FuNGI

A0A4V6S1I6

Protein Details

Accession

A0A4V6S1I6

Localization Confidence

High

Confidence Score

20.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
826-853	YEKRHRKYETFEKRQRLREKEKLQHEHY	Basic
1068-1087	TSATNIVRRQPRKRAPDGTF	Hydrophilic
1093-1118	EPESWTPSATRPRKRPRSVLHDAKDG	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
413-454	SDRGRGRGRGSKRPERVGIRAAHDSDSRGRRRDRGRGRGRGA
1108-1108	K

Subcellular Location(s)

nucl 18.5, cyto_nucl 11.5, cysk 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR038664 Gar1/Naf1_Cbf5-bd_sf IPR007504 H/ACA_rnp_Gar1/Naf1 IPR040309 Naf1 IPR029332 PEHE_dom IPR009000 Transl_B-barrel_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0005732 C:sno(s)RNA-containing ribonucleoprotein complex GO:0003723 F:RNA binding GO:0000493 P:box H/ACA snoRNP assembly GO:0001522 P:pseudouridine synthesis GO:0042254 P:ribosome biogenesis
Pfam	View protein in Pfam PF04410 Gar1

Amino Acid Sequences

MEDPVFRIPSLIPQDILIIQDIVEHTPEPAPTPAAPQPKTAPEADSIASSGDETGEEGNSEDEVEADIVLDDDEERRSTPPTSSVFLDPPCSTHLGHLRLHNSAPLADSSSDSSPESDSEPEGETSTSHAQVKSHDVDEDDDEEGGPTTTTTIRTKNEVVEDAIVIPKISEVGPDEHLEKVGEVMNIIDKVAIVKGIASDTQGKASEKALDSDTLLVFEDRKVMGYIYETFGPTYQPLYQVKFSEDYPLDPDKVKVAREVFHVPQRSKFVFVSELKRWRGSDASNVHDEEPAEYELEFSDDEQEAAFKAKLKQRRQGSREPSVTPSRHSTPTPSQVRDQELGADTLYGLNPYDAHGAYDMDFAAGPSRPPPIPYDDPYSDQYNMDTSNSQPAEPSADKKPDFSRHHDRPLQGSDRGRGRGRGSKRPERVGIRAAHDSDSRGRRRDRGRGRGRGADFGRQRAGWQTGNPRSFGATEEYSPHIPQSVSAAAIVHVPGPYAGDTGASVLSDYAEPHGGSSDGQWPYESQYSQLNSYGGYAQPQFVQPHINPRFASTFGFNIPFMQQQHNEYSQYGTHAGSGYGSSEGAGTDEKATAIYRRTLDKKLNSSLSFSVFSAMAATARTKVTTVVEPDPSANGSTSAHPVAGPSTISQAPTPTSRATSSGMQTRHKRILPSRSRRGGPGVGSCDADLMILDTLKRRQENEPLIPRDTRFVLTTNSALVPATSPSGLSELHLNTSAYERYFDKPEVLKAYREQQIIETPEFSVLSEHAAVGGRFRPRSSEDVRLCSYFFVQDRTLIHDLFAIHMSPFISRCAWTQVGADTSDAAYEKRHRKYETFEKRQRLREKEKLQHEHYKLKERIDQLQSMDVHAFLSLPSSSFNQNSSTSDPFLEEPIPFDPTGAHAHNLATLHEGVRRKAAMLDAAMTLEDRYRTLLNLNSDRRRNESRAQSLGASMEQDLQSAAEEEEGEEEEESVTAPVKQEKIKLTIKWPPRGLPSVTASPIPTSPFXKARMGVVSPRAALVRQTKQPVTSPLAPDASGLFPAHVSTSAYSPTPYQDLANTAASXNPPTVTSATNIVRRQPRKRAPDGTFLKKGVEPESWTPSATRPRKRPRSVLHDAKDGESVGEADHSYGTAASPSVSTHHRRPEPSSLVVSAMRTASTPNARHTQRHVTAFGVKLPHELEIVRDFQIPEWAWPQSGSSAYEGEGSSATYARSDVAVEEIL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.28
2	0.27
3	0.27
4	0.2
5	0.13
6	0.11
7	0.13
8	0.13
9	0.12
10	0.13
11	0.12
12	0.12
13	0.14
14	0.15
15	0.15
16	0.16
17	0.18
18	0.17
19	0.23
20	0.29
21	0.36
22	0.37
23	0.39
24	0.42
25	0.45
26	0.48
27	0.44
28	0.39
29	0.32
30	0.34
31	0.31
32	0.26
33	0.21
34	0.18
35	0.17
36	0.15
37	0.12
38	0.09
39	0.08
40	0.08
41	0.08
42	0.08
43	0.08
44	0.08
45	0.09
46	0.08
47	0.09
48	0.08
49	0.07
50	0.08
51	0.08
52	0.07
53	0.06
54	0.06
55	0.06
56	0.06
57	0.06
58	0.05
59	0.07
60	0.09
61	0.09
62	0.11
63	0.12
64	0.15
65	0.17
66	0.19
67	0.24
68	0.26
69	0.28
70	0.3
71	0.33
72	0.35
73	0.35
74	0.38
75	0.31
76	0.29
77	0.29
78	0.28
79	0.24
80	0.27
81	0.33
82	0.32
83	0.36
84	0.41
85	0.41
86	0.42
87	0.42
88	0.38
89	0.31
90	0.27
91	0.25
92	0.19
93	0.19
94	0.17
95	0.18
96	0.19
97	0.19
98	0.2
99	0.19
100	0.18
101	0.16
102	0.17
103	0.18
104	0.16
105	0.15
106	0.16
107	0.17
108	0.17
109	0.17
110	0.16
111	0.14
112	0.17
113	0.2
114	0.21
115	0.22
116	0.22
117	0.22
118	0.25
119	0.32
120	0.31
121	0.29
122	0.27
123	0.25
124	0.26
125	0.28
126	0.28
127	0.21
128	0.17
129	0.16
130	0.15
131	0.14
132	0.12
133	0.09
134	0.06
135	0.07
136	0.09
137	0.13
138	0.16
139	0.21
140	0.24
141	0.29
142	0.31
143	0.34
144	0.36
145	0.35
146	0.33
147	0.29
148	0.27
149	0.24
150	0.22
151	0.18
152	0.14
153	0.11
154	0.09
155	0.09
156	0.08
157	0.08
158	0.1
159	0.13
160	0.15
161	0.17
162	0.19
163	0.18
164	0.19
165	0.18
166	0.15
167	0.13
168	0.14
169	0.12
170	0.11
171	0.11
172	0.13
173	0.13
174	0.12
175	0.11
176	0.08
177	0.09
178	0.09
179	0.09
180	0.05
181	0.06
182	0.07
183	0.08
184	0.08
185	0.1
186	0.14
187	0.14
188	0.18
189	0.2
190	0.21
191	0.21
192	0.22
193	0.26
194	0.22
195	0.24
196	0.23
197	0.21
198	0.2
199	0.22
200	0.2
201	0.15
202	0.14
203	0.13
204	0.12
205	0.11
206	0.13
207	0.11
208	0.12
209	0.12
210	0.11
211	0.11
212	0.13
213	0.15
214	0.15
215	0.16
216	0.16
217	0.15
218	0.16
219	0.16
220	0.14
221	0.15
222	0.13
223	0.17
224	0.2
225	0.24
226	0.27
227	0.27
228	0.29
229	0.28
230	0.27
231	0.3
232	0.28
233	0.25
234	0.27
235	0.28
236	0.27
237	0.26
238	0.27
239	0.25
240	0.27
241	0.26
242	0.26
243	0.26
244	0.26
245	0.3
246	0.35
247	0.34
248	0.38
249	0.45
250	0.41
251	0.43
252	0.48
253	0.45
254	0.42
255	0.38
256	0.34
257	0.34
258	0.37
259	0.39
260	0.4
261	0.47
262	0.46
263	0.49
264	0.47
265	0.42
266	0.41
267	0.36
268	0.37
269	0.34
270	0.36
271	0.36
272	0.37
273	0.35
274	0.33
275	0.31
276	0.23
277	0.2
278	0.16
279	0.13
280	0.11
281	0.11
282	0.09
283	0.1
284	0.09
285	0.07
286	0.09
287	0.09
288	0.09
289	0.09
290	0.09
291	0.08
292	0.1
293	0.11
294	0.11
295	0.17
296	0.24
297	0.33
298	0.4
299	0.48
300	0.56
301	0.66
302	0.69
303	0.73
304	0.75
305	0.76
306	0.74
307	0.68
308	0.64
309	0.62
310	0.56
311	0.49
312	0.47
313	0.42
314	0.41
315	0.39
316	0.4
317	0.39
318	0.47
319	0.51
320	0.48
321	0.49
322	0.5
323	0.53
324	0.48
325	0.41
326	0.34
327	0.28
328	0.25
329	0.2
330	0.16
331	0.11
332	0.1
333	0.1
334	0.07
335	0.06
336	0.05
337	0.05
338	0.07
339	0.09
340	0.08
341	0.09
342	0.09
343	0.1
344	0.1
345	0.11
346	0.1
347	0.07
348	0.07
349	0.07
350	0.08
351	0.07
352	0.07
353	0.07
354	0.11
355	0.11
356	0.12
357	0.15
358	0.21
359	0.26
360	0.29
361	0.35
362	0.35
363	0.38
364	0.39
365	0.41
366	0.34
367	0.29
368	0.26
369	0.2
370	0.18
371	0.16
372	0.14
373	0.11
374	0.18
375	0.18
376	0.18
377	0.16
378	0.16
379	0.21
380	0.21
381	0.24
382	0.22
383	0.28
384	0.29
385	0.32
386	0.37
387	0.41
388	0.45
389	0.5
390	0.54
391	0.55
392	0.64
393	0.66
394	0.61
395	0.57
396	0.59
397	0.55
398	0.5
399	0.46
400	0.42
401	0.42
402	0.45
403	0.41
404	0.37
405	0.37
406	0.4
407	0.44
408	0.48
409	0.52
410	0.57
411	0.62
412	0.64
413	0.66
414	0.63
415	0.61
416	0.58
417	0.53
418	0.47
419	0.45
420	0.4
421	0.36
422	0.31
423	0.29
424	0.29
425	0.33
426	0.33
427	0.35
428	0.37
429	0.43
430	0.49
431	0.57
432	0.6
433	0.63
434	0.69
435	0.73
436	0.75
437	0.75
438	0.7
439	0.68
440	0.59
441	0.57
442	0.49
443	0.43
444	0.4
445	0.31
446	0.3
447	0.26
448	0.28
449	0.21
450	0.22
451	0.29
452	0.34
453	0.36
454	0.36
455	0.32
456	0.3
457	0.29
458	0.26
459	0.21
460	0.15
461	0.14
462	0.16
463	0.18
464	0.18
465	0.18
466	0.16
467	0.13
468	0.12
469	0.11
470	0.12
471	0.11
472	0.1
473	0.1
474	0.1
475	0.09
476	0.09
477	0.09
478	0.06
479	0.05
480	0.05
481	0.05
482	0.05
483	0.05
484	0.05
485	0.05
486	0.04
487	0.04
488	0.05
489	0.05
490	0.04
491	0.04
492	0.04
493	0.04
494	0.04
495	0.05
496	0.05
497	0.06
498	0.06
499	0.06
500	0.06
501	0.06
502	0.06
503	0.07
504	0.13
505	0.13
506	0.13
507	0.13
508	0.13
509	0.16
510	0.19
511	0.17
512	0.12
513	0.15
514	0.16
515	0.17
516	0.18
517	0.15
518	0.13
519	0.14
520	0.14
521	0.09
522	0.1
523	0.09
524	0.09
525	0.09
526	0.12
527	0.12
528	0.11
529	0.15
530	0.14
531	0.24
532	0.26
533	0.29
534	0.26
535	0.28
536	0.29
537	0.26
538	0.27
539	0.18
540	0.16
541	0.14
542	0.16
543	0.13
544	0.12
545	0.12
546	0.14
547	0.14
548	0.16
549	0.16
550	0.17
551	0.21
552	0.21
553	0.21
554	0.19
555	0.18
556	0.16
557	0.16
558	0.15
559	0.11
560	0.1
561	0.09
562	0.09
563	0.08
564	0.08
565	0.07
566	0.05
567	0.05
568	0.05
569	0.04
570	0.04
571	0.05
572	0.05
573	0.04
574	0.05
575	0.05
576	0.05
577	0.05
578	0.06
579	0.07
580	0.08
581	0.11
582	0.12
583	0.16
584	0.2
585	0.24
586	0.3
587	0.33
588	0.37
589	0.38
590	0.42
591	0.38
592	0.37
593	0.34
594	0.3
595	0.26
596	0.21
597	0.17
598	0.12
599	0.12
600	0.09
601	0.08
602	0.06
603	0.05
604	0.06
605	0.06
606	0.06
607	0.07
608	0.06
609	0.07
610	0.09
611	0.1
612	0.13
613	0.14
614	0.15
615	0.15
616	0.15
617	0.15
618	0.14
619	0.13
620	0.09
621	0.07
622	0.07
623	0.08
624	0.1
625	0.09
626	0.09
627	0.08
628	0.08
629	0.08
630	0.08
631	0.07
632	0.05
633	0.08
634	0.09
635	0.1
636	0.09
637	0.1
638	0.11
639	0.12
640	0.14
641	0.11
642	0.12
643	0.12
644	0.14
645	0.16
646	0.17
647	0.18
648	0.22
649	0.24
650	0.29
651	0.33
652	0.37
653	0.4
654	0.39
655	0.41
656	0.41
657	0.49
658	0.53
659	0.59
660	0.63
661	0.63
662	0.62
663	0.6
664	0.58
665	0.5
666	0.42
667	0.36
668	0.31
669	0.26
670	0.25
671	0.23
672	0.19
673	0.16
674	0.13
675	0.08
676	0.05
677	0.04
678	0.04
679	0.04
680	0.06
681	0.09
682	0.12
683	0.13
684	0.15
685	0.18
686	0.26
687	0.33
688	0.4
689	0.46
690	0.46
691	0.48
692	0.46
693	0.44
694	0.38
695	0.33
696	0.25
697	0.18
698	0.16
699	0.15
700	0.15
701	0.15
702	0.14
703	0.13
704	0.12
705	0.1
706	0.09
707	0.08
708	0.06
709	0.07
710	0.06
711	0.05
712	0.06
713	0.07
714	0.07
715	0.07
716	0.09
717	0.09
718	0.1
719	0.11
720	0.11
721	0.1
722	0.12
723	0.13
724	0.1
725	0.11
726	0.12
727	0.14
728	0.17
729	0.17
730	0.19
731	0.19
732	0.22
733	0.27
734	0.27
735	0.27
736	0.26
737	0.32
738	0.33
739	0.32
740	0.3
741	0.24
742	0.28
743	0.29
744	0.28
745	0.22
746	0.17
747	0.17
748	0.16
749	0.15
750	0.1
751	0.07
752	0.08
753	0.07
754	0.07
755	0.07
756	0.08
757	0.08
758	0.08
759	0.12
760	0.14
761	0.14
762	0.15
763	0.17
764	0.19
765	0.26
766	0.29
767	0.35
768	0.35
769	0.4
770	0.42
771	0.4
772	0.37
773	0.31
774	0.27
775	0.21
776	0.18
777	0.16
778	0.15
779	0.17
780	0.17
781	0.23
782	0.25
783	0.21
784	0.2
785	0.19
786	0.18
787	0.16
788	0.16
789	0.1
790	0.08
791	0.09
792	0.09
793	0.08
794	0.09
795	0.09
796	0.09
797	0.1
798	0.11
799	0.15
800	0.16
801	0.16
802	0.16
803	0.16
804	0.17
805	0.16
806	0.15
807	0.11
808	0.1
809	0.1
810	0.09
811	0.08
812	0.09
813	0.17
814	0.25
815	0.3
816	0.36
817	0.39
818	0.41
819	0.5
820	0.58
821	0.62
822	0.65
823	0.67
824	0.71
825	0.75
826	0.82
827	0.83
828	0.81
829	0.79
830	0.79
831	0.8
832	0.79
833	0.82
834	0.81
835	0.79
836	0.79
837	0.75
838	0.73
839	0.68
840	0.69
841	0.62
842	0.58
843	0.57
844	0.5
845	0.54
846	0.49
847	0.47
848	0.38
849	0.41
850	0.37
851	0.33
852	0.3
853	0.21
854	0.16
855	0.13
856	0.12
857	0.06
858	0.07
859	0.06
860	0.06
861	0.07
862	0.09
863	0.12
864	0.13
865	0.14
866	0.15
867	0.17
868	0.2
869	0.22
870	0.23
871	0.22
872	0.21
873	0.22
874	0.19
875	0.2
876	0.18
877	0.14
878	0.14
879	0.14
880	0.16
881	0.14
882	0.14
883	0.12
884	0.13
885	0.18
886	0.17
887	0.16
888	0.14
889	0.15
890	0.17
891	0.17
892	0.15
893	0.12
894	0.12
895	0.12
896	0.16
897	0.18
898	0.16
899	0.2
900	0.2
901	0.18
902	0.19
903	0.19
904	0.17
905	0.15
906	0.16
907	0.13
908	0.12
909	0.12
910	0.11
911	0.09
912	0.08
913	0.08
914	0.07
915	0.09
916	0.09
917	0.1
918	0.13
919	0.17
920	0.23
921	0.31
922	0.39
923	0.45
924	0.49
925	0.51
926	0.55
927	0.57
928	0.56
929	0.56
930	0.57
931	0.56
932	0.55
933	0.55
934	0.49
935	0.43
936	0.39
937	0.31
938	0.22
939	0.15
940	0.14
941	0.12
942	0.12
943	0.11
944	0.1
945	0.09
946	0.1
947	0.09
948	0.06
949	0.06
950	0.06
951	0.07
952	0.08
953	0.08
954	0.07
955	0.07
956	0.07
957	0.07
958	0.07
959	0.06
960	0.06
961	0.06
962	0.08
963	0.11
964	0.15
965	0.18
966	0.23
967	0.26
968	0.33
969	0.39
970	0.4
971	0.44
972	0.49
973	0.55
974	0.58
975	0.58
976	0.54
977	0.54
978	0.56
979	0.51
980	0.48
981	0.45
982	0.41
983	0.39
984	0.37
985	0.31
986	0.28
987	0.27
988	0.25
989	0.22
990	0.22
991	0.25
992	0.28
993	0.29
994	0.3
995	0.3
996	0.3
997	0.33
998	0.35
999	0.35
1000	0.32
1001	0.31
1002	0.29
1003	0.29
1004	0.26
1005	0.26
1006	0.27
1007	0.3
1008	0.34
1009	0.4
1010	0.41
1011	0.43
1012	0.46
1013	0.47
1014	0.46
1015	0.45
1016	0.42
1017	0.4
1018	0.4
1019	0.37
1020	0.33
1021	0.3
1022	0.23
1023	0.19
1024	0.16
1025	0.12
1026	0.1
1027	0.11
1028	0.11
1029	0.1
1030	0.1
1031	0.09
1032	0.11
1033	0.12
1034	0.13
1035	0.14
1036	0.14
1037	0.15
1038	0.16
1039	0.16
1040	0.16
1041	0.15
1042	0.18
1043	0.2
1044	0.22
1045	0.2
1046	0.18
1047	0.21
1048	0.2
1049	0.2
1050	0.17
1051	0.15
1052	0.13
1053	0.14
1054	0.15
1055	0.13
1056	0.2
1057	0.24
1058	0.31
1059	0.32
1060	0.38
1061	0.47
1062	0.54
1063	0.61
1064	0.65
1065	0.7
1066	0.72
1067	0.8
1068	0.82
1069	0.77
1070	0.8
1071	0.79
1072	0.77
1073	0.74
1074	0.65
1075	0.59
1076	0.51
1077	0.48
1078	0.42
1079	0.37
1080	0.33
1081	0.32
1082	0.38
1083	0.36
1084	0.35
1085	0.34
1086	0.36
1087	0.43
1088	0.47
1089	0.52
1090	0.55
1091	0.65
1092	0.76
1093	0.83
1094	0.87
1095	0.86
1096	0.86
1097	0.87
1098	0.87
1099	0.82
1100	0.79
1101	0.72
1102	0.64
1103	0.56
1104	0.46
1105	0.36
1106	0.26
1107	0.2
1108	0.12
1109	0.12
1110	0.1
1111	0.09
1112	0.09
1113	0.08
1114	0.08
1115	0.08
1116	0.08
1117	0.07
1118	0.07
1119	0.07
1120	0.07
1121	0.08
1122	0.11
1123	0.17
1124	0.23
1125	0.3
1126	0.4
1127	0.46
1128	0.5
1129	0.56
1130	0.63
1131	0.62
1132	0.61
1133	0.58
1134	0.49
1135	0.46
1136	0.43
1137	0.37
1138	0.29
1139	0.24
1140	0.19
1141	0.15
1142	0.16
1143	0.19
1144	0.26
1145	0.28
1146	0.32
1147	0.41
1148	0.44
1149	0.49
1150	0.54
1151	0.58
1152	0.57
1153	0.6
1154	0.56
1155	0.5
1156	0.53
1157	0.5
1158	0.47
1159	0.41
1160	0.34
1161	0.31
1162	0.3
1163	0.27
1164	0.22
1165	0.2
1166	0.2
1167	0.2
1168	0.22
1169	0.21
1170	0.23
1171	0.22
1172	0.22
1173	0.29
1174	0.27
1175	0.26
1176	0.27
1177	0.27
1178	0.25
1179	0.25
1180	0.25
1181	0.2
1182	0.22
1183	0.2
1184	0.18
1185	0.18
1186	0.18
1187	0.2
1188	0.19
1189	0.17
1190	0.15
1191	0.13
1192	0.12
1193	0.12
1194	0.12
1195	0.1
1196	0.1
1197	0.1
1198	0.1
1199	0.1
1200	0.09

A0A4V6S1I6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer