Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4S4M0D9

Protein Details
Accession A0A4S4M0D9    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
179-202IPEVGNLTRKKRRKDERSFVVPDSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
188-191KKRR
Subcellular Location(s) nucl 11.5, cyto_nucl 11.333, cyto 10, cyto_mito 7.333, mito 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003107  HAT  
IPR010491  PRP1_N  
IPR045075  Syf1-like  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR019734  TPR_repeat  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF06424  PRP1_N  
PF13432  TPR_16  
Amino Acid Sequences MSSLISSLLTIDTDDHDRDVNLNHTVFQQLNMASNKPNKLAFLSMPAPASYVAGLGRGASGFTTRSDIGPAREGPSAEVIAEAQARRGEEAEVDPEQFQDPDNEYGLFAGTTYEADDEEADKIYEQVDQNMDARRRVRRETREEVELAKLRAERPKLQQQFADLKRGLAVVTDAEWENIPEVGNLTRKKRRKDERSFVVPDSVIVGDRTKGEYESALDPMQQKQGGFETPADSGTLTNFVEIGQARDKILSLKLDQISGTSTTSGSATSVDPKGYLTSLNSVVLKTDAEIGDIKRARMLFDSLVKSNPKHAPGWIAAAALEEHAGRMVAARKLIKMGCEQCPKSEDVWLEAARLHNNEDAKVILANAVQHVGQSVKIWLAAADLEHDAKAKKRVLRKALEHIPNSVRLWKETVNLESSASDARILLARAVEVIPLSVELWLTLARLETPEKAKAVLNKARKAVPTSHDIWIAAGRLLEQEAYAAEKSEAGREKELNAVDKTIEMGVRELRRHQVLLTREQWLKEAERCETEGSPRTCEAIIKATVAMEVEEEDRLDTWVGDAESAESRGKVGTAKAIIAYALRVFPDKRDLWRRAADLEKAHGTRESLDAILARSVQHCPQAEVLWLMWAKEKWMGGDVPQAREVLEKAFVANPESEQIWLAAVKLDAENGELGVARELLVRARTVADTERIWMKSAVFERQQGQIEAAMSTVSTAISKYPKFGKLYMIQGQLYESQKNYAAARASYAAGLKAVPKEVTLWILASRLEEADGKSIRARAILDKARLVNPKTDRLWAEAVGVEERSGGAAQAKTMLARGLQECPESGLLWSMAIWAEPRPSRKSKSVDALKKCQDDPTVICTVARLFWAERKIEKARQWFGRAVGADPDLGDAWGWWLKFERQHGVKEHQDEVINRCVAAEPHHGPTWQAIAKDDKNAGKKVQDILELVAAALR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.16
3 0.17
4 0.17
5 0.19
6 0.21
7 0.22
8 0.23
9 0.22
10 0.22
11 0.23
12 0.26
13 0.24
14 0.22
15 0.23
16 0.19
17 0.25
18 0.26
19 0.27
20 0.3
21 0.37
22 0.39
23 0.38
24 0.39
25 0.34
26 0.34
27 0.37
28 0.31
29 0.32
30 0.31
31 0.3
32 0.29
33 0.28
34 0.25
35 0.21
36 0.2
37 0.13
38 0.12
39 0.09
40 0.09
41 0.09
42 0.08
43 0.08
44 0.08
45 0.08
46 0.07
47 0.09
48 0.09
49 0.1
50 0.14
51 0.14
52 0.15
53 0.19
54 0.22
55 0.23
56 0.28
57 0.29
58 0.28
59 0.29
60 0.29
61 0.26
62 0.27
63 0.24
64 0.18
65 0.17
66 0.14
67 0.13
68 0.16
69 0.15
70 0.14
71 0.15
72 0.16
73 0.17
74 0.17
75 0.16
76 0.15
77 0.17
78 0.19
79 0.19
80 0.2
81 0.19
82 0.19
83 0.2
84 0.18
85 0.16
86 0.15
87 0.17
88 0.18
89 0.2
90 0.19
91 0.18
92 0.18
93 0.17
94 0.13
95 0.09
96 0.08
97 0.06
98 0.06
99 0.07
100 0.07
101 0.07
102 0.08
103 0.08
104 0.09
105 0.09
106 0.1
107 0.1
108 0.09
109 0.09
110 0.09
111 0.13
112 0.13
113 0.15
114 0.16
115 0.18
116 0.21
117 0.29
118 0.31
119 0.31
120 0.36
121 0.4
122 0.44
123 0.51
124 0.58
125 0.61
126 0.67
127 0.72
128 0.72
129 0.69
130 0.65
131 0.58
132 0.56
133 0.5
134 0.42
135 0.36
136 0.33
137 0.3
138 0.36
139 0.39
140 0.38
141 0.42
142 0.52
143 0.55
144 0.57
145 0.56
146 0.55
147 0.6
148 0.56
149 0.57
150 0.46
151 0.4
152 0.37
153 0.35
154 0.28
155 0.18
156 0.16
157 0.08
158 0.09
159 0.1
160 0.1
161 0.1
162 0.1
163 0.1
164 0.1
165 0.1
166 0.09
167 0.07
168 0.08
169 0.11
170 0.18
171 0.22
172 0.29
173 0.38
174 0.46
175 0.54
176 0.64
177 0.72
178 0.76
179 0.83
180 0.85
181 0.86
182 0.88
183 0.84
184 0.75
185 0.68
186 0.57
187 0.46
188 0.37
189 0.28
190 0.19
191 0.15
192 0.14
193 0.11
194 0.12
195 0.14
196 0.12
197 0.12
198 0.13
199 0.13
200 0.15
201 0.16
202 0.17
203 0.15
204 0.17
205 0.18
206 0.2
207 0.23
208 0.21
209 0.19
210 0.18
211 0.21
212 0.2
213 0.2
214 0.19
215 0.17
216 0.16
217 0.16
218 0.15
219 0.12
220 0.11
221 0.1
222 0.11
223 0.09
224 0.08
225 0.08
226 0.08
227 0.1
228 0.1
229 0.13
230 0.14
231 0.15
232 0.15
233 0.15
234 0.16
235 0.15
236 0.17
237 0.17
238 0.15
239 0.21
240 0.21
241 0.22
242 0.21
243 0.2
244 0.19
245 0.18
246 0.17
247 0.11
248 0.1
249 0.1
250 0.1
251 0.09
252 0.08
253 0.08
254 0.08
255 0.12
256 0.13
257 0.12
258 0.12
259 0.13
260 0.14
261 0.13
262 0.13
263 0.1
264 0.12
265 0.13
266 0.15
267 0.15
268 0.14
269 0.14
270 0.14
271 0.12
272 0.09
273 0.12
274 0.09
275 0.1
276 0.12
277 0.13
278 0.2
279 0.21
280 0.21
281 0.2
282 0.2
283 0.2
284 0.2
285 0.21
286 0.16
287 0.21
288 0.25
289 0.23
290 0.27
291 0.28
292 0.27
293 0.32
294 0.33
295 0.3
296 0.28
297 0.27
298 0.28
299 0.27
300 0.3
301 0.23
302 0.19
303 0.16
304 0.16
305 0.15
306 0.1
307 0.09
308 0.05
309 0.05
310 0.04
311 0.04
312 0.04
313 0.06
314 0.09
315 0.1
316 0.13
317 0.14
318 0.15
319 0.18
320 0.19
321 0.19
322 0.22
323 0.25
324 0.3
325 0.38
326 0.38
327 0.37
328 0.39
329 0.39
330 0.33
331 0.33
332 0.25
333 0.19
334 0.23
335 0.21
336 0.19
337 0.18
338 0.19
339 0.17
340 0.17
341 0.16
342 0.15
343 0.15
344 0.15
345 0.14
346 0.13
347 0.11
348 0.11
349 0.09
350 0.07
351 0.07
352 0.07
353 0.07
354 0.07
355 0.06
356 0.06
357 0.06
358 0.06
359 0.06
360 0.06
361 0.06
362 0.06
363 0.06
364 0.06
365 0.06
366 0.05
367 0.05
368 0.05
369 0.06
370 0.06
371 0.06
372 0.06
373 0.07
374 0.08
375 0.1
376 0.16
377 0.19
378 0.23
379 0.3
380 0.38
381 0.46
382 0.52
383 0.55
384 0.58
385 0.63
386 0.65
387 0.58
388 0.54
389 0.48
390 0.44
391 0.4
392 0.35
393 0.26
394 0.2
395 0.22
396 0.19
397 0.2
398 0.2
399 0.2
400 0.19
401 0.19
402 0.18
403 0.15
404 0.15
405 0.12
406 0.1
407 0.08
408 0.06
409 0.06
410 0.07
411 0.07
412 0.07
413 0.06
414 0.06
415 0.06
416 0.06
417 0.06
418 0.05
419 0.04
420 0.04
421 0.04
422 0.04
423 0.04
424 0.03
425 0.03
426 0.04
427 0.04
428 0.04
429 0.04
430 0.04
431 0.04
432 0.05
433 0.07
434 0.09
435 0.11
436 0.13
437 0.13
438 0.14
439 0.16
440 0.18
441 0.25
442 0.3
443 0.34
444 0.36
445 0.38
446 0.4
447 0.39
448 0.38
449 0.35
450 0.3
451 0.28
452 0.28
453 0.27
454 0.25
455 0.24
456 0.21
457 0.18
458 0.16
459 0.11
460 0.08
461 0.06
462 0.06
463 0.06
464 0.05
465 0.04
466 0.04
467 0.03
468 0.05
469 0.05
470 0.05
471 0.05
472 0.06
473 0.07
474 0.11
475 0.14
476 0.14
477 0.16
478 0.16
479 0.17
480 0.19
481 0.2
482 0.2
483 0.17
484 0.16
485 0.14
486 0.14
487 0.13
488 0.1
489 0.09
490 0.06
491 0.07
492 0.1
493 0.13
494 0.14
495 0.15
496 0.17
497 0.18
498 0.18
499 0.18
500 0.2
501 0.2
502 0.26
503 0.26
504 0.28
505 0.29
506 0.29
507 0.29
508 0.25
509 0.25
510 0.22
511 0.22
512 0.19
513 0.19
514 0.2
515 0.2
516 0.19
517 0.2
518 0.24
519 0.23
520 0.24
521 0.23
522 0.23
523 0.21
524 0.21
525 0.18
526 0.15
527 0.15
528 0.13
529 0.12
530 0.11
531 0.11
532 0.11
533 0.09
534 0.05
535 0.05
536 0.05
537 0.05
538 0.05
539 0.05
540 0.05
541 0.06
542 0.06
543 0.05
544 0.04
545 0.06
546 0.06
547 0.06
548 0.06
549 0.07
550 0.07
551 0.09
552 0.09
553 0.07
554 0.07
555 0.07
556 0.08
557 0.07
558 0.07
559 0.09
560 0.1
561 0.1
562 0.1
563 0.1
564 0.1
565 0.09
566 0.09
567 0.06
568 0.06
569 0.06
570 0.08
571 0.08
572 0.09
573 0.16
574 0.17
575 0.24
576 0.32
577 0.35
578 0.39
579 0.43
580 0.43
581 0.41
582 0.42
583 0.39
584 0.32
585 0.32
586 0.31
587 0.28
588 0.27
589 0.23
590 0.2
591 0.18
592 0.17
593 0.15
594 0.1
595 0.1
596 0.1
597 0.1
598 0.1
599 0.09
600 0.08
601 0.08
602 0.1
603 0.11
604 0.16
605 0.16
606 0.17
607 0.18
608 0.18
609 0.17
610 0.17
611 0.15
612 0.14
613 0.13
614 0.12
615 0.13
616 0.13
617 0.13
618 0.14
619 0.15
620 0.11
621 0.14
622 0.14
623 0.12
624 0.2
625 0.22
626 0.21
627 0.22
628 0.22
629 0.19
630 0.2
631 0.2
632 0.13
633 0.12
634 0.1
635 0.1
636 0.12
637 0.12
638 0.13
639 0.13
640 0.12
641 0.12
642 0.12
643 0.11
644 0.09
645 0.09
646 0.08
647 0.07
648 0.07
649 0.07
650 0.06
651 0.07
652 0.07
653 0.07
654 0.06
655 0.07
656 0.07
657 0.05
658 0.06
659 0.05
660 0.05
661 0.06
662 0.06
663 0.05
664 0.06
665 0.06
666 0.08
667 0.08
668 0.08
669 0.09
670 0.1
671 0.1
672 0.11
673 0.13
674 0.14
675 0.14
676 0.16
677 0.21
678 0.2
679 0.21
680 0.2
681 0.19
682 0.21
683 0.24
684 0.27
685 0.25
686 0.27
687 0.28
688 0.32
689 0.34
690 0.28
691 0.27
692 0.22
693 0.2
694 0.17
695 0.15
696 0.1
697 0.07
698 0.07
699 0.06
700 0.05
701 0.04
702 0.04
703 0.07
704 0.13
705 0.13
706 0.17
707 0.22
708 0.28
709 0.3
710 0.32
711 0.35
712 0.35
713 0.42
714 0.45
715 0.43
716 0.38
717 0.35
718 0.36
719 0.34
720 0.32
721 0.27
722 0.21
723 0.19
724 0.2
725 0.22
726 0.21
727 0.2
728 0.19
729 0.18
730 0.19
731 0.19
732 0.17
733 0.16
734 0.16
735 0.13
736 0.11
737 0.11
738 0.12
739 0.12
740 0.13
741 0.12
742 0.12
743 0.14
744 0.15
745 0.16
746 0.14
747 0.13
748 0.12
749 0.13
750 0.13
751 0.11
752 0.11
753 0.09
754 0.1
755 0.11
756 0.11
757 0.17
758 0.17
759 0.18
760 0.19
761 0.21
762 0.2
763 0.2
764 0.21
765 0.19
766 0.28
767 0.33
768 0.34
769 0.36
770 0.39
771 0.43
772 0.47
773 0.45
774 0.44
775 0.42
776 0.47
777 0.45
778 0.48
779 0.43
780 0.41
781 0.42
782 0.34
783 0.32
784 0.25
785 0.25
786 0.2
787 0.19
788 0.14
789 0.11
790 0.11
791 0.1
792 0.08
793 0.07
794 0.09
795 0.09
796 0.1
797 0.12
798 0.13
799 0.12
800 0.13
801 0.13
802 0.1
803 0.13
804 0.15
805 0.17
806 0.19
807 0.2
808 0.19
809 0.21
810 0.21
811 0.18
812 0.17
813 0.14
814 0.12
815 0.11
816 0.11
817 0.09
818 0.08
819 0.08
820 0.09
821 0.08
822 0.14
823 0.18
824 0.24
825 0.3
826 0.37
827 0.43
828 0.51
829 0.56
830 0.58
831 0.64
832 0.7
833 0.72
834 0.74
835 0.77
836 0.77
837 0.76
838 0.69
839 0.63
840 0.55
841 0.51
842 0.45
843 0.42
844 0.37
845 0.32
846 0.31
847 0.27
848 0.25
849 0.21
850 0.19
851 0.15
852 0.14
853 0.19
854 0.25
855 0.28
856 0.29
857 0.36
858 0.42
859 0.47
860 0.52
861 0.56
862 0.6
863 0.64
864 0.66
865 0.63
866 0.58
867 0.57
868 0.5
869 0.43
870 0.38
871 0.31
872 0.26
873 0.22
874 0.21
875 0.14
876 0.13
877 0.11
878 0.07
879 0.1
880 0.12
881 0.12
882 0.12
883 0.15
884 0.19
885 0.25
886 0.31
887 0.37
888 0.39
889 0.46
890 0.52
891 0.56
892 0.6
893 0.59
894 0.56
895 0.5
896 0.5
897 0.47
898 0.45
899 0.45
900 0.38
901 0.33
902 0.31
903 0.29
904 0.25
905 0.27
906 0.3
907 0.26
908 0.31
909 0.34
910 0.33
911 0.32
912 0.34
913 0.36
914 0.31
915 0.28
916 0.26
917 0.32
918 0.35
919 0.4
920 0.43
921 0.43
922 0.46
923 0.5
924 0.51
925 0.47
926 0.49
927 0.49
928 0.47
929 0.44
930 0.39
931 0.37
932 0.35
933 0.31