.15
760 0.14
761 0.14
762 0.13
763 0.12
764 0.14
765 0.12
766 0.11
767 0.12
768 0.12
769 0.11
770 0.11
771 0.12
772 0.13
773 0.13
774 0.12