FuNGI

A0A4S4LQ58

Protein Details

Accession

A0A4S4LQ58

Localization Confidence

Low

Confidence Score

7.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
251-274	AVEKSSGKRKRCCRPQPRLFNPDE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

cyto_nucl 9, nucl 8.5, cyto 8.5, mito 4, plas 2, extr 1, pero 1, cysk 1, vacu 1

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR005824 KOW IPR041973 KOW_Spt5_1 IPR005100 NGN-domain IPR036735 NGN_dom_sf IPR039659 SPT5
Gene Ontology	GO:0032784 P:regulation of DNA-templated transcription elongation GO:0006357 P:regulation of transcription by RNA polymerase II
Pfam	View protein in Pfam PF03439 Spt5-NGN
CDD	cd06081 KOW_Spt5_1

Amino Acid Sequences

MSCQNRARKAQNPFLDLEAEEDSRDEDSEEEDGDFVDFLQDDISAEDTAGEPFLDPGPTYRAEALSDDNPSALEAIADQYKVRARHRVASSWRKRATPVERQGEGTPTAAIGNGRRADVVEHIRCSATRVGMGGEKPPTIGEVFSVPSLRGLVYIEAPSSLDVRNAVGGHSGVNPLDAIRLVPVEERSQVYVLKTRPNSDVDFATGQWVRIRRGPYAKDLALVQEVDVKHGLLTVAVCPRIALSEKPDIEAVEKSSGKRKRCCRPQPRLFNPDEIRRLYGPASVQQHDLYLVFSAAKYRYGLRFMKVAYRSAIPCKETPSNGDVLPFLDALNQGLPFHGGLVAQILTAEAQEALRHGDRVRIISGEQSGLWGTFRHAQDGTAIVAVEASIIPGLLLSSHREDEDVDAPVTEFVVPLSSIRPYFRPGDHVKVRHEDQTGIVFAVDDVSSSVSFIETTTQNT

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.57
2	0.51
3	0.43
4	0.37
5	0.3
6	0.23
7	0.19
8	0.17
9	0.16
10	0.15
11	0.15
12	0.12
13	0.09
14	0.11
15	0.12
16	0.12
17	0.12
18	0.11
19	0.11
20	0.1
21	0.1
22	0.07
23	0.08
24	0.06
25	0.06
26	0.06
27	0.06
28	0.06
29	0.07
30	0.09
31	0.08
32	0.08
33	0.08
34	0.08
35	0.09
36	0.09
37	0.08
38	0.06
39	0.07
40	0.09
41	0.09
42	0.08
43	0.1
44	0.14
45	0.15
46	0.17
47	0.18
48	0.17
49	0.18
50	0.2
51	0.22
52	0.21
53	0.22
54	0.2
55	0.18
56	0.17
57	0.16
58	0.15
59	0.1
60	0.07
61	0.05
62	0.08
63	0.09
64	0.1
65	0.09
66	0.12
67	0.17
68	0.22
69	0.25
70	0.31
71	0.33
72	0.42
73	0.47
74	0.53
75	0.58
76	0.65
77	0.71
78	0.72
79	0.73
80	0.65
81	0.64
82	0.65
83	0.64
84	0.63
85	0.63
86	0.61
87	0.59
88	0.6
89	0.58
90	0.52
91	0.44
92	0.34
93	0.24
94	0.16
95	0.14
96	0.12
97	0.12
98	0.1
99	0.15
100	0.16
101	0.16
102	0.16
103	0.16
104	0.16
105	0.21
106	0.28
107	0.25
108	0.26
109	0.26
110	0.27
111	0.26
112	0.29
113	0.26
114	0.18
115	0.15
116	0.14
117	0.14
118	0.17
119	0.18
120	0.18
121	0.17
122	0.16
123	0.16
124	0.15
125	0.15
126	0.12
127	0.11
128	0.08
129	0.08
130	0.09
131	0.1
132	0.1
133	0.09
134	0.09
135	0.1
136	0.09
137	0.07
138	0.07
139	0.07
140	0.08
141	0.09
142	0.09
143	0.08
144	0.08
145	0.08
146	0.09
147	0.08
148	0.07
149	0.07
150	0.07
151	0.09
152	0.09
153	0.08
154	0.08
155	0.08
156	0.08
157	0.09
158	0.09
159	0.07
160	0.07
161	0.07
162	0.06
163	0.07
164	0.06
165	0.05
166	0.05
167	0.05
168	0.05
169	0.06
170	0.08
171	0.09
172	0.1
173	0.11
174	0.12
175	0.13
176	0.13
177	0.13
178	0.17
179	0.18
180	0.23
181	0.24
182	0.25
183	0.27
184	0.29
185	0.29
186	0.26
187	0.25
188	0.2
189	0.2
190	0.17
191	0.18
192	0.16
193	0.14
194	0.15
195	0.17
196	0.16
197	0.18
198	0.21
199	0.21
200	0.27
201	0.29
202	0.31
203	0.34
204	0.33
205	0.3
206	0.28
207	0.25
208	0.19
209	0.17
210	0.12
211	0.11
212	0.11
213	0.11
214	0.11
215	0.1
216	0.08
217	0.09
218	0.09
219	0.05
220	0.05
221	0.06
222	0.08
223	0.08
224	0.08
225	0.08
226	0.08
227	0.09
228	0.1
229	0.08
230	0.11
231	0.17
232	0.18
233	0.19
234	0.19
235	0.18
236	0.18
237	0.18
238	0.16
239	0.14
240	0.15
241	0.15
242	0.24
243	0.29
244	0.34
245	0.41
246	0.48
247	0.54
248	0.64
249	0.74
250	0.77
251	0.82
252	0.86
253	0.9
254	0.9
255	0.87
256	0.78
257	0.76
258	0.69
259	0.65
260	0.59
261	0.49
262	0.43
263	0.36
264	0.35
265	0.27
266	0.25
267	0.19
268	0.19
269	0.22
270	0.21
271	0.22
272	0.2
273	0.2
274	0.18
275	0.18
276	0.12
277	0.08
278	0.07
279	0.06
280	0.06
281	0.08
282	0.08
283	0.09
284	0.1
285	0.12
286	0.14
287	0.2
288	0.22
289	0.21
290	0.24
291	0.24
292	0.31
293	0.3
294	0.3
295	0.25
296	0.27
297	0.27
298	0.3
299	0.33
300	0.29
301	0.28
302	0.32
303	0.33
304	0.31
305	0.33
306	0.29
307	0.28
308	0.25
309	0.25
310	0.19
311	0.16
312	0.16
313	0.13
314	0.1
315	0.08
316	0.08
317	0.08
318	0.09
319	0.09
320	0.08
321	0.08
322	0.08
323	0.07
324	0.07
325	0.07
326	0.05
327	0.05
328	0.07
329	0.07
330	0.06
331	0.06
332	0.05
333	0.05
334	0.05
335	0.05
336	0.04
337	0.04
338	0.04
339	0.05
340	0.09
341	0.1
342	0.12
343	0.12
344	0.16
345	0.18
346	0.2
347	0.21
348	0.18
349	0.18
350	0.2
351	0.21
352	0.17
353	0.15
354	0.14
355	0.13
356	0.12
357	0.12
358	0.09
359	0.1
360	0.17
361	0.17
362	0.2
363	0.2
364	0.2
365	0.21
366	0.22
367	0.2
368	0.14
369	0.13
370	0.09
371	0.09
372	0.09
373	0.07
374	0.05
375	0.05
376	0.04
377	0.03
378	0.03
379	0.03
380	0.04
381	0.04
382	0.05
383	0.09
384	0.12
385	0.14
386	0.14
387	0.15
388	0.16
389	0.19
390	0.21
391	0.2
392	0.17
393	0.16
394	0.17
395	0.16
396	0.16
397	0.12
398	0.08
399	0.06
400	0.07
401	0.07
402	0.07
403	0.09
404	0.12
405	0.14
406	0.16
407	0.19
408	0.21
409	0.26
410	0.27
411	0.34
412	0.37
413	0.46
414	0.52
415	0.56
416	0.58
417	0.61
418	0.63
419	0.6
420	0.57
421	0.48
422	0.41
423	0.41
424	0.36
425	0.28
426	0.25
427	0.18
428	0.16
429	0.16
430	0.13
431	0.08
432	0.07
433	0.09
434	0.09
435	0.09
436	0.09
437	0.07
438	0.08
439	0.08
440	0.12

A0A4S4LQ58

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer