Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5FDC1

Protein Details
Accession C5FDC1    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
797-820QPSEPAQPPPQIRRRPKAEDMFADHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006569  CID_dom  
IPR008942  ENTH_VHS  
IPR000061  Surp  
IPR035967  SWAP/Surp_sf  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006396  P:RNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF01805  Surp  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51391  CID  
Amino Acid Sequences MSDDTPVKSIFDTPSAKPSTAKRSQFERQKAEAEAKRQRDKAETAAVYEDFVKSFDHDSGPSTAFNTFSGRSTQHPHHHASTTGHSTSGPSKRHFAGPMRNSSEALGRPPASFSKKRPFDSLRDSQRDRDKPRGIFGFEGSRPGDSINAFQASDGEEDKTADKKEAEKAAAKPTLHVSSLPPGTSPAVIKSLIPPILVVDNVKILPPPPPAHGGGHEKRIWSAIVTLAQDTAATDMDTVVSSLQNKYLGWGFYLSISRHLSSAAIHSTIPITPGSTSLTNQPFGARPITRTSHFGRGGPHRSGIAPPSSYDSRYGSRSNQGLQVDVKPPSDLRQLKLIHKTIENMLTFGPEFEALLMSRPEVQKEEKWAWIWNPKSTGGVWYRWKLWDILTNPGKRRGGRGRVSSTVIFENGPIWSEPERNLQFEYTTKLDEFVSDEDYDSSDEDDSDREEEKKLTETSNDASNDGMGHLNPLQKAKLTHLLARLPISHSKLRRGDVARVTAFAIKHAGGGGDEVVDMIVSNVNKPFAYTSANPERQKDENEASGPGLGQDDAEEPANANNTESTDRNKKPGAGEKLDTSSASLVGLYIISDILSSSSTSGVRHAWRYRQLFENALKQQKTFEKLGRVEKELGWGRLKIEKWRRSIGILLNLWESWCVFPQASHEAFVKSYDHPPPTEKEQAEEKARVEEGKETGVFGGKGKNKWKSVEDNGSTEQFNPANPTDDGEPMDLDVDGAPVHEDDLDDEVFSDIDGVPMEDSDLEEAEDAPPDQDKSVSKEQEQAPASKEEPASKETGPQPSEPAQPPPQIRRRPKAEDMFADSDSEG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.37
2 0.39
3 0.39
4 0.4
5 0.44
6 0.47
7 0.52
8 0.57
9 0.54
10 0.59
11 0.68
12 0.75
13 0.77
14 0.76
15 0.71
16 0.68
17 0.66
18 0.68
19 0.64
20 0.64
21 0.63
22 0.64
23 0.68
24 0.67
25 0.66
26 0.63
27 0.61
28 0.58
29 0.58
30 0.5
31 0.43
32 0.43
33 0.4
34 0.34
35 0.31
36 0.25
37 0.16
38 0.15
39 0.14
40 0.12
41 0.14
42 0.15
43 0.17
44 0.16
45 0.19
46 0.23
47 0.23
48 0.22
49 0.21
50 0.2
51 0.18
52 0.19
53 0.2
54 0.17
55 0.17
56 0.2
57 0.21
58 0.24
59 0.3
60 0.38
61 0.43
62 0.47
63 0.51
64 0.52
65 0.53
66 0.53
67 0.5
68 0.49
69 0.46
70 0.41
71 0.36
72 0.31
73 0.31
74 0.36
75 0.39
76 0.38
77 0.34
78 0.39
79 0.41
80 0.46
81 0.5
82 0.49
83 0.52
84 0.54
85 0.61
86 0.61
87 0.6
88 0.55
89 0.5
90 0.48
91 0.39
92 0.35
93 0.31
94 0.27
95 0.26
96 0.28
97 0.34
98 0.36
99 0.4
100 0.44
101 0.5
102 0.56
103 0.59
104 0.65
105 0.64
106 0.65
107 0.67
108 0.7
109 0.69
110 0.7
111 0.7
112 0.69
113 0.74
114 0.75
115 0.72
116 0.72
117 0.7
118 0.64
119 0.68
120 0.66
121 0.59
122 0.52
123 0.48
124 0.46
125 0.38
126 0.4
127 0.32
128 0.27
129 0.24
130 0.23
131 0.22
132 0.15
133 0.16
134 0.16
135 0.17
136 0.16
137 0.16
138 0.16
139 0.15
140 0.16
141 0.15
142 0.12
143 0.11
144 0.12
145 0.14
146 0.17
147 0.16
148 0.18
149 0.18
150 0.21
151 0.27
152 0.32
153 0.34
154 0.36
155 0.38
156 0.44
157 0.47
158 0.44
159 0.39
160 0.38
161 0.37
162 0.33
163 0.3
164 0.24
165 0.25
166 0.27
167 0.26
168 0.21
169 0.2
170 0.2
171 0.21
172 0.19
173 0.14
174 0.14
175 0.15
176 0.15
177 0.16
178 0.2
179 0.19
180 0.18
181 0.16
182 0.15
183 0.16
184 0.16
185 0.14
186 0.09
187 0.11
188 0.11
189 0.11
190 0.1
191 0.09
192 0.13
193 0.17
194 0.19
195 0.19
196 0.23
197 0.25
198 0.26
199 0.31
200 0.36
201 0.35
202 0.39
203 0.39
204 0.35
205 0.34
206 0.33
207 0.28
208 0.2
209 0.17
210 0.13
211 0.15
212 0.15
213 0.15
214 0.13
215 0.13
216 0.12
217 0.11
218 0.09
219 0.06
220 0.05
221 0.05
222 0.05
223 0.05
224 0.06
225 0.06
226 0.05
227 0.06
228 0.07
229 0.08
230 0.1
231 0.1
232 0.1
233 0.12
234 0.14
235 0.13
236 0.13
237 0.13
238 0.12
239 0.13
240 0.17
241 0.16
242 0.18
243 0.2
244 0.19
245 0.18
246 0.18
247 0.16
248 0.13
249 0.16
250 0.12
251 0.11
252 0.11
253 0.11
254 0.12
255 0.11
256 0.12
257 0.09
258 0.08
259 0.07
260 0.08
261 0.11
262 0.11
263 0.11
264 0.17
265 0.2
266 0.2
267 0.2
268 0.2
269 0.19
270 0.2
271 0.24
272 0.18
273 0.17
274 0.22
275 0.25
276 0.25
277 0.28
278 0.31
279 0.35
280 0.35
281 0.35
282 0.35
283 0.4
284 0.44
285 0.41
286 0.38
287 0.3
288 0.3
289 0.3
290 0.27
291 0.21
292 0.16
293 0.15
294 0.2
295 0.2
296 0.2
297 0.2
298 0.21
299 0.2
300 0.23
301 0.25
302 0.22
303 0.26
304 0.28
305 0.27
306 0.29
307 0.27
308 0.26
309 0.25
310 0.25
311 0.24
312 0.23
313 0.22
314 0.17
315 0.17
316 0.18
317 0.25
318 0.24
319 0.22
320 0.29
321 0.32
322 0.36
323 0.43
324 0.43
325 0.37
326 0.35
327 0.36
328 0.3
329 0.32
330 0.27
331 0.21
332 0.18
333 0.16
334 0.15
335 0.14
336 0.11
337 0.06
338 0.06
339 0.05
340 0.06
341 0.05
342 0.06
343 0.06
344 0.06
345 0.1
346 0.1
347 0.11
348 0.13
349 0.15
350 0.16
351 0.22
352 0.24
353 0.23
354 0.24
355 0.25
356 0.26
357 0.31
358 0.31
359 0.27
360 0.27
361 0.25
362 0.25
363 0.24
364 0.26
365 0.21
366 0.24
367 0.26
368 0.25
369 0.27
370 0.26
371 0.27
372 0.22
373 0.2
374 0.22
375 0.19
376 0.26
377 0.31
378 0.35
379 0.36
380 0.42
381 0.43
382 0.37
383 0.42
384 0.42
385 0.45
386 0.46
387 0.51
388 0.49
389 0.49
390 0.51
391 0.45
392 0.38
393 0.3
394 0.24
395 0.17
396 0.13
397 0.11
398 0.08
399 0.08
400 0.06
401 0.07
402 0.08
403 0.09
404 0.1
405 0.17
406 0.18
407 0.19
408 0.2
409 0.18
410 0.18
411 0.18
412 0.2
413 0.13
414 0.13
415 0.12
416 0.12
417 0.12
418 0.11
419 0.12
420 0.1
421 0.11
422 0.1
423 0.1
424 0.09
425 0.1
426 0.1
427 0.08
428 0.08
429 0.06
430 0.06
431 0.06
432 0.06
433 0.06
434 0.07
435 0.08
436 0.09
437 0.1
438 0.1
439 0.11
440 0.14
441 0.14
442 0.14
443 0.14
444 0.15
445 0.15
446 0.2
447 0.2
448 0.17
449 0.16
450 0.15
451 0.14
452 0.12
453 0.11
454 0.05
455 0.06
456 0.08
457 0.1
458 0.11
459 0.12
460 0.12
461 0.13
462 0.14
463 0.16
464 0.22
465 0.21
466 0.24
467 0.26
468 0.28
469 0.28
470 0.28
471 0.26
472 0.21
473 0.23
474 0.24
475 0.25
476 0.26
477 0.32
478 0.35
479 0.35
480 0.39
481 0.39
482 0.41
483 0.41
484 0.45
485 0.37
486 0.34
487 0.34
488 0.29
489 0.26
490 0.2
491 0.17
492 0.11
493 0.11
494 0.1
495 0.09
496 0.06
497 0.06
498 0.06
499 0.04
500 0.04
501 0.04
502 0.03
503 0.03
504 0.03
505 0.03
506 0.05
507 0.05
508 0.06
509 0.07
510 0.08
511 0.08
512 0.08
513 0.09
514 0.09
515 0.13
516 0.14
517 0.21
518 0.3
519 0.38
520 0.39
521 0.41
522 0.43
523 0.41
524 0.43
525 0.41
526 0.34
527 0.29
528 0.29
529 0.28
530 0.24
531 0.22
532 0.18
533 0.13
534 0.11
535 0.07
536 0.06
537 0.05
538 0.06
539 0.07
540 0.07
541 0.07
542 0.07
543 0.08
544 0.1
545 0.1
546 0.09
547 0.08
548 0.1
549 0.12
550 0.13
551 0.18
552 0.26
553 0.27
554 0.31
555 0.33
556 0.34
557 0.37
558 0.45
559 0.48
560 0.43
561 0.44
562 0.42
563 0.43
564 0.41
565 0.35
566 0.27
567 0.19
568 0.14
569 0.12
570 0.09
571 0.06
572 0.05
573 0.05
574 0.04
575 0.04
576 0.04
577 0.03
578 0.03
579 0.03
580 0.04
581 0.04
582 0.05
583 0.05
584 0.07
585 0.08
586 0.08
587 0.1
588 0.13
589 0.16
590 0.23
591 0.27
592 0.32
593 0.41
594 0.45
595 0.46
596 0.49
597 0.48
598 0.48
599 0.47
600 0.49
601 0.48
602 0.51
603 0.48
604 0.42
605 0.45
606 0.44
607 0.45
608 0.41
609 0.39
610 0.39
611 0.44
612 0.53
613 0.52
614 0.5
615 0.48
616 0.44
617 0.47
618 0.43
619 0.42
620 0.35
621 0.32
622 0.3
623 0.33
624 0.35
625 0.36
626 0.42
627 0.46
628 0.48
629 0.53
630 0.53
631 0.49
632 0.53
633 0.49
634 0.47
635 0.41
636 0.38
637 0.33
638 0.31
639 0.29
640 0.24
641 0.19
642 0.11
643 0.11
644 0.11
645 0.1
646 0.1
647 0.14
648 0.21
649 0.21
650 0.22
651 0.22
652 0.22
653 0.22
654 0.24
655 0.22
656 0.18
657 0.23
658 0.27
659 0.28
660 0.29
661 0.32
662 0.36
663 0.4
664 0.46
665 0.4
666 0.38
667 0.42
668 0.47
669 0.49
670 0.48
671 0.42
672 0.37
673 0.38
674 0.34
675 0.29
676 0.26
677 0.22
678 0.23
679 0.22
680 0.19
681 0.18
682 0.2
683 0.19
684 0.16
685 0.23
686 0.24
687 0.3
688 0.38
689 0.45
690 0.47
691 0.51
692 0.56
693 0.57
694 0.6
695 0.64
696 0.6
697 0.57
698 0.56
699 0.54
700 0.49
701 0.4
702 0.36
703 0.26
704 0.23
705 0.23
706 0.21
707 0.22
708 0.22
709 0.24
710 0.22
711 0.23
712 0.24
713 0.2
714 0.19
715 0.15
716 0.15
717 0.12
718 0.11
719 0.08
720 0.07
721 0.06
722 0.06
723 0.06
724 0.06
725 0.06
726 0.06
727 0.06
728 0.07
729 0.1
730 0.1
731 0.09
732 0.1
733 0.1
734 0.09
735 0.09
736 0.09
737 0.06
738 0.06
739 0.07
740 0.07
741 0.07
742 0.07
743 0.07
744 0.06
745 0.07
746 0.07
747 0.07
748 0.07
749 0.07
750 0.08
751 0.08
752 0.09
753 0.09
754 0.09
755 0.11
756 0.12
757 0.12
758 0.15
759 0.17
760 0.23
761 0.33
762 0.37
763 0.37
764 0.44
765 0.46
766 0.51
767 0.51
768 0.47
769 0.41
770 0.41
771 0.4
772 0.38
773 0.38
774 0.35
775 0.35
776 0.35
777 0.36
778 0.32
779 0.38
780 0.38
781 0.45
782 0.41
783 0.4
784 0.42
785 0.42
786 0.5
787 0.46
788 0.48
789 0.46
790 0.5
791 0.56
792 0.61
793 0.66
794 0.69
795 0.76
796 0.78
797 0.81
798 0.82
799 0.85
800 0.84
801 0.82
802 0.79
803 0.77
804 0.71
805 0.63