FuNGI

A0A4S4M9G2

Protein Details

Accession

A0A4S4M9G2

Localization Confidence

Low

Confidence Score

6.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
116-137	EPYRRSYLKRFRRTLENVQRQS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

cyto 12.5, cyto_nucl 10.5, mito 9, nucl 5.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR045867 DNA-dir_RpoC_beta_prime IPR000722 RNA_pol_asu IPR006592 RNA_pol_N IPR007080 RNA_pol_Rpb1_1 IPR007066 RNA_pol_Rpb1_3 IPR042102 RNA_pol_Rpb1_3_sf IPR007083 RNA_pol_Rpb1_4 IPR007081 RNA_pol_Rpb1_5 IPR044893 RNA_pol_Rpb1_clamp_domain IPR035698 RNAP_III_Rpc1_C IPR035697 RNAP_III_RPC1_N IPR038120 Rpb1_funnel_sf
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0003899 F:DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity GO:0006351 P:DNA-templated transcription
Pfam	View protein in Pfam PF04997 RNA_pol_Rpb1_1 PF00623 RNA_pol_Rpb1_2 PF04983 RNA_pol_Rpb1_3 PF05000 RNA_pol_Rpb1_4 PF04998 RNA_pol_Rpb1_5
CDD	cd02736 RNAP_III_Rpc1_C cd02583 RNAP_III_RPC1_N

Amino Acid Sequences

MKDTVPHKTPKIIKGLQFGTLTAQDVVKTSEFQVTHRDLYTAVDRVPVKDGVLDRRLGTTDKGAYCETCGMNAVDCIGHFAYIKLVVPVFHVGFFRHIIQILQCICKTCARVLLEEPYRRSYLKRFRRTLENVQRQSLIKAVNAISRKAVYCPYCSATNGTVKKAGALKIIHDKFRAKKTAEELEKWKQTFNGAIETQKELGMTYISVPPVCIRPSVARDGASNEDDLTVKLTEIVFTNALIKQGLAKGAPAVQLMEQWEFLQLSVAMYINSEVPGIPSQTSQKPIRGFAQRLKGKQGRFRGNLSGKRVDFSGRTVISPDPNLRIDEVAVPERVAKILTYPERVTSWNIDKLKDAVRNGCDVHPGANYVTVGSSGFKKYLKFGNRAQIAEGLTVGDVVERHITDGDIVLFNRQPSLHKTEEARAEALQLMSVTHNMVTPRNGEPVIAAIQDFITAAWFLSSRDRFFDRAQFTQICSYFSDADLHIDLPPPTIWKPVRLWTGKQVFNTLMRPNKKSKVMVNVETKCHSRVRPNPQCYAKMTPPPDLSPNDGWLVIVNSEIICGVMDKATLGGGKKKSVFGVILRDYGPQEAAAAMNRLSRLCSRWLANFGFSIGINDVVPGPLLFSQKDALIEQAYAYCVALISRAKKGQLENKPGCDQGQTLEAEISAALSKVREEVGAICMKELSRHNASYIMASCGSKGSVINVSQMVACVGQQIIAGHRVPDGFQDRSLPHFPKKSRDPPSKGFVRNSFFTGLSPTEFLFHAISGREGLVDTAVKTAETGYMQRRLMKALEDLTTQYDLSVRNGTGGVVQFQYGDDGLDPACLEGDAQPVDMVRIWNHASAITTRHSRGLLPYEILAIVDRELSRQRFTEEGMAAYESTIRDFIIEYVVIRLAEARRSRGMFDAMECDREWDADTDLSMGASGGFKPEEVDDFFQSGFTILNIPHLLLTDADKAIVDNKAKVTEDQLLAFLNICRGKYMKAKIEPGSTVGAVGAQSIGEPGTQMTLKTFHFAGVASMNITLGVPRIKEIINASKTISTPIISCKLVTNDSEPSARIVKGRLEKTYLGDIASVLEEAWASEYTYIGVIVDLQSIQKLQLELTLDDIKRAILNTKKLQVKPASVIIVPQKDRLRIYVDGQDKYYRLRELRRMLPEVVVKGIPSISRAVINIKDKDDERGKKGDKELLLEGYGLQKVLVTEGIVGEQTSSNHVIEVAQVLGIEAARFTIISEIQYTMAQHSMSIDPRHVMLLGDVMTYKVCRPTLHGEVLGITRFGVAKMKDSVLMLASFEKTTDHLFDASAFGKKDDIVGVSESIIMGNPAANCGTSM

