FuNGI

A0A4V3XFE4

Protein Details

Accession

A0A4V3XFE4

Localization Confidence

High

Confidence Score

22.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
252-271	FKYAKGGPSKRKTRGQSEKE	Basic
798-821	MPAARNVRRSHRLRKRPQNGIGVD	Hydrophilic
884-905	EFQTHGRKKRHLKEGHIPRPPN	Basic
966-995	HYKYAPVWKRTKSTKRKVRRNGEEKEERCK	Basic
1021-1040	GTGRRHTRQSSRTTHRRSSS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
257-267	GGPSKRKTRGQ
660-728	LPKPSKLKRRDMGKIGRPEAVNPARRMGRSEAMKKRTDASPVSHHRDMIAGSKRRKEKAGHKDFGKPRR
811-811	R
890-896	RKKRHLK
974-986	KRTKSTKRKVRRN

Subcellular Location(s)

nucl 22.5, cyto_nucl 14, cyto 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR044764 DDX52/Rok1_DEADc IPR011545 DEAD/DEAH_box_helicase_dom IPR037202 ESCRT_assembly_dom IPR014001 Helicase_ATP-bd IPR001650 Helicase_C IPR009071 HMG_box_dom IPR036910 HMG_box_dom_sf IPR027417 P-loop_NTPase IPR000629 RNA-helicase_DEAD-box_CS IPR007143 Vps28 IPR017899 VPS28_C IPR037206 VPS28_C_sf IPR017898 VPS28_N IPR038358 VPS28_N_sf
Gene Ontology	GO:0000813 C:ESCRT I complex GO:0005634 C:nucleus GO:0005524 F:ATP binding GO:0003677 F:DNA binding GO:0016787 F:hydrolase activity GO:0003724 F:RNA helicase activity GO:0032509 P:endosome transport via multivesicular body sorting pathway GO:0072666 P:establishment of protein localization to vacuole GO:0006886 P:intracellular protein transport GO:0030490 P:maturation of SSU-rRNA GO:0043162 P:ubiquitin-dependent protein catabolic process via the multivesicular body sorting pathway GO:0007034 P:vacuolar transport
Pfam	View protein in Pfam PF00270 DEAD PF00271 Helicase_C PF00505 HMG_box PF03997 VPS28
PROSITE	View protein in PROSITE PS00039 DEAD_ATP_HELICASE PS51192 HELICASE_ATP_BIND_1 PS51194 HELICASE_CTER PS50118 HMG_BOX_2 PS51310 VPS28_C PS51313 VPS28_N
CDD	cd17957 DEADc_DDX52 cd01389 HMG-box_ROX1-like cd18787 SF2_C_DEAD

Amino Acid Sequences

MSALLSLDEEVRLYTTNSEREKYESLATLYGIIVALDYLERAYVRDSVTAVEYSPACTRLLSQCKTTLRLVGEDVPSIEQFMSRYRMDHPAALHRLQVGVPATVEHSSEAGPETGKWVAETTQSFITFMDALKLRLRAKDQLHPILQELVTGYARFKGSKDWEGRSKMVGWLITLNGMKASEEITEEQSRQLLFDVDHAFRSDVDLFNVSDAHFALHASTQLVVQAKKGKKAEGKDVAKPAQGEIPADLDFFKYAKGGPSKRKTRGQSEKEEASNVKRRKVSEESQDEQDDEENGDVETQNKGSASTQQRHRVATKGSNVPAHAETFAELNKRYRIPSHLMANLEQYGYQHPTGIQSYGCPILLESRDLAAISPTGTGKTLSYLLPVMANLGAPISSLKTEGGKGVRAVILAPTRELAHQIYNECLKLAQGRKWRIVLFSKATAATIADKSVRDNVDIIISTPLRLVASLQSGNLELSNVQHLILDEADRMLDAEFISQVQEVAASCTHENMQKAVFSATLPANAEKVAMDMLRNPPRAASLAEELVLNSVPNVDCLHAGMSKKEREDAVSRMRRGESWVMVSTEVMARGMDFKGVREVINYDFPQSVQSYVHRIGRTGRAGREGKAITYFTNDDAPYLKTIANVLLQSGSSVPEWILKLPKPSKLKRRDMGKIGRPEAVNPARRMGRSEAMKKRTDASPVSHHRDMIAGSKRRKEKAGHKDFGKPRRSPDCGKFVALAITIGKLWQLPRGGLEVIKDVSPANARYGPSTDRSQADFAYFNNLSPANTFFTCLLCFTMPAARNVRRSHRLRKRPQNGIGVDGSKPSNLDSHSDQDPTSGSTIDTTPTSTHGPDSKPTIFTTDFAKEVIKSCPPLYALVSGNAHEFQTHGRKKRHLKEGHIPRPPNAFLIFRSHLCSRKVTRKVEHEHSHISRIGGHCWRGLTEPKREPYKQMAKEAQRLHAALFPHYKYAPVWKRTKSTKRKVRRNGEEKEERCKTVASLVVSGVEGRDLEMEVKRLKFPGTGRRHTRQSSRTTHRRSSSTIASPEATQVQEGQIAAMLPSDSPSTVSDHSLPATPILPTVNVPQAGEEACALTCTNSPDTTVSVYGKDDEFDPEIQPPHLVVADYENEQTLSSREALMAGNITLFALNNLETDDSPYLPNLALSEAFLPTSTSANSLSVLSSSSDMASPCSYLQKTSSEDATMDADDIDFTDQYINYDQAL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.15
2	0.2
3	0.28
4	0.32
5	0.34
6	0.34
7	0.39
8	0.41
9	0.39
10	0.38
11	0.33
12	0.31
13	0.31
14	0.29
15	0.25
16	0.21
17	0.19
18	0.14
19	0.1
20	0.08
21	0.06
22	0.06
23	0.05
24	0.05
25	0.04
26	0.06
27	0.06
28	0.07
29	0.09
30	0.12
31	0.14
32	0.15
33	0.16
34	0.17
35	0.19
36	0.19
37	0.17
38	0.18
39	0.16
40	0.18
41	0.2
42	0.19
43	0.17
44	0.17
45	0.2
46	0.26
47	0.36
48	0.36
49	0.38
50	0.44
51	0.48
52	0.52
53	0.51
54	0.47
55	0.4
56	0.39
57	0.38
58	0.37
59	0.34
60	0.31
61	0.3
62	0.26
63	0.24
64	0.22
65	0.19
66	0.13
67	0.13
68	0.16
69	0.2
70	0.18
71	0.2
72	0.22
73	0.3
74	0.32
75	0.34
76	0.34
77	0.39
78	0.44
79	0.43
80	0.41
81	0.34
82	0.33
83	0.29
84	0.3
85	0.22
86	0.17
87	0.16
88	0.15
89	0.16
90	0.15
91	0.16
92	0.12
93	0.11
94	0.1
95	0.11
96	0.12
97	0.11
98	0.11
99	0.1
100	0.13
101	0.14
102	0.14
103	0.13
104	0.13
105	0.14
106	0.18
107	0.2
108	0.2
109	0.23
110	0.23
111	0.23
112	0.22
113	0.22
114	0.18
115	0.16
116	0.19
117	0.16
118	0.18
119	0.21
120	0.26
121	0.27
122	0.31
123	0.35
124	0.37
125	0.41
126	0.47
127	0.52
128	0.55
129	0.56
130	0.52
131	0.5
132	0.47
133	0.41
134	0.33
135	0.26
136	0.2
137	0.18
138	0.17
139	0.16
140	0.15
141	0.17
142	0.17
143	0.17
144	0.22
145	0.27
146	0.36
147	0.42
148	0.45
149	0.52
150	0.57
151	0.58
152	0.52
153	0.48
154	0.42
155	0.39
156	0.32
157	0.25
158	0.22
159	0.2
160	0.22
161	0.2
162	0.17
163	0.14
164	0.14
165	0.13
166	0.11
167	0.12
168	0.08
169	0.1
170	0.12
171	0.16
172	0.19
173	0.19
174	0.2
175	0.21
176	0.2
177	0.19
178	0.18
179	0.14
180	0.11
181	0.17
182	0.21
183	0.19
184	0.21
185	0.22
186	0.21
187	0.19
188	0.23
189	0.19
190	0.15
191	0.16
192	0.17
193	0.16
194	0.16
195	0.17
196	0.13
197	0.12
198	0.11
199	0.09
200	0.08
201	0.08
202	0.08
203	0.08
204	0.09
205	0.09
206	0.09
207	0.08
208	0.11
209	0.15
210	0.14
211	0.17
212	0.25
213	0.27
214	0.35
215	0.37
216	0.41
217	0.44
218	0.49
219	0.56
220	0.57
221	0.59
222	0.58
223	0.64
224	0.6
225	0.56
226	0.51
227	0.42
228	0.36
229	0.32
230	0.26
231	0.19
232	0.18
233	0.16
234	0.16
235	0.15
236	0.11
237	0.11
238	0.1
239	0.1
240	0.08
241	0.08
242	0.14
243	0.23
244	0.3
245	0.39
246	0.49
247	0.59
248	0.66
249	0.74
250	0.74
251	0.77
252	0.8
253	0.78
254	0.78
255	0.76
256	0.74
257	0.67
258	0.64
259	0.56
260	0.53
261	0.54
262	0.48
263	0.47
264	0.45
265	0.45
266	0.48
267	0.53
268	0.52
269	0.53
270	0.58
271	0.55
272	0.56
273	0.56
274	0.49
275	0.42
276	0.36
277	0.26
278	0.18
279	0.14
280	0.09
281	0.08
282	0.08
283	0.08
284	0.08
285	0.09
286	0.08
287	0.09
288	0.08
289	0.09
290	0.09
291	0.18
292	0.25
293	0.31
294	0.39
295	0.48
296	0.51
297	0.54
298	0.55
299	0.52
300	0.5
301	0.49
302	0.49
303	0.46
304	0.46
305	0.45
306	0.43
307	0.41
308	0.37
309	0.31
310	0.24
311	0.17
312	0.14
313	0.13
314	0.14
315	0.14
316	0.14
317	0.16
318	0.2
319	0.21
320	0.23
321	0.24
322	0.28
323	0.31
324	0.35
325	0.38
326	0.38
327	0.38
328	0.37
329	0.37
330	0.33
331	0.26
332	0.21
333	0.16
334	0.15
335	0.16
336	0.15
337	0.13
338	0.12
339	0.15
340	0.16
341	0.16
342	0.13
343	0.11
344	0.13
345	0.13
346	0.13
347	0.1
348	0.09
349	0.13
350	0.13
351	0.14
352	0.12
353	0.12
354	0.12
355	0.12
356	0.12
357	0.08
358	0.07
359	0.06
360	0.07
361	0.07
362	0.07
363	0.08
364	0.08
365	0.08
366	0.09
367	0.1
368	0.09
369	0.1
370	0.1
371	0.1
372	0.1
373	0.1
374	0.09
375	0.07
376	0.07
377	0.05
378	0.05
379	0.04
380	0.04
381	0.05
382	0.05
383	0.05
384	0.06
385	0.06
386	0.08
387	0.08
388	0.12
389	0.13
390	0.14
391	0.14
392	0.15
393	0.15
394	0.14
395	0.13
396	0.13
397	0.15
398	0.13
399	0.14
400	0.12
401	0.13
402	0.13
403	0.15
404	0.12
405	0.12
406	0.14
407	0.15
408	0.17
409	0.18
410	0.18
411	0.16
412	0.14
413	0.12
414	0.17
415	0.19
416	0.23
417	0.3
418	0.34
419	0.38
420	0.41
421	0.41
422	0.39
423	0.4
424	0.4
425	0.35
426	0.32
427	0.31
428	0.27
429	0.26
430	0.22
431	0.18
432	0.15
433	0.12
434	0.11
435	0.11
436	0.11
437	0.12
438	0.17
439	0.16
440	0.14
441	0.15
442	0.14
443	0.14
444	0.14
445	0.14
446	0.12
447	0.12
448	0.11
449	0.11
450	0.11
451	0.08
452	0.08
453	0.08
454	0.06
455	0.1
456	0.1
457	0.1
458	0.1
459	0.1
460	0.11
461	0.1
462	0.08
463	0.05
464	0.06
465	0.07
466	0.07
467	0.07
468	0.07
469	0.07
470	0.08
471	0.08
472	0.07
473	0.06
474	0.06
475	0.05
476	0.05
477	0.05
478	0.04
479	0.05
480	0.04
481	0.04
482	0.04
483	0.05
484	0.05
485	0.05
486	0.05
487	0.04
488	0.05
489	0.04
490	0.06
491	0.06
492	0.07
493	0.07
494	0.08
495	0.09
496	0.11
497	0.12
498	0.11
499	0.12
500	0.11
501	0.12
502	0.11
503	0.1
504	0.08
505	0.1
506	0.1
507	0.1
508	0.11
509	0.1
510	0.1
511	0.1
512	0.1
513	0.07
514	0.07
515	0.06
516	0.05
517	0.05
518	0.08
519	0.15
520	0.21
521	0.22
522	0.22
523	0.21
524	0.22
525	0.23
526	0.21
527	0.16
528	0.12
529	0.12
530	0.12
531	0.12
532	0.11
533	0.1
534	0.09
535	0.06
536	0.04
537	0.05
538	0.04
539	0.05
540	0.06
541	0.06
542	0.06
543	0.06
544	0.08
545	0.09
546	0.1
547	0.12
548	0.16
549	0.18
550	0.18
551	0.2
552	0.19
553	0.19
554	0.22
555	0.25
556	0.3
557	0.34
558	0.35
559	0.35
560	0.35
561	0.33
562	0.33
563	0.31
564	0.22
565	0.18
566	0.19
567	0.17
568	0.17
569	0.16
570	0.13
571	0.11
572	0.1
573	0.07
574	0.05
575	0.04
576	0.06
577	0.06
578	0.07
579	0.07
580	0.07
581	0.1
582	0.11
583	0.11
584	0.1
585	0.11
586	0.11
587	0.16
588	0.16
589	0.15
590	0.14
591	0.14
592	0.15
593	0.14
594	0.13
595	0.09
596	0.1
597	0.12
598	0.15
599	0.19
600	0.18
601	0.18
602	0.2
603	0.24
604	0.28
605	0.27
606	0.26
607	0.29
608	0.3
609	0.3
610	0.33
611	0.28
612	0.24
613	0.23
614	0.22
615	0.15
616	0.16
617	0.16
618	0.11
619	0.14
620	0.13
621	0.12
622	0.13
623	0.13
624	0.11
625	0.12
626	0.11
627	0.08
628	0.09
629	0.1
630	0.1
631	0.09
632	0.08
633	0.07
634	0.07
635	0.07
636	0.07
637	0.07
638	0.05
639	0.06
640	0.05
641	0.07
642	0.08
643	0.09
644	0.12
645	0.12
646	0.2
647	0.22
648	0.29
649	0.35
650	0.42
651	0.51
652	0.58
653	0.66
654	0.65
655	0.7
656	0.7
657	0.71
658	0.73
659	0.7
660	0.68
661	0.61
662	0.58
663	0.5
664	0.44
665	0.44
666	0.41
667	0.38
668	0.32
669	0.33
670	0.32
671	0.32
672	0.35
673	0.29
674	0.29
675	0.3
676	0.39
677	0.43
678	0.46
679	0.48
680	0.46
681	0.46
682	0.42
683	0.4
684	0.33
685	0.29
686	0.33
687	0.38
688	0.45
689	0.42
690	0.4
691	0.36
692	0.34
693	0.31
694	0.29
695	0.3
696	0.3
697	0.33
698	0.4
699	0.44
700	0.46
701	0.49
702	0.48
703	0.5
704	0.55
705	0.61
706	0.61
707	0.59
708	0.67
709	0.7
710	0.73
711	0.7
712	0.61
713	0.57
714	0.59
715	0.62
716	0.58
717	0.57
718	0.56
719	0.5
720	0.49
721	0.42
722	0.35
723	0.31
724	0.24
725	0.18
726	0.1
727	0.09
728	0.07
729	0.06
730	0.06
731	0.06
732	0.06
733	0.09
734	0.1
735	0.09
736	0.1
737	0.13
738	0.13
739	0.13
740	0.13
741	0.12
742	0.12
743	0.11
744	0.11
745	0.09
746	0.1
747	0.11
748	0.11
749	0.12
750	0.15
751	0.15
752	0.16
753	0.19
754	0.19
755	0.21
756	0.23
757	0.23
758	0.22
759	0.24
760	0.24
761	0.22
762	0.21
763	0.19
764	0.16
765	0.2
766	0.18
767	0.16
768	0.16
769	0.16
770	0.15
771	0.15
772	0.16
773	0.12
774	0.12
775	0.14
776	0.12
777	0.13
778	0.13
779	0.13
780	0.12
781	0.09
782	0.1
783	0.09
784	0.15
785	0.15
786	0.19
787	0.25
788	0.28
789	0.34
790	0.37
791	0.44
792	0.48
793	0.53
794	0.6
795	0.65
796	0.71
797	0.76
798	0.83
799	0.85
800	0.85
801	0.86
802	0.84
803	0.74
804	0.67
805	0.59
806	0.49
807	0.4
808	0.33
809	0.26
810	0.17
811	0.16
812	0.13
813	0.12
814	0.11
815	0.14
816	0.15
817	0.19
818	0.21
819	0.22
820	0.21
821	0.19
822	0.19
823	0.17
824	0.15
825	0.11
826	0.09
827	0.09
828	0.1
829	0.1
830	0.1
831	0.1
832	0.09
833	0.11
834	0.13
835	0.12
836	0.14
837	0.17
838	0.19
839	0.2
840	0.26
841	0.26
842	0.26
843	0.26
844	0.29
845	0.25
846	0.24
847	0.26
848	0.22
849	0.2
850	0.19
851	0.2
852	0.16
853	0.17
854	0.2
855	0.18
856	0.18
857	0.18
858	0.2
859	0.2
860	0.2
861	0.2
862	0.2
863	0.19
864	0.2
865	0.2
866	0.18
867	0.19
868	0.18
869	0.16
870	0.12
871	0.11
872	0.12
873	0.22
874	0.29
875	0.36
876	0.41
877	0.5
878	0.61
879	0.7
880	0.75
881	0.72
882	0.73
883	0.76
884	0.81
885	0.82
886	0.81
887	0.73
888	0.66
889	0.65
890	0.57
891	0.49
892	0.4
893	0.32
894	0.25
895	0.31
896	0.3
897	0.25
898	0.29
899	0.31
900	0.34
901	0.34
902	0.39
903	0.39
904	0.46
905	0.54
906	0.57
907	0.6
908	0.64
909	0.7
910	0.73
911	0.73
912	0.68
913	0.68
914	0.63
915	0.6
916	0.52
917	0.44
918	0.38
919	0.33
920	0.34
921	0.3
922	0.29
923	0.26
924	0.25
925	0.26
926	0.25
927	0.32
928	0.32
929	0.37
930	0.43
931	0.48
932	0.56
933	0.56
934	0.58
935	0.59
936	0.64
937	0.6
938	0.62
939	0.64
940	0.62
941	0.69
942	0.67
943	0.62
944	0.55
945	0.5
946	0.42
947	0.36
948	0.31
949	0.27
950	0.3
951	0.26
952	0.25
953	0.25
954	0.25
955	0.22
956	0.32
957	0.36
958	0.39
959	0.46
960	0.48
961	0.56
962	0.66
963	0.76
964	0.76
965	0.79
966	0.81
967	0.84
968	0.9
969	0.92
970	0.93
971	0.93
972	0.92
973	0.89
974	0.89
975	0.88
976	0.8
977	0.8
978	0.73
979	0.63
980	0.55
981	0.48
982	0.38
983	0.33
984	0.34
985	0.26
986	0.23
987	0.22
988	0.21
989	0.2
990	0.2
991	0.14
992	0.1
993	0.07
994	0.06
995	0.07
996	0.06
997	0.09
998	0.1
999	0.14
1000	0.18
1001	0.2
1002	0.21
1003	0.22
1004	0.22
1005	0.25
1006	0.29
1007	0.36
1008	0.41
1009	0.49
1010	0.56
1011	0.62
1012	0.69
1013	0.71
1014	0.75
1015	0.72
1016	0.72
1017	0.73
1018	0.75
1019	0.78
1020	0.78
1021	0.8
1022	0.78
1023	0.74
1024	0.7
1025	0.66
1026	0.63
1027	0.6
1028	0.55
1029	0.49
1030	0.44
1031	0.4
1032	0.37
1033	0.33
1034	0.26
1035	0.19
1036	0.16
1037	0.15
1038	0.15
1039	0.14
1040	0.12
1041	0.1
1042	0.09
1043	0.09
1044	0.09
1045	0.08
1046	0.06
1047	0.07
1048	0.08
1049	0.07
1050	0.09
1051	0.1
1052	0.13
1053	0.15
1054	0.18
1055	0.18
1056	0.19
1057	0.2
1058	0.21
1059	0.2
1060	0.18
1061	0.17
1062	0.15
1063	0.14
1064	0.14
1065	0.13
1066	0.13
1067	0.16
1068	0.2
1069	0.2
1070	0.19
1071	0.19
1072	0.2
1073	0.19
1074	0.19
1075	0.15
1076	0.11
1077	0.1
1078	0.11
1079	0.1
1080	0.09
1081	0.11
1082	0.14
1083	0.16
1084	0.16
1085	0.17
1086	0.18
1087	0.2
1088	0.21
1089	0.22
1090	0.2
1091	0.19
1092	0.2
1093	0.2
1094	0.19
1095	0.18
1096	0.17
1097	0.17
1098	0.19
1099	0.19
1100	0.19
1101	0.21
1102	0.22
1103	0.22
1104	0.22
1105	0.18
1106	0.17
1107	0.16
1108	0.15
1109	0.12
1110	0.14
1111	0.16
1112	0.18
1113	0.18
1114	0.16
1115	0.16
1116	0.16
1117	0.16
1118	0.13
1119	0.13
1120	0.12
1121	0.12
1122	0.12
1123	0.13
1124	0.13
1125	0.13
1126	0.13
1127	0.11
1128	0.1
1129	0.09
1130	0.09
1131	0.08
1132	0.08
1133	0.07
1134	0.07
1135	0.07
1136	0.07
1137	0.08
1138	0.1
1139	0.1
1140	0.14
1141	0.16
1142	0.16
1143	0.16
1144	0.16
1145	0.17
1146	0.15
1147	0.16
1148	0.12
1149	0.12
1150	0.11
1151	0.11
1152	0.12
1153	0.12
1154	0.12
1155	0.11
1156	0.12
1157	0.11
1158	0.13
1159	0.12
1160	0.12
1161	0.13
1162	0.14
1163	0.14
1164	0.14
1165	0.13
1166	0.12
1167	0.12
1168	0.12
1169	0.11
1170	0.11
1171	0.11
1172	0.12
1173	0.12
1174	0.15
1175	0.15
1176	0.15
1177	0.15
1178	0.22
1179	0.22
1180	0.22
1181	0.25
1182	0.27
1183	0.31
1184	0.34
1185	0.35
1186	0.29
1187	0.28
1188	0.28
1189	0.28
1190	0.23
1191	0.19
1192	0.15
1193	0.12
1194	0.11
1195	0.11
1196	0.11
1197	0.08
1198	0.08
1199	0.11
1200	0.11
1201	0.13
1202	0.16

A0A4V3XFE4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer