Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5FNM9

Protein Details
Accession C5FNM9    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
31-61QLTKGISKSKTKHMGKKKKGEKEGSRSCDRVBasic
293-324RDIGLEREEKRQRRRQRRRQRRSLPYPIPPSLBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
37-53SKSKTKHMGKKKKGEKE
301-314EKRQRRRQRRRQRR
Subcellular Location(s) mito 12.5, cyto_mito 8, E.R. 4, plas 3, pero 3, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR038279  Ndc10_dom2_sf  
IPR031872  NDC10_II  
IPR022210  TF_GCR1-like  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF12550  GCR1_C  
PF16787  NDC10_II  
Amino Acid Sequences MTNVSNVTNITNKTNIRMCFVMLTAEESSIQLTKGISKSKTKHMGKKKKGEKEGSRSCDRVEGHVRESKRGSLVMASPDRPCCLKGIGVQPLTEPYLRTAIDLLLAYNLLLRGEIRRTVELPDLFIVSLPNKGLTPCHPLIMIMDNGKTNSVGRLEYMAVIRYRNPLLYTMANLAFYLFVRWDIGNYFLPRAKVQPPESLTVALWPWLDIWVSWFKSYEEKVSPSGSLLPKAVRFDEGATDRNDLVAQGFLRLLSRLRTILLQDSVIFKTISSSPISYGNNRALPLLVNLNIRDIGLEREEKRQRRRQRRRQRRSLPYPIPPSLFRQLQPAIDTESGLPSIYTLSRTIETVPDLWREWTIGLGGGPTVRDLEERLRTTYRRKVVLDKLNLIPLLFVRSLFLPYFYLFLSLSYPPLYPLLLLSIPSPTFSHPLLSFISSLCLLYVFFLFTLSVRYLVSGESNIALLSLPPFLLLSYDESDSYYS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.4
2 0.38
3 0.38
4 0.37
5 0.34
6 0.3
7 0.29
8 0.26
9 0.2
10 0.22
11 0.18
12 0.18
13 0.17
14 0.15
15 0.16
16 0.14
17 0.14
18 0.11
19 0.11
20 0.16
21 0.2
22 0.27
23 0.3
24 0.38
25 0.43
26 0.52
27 0.63
28 0.66
29 0.71
30 0.76
31 0.83
32 0.84
33 0.9
34 0.9
35 0.9
36 0.9
37 0.91
38 0.9
39 0.89
40 0.89
41 0.86
42 0.83
43 0.74
44 0.65
45 0.61
46 0.52
47 0.49
48 0.48
49 0.45
50 0.43
51 0.48
52 0.48
53 0.47
54 0.48
55 0.44
56 0.37
57 0.33
58 0.29
59 0.26
60 0.28
61 0.31
62 0.33
63 0.32
64 0.33
65 0.34
66 0.35
67 0.32
68 0.29
69 0.23
70 0.21
71 0.21
72 0.24
73 0.3
74 0.36
75 0.36
76 0.36
77 0.34
78 0.35
79 0.34
80 0.29
81 0.21
82 0.15
83 0.18
84 0.18
85 0.18
86 0.16
87 0.14
88 0.15
89 0.14
90 0.12
91 0.09
92 0.08
93 0.08
94 0.08
95 0.08
96 0.06
97 0.06
98 0.06
99 0.08
100 0.11
101 0.15
102 0.16
103 0.18
104 0.19
105 0.22
106 0.28
107 0.25
108 0.25
109 0.22
110 0.2
111 0.18
112 0.17
113 0.16
114 0.1
115 0.11
116 0.1
117 0.1
118 0.09
119 0.1
120 0.12
121 0.14
122 0.21
123 0.2
124 0.21
125 0.2
126 0.2
127 0.21
128 0.22
129 0.21
130 0.14
131 0.14
132 0.14
133 0.15
134 0.15
135 0.14
136 0.11
137 0.11
138 0.11
139 0.1
140 0.1
141 0.11
142 0.12
143 0.13
144 0.13
145 0.13
146 0.13
147 0.14
148 0.14
149 0.16
150 0.16
151 0.16
152 0.16
153 0.15
154 0.17
155 0.17
156 0.17
157 0.17
158 0.17
159 0.16
160 0.15
161 0.13
162 0.11
163 0.1
164 0.09
165 0.06
166 0.05
167 0.07
168 0.07
169 0.07
170 0.08
171 0.11
172 0.13
173 0.14
174 0.16
175 0.17
176 0.18
177 0.18
178 0.21
179 0.22
180 0.26
181 0.27
182 0.31
183 0.32
184 0.34
185 0.34
186 0.32
187 0.27
188 0.21
189 0.19
190 0.14
191 0.11
192 0.08
193 0.08
194 0.07
195 0.07
196 0.05
197 0.08
198 0.12
199 0.13
200 0.13
201 0.14
202 0.14
203 0.18
204 0.19
205 0.2
206 0.18
207 0.19
208 0.2
209 0.21
210 0.2
211 0.17
212 0.22
213 0.18
214 0.17
215 0.16
216 0.16
217 0.16
218 0.17
219 0.17
220 0.13
221 0.12
222 0.12
223 0.15
224 0.15
225 0.16
226 0.16
227 0.17
228 0.16
229 0.16
230 0.15
231 0.11
232 0.09
233 0.08
234 0.07
235 0.06
236 0.06
237 0.06
238 0.06
239 0.07
240 0.07
241 0.07
242 0.08
243 0.08
244 0.09
245 0.1
246 0.1
247 0.13
248 0.13
249 0.11
250 0.11
251 0.13
252 0.13
253 0.13
254 0.12
255 0.09
256 0.1
257 0.11
258 0.12
259 0.11
260 0.11
261 0.11
262 0.17
263 0.18
264 0.18
265 0.2
266 0.23
267 0.23
268 0.23
269 0.22
270 0.17
271 0.16
272 0.16
273 0.14
274 0.13
275 0.12
276 0.12
277 0.13
278 0.12
279 0.12
280 0.11
281 0.09
282 0.09
283 0.09
284 0.14
285 0.15
286 0.24
287 0.32
288 0.39
289 0.48
290 0.56
291 0.65
292 0.72
293 0.82
294 0.84
295 0.88
296 0.92
297 0.94
298 0.96
299 0.96
300 0.95
301 0.94
302 0.93
303 0.89
304 0.86
305 0.82
306 0.74
307 0.66
308 0.56
309 0.51
310 0.47
311 0.42
312 0.33
313 0.32
314 0.31
315 0.3
316 0.3
317 0.25
318 0.23
319 0.21
320 0.21
321 0.15
322 0.14
323 0.13
324 0.12
325 0.1
326 0.06
327 0.07
328 0.07
329 0.08
330 0.08
331 0.1
332 0.11
333 0.12
334 0.13
335 0.13
336 0.14
337 0.15
338 0.16
339 0.17
340 0.17
341 0.17
342 0.17
343 0.16
344 0.14
345 0.13
346 0.11
347 0.09
348 0.08
349 0.07
350 0.07
351 0.06
352 0.06
353 0.06
354 0.06
355 0.06
356 0.07
357 0.09
358 0.15
359 0.22
360 0.24
361 0.28
362 0.32
363 0.35
364 0.42
365 0.49
366 0.49
367 0.49
368 0.5
369 0.54
370 0.59
371 0.65
372 0.64
373 0.61
374 0.56
375 0.53
376 0.5
377 0.42
378 0.33
379 0.24
380 0.22
381 0.16
382 0.14
383 0.12
384 0.12
385 0.15
386 0.15
387 0.16
388 0.13
389 0.13
390 0.14
391 0.13
392 0.14
393 0.11
394 0.12
395 0.13
396 0.12
397 0.13
398 0.14
399 0.14
400 0.13
401 0.14
402 0.13
403 0.1
404 0.1
405 0.13
406 0.12
407 0.12
408 0.11
409 0.15
410 0.15
411 0.16
412 0.17
413 0.15
414 0.18
415 0.18
416 0.22
417 0.18
418 0.21
419 0.22
420 0.22
421 0.21
422 0.18
423 0.2
424 0.15
425 0.15
426 0.12
427 0.1
428 0.09
429 0.09
430 0.09
431 0.08
432 0.07
433 0.08
434 0.08
435 0.08
436 0.12
437 0.11
438 0.12
439 0.11
440 0.12
441 0.12
442 0.12
443 0.14
444 0.12
445 0.12
446 0.11
447 0.12
448 0.1
449 0.1
450 0.09
451 0.08
452 0.08
453 0.08
454 0.07
455 0.07
456 0.07
457 0.07
458 0.08
459 0.09
460 0.13
461 0.15
462 0.16
463 0.16