Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5FET0

Protein Details
Accession C5FET0    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
10-31GDQQPRPARRARKTQAPPEDAEHydrophilic
38-66ESSHATPKSQKRQTKSSQKGEPERRLRAFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
59-64PERRLR
Subcellular Location(s) nucl 10.5, cyto_nucl 10, cyto 8.5, mito 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001841  Znf_RING  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
IPR007527  Znf_SWIM  
IPR039903  Zswim2  
Gene Ontology GO:0061630  F:ubiquitin protein ligase activity  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF04434  SWIM  
PF13639  zf-RING_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50089  ZF_RING_2  
PS50966  ZF_SWIM  
CDD cd16494  RING-CH-C4HC3_ZSWM2  
Amino Acid Sequences MKRKRPADVGDQQPRPARRARKTQAPPEDAEVIDLTGESSHATPKSQKRQTKSSQKGEPERRLRAFRSKPPQTYLVKLERARTQRLFVLKRTRGGTDEVPEEYIDIAGSTGNVYQVVIGKEPTCNCPDARKGNQCKHVVYVLYHVLRVHEHLRYQLAFLSSELREIFEHAPQNPAEAASTGNSEGNRKEIDGDCPICFMPFEAENESIVWCRAACGNNIHKSCFQQWVSSQSGKAVRCVYCRTPWQLDDVPLLENLLEKGKVNSEGYLNVGASLGLSRLRDCSTYHQGSGYRRWYR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.65
2 0.59
3 0.58
4 0.57
5 0.56
6 0.64
7 0.67
8 0.7
9 0.77
10 0.83
11 0.85
12 0.8
13 0.74
14 0.68
15 0.64
16 0.53
17 0.44
18 0.34
19 0.24
20 0.18
21 0.15
22 0.1
23 0.06
24 0.07
25 0.06
26 0.06
27 0.1
28 0.11
29 0.13
30 0.21
31 0.31
32 0.42
33 0.5
34 0.57
35 0.6
36 0.7
37 0.78
38 0.81
39 0.82
40 0.8
41 0.79
42 0.81
43 0.85
44 0.85
45 0.85
46 0.82
47 0.81
48 0.77
49 0.74
50 0.7
51 0.7
52 0.69
53 0.68
54 0.7
55 0.7
56 0.69
57 0.68
58 0.7
59 0.63
60 0.6
61 0.57
62 0.54
63 0.52
64 0.5
65 0.5
66 0.49
67 0.5
68 0.52
69 0.47
70 0.42
71 0.39
72 0.46
73 0.45
74 0.44
75 0.51
76 0.47
77 0.5
78 0.5
79 0.46
80 0.4
81 0.4
82 0.36
83 0.29
84 0.28
85 0.23
86 0.22
87 0.2
88 0.19
89 0.15
90 0.11
91 0.08
92 0.05
93 0.04
94 0.04
95 0.04
96 0.04
97 0.04
98 0.04
99 0.04
100 0.04
101 0.04
102 0.07
103 0.08
104 0.08
105 0.09
106 0.09
107 0.12
108 0.13
109 0.15
110 0.14
111 0.15
112 0.15
113 0.19
114 0.24
115 0.3
116 0.36
117 0.43
118 0.5
119 0.55
120 0.63
121 0.61
122 0.56
123 0.5
124 0.45
125 0.37
126 0.29
127 0.25
128 0.21
129 0.19
130 0.18
131 0.16
132 0.15
133 0.14
134 0.15
135 0.14
136 0.11
137 0.11
138 0.12
139 0.14
140 0.13
141 0.14
142 0.13
143 0.12
144 0.11
145 0.11
146 0.13
147 0.11
148 0.12
149 0.12
150 0.11
151 0.1
152 0.13
153 0.13
154 0.13
155 0.16
156 0.15
157 0.18
158 0.16
159 0.17
160 0.15
161 0.14
162 0.11
163 0.08
164 0.09
165 0.07
166 0.08
167 0.07
168 0.09
169 0.09
170 0.1
171 0.1
172 0.12
173 0.12
174 0.11
175 0.14
176 0.14
177 0.17
178 0.21
179 0.23
180 0.2
181 0.21
182 0.21
183 0.18
184 0.16
185 0.13
186 0.1
187 0.1
188 0.12
189 0.14
190 0.14
191 0.15
192 0.15
193 0.16
194 0.13
195 0.12
196 0.1
197 0.07
198 0.07
199 0.1
200 0.11
201 0.13
202 0.2
203 0.28
204 0.36
205 0.37
206 0.4
207 0.38
208 0.41
209 0.42
210 0.42
211 0.36
212 0.32
213 0.33
214 0.36
215 0.39
216 0.37
217 0.34
218 0.31
219 0.36
220 0.33
221 0.34
222 0.34
223 0.31
224 0.33
225 0.39
226 0.38
227 0.39
228 0.45
229 0.48
230 0.48
231 0.46
232 0.48
233 0.46
234 0.44
235 0.41
236 0.36
237 0.3
238 0.24
239 0.24
240 0.16
241 0.13
242 0.12
243 0.11
244 0.11
245 0.1
246 0.12
247 0.15
248 0.19
249 0.19
250 0.2
251 0.19
252 0.2
253 0.22
254 0.22
255 0.19
256 0.16
257 0.14
258 0.12
259 0.11
260 0.1
261 0.08
262 0.08
263 0.09
264 0.1
265 0.13
266 0.15
267 0.16
268 0.19
269 0.26
270 0.34
271 0.38
272 0.38
273 0.4
274 0.43
275 0.47
276 0.54