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.64
2	0.63
3	0.59
4	0.52
5	0.46
6	0.4
7	0.35
8	0.31
9	0.23
10	0.22
11	0.16
12	0.17
13	0.2
14	0.17
15	0.17
16	0.16
17	0.21
18	0.21
19	0.22
20	0.3
21	0.31
22	0.33
23	0.33
24	0.31
25	0.25
26	0.29
27	0.33
28	0.28
29	0.23
30	0.26
31	0.26
32	0.28
33	0.31
34	0.28
35	0.23
36	0.25
37	0.29
38	0.3
39	0.33
40	0.34
41	0.31
42	0.32
43	0.34
44	0.31
45	0.29
46	0.27
47	0.31
48	0.3
49	0.32
50	0.32
51	0.3
52	0.31
53	0.34
54	0.28
55	0.21
56	0.22
57	0.19
58	0.19
59	0.18
60	0.17
61	0.12
62	0.11
63	0.15
64	0.13
65	0.13
66	0.12
67	0.12
68	0.13
69	0.15
70	0.15
71	0.13
72	0.13
73	0.13
74	0.15
75	0.19
76	0.18
77	0.18
78	0.18
79	0.18
80	0.2
81	0.22
82	0.22
83	0.19
84	0.19
85	0.18
86	0.19
87	0.24
88	0.25
89	0.28
90	0.27
91	0.28
92	0.3
93	0.33
94	0.34
95	0.29
96	0.33
97	0.31
98	0.33
99	0.34
100	0.41
101	0.46
102	0.49
103	0.51
104	0.48
105	0.48
106	0.46
107	0.46
108	0.47
109	0.49
110	0.54
111	0.61
112	0.63
113	0.66
114	0.75
115	0.8
116	0.81
117	0.81
118	0.81
119	0.75
120	0.71
121	0.7
122	0.61
123	0.54
124	0.47
125	0.38
126	0.27
127	0.27
128	0.26
129	0.28
130	0.29
131	0.28
132	0.27
133	0.28
134	0.28
135	0.26
136	0.31
137	0.27
138	0.29
139	0.32
140	0.33
141	0.33
142	0.33
143	0.35
144	0.32
145	0.39
146	0.38
147	0.37
148	0.37
149	0.35
150	0.37
151	0.38
152	0.35
153	0.32
154	0.3
155	0.31
156	0.38
157	0.42
158	0.42
159	0.41
160	0.46
161	0.48
162	0.56
163	0.59
164	0.5
165	0.52
166	0.56
167	0.62
168	0.61
169	0.6
170	0.59
171	0.61
172	0.66
173	0.6
174	0.55
175	0.46
176	0.42
177	0.41
178	0.36
179	0.33
180	0.28
181	0.3
182	0.31
183	0.33
184	0.31
185	0.26
186	0.24
187	0.16
188	0.15
189	0.13
190	0.11
191	0.1
192	0.12
193	0.13
194	0.13
195	0.13
196	0.14
197	0.17
198	0.18
199	0.16
200	0.16
201	0.21
202	0.26
203	0.32
204	0.33
205	0.3
206	0.3
207	0.34
208	0.35
209	0.3
210	0.26
211	0.2
212	0.19
213	0.18
214	0.17
215	0.15
216	0.11
217	0.1
218	0.11
219	0.11
220	0.1
221	0.11
222	0.13
223	0.11
224	0.11
225	0.14
226	0.13
227	0.14
228	0.13
229	0.12
230	0.12
231	0.14
232	0.15
233	0.12
234	0.12
235	0.12
236	0.14
237	0.15
238	0.13
239	0.12
240	0.11
241	0.13
242	0.15
243	0.15
244	0.13
245	0.12
246	0.13
247	0.12
248	0.12
249	0.11
250	0.09
251	0.08
252	0.09
253	0.09
254	0.07
255	0.07
256	0.08
257	0.07
258	0.07
259	0.07
260	0.06
261	0.08
262	0.09
263	0.1
264	0.11
265	0.12
266	0.17
267	0.2
268	0.27
269	0.28
270	0.33
271	0.34
272	0.37
273	0.42
274	0.45
275	0.46
276	0.47
277	0.54
278	0.55
279	0.55
280	0.61
281	0.6
282	0.57
283	0.6
284	0.63
285	0.62
286	0.6
287	0.61
288	0.62
289	0.65
290	0.66
291	0.65
292	0.63
293	0.54
294	0.51
295	0.47
296	0.4
297	0.32
298	0.29
299	0.3
300	0.22
301	0.22
302	0.24
303	0.25
304	0.25
305	0.27
306	0.27
307	0.23
308	0.24
309	0.24
310	0.23
311	0.21
312	0.19
313	0.19
314	0.19
315	0.18
316	0.16
317	0.16
318	0.16
319	0.16
320	0.15
321	0.12
322	0.09
323	0.08
324	0.16
325	0.19
326	0.23
327	0.23
328	0.25
329	0.26
330	0.27
331	0.29
332	0.27
333	0.29
334	0.33
335	0.34
336	0.33
337	0.33
338	0.34
339	0.38
340	0.36
341	0.34
342	0.32
343	0.32
344	0.34
345	0.35
346	0.32
347	0.29
348	0.24
349	0.23
350	0.18
351	0.18
352	0.15
353	0.14
354	0.13
355	0.1
356	0.1
357	0.09
358	0.08
359	0.08
360	0.1
361	0.1
362	0.12
363	0.14
364	0.14
365	0.17
366	0.25
367	0.3
368	0.33
369	0.37
370	0.45
371	0.48
372	0.48
373	0.46
374	0.41
375	0.36
376	0.31
377	0.25
378	0.16
379	0.11
380	0.1
381	0.08
382	0.05
383	0.04
384	0.05
385	0.07
386	0.06
387	0.07
388	0.07
389	0.08
390	0.07
391	0.08
392	0.09
393	0.08
394	0.08
395	0.1
396	0.11
397	0.11
398	0.12
399	0.12
400	0.13
401	0.16
402	0.23
403	0.23
404	0.25
405	0.28
406	0.32
407	0.37
408	0.37
409	0.33
410	0.27
411	0.26
412	0.24
413	0.21
414	0.15
415	0.1
416	0.08
417	0.07
418	0.08
419	0.07
420	0.06
421	0.08
422	0.09
423	0.1
424	0.11
425	0.13
426	0.14
427	0.17
428	0.17
429	0.15
430	0.14
431	0.14
432	0.14
433	0.12
434	0.1
435	0.07
436	0.07
437	0.07
438	0.07
439	0.05
440	0.04
441	0.04
442	0.04
443	0.04
444	0.05
445	0.05
446	0.13
447	0.15
448	0.15
449	0.18
450	0.21
451	0.23
452	0.26
453	0.33
454	0.3
455	0.3
456	0.34
457	0.32
458	0.32
459	0.34
460	0.33
461	0.26
462	0.22
463	0.22
464	0.18
465	0.18
466	0.18
467	0.12
468	0.13
469	0.13
470	0.12
471	0.1
472	0.12
473	0.11
474	0.1
475	0.1
476	0.11
477	0.11
478	0.17
479	0.17
480	0.2
481	0.22
482	0.27
483	0.35
484	0.36
485	0.38
486	0.4
487	0.47
488	0.46
489	0.44
490	0.41
491	0.34
492	0.34
493	0.36
494	0.32
495	0.32
496	0.33
497	0.37
498	0.4
499	0.44
500	0.46
501	0.46
502	0.45
503	0.47
504	0.49
505	0.52
506	0.56
507	0.53
508	0.51
509	0.5
510	0.47
511	0.39
512	0.37
513	0.32
514	0.31
515	0.37
516	0.46
517	0.54
518	0.57
519	0.62
520	0.63
521	0.64
522	0.6
523	0.57
524	0.5
525	0.48
526	0.45
527	0.43
528	0.4
529	0.38
530	0.38
531	0.33
532	0.33
533	0.27
534	0.26
535	0.22
536	0.2
537	0.18
538	0.14
539	0.13
540	0.08
541	0.07
542	0.06
543	0.04
544	0.05
545	0.04
546	0.04
547	0.03
548	0.03
549	0.04
550	0.04
551	0.04
552	0.04
553	0.04
554	0.04
555	0.05
556	0.06
557	0.12
558	0.13
559	0.16
560	0.17
561	0.18
562	0.18
563	0.18
564	0.19
565	0.15
566	0.21
567	0.2
568	0.2
569	0.2
570	0.2
571	0.19
572	0.18
573	0.16
574	0.09
575	0.08
576	0.06
577	0.06
578	0.06
579	0.06
580	0.06
581	0.07
582	0.08
583	0.08
584	0.09
585	0.1
586	0.11
587	0.14
588	0.16
589	0.17
590	0.19
591	0.23
592	0.23
593	0.22
594	0.2
595	0.17
596	0.15
597	0.13
598	0.12
599	0.08
600	0.07
601	0.06
602	0.06
603	0.06
604	0.05
605	0.05
606	0.04
607	0.04
608	0.06
609	0.07
610	0.07
611	0.08
612	0.09
613	0.09
614	0.1
615	0.1
616	0.08
617	0.08
618	0.08
619	0.07
620	0.07
621	0.06
622	0.06
623	0.05
624	0.04
625	0.04
626	0.04
627	0.06
628	0.07
629	0.09
630	0.12
631	0.13
632	0.14
633	0.16
634	0.2
635	0.27
636	0.33
637	0.41
638	0.41
639	0.44
640	0.45
641	0.43
642	0.4
643	0.32
644	0.24
645	0.15
646	0.16
647	0.12
648	0.11
649	0.1
650	0.09
651	0.08
652	0.08
653	0.07
654	0.04
655	0.04
656	0.03
657	0.03
658	0.04
659	0.04
660	0.05
661	0.04
662	0.05
663	0.05
664	0.09
665	0.11
666	0.11
667	0.1
668	0.11
669	0.1
670	0.13
671	0.14
672	0.16
673	0.17
674	0.17
675	0.18
676	0.2
677	0.2
678	0.19
679	0.18
680	0.14
681	0.12
682	0.12
683	0.11
684	0.1
685	0.1
686	0.08
687	0.07
688	0.07
689	0.09
690	0.09
691	0.1
692	0.1
693	0.11
694	0.1
695	0.1
696	0.09
697	0.06
698	0.05
699	0.05
700	0.04
701	0.04
702	0.05
703	0.05
704	0.05
705	0.08
706	0.08
707	0.07
708	0.08
709	0.08
710	0.08
711	0.11
712	0.15
713	0.13
714	0.13
715	0.16
716	0.16
717	0.21
718	0.25
719	0.25
720	0.25
721	0.31
722	0.33
723	0.38
724	0.46
725	0.51
726	0.56
727	0.63
728	0.66
729	0.64
730	0.69
731	0.7
732	0.65
733	0.6
734	0.56
735	0.51
736	0.45
737	0.42
738	0.37
739	0.29
740	0.25
741	0.22
742	0.17
743	0.14
744	0.13
745	0.11
746	0.1
747	0.1
748	0.11
749	0.09
750	0.08
751	0.08
752	0.08
753	0.08
754	0.07
755	0.07
756	0.06
757	0.06
758	0.06
759	0.05
760	0.05
761	0.05
762	0.06
763	0.06
764	0.05
765	0.05
766	0.06
767	0.06
768	0.06
769	0.09
770	0.12
771	0.17
772	0.18
773	0.21
774	0.22
775	0.22
776	0.22
777	0.21
778	0.2
779	0.17
780	0.17
781	0.15
782	0.15
783	0.15
784	0.15
785	0.13
786	0.11
787	0.11
788	0.1
789	0.11
790	0.12
791	0.1
792	0.1
793	0.11
794	0.11
795	0.11
796	0.11
797	0.1
798	0.08
799	0.09
800	0.08
801	0.08
802	0.08
803	0.06
804	0.06
805	0.05
806	0.05
807	0.05
808	0.05
809	0.05
810	0.04
811	0.04
812	0.04
813	0.04
814	0.04
815	0.06
816	0.06
817	0.06
818	0.06
819	0.06
820	0.07
821	0.08
822	0.08
823	0.06
824	0.09
825	0.1
826	0.11
827	0.11
828	0.11
829	0.11
830	0.12
831	0.14
832	0.14
833	0.16
834	0.16
835	0.18
836	0.18
837	0.18
838	0.2
839	0.22
840	0.2
841	0.18
842	0.18
843	0.16
844	0.16
845	0.15
846	0.12
847	0.07
848	0.06
849	0.07
850	0.07
851	0.08
852	0.13
853	0.14
854	0.16
855	0.16
856	0.18
857	0.17
858	0.19
859	0.22
860	0.19
861	0.17
862	0.17
863	0.16
864	0.14
865	0.13
866	0.14
867	0.08
868	0.08
869	0.08
870	0.06
871	0.06
872	0.07
873	0.07
874	0.07
875	0.07
876	0.07
877	0.08
878	0.09
879	0.08
880	0.08
881	0.1
882	0.09
883	0.15
884	0.17
885	0.19
886	0.22
887	0.23
888	0.24
889	0.24
890	0.26
891	0.2
892	0.2
893	0.22
894	0.19
895	0.2
896	0.19
897	0.19
898	0.16
899	0.16
900	0.16
901	0.11
902	0.12
903	0.11
904	0.11
905	0.09
906	0.09
907	0.09
908	0.07
909	0.06
910	0.05
911	0.05
912	0.05
913	0.05
914	0.05
915	0.06
916	0.06
917	0.07
918	0.09
919	0.11
920	0.14
921	0.14
922	0.15
923	0.15
924	0.14
925	0.14
926	0.12
927	0.09
928	0.07
929	0.07
930	0.06
931	0.09
932	0.09
933	0.09
934	0.09
935	0.09
936	0.1
937	0.09
938	0.11
939	0.11
940	0.11
941	0.11
942	0.1
943	0.1
944	0.12
945	0.15
946	0.14
947	0.14
948	0.15
949	0.18
950	0.19
951	0.19
952	0.2
953	0.22
954	0.22
955	0.2
956	0.19
957	0.17
958	0.16
959	0.17
960	0.14
961	0.13
962	0.14
963	0.13
964	0.14
965	0.14
966	0.18
967	0.25
968	0.31
969	0.35
970	0.39
971	0.45
972	0.48
973	0.5
974	0.48
975	0.42
976	0.38
977	0.29
978	0.23
979	0.17
980	0.14
981	0.1
982	0.09
983	0.07
984	0.04
985	0.04
986	0.04
987	0.04
988	0.04
989	0.04
990	0.04
991	0.06
992	0.07
993	0.07
994	0.08
995	0.11
996	0.12
997	0.14
998	0.14
999	0.12
1000	0.12
1001	0.12
1002	0.12
1003	0.1
1004	0.1
1005	0.09
1006	0.09
1007	0.08
1008	0.08
1009	0.07
1010	0.06
1011	0.07
1012	0.08
1013	0.08
1014	0.08
1015	0.11
1016	0.11
1017	0.13
1018	0.18
1019	0.25
1020	0.26
1021	0.27
1022	0.28
1023	0.28
1024	0.28
1025	0.29
1026	0.25
1027	0.17
1028	0.16
1029	0.19
1030	0.22
1031	0.2
1032	0.2
1033	0.21
1034	0.23
1035	0.25
1036	0.25
1037	0.24
1038	0.23
1039	0.25
1040	0.25
1041	0.23
1042	0.22
1043	0.23
1044	0.22
1045	0.2
1046	0.19
1047	0.24
1048	0.31
1049	0.34
1050	0.34
1051	0.36
1052	0.37
1053	0.39
1054	0.41
1055	0.35
1056	0.27
1057	0.23
1058	0.2
1059	0.17
1060	0.16
1061	0.12
1062	0.07
1063	0.06
1064	0.05
1065	0.05
1066	0.07
1067	0.06
1068	0.06
1069	0.07
1070	0.07
1071	0.07
1072	0.07
1073	0.07
1074	0.05
1075	0.05
1076	0.05
1077	0.05
1078	0.06
1079	0.06
1080	0.06
1081	0.07
1082	0.07
1083	0.08
1084	0.09
1085	0.09
1086	0.08
1087	0.11
1088	0.14
1089	0.13
1090	0.18
1091	0.24
1092	0.22
1093	0.23
1094	0.23
1095	0.2
1096	0.18
1097	0.19
1098	0.21
1099	0.21
1100	0.29
1101	0.35
1102	0.43
1103	0.5
1104	0.51
1105	0.58
1106	0.57
1107	0.55
1108	0.51
1109	0.49
1110	0.44
1111	0.36
1112	0.39
1113	0.38
1114	0.4
1115	0.37
1116	0.4
1117	0.39
1118	0.4
1119	0.41
1120	0.4
1121	0.38
1122	0.33
1123	0.35
1124	0.37
1125	0.4
1126	0.38
1127	0.39
1128	0.4
1129	0.36
1130	0.37
1131	0.37
1132	0.35
1133	0.34
1134	0.39
1135	0.46
1136	0.5
1137	0.58
1138	0.61
1139	0.61
1140	0.57
1141	0.57
1142	0.53
1143	0.46
1144	0.41
1145	0.32
1146	0.25
1147	0.21
1148	0.21
1149	0.17
1150	0.14
1151	0.14
1152	0.13
1153	0.14
1154	0.15
1155	0.18
1156	0.23
1157	0.3
1158	0.33
1159	0.33
1160	0.36
1161	0.35
1162	0.43
1163	0.48
1164	0.48
1165	0.46
1166	0.52
1167	0.54
1168	0.56
1169	0.6
1170	0.6
1171	0.52
1172	0.5
1173	0.48
1174	0.41
1175	0.37
1176	0.31
1177	0.27
1178	0.23
1179	0.21
1180	0.16
1181	0.13
1182	0.11
1183	0.1
1184	0.11
1185	0.11
1186	0.07
1187	0.08
1188	0.08
1189	0.09
1190	0.08
1191	0.08
1192	0.08
1193	0.09
1194	0.09
1195	0.12
1196	0.14
1197	0.14
1198	0.14
1199	0.14
1200	0.13
1201	0.12
1202	0.13
1203	0.1
1204	0.08
1205	0.07
1206	0.07
1207	0.08
1208	0.08
1209	0.07
1210	0.05
1211	0.05
1212	0.05
1213	0.05
1214	0.05
1215	0.08
1216	0.08
1217	0.1
1218	0.12
1219	0.12
1220	0.14
1221	0.15
1222	0.15
1223	0.14
1224	0.16
1225	0.14
1226	0.13
1227	0.15
1228	0.18
1229	0.22
1230	0.23
1231	0.23
1232	0.22
1233	0.23
1234	0.24
1235	0.21
1236	0.18
1237	0.13
1238	0.14
1239	0.12
1240	0.12
1241	0.11
1242	0.11
1243	0.12
1244	0.12
1245	0.14
1246	0.16
1247	0.17
1248	0.17
1249	0.23
1250	0.31
1251	0.37
1252	0.41
1253	0.4
1254	0.36
1255	0.36
1256	0.38
1257	0.33
1258	0.25
1259	0.18
1260	0.14
1261	0.13
1262	0.13
1263	0.17
1264	0.15
1265	0.19
1266	0.23
1267	0.24
1268	0.25
1269	0.25
1270	0.26
1271	0.21
1272	0.21
1273	0.18
1274	0.17
1275	0.17
1276	0.15
1277	0.15
1278	0.14
1279	0.14
1280	0.16
1281	0.18
1282	0.17
1283	0.16
1284	0.16
1285	0.17
1286	0.2
1287	0.21
1288	0.22
1289	0.2
1290	0.18
1291	0.19
1292	0.18
1293	0.19
1294	0.18
1295	0.17
1296	0.15
1297	0.16
1298	0.17
1299	0.16
1300	0.16
1301	0.14
1302	0.12
1303	0.11
1304	0.09
1305	0.07
1306	0.09
1307	0.08
1308	0.1
1309	0.1

A0A4S4M9G2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer