Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4S4LYD4

Protein Details
Accession A0A4S4LYD4    Localization Confidence High Confidence Score 16.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
104-129DADRPARPSRHRSHSQTNTPARRQQPHydrophilic
998-1020AIMPTRSGPQRRTPRPPPHNRPPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
1012-1013RP
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto 4, mito 2, plas 1, pero 1, golg 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR007275  YTH_domain  
IPR045168  YTH_prot  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF04146  YTH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
PS50882  YTH  
CDD cd00590  RRM_SF  
cd21134  YTH  
Amino Acid Sequences MASLVKPSSFLESHLPAGSPDMTAGTLGRPSMYDPYPILQNYPPTEPVFYDLQSRLPSSSKHISSFHPERSRNVVAPRTEYKGDASPSPRVLNNMADSPVQPTDADRPARPSRHRSHSQTNTPARRQQPPRPPFHASTPHMYQHGSSSNVHESNASTSSTTSFPAPSSIYQPSPPFGQRGGFVGPQYTMSHQQPPPMVHSPHQFAFPHHPGMPGPDTSMPHLTYSSASMMPVMQTPMFPFNSEPSSSQHPFTTGTGQTLSVFTHPQVNPSSPPHSPLSPVQGSSSQAGRHTVSYTGQPTFSPMRYSTPPQYAYAPPPSFPPNPSMFQSQFGPSHYPQSYGLPSDQEGQGTWWYLPPGATTSSGSYEGPQSHFQTMYGMSYPSVARREGEGYNNSGPSNPPSGGPPSSQQQVSSRFGDLYAGVATFKDPPLSQSPSRSPSSTHPPSTVPPTASSEHASAATEPEPRHVPRRPYHPNPPTQRSEWVMWAGNVPSDATHDELWRFFNQPASSNLSETSLSGTVSDDVSGGVSSIFLISRSNCAFVNFATEQHLEAATARFNGQTIRPNDPRCPRFVCRIRRRIDDLRAGVGGQRGIGMHTKWIKERKEQTRQEQRSSDLDDPTSPELLNFPPSVSSPEDFSGRLQDLSLLDDEGVQSLRKKTSHSNSSGSFASTNSSLLTRYFPERYFILKSLTQFDLDLSVEKGLWATQRHNEGILDQAYRTSKDVYLIFGVNKSGEFYGYARMAGPISRGEQRVPWATPSAPSSSPPAQSPSGNPQPSLSYSRSPQAEIHNIIPADEHRFSDESPLPVSGAQERSGLIHSPSTAALPQQALAGQVVSAPADLREAQRRLGSRLPLPRFSLDARRGVAPQDEFELDASAPIRALKHTPDASPDITSSPSSSRKEQSEPLLQTVTEDEERRDPVDPPKEEDYGEVWGEPFKVEWIQTERLPFYRTRNLRNPWNHGREVKVSRDGTELEPGVGKDLLEEWARPPPSSPTMPAIMPTRSGPQRRTPRPPPHNRPP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.28
3 0.22
4 0.25
5 0.24
6 0.17
7 0.14
8 0.13
9 0.11
10 0.11
11 0.12
12 0.1
13 0.11
14 0.11
15 0.11
16 0.1
17 0.13
18 0.18
19 0.19
20 0.21
21 0.21
22 0.24
23 0.29
24 0.29
25 0.3
26 0.28
27 0.33
28 0.34
29 0.36
30 0.37
31 0.33
32 0.35
33 0.32
34 0.32
35 0.28
36 0.25
37 0.27
38 0.25
39 0.27
40 0.28
41 0.29
42 0.28
43 0.27
44 0.28
45 0.3
46 0.38
47 0.37
48 0.39
49 0.4
50 0.42
51 0.49
52 0.55
53 0.57
54 0.58
55 0.57
56 0.57
57 0.62
58 0.64
59 0.59
60 0.59
61 0.56
62 0.5
63 0.54
64 0.54
65 0.52
66 0.48
67 0.44
68 0.4
69 0.39
70 0.38
71 0.37
72 0.37
73 0.37
74 0.4
75 0.42
76 0.39
77 0.37
78 0.37
79 0.35
80 0.34
81 0.32
82 0.29
83 0.27
84 0.26
85 0.27
86 0.25
87 0.21
88 0.17
89 0.17
90 0.21
91 0.27
92 0.31
93 0.28
94 0.35
95 0.43
96 0.52
97 0.57
98 0.6
99 0.62
100 0.68
101 0.76
102 0.76
103 0.79
104 0.8
105 0.83
106 0.83
107 0.85
108 0.84
109 0.82
110 0.82
111 0.77
112 0.77
113 0.76
114 0.75
115 0.76
116 0.76
117 0.78
118 0.76
119 0.77
120 0.71
121 0.71
122 0.71
123 0.64
124 0.62
125 0.59
126 0.56
127 0.5
128 0.47
129 0.38
130 0.34
131 0.34
132 0.3
133 0.25
134 0.26
135 0.32
136 0.32
137 0.31
138 0.27
139 0.24
140 0.24
141 0.25
142 0.21
143 0.14
144 0.14
145 0.16
146 0.16
147 0.16
148 0.14
149 0.13
150 0.13
151 0.15
152 0.17
153 0.16
154 0.2
155 0.23
156 0.24
157 0.27
158 0.28
159 0.28
160 0.3
161 0.3
162 0.28
163 0.25
164 0.25
165 0.22
166 0.23
167 0.25
168 0.23
169 0.21
170 0.2
171 0.19
172 0.19
173 0.2
174 0.2
175 0.22
176 0.22
177 0.3
178 0.3
179 0.34
180 0.36
181 0.37
182 0.4
183 0.42
184 0.41
185 0.38
186 0.42
187 0.43
188 0.4
189 0.43
190 0.37
191 0.33
192 0.4
193 0.39
194 0.38
195 0.34
196 0.34
197 0.29
198 0.34
199 0.33
200 0.24
201 0.24
202 0.22
203 0.23
204 0.24
205 0.28
206 0.23
207 0.21
208 0.21
209 0.19
210 0.16
211 0.17
212 0.16
213 0.13
214 0.12
215 0.11
216 0.11
217 0.11
218 0.12
219 0.12
220 0.09
221 0.09
222 0.11
223 0.15
224 0.16
225 0.16
226 0.15
227 0.17
228 0.2
229 0.21
230 0.21
231 0.21
232 0.28
233 0.29
234 0.3
235 0.27
236 0.25
237 0.26
238 0.26
239 0.27
240 0.2
241 0.2
242 0.19
243 0.19
244 0.18
245 0.17
246 0.16
247 0.12
248 0.12
249 0.11
250 0.19
251 0.18
252 0.21
253 0.23
254 0.25
255 0.27
256 0.3
257 0.35
258 0.26
259 0.3
260 0.3
261 0.28
262 0.28
263 0.28
264 0.31
265 0.28
266 0.28
267 0.26
268 0.25
269 0.26
270 0.25
271 0.25
272 0.18
273 0.18
274 0.2
275 0.19
276 0.18
277 0.17
278 0.17
279 0.16
280 0.19
281 0.21
282 0.19
283 0.19
284 0.17
285 0.2
286 0.23
287 0.22
288 0.21
289 0.19
290 0.23
291 0.26
292 0.32
293 0.33
294 0.36
295 0.37
296 0.35
297 0.38
298 0.36
299 0.37
300 0.41
301 0.36
302 0.3
303 0.31
304 0.35
305 0.33
306 0.31
307 0.32
308 0.27
309 0.29
310 0.31
311 0.34
312 0.3
313 0.3
314 0.31
315 0.29
316 0.26
317 0.26
318 0.28
319 0.22
320 0.29
321 0.27
322 0.27
323 0.24
324 0.26
325 0.26
326 0.23
327 0.23
328 0.17
329 0.17
330 0.18
331 0.18
332 0.14
333 0.13
334 0.12
335 0.13
336 0.12
337 0.11
338 0.1
339 0.1
340 0.1
341 0.1
342 0.09
343 0.1
344 0.1
345 0.11
346 0.11
347 0.12
348 0.13
349 0.15
350 0.14
351 0.13
352 0.14
353 0.15
354 0.17
355 0.19
356 0.19
357 0.2
358 0.2
359 0.19
360 0.18
361 0.17
362 0.15
363 0.13
364 0.11
365 0.09
366 0.1
367 0.11
368 0.12
369 0.13
370 0.12
371 0.12
372 0.13
373 0.17
374 0.17
375 0.21
376 0.2
377 0.22
378 0.24
379 0.24
380 0.23
381 0.2
382 0.19
383 0.17
384 0.18
385 0.14
386 0.13
387 0.14
388 0.17
389 0.18
390 0.19
391 0.18
392 0.19
393 0.21
394 0.21
395 0.21
396 0.22
397 0.26
398 0.28
399 0.28
400 0.25
401 0.22
402 0.22
403 0.21
404 0.16
405 0.11
406 0.08
407 0.07
408 0.06
409 0.06
410 0.06
411 0.07
412 0.07
413 0.07
414 0.07
415 0.1
416 0.15
417 0.2
418 0.21
419 0.25
420 0.3
421 0.33
422 0.35
423 0.33
424 0.3
425 0.3
426 0.38
427 0.38
428 0.36
429 0.33
430 0.33
431 0.34
432 0.37
433 0.35
434 0.26
435 0.22
436 0.24
437 0.24
438 0.24
439 0.24
440 0.18
441 0.17
442 0.16
443 0.14
444 0.11
445 0.11
446 0.11
447 0.12
448 0.12
449 0.13
450 0.16
451 0.17
452 0.23
453 0.27
454 0.33
455 0.34
456 0.44
457 0.51
458 0.54
459 0.64
460 0.65
461 0.69
462 0.69
463 0.71
464 0.65
465 0.58
466 0.55
467 0.47
468 0.42
469 0.35
470 0.29
471 0.24
472 0.19
473 0.18
474 0.15
475 0.12
476 0.1
477 0.08
478 0.06
479 0.06
480 0.07
481 0.07
482 0.08
483 0.09
484 0.09
485 0.1
486 0.12
487 0.12
488 0.13
489 0.12
490 0.16
491 0.16
492 0.17
493 0.19
494 0.23
495 0.22
496 0.21
497 0.21
498 0.18
499 0.17
500 0.15
501 0.14
502 0.08
503 0.08
504 0.08
505 0.08
506 0.07
507 0.07
508 0.07
509 0.05
510 0.04
511 0.05
512 0.04
513 0.04
514 0.03
515 0.03
516 0.03
517 0.03
518 0.03
519 0.03
520 0.04
521 0.05
522 0.08
523 0.08
524 0.1
525 0.1
526 0.11
527 0.11
528 0.1
529 0.16
530 0.13
531 0.13
532 0.16
533 0.16
534 0.15
535 0.15
536 0.15
537 0.09
538 0.09
539 0.1
540 0.07
541 0.07
542 0.07
543 0.06
544 0.07
545 0.08
546 0.09
547 0.16
548 0.18
549 0.25
550 0.3
551 0.33
552 0.39
553 0.47
554 0.47
555 0.44
556 0.47
557 0.43
558 0.48
559 0.54
560 0.59
561 0.6
562 0.68
563 0.68
564 0.67
565 0.72
566 0.69
567 0.66
568 0.63
569 0.54
570 0.46
571 0.41
572 0.36
573 0.3
574 0.24
575 0.17
576 0.09
577 0.08
578 0.07
579 0.07
580 0.09
581 0.08
582 0.12
583 0.16
584 0.17
585 0.22
586 0.29
587 0.31
588 0.38
589 0.48
590 0.53
591 0.6
592 0.65
593 0.71
594 0.75
595 0.77
596 0.75
597 0.68
598 0.61
599 0.54
600 0.52
601 0.44
602 0.35
603 0.3
604 0.25
605 0.25
606 0.23
607 0.2
608 0.15
609 0.11
610 0.11
611 0.11
612 0.14
613 0.11
614 0.1
615 0.1
616 0.1
617 0.13
618 0.14
619 0.14
620 0.13
621 0.14
622 0.16
623 0.15
624 0.15
625 0.16
626 0.14
627 0.14
628 0.12
629 0.12
630 0.11
631 0.12
632 0.12
633 0.09
634 0.08
635 0.08
636 0.08
637 0.07
638 0.07
639 0.06
640 0.08
641 0.1
642 0.14
643 0.14
644 0.17
645 0.25
646 0.33
647 0.41
648 0.44
649 0.46
650 0.44
651 0.47
652 0.45
653 0.37
654 0.28
655 0.2
656 0.17
657 0.13
658 0.12
659 0.09
660 0.09
661 0.09
662 0.09
663 0.11
664 0.11
665 0.15
666 0.18
667 0.18
668 0.2
669 0.2
670 0.23
671 0.25
672 0.25
673 0.25
674 0.24
675 0.25
676 0.27
677 0.27
678 0.23
679 0.19
680 0.18
681 0.16
682 0.14
683 0.14
684 0.1
685 0.09
686 0.09
687 0.08
688 0.08
689 0.07
690 0.1
691 0.12
692 0.14
693 0.18
694 0.23
695 0.23
696 0.24
697 0.23
698 0.21
699 0.23
700 0.22
701 0.18
702 0.14
703 0.16
704 0.16
705 0.17
706 0.18
707 0.16
708 0.14
709 0.17
710 0.18
711 0.17
712 0.18
713 0.18
714 0.18
715 0.16
716 0.16
717 0.13
718 0.12
719 0.12
720 0.1
721 0.08
722 0.09
723 0.09
724 0.13
725 0.13
726 0.13
727 0.12
728 0.12
729 0.12
730 0.12
731 0.12
732 0.1
733 0.12
734 0.16
735 0.17
736 0.18
737 0.19
738 0.23
739 0.27
740 0.26
741 0.25
742 0.24
743 0.23
744 0.25
745 0.25
746 0.25
747 0.21
748 0.21
749 0.25
750 0.26
751 0.27
752 0.26
753 0.28
754 0.26
755 0.26
756 0.29
757 0.32
758 0.38
759 0.37
760 0.36
761 0.32
762 0.33
763 0.35
764 0.37
765 0.31
766 0.26
767 0.27
768 0.33
769 0.33
770 0.32
771 0.32
772 0.33
773 0.36
774 0.35
775 0.34
776 0.33
777 0.32
778 0.3
779 0.28
780 0.22
781 0.22
782 0.2
783 0.19
784 0.18
785 0.19
786 0.19
787 0.25
788 0.27
789 0.23
790 0.23
791 0.23
792 0.2
793 0.2
794 0.21
795 0.19
796 0.18
797 0.17
798 0.16
799 0.16
800 0.17
801 0.18
802 0.18
803 0.14
804 0.14
805 0.13
806 0.13
807 0.14
808 0.13
809 0.12
810 0.12
811 0.13
812 0.12
813 0.12
814 0.11
815 0.11
816 0.11
817 0.1
818 0.1
819 0.07
820 0.07
821 0.07
822 0.06
823 0.06
824 0.05
825 0.05
826 0.07
827 0.09
828 0.12
829 0.2
830 0.22
831 0.24
832 0.29
833 0.31
834 0.34
835 0.39
836 0.4
837 0.38
838 0.47
839 0.5
840 0.5
841 0.51
842 0.48
843 0.46
844 0.45
845 0.47
846 0.42
847 0.42
848 0.39
849 0.38
850 0.37
851 0.36
852 0.37
853 0.29
854 0.25
855 0.24
856 0.22
857 0.2
858 0.2
859 0.19
860 0.14
861 0.14
862 0.13
863 0.1
864 0.09
865 0.1
866 0.11
867 0.11
868 0.14
869 0.16
870 0.23
871 0.26
872 0.27
873 0.31
874 0.34
875 0.34
876 0.33
877 0.31
878 0.24
879 0.24
880 0.23
881 0.2
882 0.21
883 0.27
884 0.29
885 0.34
886 0.38
887 0.41
888 0.46
889 0.49
890 0.51
891 0.54
892 0.53
893 0.51
894 0.47
895 0.42
896 0.37
897 0.33
898 0.3
899 0.24
900 0.23
901 0.21
902 0.24
903 0.26
904 0.27
905 0.27
906 0.26
907 0.31
908 0.4
909 0.4
910 0.41
911 0.44
912 0.44
913 0.43
914 0.42
915 0.34
916 0.29
917 0.27
918 0.21
919 0.17
920 0.16
921 0.16
922 0.15
923 0.13
924 0.11
925 0.12
926 0.12
927 0.17
928 0.22
929 0.26
930 0.28
931 0.33
932 0.34
933 0.35
934 0.37
935 0.35
936 0.37
937 0.44
938 0.48
939 0.52
940 0.59
941 0.63
942 0.71
943 0.76
944 0.78
945 0.78
946 0.79
947 0.77
948 0.71
949 0.69
950 0.68
951 0.66
952 0.62
953 0.61
954 0.54
955 0.49
956 0.48
957 0.45
958 0.38
959 0.39
960 0.33
961 0.25
962 0.26
963 0.24
964 0.24
965 0.21
966 0.19
967 0.13
968 0.13
969 0.16
970 0.15
971 0.16
972 0.15
973 0.24
974 0.25
975 0.25
976 0.26
977 0.29
978 0.34
979 0.37
980 0.39
981 0.35
982 0.37
983 0.37
984 0.39
985 0.37
986 0.32
987 0.3
988 0.28
989 0.32
990 0.37
991 0.44
992 0.45
993 0.51
994 0.6
995 0.68
996 0.76
997 0.78
998 0.81
999 0.85
1000 0.92