FuNGI

A0A4S4LK86

Protein Details

Accession

A0A4S4LK86

Localization Confidence

High

Confidence Score

18.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
388-410	GEDTRAKKRSKKTNGATTKAKKA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
326-381	KNKKEARAGRKSDTKSKPSASREPRKSIAKESISDDGKPSTKKRGRGGASRKSINR
392-409	RAKKRSKKTNGATTKAKK

Subcellular Location(s)

nucl 21, cyto 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR016197 Chromo-like_dom_sf IPR000953 Chromo/chromo_shadow_dom IPR023780 Chromo_domain IPR008251 Chromo_shadow_dom IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR008111 RNA-bd_8 IPR000504 RRM_dom IPR033744 RRM_RBM8
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0005634 C:nucleus GO:0003729 F:mRNA binding GO:0006396 P:RNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF00385 Chromo PF01393 Chromo_shadow PF00076 RRM_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50013 CHROMO_2 PS50102 RRM
CDD	cd12324 RRM_RBM8

Amino Acid Sequences

MSDDEMNIDDGASPPEEVSLGRGDAASKTLRLLRLDCPVGNEQGVSSEHTFDRVETTQARDVDTRAARSVEGWIVLVTNVHEEATEEDVMEKFAEFGEIKNLHLNLDRRTGYVKGYALVEYETMADAQAAIDGASGTTLLEQTLHCDYAFFVLPAVHCEISSWSLRLSLQFINERHLVDIQSRSRRVRKQHLEHVARLLNVRHLSQRVWSLPPLLTYWSPLTHRFKMPRVELASDSENEQEKIKQSPKSLKKQVAESNNDEGSEAEAEEEVEFEIEEILEAKHGVFPNGRIGYLVKWKGFTEEDNSWVDEHDAANAKDLIDAYWEKNKKEARAGRKSDTKSKPSASREPRKSIAKESISDDGKPSTKKRGRGGASRKSINRAETDEEGEDTRAKKRSKKTNGATTKAKKASISTEEDEKEPIVPSTMKKYKDLASWEDIVDNIETVEKSSKNLIVYFRLKRQGEHCREVSSVCNDKFPQKMIQFYEGNLRWKQSEVSDNDEGSDEA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.09
2	0.1
3	0.1
4	0.1
5	0.11
6	0.12
7	0.11
8	0.12
9	0.12
10	0.13
11	0.13
12	0.17
13	0.16
14	0.14
15	0.17
16	0.21
17	0.25
18	0.27
19	0.29
20	0.3
21	0.36
22	0.4
23	0.37
24	0.38
25	0.37
26	0.37
27	0.34
28	0.29
29	0.21
30	0.21
31	0.21
32	0.2
33	0.18
34	0.19
35	0.18
36	0.21
37	0.21
38	0.18
39	0.23
40	0.2
41	0.22
42	0.22
43	0.27
44	0.31
45	0.31
46	0.34
47	0.3
48	0.3
49	0.34
50	0.35
51	0.32
52	0.28
53	0.28
54	0.25
55	0.25
56	0.27
57	0.2
58	0.17
59	0.15
60	0.12
61	0.12
62	0.12
63	0.11
64	0.08
65	0.09
66	0.08
67	0.08
68	0.08
69	0.08
70	0.1
71	0.13
72	0.12
73	0.11
74	0.12
75	0.12
76	0.13
77	0.12
78	0.1
79	0.06
80	0.06
81	0.09
82	0.08
83	0.09
84	0.17
85	0.17
86	0.18
87	0.22
88	0.23
89	0.21
90	0.27
91	0.3
92	0.25
93	0.31
94	0.31
95	0.28
96	0.31
97	0.3
98	0.27
99	0.28
100	0.25
101	0.19
102	0.2
103	0.19
104	0.17
105	0.16
106	0.14
107	0.1
108	0.1
109	0.08
110	0.07
111	0.06
112	0.06
113	0.05
114	0.05
115	0.05
116	0.04
117	0.04
118	0.04
119	0.04
120	0.04
121	0.03
122	0.03
123	0.03
124	0.03
125	0.04
126	0.04
127	0.05
128	0.05
129	0.08
130	0.1
131	0.11
132	0.1
133	0.11
134	0.11
135	0.12
136	0.13
137	0.1
138	0.08
139	0.09
140	0.09
141	0.11
142	0.14
143	0.11
144	0.11
145	0.11
146	0.12
147	0.14
148	0.15
149	0.13
150	0.11
151	0.12
152	0.12
153	0.13
154	0.14
155	0.13
156	0.16
157	0.21
158	0.21
159	0.24
160	0.26
161	0.25
162	0.23
163	0.23
164	0.2
165	0.17
166	0.23
167	0.25
168	0.3
169	0.34
170	0.38
171	0.45
172	0.5
173	0.56
174	0.6
175	0.65
176	0.66
177	0.71
178	0.77
179	0.74
180	0.7
181	0.67
182	0.58
183	0.48
184	0.41
185	0.32
186	0.26
187	0.22
188	0.22
189	0.19
190	0.18
191	0.18
192	0.19
193	0.22
194	0.2
195	0.21
196	0.21
197	0.2
198	0.19
199	0.2
200	0.18
201	0.16
202	0.14
203	0.14
204	0.14
205	0.14
206	0.16
207	0.21
208	0.27
209	0.28
210	0.33
211	0.35
212	0.39
213	0.43
214	0.43
215	0.43
216	0.4
217	0.38
218	0.34
219	0.33
220	0.3
221	0.24
222	0.23
223	0.19
224	0.17
225	0.15
226	0.15
227	0.13
228	0.13
229	0.17
230	0.21
231	0.22
232	0.25
233	0.35
234	0.43
235	0.51
236	0.57
237	0.59
238	0.56
239	0.6
240	0.62
241	0.6
242	0.57
243	0.5
244	0.47
245	0.41
246	0.38
247	0.32
248	0.25
249	0.18
250	0.13
251	0.09
252	0.05
253	0.05
254	0.05
255	0.05
256	0.05
257	0.04
258	0.03
259	0.03
260	0.03
261	0.03
262	0.03
263	0.03
264	0.03
265	0.03
266	0.03
267	0.04
268	0.04
269	0.07
270	0.07
271	0.09
272	0.09
273	0.1
274	0.17
275	0.17
276	0.17
277	0.15
278	0.15
279	0.17
280	0.24
281	0.26
282	0.19
283	0.2
284	0.2
285	0.22
286	0.23
287	0.21
288	0.2
289	0.18
290	0.2
291	0.2
292	0.21
293	0.18
294	0.17
295	0.16
296	0.12
297	0.1
298	0.1
299	0.12
300	0.12
301	0.13
302	0.13
303	0.13
304	0.13
305	0.13
306	0.1
307	0.1
308	0.11
309	0.12
310	0.2
311	0.22
312	0.22
313	0.28
314	0.31
315	0.31
316	0.39
317	0.45
318	0.47
319	0.55
320	0.6
321	0.61
322	0.67
323	0.69
324	0.7
325	0.7
326	0.65
327	0.6
328	0.61
329	0.62
330	0.6
331	0.66
332	0.66
333	0.69
334	0.71
335	0.71
336	0.72
337	0.72
338	0.68
339	0.63
340	0.62
341	0.55
342	0.5
343	0.47
344	0.48
345	0.42
346	0.39
347	0.34
348	0.29
349	0.29
350	0.3
351	0.3
352	0.34
353	0.38
354	0.44
355	0.49
356	0.55
357	0.57
358	0.64
359	0.71
360	0.7
361	0.72
362	0.73
363	0.69
364	0.66
365	0.63
366	0.56
367	0.5
368	0.44
369	0.4
370	0.35
371	0.36
372	0.3
373	0.28
374	0.26
375	0.23
376	0.22
377	0.19
378	0.22
379	0.26
380	0.29
381	0.36
382	0.44
383	0.54
384	0.62
385	0.72
386	0.76
387	0.79
388	0.85
389	0.84
390	0.85
391	0.8
392	0.8
393	0.73
394	0.66
395	0.56
396	0.49
397	0.49
398	0.45
399	0.45
400	0.38
401	0.41
402	0.41
403	0.4
404	0.39
405	0.32
406	0.27
407	0.21
408	0.18
409	0.14
410	0.15
411	0.17
412	0.26
413	0.32
414	0.33
415	0.35
416	0.38
417	0.4
418	0.44
419	0.47
420	0.42
421	0.41
422	0.41
423	0.39
424	0.36
425	0.31
426	0.26
427	0.21
428	0.15
429	0.1
430	0.1
431	0.09
432	0.1
433	0.15
434	0.14
435	0.16
436	0.19
437	0.22
438	0.23
439	0.26
440	0.28
441	0.31
442	0.39
443	0.44
444	0.48
445	0.54
446	0.53
447	0.53
448	0.59
449	0.62
450	0.62
451	0.64
452	0.59
453	0.54
454	0.54
455	0.51
456	0.48
457	0.46
458	0.46
459	0.39
460	0.42
461	0.41
462	0.45
463	0.47
464	0.45
465	0.46
466	0.41
467	0.48
468	0.46
469	0.51
470	0.47
471	0.44
472	0.51
473	0.47
474	0.48
475	0.43
476	0.41
477	0.36
478	0.37
479	0.38
480	0.33
481	0.37
482	0.35
483	0.41
484	0.43
485	0.41
486	0.4

A0A4S4LK86

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer