FuNGI

A0A4S4LWA6

Protein Details

Accession

A0A4S4LWA6

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
27-55	PANFMAGPPAKKRKRNNQRNVRQHGRAAG	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
35-45	PAKKRKRNNQR

Subcellular Location(s)

nucl 14.5, cyto_nucl 10.5, cyto 5.5, mito 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007231 Nucleoporin_int_Nup93/Nic96 IPR047313 SMN_C
Gene Ontology	GO:0005643 C:nuclear pore GO:0017056 F:structural constituent of nuclear pore GO:0006397 P:mRNA processing GO:0008380 P:RNA splicing
Pfam	View protein in Pfam PF04097 Nic96
CDD	cd22852 SMN_C cd22851 SMN_N

Amino Acid Sequences

MRPLISYDDIVPTNSTNAGRSLEPQLPANFMAGPPAKKRKRNNQRNVRQHGRAAGAQHHIQHWDDPGSAAQQMEYDEAVSTSDVTAITLKADGEDEATMEEQEEEQEDEESRELTHEEIWDDSVLIDAWESAMAEYEAFNGTSDWKAEPVKKSPLWYNVPPSPSKLKKSTQQTVVNETAEVAADDSRPINFEDFVPHHDASLASGIVPPVSAQHQLAEVPAGSVSQDEAFNRALGAMYWAGYWTAVYHSHKKVEEKMVDNVSGEEDGGEYEDQDQIPGEATGDGDEELISTQRLVPQLKNLSAHLRISSQTPDIFRPTDRHTIAYNFPVACAGFTDMASDLSSLLTSSKALSSHLSRPDLPHVNPSLDQIEAQSRRLVSRQPGATADSGRANYLLAQAHVDVPALASSIAHLNTSTTFSPLRPLQDTNITGFLRHVHEQNIISTIEEARRETQEDFYRVXEDRSRGDWEARKKRVFEELGGRVGGENQARGEWRKSQHGKSSLALSTGPSPSLQMQSKMMAYDRVVTALNAARLRGISYPIVHSLIQASLSTNADHTQQITQNFHILAKITGEPPALPPLEHAGAHILNTPLFERKHARAYLGDASSRDAVELRRQIARGAREALEEQYFDVLDRAVQARPFEARLGGDPSVANKVRAFLLVRYYRNGEWQDRIELVASQPLWAKLFYLVRTGHTQEALAEALKYQQAIEHREDSFVSHFRTWIESTDRRLPKPHRDHIQSIYNAHMLHSTTVDPFKLALYKLMGRLDPTRRTVPLVTTTTEDWLWFQLAMVDEDENGGLRGLADILLGYGERHFEGTPGQKTGRTGLWSAVLLLSGQFERAVAALWEHPETEIEAVHLAIALSYHGLLRVPSRTETSDMTLSLSPNAPPALSLSTLIWRYVRQFVKMDAKEALQYVYTVTLNSDQGGGVGQEQVENAWDLVRRIIILANAGPAWDELVGGFRSDGTRFSGVIEQGAALLKLQDARQFNEHILVRAAKHSEENDRVLEAIKLYNLAGDYQTVITCLAQALGNTMSQPNGGGEKGKAVEQTATDIVRHYERTNRALGKERDAVVKLLRIREAMNAKADGRVESALDILESTDLMPLDGDVAKITRRTEEFRELHDALQRNLQVYLPLTMDCIAAVYQKNKASGMSDASRQMSLATLRKKSRSLMVFAGMLRYRLSPDVYSYLARLDVEIAL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.22
2	0.21
3	0.17
4	0.19
5	0.2
6	0.2
7	0.22
8	0.27
9	0.28
10	0.29
11	0.32
12	0.31
13	0.32
14	0.31
15	0.29
16	0.24
17	0.19
18	0.25
19	0.25
20	0.28
21	0.34
22	0.44
23	0.52
24	0.6
25	0.7
26	0.74
27	0.81
28	0.88
29	0.9
30	0.91
31	0.93
32	0.95
33	0.95
34	0.93
35	0.88
36	0.81
37	0.76
38	0.7
39	0.62
40	0.55
41	0.51
42	0.47
43	0.44
44	0.42
45	0.38
46	0.36
47	0.34
48	0.32
49	0.3
50	0.26
51	0.23
52	0.22
53	0.21
54	0.2
55	0.2
56	0.18
57	0.14
58	0.13
59	0.13
60	0.13
61	0.12
62	0.11
63	0.09
64	0.09
65	0.1
66	0.09
67	0.09
68	0.07
69	0.08
70	0.08
71	0.08
72	0.09
73	0.09
74	0.09
75	0.1
76	0.09
77	0.09
78	0.1
79	0.09
80	0.1
81	0.1
82	0.09
83	0.1
84	0.1
85	0.1
86	0.09
87	0.1
88	0.08
89	0.09
90	0.1
91	0.09
92	0.09
93	0.11
94	0.11
95	0.12
96	0.13
97	0.12
98	0.11
99	0.11
100	0.11
101	0.11
102	0.12
103	0.12
104	0.13
105	0.14
106	0.15
107	0.14
108	0.13
109	0.12
110	0.11
111	0.09
112	0.08
113	0.07
114	0.05
115	0.05
116	0.05
117	0.06
118	0.05
119	0.06
120	0.06
121	0.06
122	0.06
123	0.07
124	0.08
125	0.08
126	0.09
127	0.08
128	0.1
129	0.11
130	0.13
131	0.12
132	0.14
133	0.19
134	0.25
135	0.3
136	0.35
137	0.42
138	0.44
139	0.48
140	0.51
141	0.55
142	0.56
143	0.56
144	0.58
145	0.55
146	0.57
147	0.54
148	0.52
149	0.54
150	0.53
151	0.55
152	0.54
153	0.55
154	0.59
155	0.67
156	0.71
157	0.7
158	0.72
159	0.69
160	0.69
161	0.67
162	0.59
163	0.49
164	0.4
165	0.31
166	0.22
167	0.18
168	0.11
169	0.08
170	0.07
171	0.08
172	0.09
173	0.08
174	0.09
175	0.11
176	0.12
177	0.11
178	0.12
179	0.18
180	0.19
181	0.23
182	0.28
183	0.27
184	0.25
185	0.25
186	0.24
187	0.19
188	0.19
189	0.15
190	0.09
191	0.1
192	0.1
193	0.09
194	0.09
195	0.08
196	0.07
197	0.09
198	0.11
199	0.1
200	0.11
201	0.12
202	0.13
203	0.13
204	0.12
205	0.1
206	0.09
207	0.08
208	0.07
209	0.06
210	0.06
211	0.07
212	0.07
213	0.08
214	0.08
215	0.11
216	0.12
217	0.12
218	0.12
219	0.11
220	0.09
221	0.08
222	0.1
223	0.08
224	0.08
225	0.08
226	0.08
227	0.08
228	0.08
229	0.07
230	0.06
231	0.07
232	0.13
233	0.18
234	0.25
235	0.29
236	0.35
237	0.38
238	0.41
239	0.46
240	0.5
241	0.52
242	0.48
243	0.51
244	0.49
245	0.46
246	0.42
247	0.36
248	0.28
249	0.21
250	0.17
251	0.1
252	0.07
253	0.06
254	0.07
255	0.07
256	0.06
257	0.06
258	0.09
259	0.08
260	0.08
261	0.09
262	0.07
263	0.08
264	0.08
265	0.08
266	0.06
267	0.06
268	0.06
269	0.07
270	0.07
271	0.06
272	0.05
273	0.05
274	0.05
275	0.06
276	0.05
277	0.05
278	0.06
279	0.09
280	0.13
281	0.15
282	0.16
283	0.24
284	0.29
285	0.31
286	0.32
287	0.32
288	0.33
289	0.33
290	0.34
291	0.27
292	0.23
293	0.21
294	0.22
295	0.23
296	0.2
297	0.2
298	0.21
299	0.22
300	0.24
301	0.25
302	0.24
303	0.26
304	0.29
305	0.35
306	0.34
307	0.34
308	0.32
309	0.35
310	0.36
311	0.34
312	0.33
313	0.24
314	0.23
315	0.22
316	0.19
317	0.15
318	0.13
319	0.12
320	0.09
321	0.09
322	0.1
323	0.09
324	0.1
325	0.1
326	0.09
327	0.07
328	0.06
329	0.06
330	0.05
331	0.05
332	0.05
333	0.05
334	0.06
335	0.07
336	0.07
337	0.09
338	0.12
339	0.16
340	0.22
341	0.27
342	0.29
343	0.29
344	0.31
345	0.38
346	0.4
347	0.37
348	0.37
349	0.33
350	0.33
351	0.32
352	0.32
353	0.26
354	0.2
355	0.19
356	0.14
357	0.2
358	0.19
359	0.2
360	0.2
361	0.19
362	0.2
363	0.22
364	0.25
365	0.22
366	0.28
367	0.28
368	0.28
369	0.29
370	0.3
371	0.3
372	0.26
373	0.24
374	0.19
375	0.18
376	0.16
377	0.15
378	0.12
379	0.11
380	0.13
381	0.12
382	0.09
383	0.1
384	0.1
385	0.11
386	0.11
387	0.1
388	0.07
389	0.06
390	0.06
391	0.05
392	0.05
393	0.04
394	0.04
395	0.06
396	0.07
397	0.06
398	0.06
399	0.07
400	0.08
401	0.11
402	0.11
403	0.1
404	0.11
405	0.11
406	0.16
407	0.18
408	0.2
409	0.2
410	0.21
411	0.21
412	0.27
413	0.28
414	0.25
415	0.29
416	0.25
417	0.23
418	0.22
419	0.22
420	0.2
421	0.2
422	0.2
423	0.16
424	0.19
425	0.2
426	0.2
427	0.2
428	0.16
429	0.15
430	0.14
431	0.13
432	0.12
433	0.13
434	0.13
435	0.13
436	0.14
437	0.16
438	0.17
439	0.21
440	0.24
441	0.26
442	0.26
443	0.26
444	0.28
445	0.26
446	0.26
447	0.23
448	0.2
449	0.2
450	0.22
451	0.21
452	0.22
453	0.27
454	0.36
455	0.44
456	0.49
457	0.5
458	0.48
459	0.48
460	0.53
461	0.49
462	0.42
463	0.4
464	0.36
465	0.34
466	0.33
467	0.31
468	0.22
469	0.21
470	0.2
471	0.12
472	0.1
473	0.08
474	0.09
475	0.1
476	0.13
477	0.15
478	0.18
479	0.2
480	0.29
481	0.35
482	0.39
483	0.45
484	0.49
485	0.49
486	0.44
487	0.46
488	0.37
489	0.32
490	0.28
491	0.21
492	0.18
493	0.16
494	0.15
495	0.1
496	0.1
497	0.11
498	0.15
499	0.15
500	0.14
501	0.15
502	0.16
503	0.16
504	0.16
505	0.15
506	0.12
507	0.11
508	0.12
509	0.11
510	0.11
511	0.1
512	0.09
513	0.11
514	0.11
515	0.14
516	0.12
517	0.12
518	0.11
519	0.1
520	0.12
521	0.11
522	0.11
523	0.09
524	0.1
525	0.11
526	0.12
527	0.14
528	0.13
529	0.12
530	0.11
531	0.1
532	0.1
533	0.08
534	0.08
535	0.07
536	0.08
537	0.08
538	0.08
539	0.08
540	0.09
541	0.09
542	0.09
543	0.1
544	0.13
545	0.15
546	0.17
547	0.16
548	0.17
549	0.17
550	0.16
551	0.14
552	0.12
553	0.09
554	0.09
555	0.1
556	0.08
557	0.09
558	0.09
559	0.09
560	0.09
561	0.12
562	0.1
563	0.09
564	0.09
565	0.11
566	0.12
567	0.12
568	0.11
569	0.1
570	0.1
571	0.1
572	0.11
573	0.09
574	0.08
575	0.08
576	0.09
577	0.1
578	0.11
579	0.13
580	0.15
581	0.17
582	0.23
583	0.24
584	0.24
585	0.21
586	0.25
587	0.27
588	0.24
589	0.23
590	0.17
591	0.18
592	0.17
593	0.16
594	0.13
595	0.09
596	0.09
597	0.13
598	0.15
599	0.15
600	0.17
601	0.17
602	0.19
603	0.22
604	0.23
605	0.2
606	0.2
607	0.19
608	0.18
609	0.19
610	0.19
611	0.15
612	0.13
613	0.11
614	0.09
615	0.08
616	0.07
617	0.06
618	0.05
619	0.04
620	0.05
621	0.06
622	0.07
623	0.08
624	0.08
625	0.09
626	0.1
627	0.11
628	0.1
629	0.09
630	0.09
631	0.09
632	0.13
633	0.12
634	0.12
635	0.11
636	0.12
637	0.17
638	0.17
639	0.16
640	0.13
641	0.13
642	0.13
643	0.15
644	0.15
645	0.1
646	0.17
647	0.22
648	0.23
649	0.24
650	0.26
651	0.25
652	0.29
653	0.32
654	0.26
655	0.24
656	0.25
657	0.25
658	0.22
659	0.22
660	0.17
661	0.14
662	0.12
663	0.12
664	0.1
665	0.09
666	0.1
667	0.1
668	0.1
669	0.1
670	0.1
671	0.1
672	0.13
673	0.12
674	0.16
675	0.16
676	0.17
677	0.21
678	0.22
679	0.2
680	0.18
681	0.17
682	0.13
683	0.13
684	0.12
685	0.09
686	0.07
687	0.06
688	0.07
689	0.07
690	0.07
691	0.05
692	0.07
693	0.1
694	0.14
695	0.17
696	0.2
697	0.2
698	0.21
699	0.21
700	0.2
701	0.2
702	0.19
703	0.19
704	0.16
705	0.16
706	0.16
707	0.19
708	0.18
709	0.18
710	0.22
711	0.22
712	0.27
713	0.36
714	0.39
715	0.38
716	0.45
717	0.48
718	0.51
719	0.58
720	0.61
721	0.6
722	0.62
723	0.65
724	0.63
725	0.65
726	0.56
727	0.48
728	0.42
729	0.36
730	0.29
731	0.25
732	0.21
733	0.14
734	0.12
735	0.12
736	0.11
737	0.1
738	0.11
739	0.11
740	0.1
741	0.09
742	0.09
743	0.11
744	0.1
745	0.1
746	0.12
747	0.14
748	0.16
749	0.18
750	0.17
751	0.18
752	0.24
753	0.28
754	0.3
755	0.32
756	0.32
757	0.31
758	0.34
759	0.33
760	0.3
761	0.3
762	0.28
763	0.25
764	0.24
765	0.24
766	0.22
767	0.21
768	0.18
769	0.12
770	0.11
771	0.1
772	0.08
773	0.08
774	0.08
775	0.09
776	0.09
777	0.09
778	0.08
779	0.08
780	0.08
781	0.08
782	0.06
783	0.05
784	0.04
785	0.04
786	0.04
787	0.04
788	0.04
789	0.04
790	0.03
791	0.03
792	0.03
793	0.03
794	0.03
795	0.04
796	0.04
797	0.05
798	0.05
799	0.06
800	0.06
801	0.07
802	0.11
803	0.17
804	0.19
805	0.22
806	0.23
807	0.23
808	0.24
809	0.26
810	0.25
811	0.21
812	0.2
813	0.18
814	0.19
815	0.17
816	0.17
817	0.14
818	0.11
819	0.09
820	0.08
821	0.08
822	0.06
823	0.06
824	0.05
825	0.05
826	0.05
827	0.05
828	0.06
829	0.04
830	0.06
831	0.07
832	0.09
833	0.09
834	0.09
835	0.09
836	0.09
837	0.1
838	0.09
839	0.08
840	0.07
841	0.06
842	0.06
843	0.06
844	0.06
845	0.05
846	0.04
847	0.04
848	0.04
849	0.03
850	0.04
851	0.04
852	0.04
853	0.05
854	0.05
855	0.08
856	0.11
857	0.13
858	0.14
859	0.17
860	0.19
861	0.21
862	0.23
863	0.24
864	0.22
865	0.2
866	0.22
867	0.2
868	0.19
869	0.18
870	0.17
871	0.13
872	0.13
873	0.13
874	0.11
875	0.09
876	0.11
877	0.11
878	0.11
879	0.12
880	0.11
881	0.15
882	0.16
883	0.17
884	0.16
885	0.15
886	0.17
887	0.25
888	0.26
889	0.25
890	0.26
891	0.31
892	0.41
893	0.4
894	0.4
895	0.33
896	0.32
897	0.3
898	0.28
899	0.24
900	0.13
901	0.13
902	0.11
903	0.11
904	0.1
905	0.09
906	0.1
907	0.11
908	0.12
909	0.12
910	0.12
911	0.09
912	0.09
913	0.09
914	0.08
915	0.06
916	0.07
917	0.06
918	0.06
919	0.06
920	0.06
921	0.07
922	0.07
923	0.07
924	0.07
925	0.08
926	0.09
927	0.1
928	0.1
929	0.09
930	0.09
931	0.1
932	0.09
933	0.1
934	0.1
935	0.11
936	0.1
937	0.1
938	0.1
939	0.08
940	0.08
941	0.06
942	0.06
943	0.04
944	0.08
945	0.08
946	0.08
947	0.08
948	0.08
949	0.1
950	0.1
951	0.12
952	0.13
953	0.14
954	0.14
955	0.17
956	0.2
957	0.19
958	0.19
959	0.18
960	0.13
961	0.13
962	0.13
963	0.11
964	0.07
965	0.07
966	0.07
967	0.09
968	0.1
969	0.15
970	0.17
971	0.2
972	0.24
973	0.25
974	0.25
975	0.3
976	0.3
977	0.26
978	0.26
979	0.25
980	0.23
981	0.25
982	0.26
983	0.2
984	0.23
985	0.24
986	0.29
987	0.31
988	0.33
989	0.3
990	0.29
991	0.28
992	0.26
993	0.23
994	0.17
995	0.14
996	0.11
997	0.11
998	0.1
999	0.11
1000	0.11
1001	0.11
1002	0.1
1003	0.09
1004	0.1
1005	0.1
1006	0.1
1007	0.09
1008	0.1
1009	0.09
1010	0.08
1011	0.08
1012	0.08
1013	0.07
1014	0.07
1015	0.09
1016	0.1
1017	0.1
1018	0.11
1019	0.11
1020	0.1
1021	0.1
1022	0.11
1023	0.09
1024	0.11
1025	0.11
1026	0.12
1027	0.12
1028	0.16
1029	0.17
1030	0.18
1031	0.18
1032	0.17
1033	0.19
1034	0.17
1035	0.21
1036	0.2
1037	0.2
1038	0.18
1039	0.18
1040	0.2
1041	0.21
1042	0.23
1043	0.21
1044	0.26
1045	0.31
1046	0.35
1047	0.41
1048	0.43
1049	0.44
1050	0.52
1051	0.53
1052	0.52
1053	0.52
1054	0.51
1055	0.48
1056	0.45
1057	0.43
1058	0.36
1059	0.38
1060	0.35
1061	0.33
1062	0.33
1063	0.29
1064	0.28
1065	0.33
1066	0.36
1067	0.33
1068	0.33
1069	0.32
1070	0.31
1071	0.33
1072	0.33
1073	0.26
1074	0.23
1075	0.21
1076	0.17
1077	0.15
1078	0.14
1079	0.11
1080	0.1
1081	0.09
1082	0.07
1083	0.06
1084	0.06
1085	0.06
1086	0.07
1087	0.07
1088	0.07
1089	0.07
1090	0.06
1091	0.09
1092	0.09
1093	0.09
1094	0.08
1095	0.1
1096	0.12
1097	0.15
1098	0.16
1099	0.2
1100	0.23
1101	0.29
1102	0.34
1103	0.43
1104	0.44
1105	0.46
1106	0.54
1107	0.49
1108	0.48
1109	0.49
1110	0.46
1111	0.37
1112	0.41
1113	0.37
1114	0.3
1115	0.3
1116	0.28
1117	0.23
1118	0.22
1119	0.23
1120	0.17
1121	0.16
1122	0.16
1123	0.15
1124	0.15
1125	0.12
1126	0.11
1127	0.09
1128	0.12
1129	0.16
1130	0.18
1131	0.23
1132	0.26
1133	0.28
1134	0.28
1135	0.29
1136	0.27
1137	0.26
1138	0.31
1139	0.29
1140	0.3
1141	0.32
1142	0.34
1143	0.33
1144	0.3
1145	0.27
1146	0.23
1147	0.25
1148	0.29
1149	0.33
1150	0.39
1151	0.45
1152	0.51
1153	0.54
1154	0.54
1155	0.57
1156	0.55
1157	0.52
1158	0.49
1159	0.47
1160	0.45
1161	0.42
1162	0.45
1163	0.37
1164	0.33
1165	0.28
1166	0.24
1167	0.23
1168	0.22
1169	0.25
1170	0.19
1171	0.23
1172	0.26
1173	0.27
1174	0.27
1175	0.25
1176	0.24
1177	0.23
1178	0.21
1179	0.17

A0A4S4LWA6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer