FuNGI

C5FD07

Protein Details

Accession

C5FD07

Localization Confidence

High

Confidence Score

21.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
83-113	PKSLRRRTASHNVKRVPRRLRARAKREMVED	Basic
170-206	EIAPRVPKIKKNKLSHPQKPLSKFRKRQICKTWLPTH	Hydrophilic
612-636	RERSREKEAWERKPKSKRVEYNSLN	Hydrophilic
669-702	EVDEKPKEEKKEKQPMKKRKEKKKQNDEVKAVDG	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
84-108	KSLRRRTASHNVKRVPRRLRARAKR
122-125	RRKP
135-158	SARRLQGLNARSKARRQAAAEAKL
172-196	APRVPKIKKNKLSHPQKPLSKFRKR
341-347	KGKEPRR
614-628	RSREKEAWERKPKSK
673-692	KPKEEKKEKQPMKKRKEKKK

Subcellular Location(s)

mito 12, nucl 11, cyto 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039182 Pop1 IPR009723 Pop1_N IPR012590 POPLD_dom
Gene Ontology	GO:0005655 C:nucleolar ribonuclease P complex GO:0000172 C:ribonuclease MRP complex GO:0001682 P:tRNA 5'-leader removal
Pfam	View protein in Pfam PF06978 POP1 PF08170 POPLD

Amino Acid Sequences

MSSNGPGKRKGAWDPSSSINRKRVKIQDARTLAVQSSDTALSKTGELDVAAFVAARQFEIRALEAGIRKSKHASMTRAFQQVPKSLRRRTASHNVKRVPRRLRARAKREMVEDNTPTVTARRRKPTELMRLRLESARRLQGLNARSKARRQAAAEAKLKESPNYAGHNAEIAPRVPKIKKNKLSHPQKPLSKFRKRQICKTWLPTHMFHAKRARLTEPKAPLWRFAIPLTPTEKCYRITHRTSGARGAIAWDMSYMSTISLEGTYASLESLLRALGVDGQNAWGNSGGKWRNGTQSLQAWVFERDGQKHPIAPVRLIWCPAKRAEDIDMVDADAVPKRQQKGKEPRRRMFLRVHPSAFLQLWEELLKVSKIQKPQVMVEDLRFEIGSIEVSGPGATEALLGTLKPALPDGAEVWPDGSPECIWQSLAGLTNSAALPQNALLAFNITDPRLRFPPKTIKIPTSEESHTKLMETLSLWKPDSTQKSPPDLFSQLARRKACWQLPSQKAINRRKSQAAPGESVPPKPGDPKIPILLLATNSSSKNSNSQGSWTVLLPWKCVTPVWYYLLFYPLSSGGNPRFGGIQEQQQLAFESKQPWFPGDFPGTKAGWEWEARERSREKEAWERKPKSKRVEYNSLNLGTGKKGEIGQGWACDWERLVSGPDTLVASEGEVDEKPKEEKKEKQPMKKRKEKKKQNDEVKAVDGDKQPNSSEKTKVSVITPPALRQLDPSMASAVISHKAKSERLPASMQSLLETPALATVVITLLNRGTPTKRSRIYRLPTLDPELRSKWLSLLDESKQPSKKSKSASKSSVHLPMPQEEDLLGFVTSGNFNLAAGKGTGIGAILVNKMCPYSPPVDSDVPPAGKGCRLAGEDKLMKVCIIRAAGENVGRLGWWEVA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.53
2	0.59
3	0.64
4	0.65
5	0.64
6	0.63
7	0.64
8	0.63
9	0.69
10	0.7
11	0.69
12	0.73
13	0.73
14	0.74
15	0.71
16	0.7
17	0.63
18	0.56
19	0.46
20	0.39
21	0.31
22	0.22
23	0.2
24	0.19
25	0.17
26	0.15
27	0.16
28	0.15
29	0.15
30	0.15
31	0.13
32	0.12
33	0.11
34	0.12
35	0.1
36	0.09
37	0.09
38	0.08
39	0.06
40	0.08
41	0.08
42	0.08
43	0.09
44	0.09
45	0.11
46	0.13
47	0.15
48	0.13
49	0.14
50	0.18
51	0.22
52	0.26
53	0.31
54	0.3
55	0.31
56	0.34
57	0.37
58	0.41
59	0.45
60	0.47
61	0.47
62	0.54
63	0.59
64	0.61
65	0.58
66	0.53
67	0.52
68	0.52
69	0.52
70	0.54
71	0.55
72	0.55
73	0.63
74	0.64
75	0.63
76	0.65
77	0.7
78	0.71
79	0.73
80	0.76
81	0.75
82	0.8
83	0.83
84	0.84
85	0.82
86	0.81
87	0.81
88	0.82
89	0.86
90	0.87
91	0.87
92	0.88
93	0.87
94	0.82
95	0.77
96	0.75
97	0.69
98	0.66
99	0.59
100	0.51
101	0.44
102	0.38
103	0.33
104	0.28
105	0.31
106	0.32
107	0.38
108	0.46
109	0.51
110	0.56
111	0.64
112	0.7
113	0.73
114	0.75
115	0.72
116	0.69
117	0.66
118	0.64
119	0.61
120	0.54
121	0.49
122	0.46
123	0.46
124	0.41
125	0.38
126	0.38
127	0.4
128	0.44
129	0.46
130	0.45
131	0.45
132	0.47
133	0.51
134	0.58
135	0.57
136	0.56
137	0.51
138	0.55
139	0.58
140	0.64
141	0.65
142	0.59
143	0.55
144	0.54
145	0.51
146	0.42
147	0.36
148	0.31
149	0.29
150	0.32
151	0.31
152	0.27
153	0.26
154	0.27
155	0.24
156	0.23
157	0.2
158	0.16
159	0.16
160	0.17
161	0.23
162	0.26
163	0.33
164	0.4
165	0.49
166	0.58
167	0.64
168	0.73
169	0.77
170	0.85
171	0.86
172	0.86
173	0.84
174	0.83
175	0.83
176	0.83
177	0.83
178	0.83
179	0.82
180	0.81
181	0.83
182	0.81
183	0.83
184	0.82
185	0.82
186	0.79
187	0.8
188	0.79
189	0.76
190	0.75
191	0.66
192	0.62
193	0.62
194	0.54
195	0.52
196	0.53
197	0.5
198	0.49
199	0.51
200	0.51
201	0.49
202	0.53
203	0.54
204	0.51
205	0.54
206	0.58
207	0.56
208	0.52
209	0.47
210	0.45
211	0.39
212	0.33
213	0.33
214	0.25
215	0.28
216	0.3
217	0.28
218	0.28
219	0.3
220	0.32
221	0.28
222	0.33
223	0.37
224	0.4
225	0.44
226	0.47
227	0.52
228	0.55
229	0.54
230	0.54
231	0.47
232	0.39
233	0.33
234	0.3
235	0.22
236	0.17
237	0.15
238	0.09
239	0.08
240	0.08
241	0.08
242	0.06
243	0.05
244	0.05
245	0.05
246	0.05
247	0.05
248	0.05
249	0.05
250	0.05
251	0.05
252	0.05
253	0.05
254	0.05
255	0.05
256	0.05
257	0.05
258	0.04
259	0.04
260	0.04
261	0.04
262	0.09
263	0.09
264	0.09
265	0.09
266	0.1
267	0.12
268	0.12
269	0.12
270	0.1
271	0.1
272	0.1
273	0.18
274	0.19
275	0.19
276	0.22
277	0.24
278	0.27
279	0.29
280	0.3
281	0.27
282	0.29
283	0.31
284	0.29
285	0.27
286	0.23
287	0.22
288	0.21
289	0.2
290	0.19
291	0.2
292	0.23
293	0.26
294	0.26
295	0.26
296	0.28
297	0.3
298	0.29
299	0.25
300	0.25
301	0.25
302	0.26
303	0.26
304	0.28
305	0.24
306	0.25
307	0.27
308	0.26
309	0.23
310	0.24
311	0.25
312	0.25
313	0.24
314	0.23
315	0.21
316	0.17
317	0.16
318	0.14
319	0.11
320	0.08
321	0.08
322	0.1
323	0.13
324	0.16
325	0.21
326	0.26
327	0.36
328	0.46
329	0.57
330	0.65
331	0.71
332	0.74
333	0.79
334	0.78
335	0.72
336	0.69
337	0.68
338	0.66
339	0.61
340	0.57
341	0.48
342	0.45
343	0.43
344	0.34
345	0.25
346	0.18
347	0.12
348	0.11
349	0.11
350	0.1
351	0.07
352	0.08
353	0.08
354	0.08
355	0.12
356	0.15
357	0.19
358	0.23
359	0.25
360	0.27
361	0.29
362	0.3
363	0.29
364	0.26
365	0.24
366	0.22
367	0.2
368	0.18
369	0.16
370	0.12
371	0.09
372	0.08
373	0.07
374	0.05
375	0.05
376	0.05
377	0.05
378	0.05
379	0.04
380	0.04
381	0.04
382	0.03
383	0.03
384	0.03
385	0.03
386	0.04
387	0.03
388	0.04
389	0.05
390	0.05
391	0.05
392	0.05
393	0.05
394	0.05
395	0.05
396	0.07
397	0.07
398	0.08
399	0.07
400	0.08
401	0.08
402	0.08
403	0.08
404	0.07
405	0.05
406	0.06
407	0.07
408	0.06
409	0.06
410	0.06
411	0.07
412	0.07
413	0.09
414	0.08
415	0.07
416	0.07
417	0.08
418	0.08
419	0.08
420	0.08
421	0.06
422	0.06
423	0.06
424	0.07
425	0.06
426	0.06
427	0.05
428	0.05
429	0.06
430	0.06
431	0.07
432	0.06
433	0.08
434	0.09
435	0.11
436	0.15
437	0.17
438	0.17
439	0.22
440	0.33
441	0.35
442	0.43
443	0.43
444	0.42
445	0.44
446	0.48
447	0.44
448	0.39
449	0.36
450	0.3
451	0.31
452	0.29
453	0.25
454	0.2
455	0.19
456	0.14
457	0.13
458	0.11
459	0.14
460	0.15
461	0.17
462	0.18
463	0.17
464	0.18
465	0.23
466	0.29
467	0.27
468	0.32
469	0.33
470	0.4
471	0.41
472	0.41
473	0.39
474	0.34
475	0.31
476	0.27
477	0.33
478	0.31
479	0.37
480	0.36
481	0.34
482	0.37
483	0.43
484	0.43
485	0.38
486	0.4
487	0.43
488	0.47
489	0.5
490	0.49
491	0.46
492	0.51
493	0.57
494	0.6
495	0.55
496	0.54
497	0.56
498	0.55
499	0.58
500	0.56
501	0.49
502	0.42
503	0.38
504	0.42
505	0.38
506	0.36
507	0.3
508	0.23
509	0.21
510	0.21
511	0.22
512	0.19
513	0.22
514	0.25
515	0.25
516	0.25
517	0.24
518	0.22
519	0.21
520	0.17
521	0.14
522	0.12
523	0.12
524	0.12
525	0.12
526	0.13
527	0.13
528	0.16
529	0.18
530	0.19
531	0.17
532	0.2
533	0.22
534	0.22
535	0.22
536	0.18
537	0.19
538	0.21
539	0.21
540	0.19
541	0.17
542	0.16
543	0.15
544	0.15
545	0.14
546	0.13
547	0.16
548	0.18
549	0.19
550	0.19
551	0.19
552	0.21
553	0.19
554	0.15
555	0.13
556	0.1
557	0.1
558	0.09
559	0.12
560	0.12
561	0.16
562	0.16
563	0.15
564	0.15
565	0.14
566	0.19
567	0.17
568	0.22
569	0.22
570	0.22
571	0.22
572	0.22
573	0.23
574	0.2
575	0.19
576	0.15
577	0.16
578	0.16
579	0.19
580	0.19
581	0.2
582	0.2
583	0.2
584	0.23
585	0.25
586	0.24
587	0.23
588	0.27
589	0.25
590	0.23
591	0.23
592	0.19
593	0.16
594	0.16
595	0.17
596	0.2
597	0.27
598	0.27
599	0.32
600	0.34
601	0.34
602	0.4
603	0.4
604	0.37
605	0.42
606	0.5
607	0.56
608	0.64
609	0.68
610	0.7
611	0.77
612	0.81
613	0.8
614	0.81
615	0.79
616	0.77
617	0.8
618	0.75
619	0.72
620	0.69
621	0.6
622	0.5
623	0.42
624	0.35
625	0.25
626	0.22
627	0.16
628	0.12
629	0.12
630	0.13
631	0.13
632	0.16
633	0.17
634	0.17
635	0.17
636	0.17
637	0.17
638	0.16
639	0.15
640	0.11
641	0.1
642	0.1
643	0.12
644	0.1
645	0.1
646	0.1
647	0.11
648	0.1
649	0.09
650	0.09
651	0.07
652	0.06
653	0.06
654	0.06
655	0.07
656	0.07
657	0.09
658	0.08
659	0.1
660	0.14
661	0.18
662	0.26
663	0.31
664	0.41
665	0.5
666	0.61
667	0.68
668	0.76
669	0.81
670	0.85
671	0.89
672	0.9
673	0.9
674	0.9
675	0.93
676	0.93
677	0.94
678	0.94
679	0.94
680	0.94
681	0.94
682	0.88
683	0.81
684	0.73
685	0.65
686	0.54
687	0.49
688	0.43
689	0.37
690	0.33
691	0.31
692	0.28
693	0.31
694	0.35
695	0.33
696	0.34
697	0.31
698	0.33
699	0.34
700	0.34
701	0.31
702	0.32
703	0.31
704	0.33
705	0.33
706	0.3
707	0.35
708	0.34
709	0.32
710	0.29
711	0.29
712	0.27
713	0.26
714	0.26
715	0.2
716	0.19
717	0.19
718	0.17
719	0.15
720	0.17
721	0.17
722	0.16
723	0.19
724	0.22
725	0.25
726	0.28
727	0.36
728	0.34
729	0.36
730	0.39
731	0.36
732	0.39
733	0.39
734	0.34
735	0.26
736	0.24
737	0.21
738	0.18
739	0.16
740	0.11
741	0.09
742	0.09
743	0.08
744	0.06
745	0.05
746	0.05
747	0.06
748	0.06
749	0.06
750	0.07
751	0.08
752	0.09
753	0.11
754	0.14
755	0.21
756	0.28
757	0.36
758	0.43
759	0.49
760	0.57
761	0.64
762	0.68
763	0.7
764	0.7
765	0.68
766	0.65
767	0.66
768	0.63
769	0.56
770	0.55
771	0.48
772	0.45
773	0.4
774	0.36
775	0.31
776	0.3
777	0.3
778	0.28
779	0.3
780	0.3
781	0.35
782	0.38
783	0.44
784	0.44
785	0.45
786	0.51
787	0.53
788	0.56
789	0.59
790	0.66
791	0.67
792	0.72
793	0.77
794	0.73
795	0.69
796	0.69
797	0.68
798	0.6
799	0.56
800	0.49
801	0.46
802	0.46
803	0.41
804	0.35
805	0.27
806	0.25
807	0.2
808	0.18
809	0.13
810	0.08
811	0.08
812	0.09
813	0.09
814	0.09
815	0.09
816	0.08
817	0.08
818	0.1
819	0.1
820	0.1
821	0.1
822	0.1
823	0.09
824	0.09
825	0.09
826	0.08
827	0.08
828	0.07
829	0.08
830	0.1
831	0.1
832	0.11
833	0.11
834	0.12
835	0.11
836	0.12
837	0.16
838	0.19
839	0.21
840	0.24
841	0.29
842	0.33
843	0.34
844	0.38
845	0.4
846	0.36
847	0.34
848	0.32
849	0.29
850	0.27
851	0.28
852	0.24
853	0.22
854	0.24
855	0.27
856	0.28
857	0.36
858	0.37
859	0.38
860	0.39
861	0.35
862	0.32
863	0.3
864	0.28
865	0.24
866	0.21
867	0.21
868	0.21
869	0.24
870	0.28
871	0.29
872	0.27
873	0.23
874	0.21
875	0.19
876	0.17

C5FD07

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer