FuNGI

A0A4S4L1U5

Protein Details

Accession

A0A4S4L1U5

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
330-352	PSQKCWAKFPHLKPKRPPRDGTT	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 16, cyto 7, pero 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR025724 GAG-pre-integrase_dom IPR001584 Integrase_cat-core IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR013103 RVT_2
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003887 F:DNA-directed DNA polymerase activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0003964 F:RNA-directed DNA polymerase activity GO:0015074 P:DNA integration GO:0032196 P:transposition
Pfam	View protein in Pfam PF13976 gag_pre-integrs PF07727 RVT_2
PROSITE	View protein in PROSITE PS50994 INTEGRASE

Amino Acid Sequences

MSGKPKKSLFEQAMTEDAKRDLEDTLGIKSLTESATDGSDINRTMRGAGGSAFPSAYSRSNSQVSPLSAVSTRGPDMFRIPLPPDPLFATPHGRRECPLSSEEDQKLTNNLISIASKFDTSSIPQLTGAENYTDWARLCASAIRGIGIVRYVDGTLPKPFDIESKEYYTWCAWDEQATSLILRTVAKDVYDRIRQDIPYANTRELWDVNYLRRALRHIFPAEGPFGPTITTIRSDLQRVYDVGAPNMDDMMSILLLQALSLNHADIARVIENSDSIDHRSIQRRLETADIRTQEEGNYNLHKTQNVAAAAFNKSSAPRPPCEHCHRSNHPSQKCWAKFPHLKPKRPPRDGTTGQADEPKKTEHTNATTSHSQVEEAVATIESMFNDEDIEYWSAASVCDAESCSVDWTTHGQLTAASSTAAATPLCHFYLDSASSCHLTPHESDFLTIRAITPRPIKGINGSCILATGISDIRLRLGKGRKKLVATGERTTNNLYALKGDPSILHANVTRASPSLDTWHRCFSHAGHQAILHMARNRLVSGMPADLPTHAPTCDACILGKQTRRPVPPTRSGSRSSVPLGIVYADLMGPVKPATTGGKRYSLDIRDDCTSKSWAILLATKSDAFSSFVEWRAVAERDSGHSLCLIRTDSGGEFTPSQFEAYLKQHGITHQTSAPYTSAHIGAIERLHRTLFDRARAMRLSANLPPSLWGECYLTAAYLHNRTATRSLPRSTPDEAWTGRKPDITHLREFGCRAFVLIQDHHNPKVNNRSLECILIGYSPNSKAYRCYHRASGHVFISYHVTFIESQDSFPSSSSTPASPFNTIPSIPLLPSLPNSSPTSSPLPSSPCCSTRTRQPSAKLATLQGLPIPSRVTQAVADSKAAAERLRLHKLNTYIPTSSDSTIPSSPIPSPSLHLLSPLSPTPSDTDLLLAAAAHLNEEPRTWAEAQASPDADKWCTAYLDELASIRAHQVYSLXPRSSVPPDHRIIKCRPIFTIKXDANNNPVRYKARLVAKGFTQIPGQDFTDTFSPVARLETQRLLLHLAAHFGWPVEQLNVKTAFLHGDLEEDLWMEQPDGFAEXGKESWVWKLLKGLYGLRQGSRIXNQKLHSXLVALGFHRLSXEWSLYYRFXSTGKCLLTIHVDDLNVXASHSTIXQAVKTSLRSXFDIVELXXVQWLVGLAISRNLPEHTITVSQTGLIDSVLDKFNLSXANTVSTPLDXNVRLTHXDSPVTNADKAAMSSIPYRELIGCLMYLSIGSRPDISFXVQHLSQFXANPGPXHWTAAKHXVRYLKGTRTFGLTLGGTNPLXLLGFTDASFXGHAGPAGSRRSVSGYXXXLXXXTXXXXXXXXXAXXXXXXLXX

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.5
2	0.45
3	0.37
4	0.32
5	0.27
6	0.23
7	0.21
8	0.15
9	0.14
10	0.17
11	0.16
12	0.18
13	0.19
14	0.18
15	0.17
16	0.17
17	0.19
18	0.15
19	0.15
20	0.13
21	0.12
22	0.14
23	0.14
24	0.14
25	0.12
26	0.15
27	0.15
28	0.16
29	0.17
30	0.16
31	0.16
32	0.18
33	0.18
34	0.15
35	0.15
36	0.17
37	0.16
38	0.17
39	0.16
40	0.14
41	0.15
42	0.16
43	0.19
44	0.19
45	0.21
46	0.25
47	0.29
48	0.29
49	0.32
50	0.35
51	0.33
52	0.33
53	0.3
54	0.28
55	0.26
56	0.28
57	0.26
58	0.23
59	0.23
60	0.22
61	0.23
62	0.22
63	0.24
64	0.26
65	0.26
66	0.27
67	0.29
68	0.31
69	0.35
70	0.34
71	0.33
72	0.32
73	0.32
74	0.31
75	0.3
76	0.35
77	0.33
78	0.42
79	0.45
80	0.42
81	0.42
82	0.45
83	0.46
84	0.41
85	0.39
86	0.37
87	0.36
88	0.43
89	0.45
90	0.42
91	0.38
92	0.36
93	0.36
94	0.31
95	0.28
96	0.2
97	0.19
98	0.18
99	0.18
100	0.17
101	0.18
102	0.17
103	0.16
104	0.15
105	0.16
106	0.16
107	0.18
108	0.24
109	0.22
110	0.22
111	0.22
112	0.23
113	0.23
114	0.23
115	0.21
116	0.16
117	0.14
118	0.14
119	0.15
120	0.16
121	0.15
122	0.14
123	0.14
124	0.12
125	0.14
126	0.16
127	0.17
128	0.19
129	0.19
130	0.18
131	0.18
132	0.17
133	0.17
134	0.15
135	0.13
136	0.09
137	0.1
138	0.09
139	0.1
140	0.13
141	0.15
142	0.18
143	0.2
144	0.19
145	0.19
146	0.19
147	0.22
148	0.25
149	0.28
150	0.28
151	0.33
152	0.34
153	0.34
154	0.37
155	0.33
156	0.29
157	0.25
158	0.22
159	0.16
160	0.18
161	0.19
162	0.18
163	0.18
164	0.18
165	0.16
166	0.15
167	0.15
168	0.13
169	0.12
170	0.12
171	0.13
172	0.13
173	0.14
174	0.15
175	0.19
176	0.24
177	0.31
178	0.31
179	0.32
180	0.36
181	0.36
182	0.38
183	0.42
184	0.39
185	0.41
186	0.43
187	0.4
188	0.37
189	0.39
190	0.38
191	0.31
192	0.29
193	0.27
194	0.26
195	0.29
196	0.32
197	0.32
198	0.3
199	0.3
200	0.33
201	0.31
202	0.32
203	0.35
204	0.32
205	0.33
206	0.34
207	0.35
208	0.34
209	0.3
210	0.27
211	0.2
212	0.18
213	0.16
214	0.14
215	0.12
216	0.11
217	0.13
218	0.13
219	0.16
220	0.18
221	0.2
222	0.21
223	0.23
224	0.24
225	0.22
226	0.23
227	0.24
228	0.23
229	0.21
230	0.21
231	0.18
232	0.15
233	0.15
234	0.12
235	0.08
236	0.07
237	0.07
238	0.06
239	0.05
240	0.05
241	0.05
242	0.05
243	0.05
244	0.06
245	0.05
246	0.07
247	0.07
248	0.08
249	0.08
250	0.08
251	0.08
252	0.08
253	0.11
254	0.1
255	0.1
256	0.1
257	0.1
258	0.1
259	0.11
260	0.12
261	0.11
262	0.12
263	0.14
264	0.16
265	0.22
266	0.29
267	0.32
268	0.35
269	0.38
270	0.37
271	0.37
272	0.43
273	0.4
274	0.37
275	0.4
276	0.37
277	0.36
278	0.35
279	0.33
280	0.27
281	0.26
282	0.24
283	0.2
284	0.22
285	0.21
286	0.23
287	0.24
288	0.23
289	0.23
290	0.24
291	0.26
292	0.23
293	0.22
294	0.21
295	0.22
296	0.24
297	0.22
298	0.19
299	0.14
300	0.15
301	0.18
302	0.24
303	0.25
304	0.27
305	0.33
306	0.39
307	0.47
308	0.55
309	0.59
310	0.58
311	0.64
312	0.67
313	0.69
314	0.73
315	0.74
316	0.7
317	0.66
318	0.66
319	0.67
320	0.61
321	0.61
322	0.56
323	0.56
324	0.59
325	0.65
326	0.7
327	0.69
328	0.75
329	0.79
330	0.85
331	0.87
332	0.85
333	0.81
334	0.76
335	0.76
336	0.72
337	0.67
338	0.64
339	0.55
340	0.49
341	0.51
342	0.45
343	0.36
344	0.34
345	0.31
346	0.25
347	0.24
348	0.28
349	0.27
350	0.31
351	0.34
352	0.34
353	0.38
354	0.38
355	0.37
356	0.34
357	0.28
358	0.23
359	0.19
360	0.17
361	0.11
362	0.09
363	0.09
364	0.07
365	0.06
366	0.06
367	0.06
368	0.05
369	0.06
370	0.06
371	0.05
372	0.06
373	0.06
374	0.06
375	0.08
376	0.1
377	0.08
378	0.08
379	0.08
380	0.08
381	0.08
382	0.08
383	0.06
384	0.05
385	0.05
386	0.06
387	0.06
388	0.07
389	0.08
390	0.09
391	0.09
392	0.09
393	0.09
394	0.11
395	0.13
396	0.13
397	0.13
398	0.11
399	0.11
400	0.13
401	0.13
402	0.1
403	0.08
404	0.06
405	0.07
406	0.07
407	0.08
408	0.06
409	0.06
410	0.08
411	0.1
412	0.1
413	0.1
414	0.1
415	0.1
416	0.13
417	0.14
418	0.13
419	0.12
420	0.13
421	0.14
422	0.14
423	0.14
424	0.11
425	0.11
426	0.12
427	0.15
428	0.17
429	0.16
430	0.17
431	0.17
432	0.17
433	0.17
434	0.15
435	0.11
436	0.12
437	0.12
438	0.16
439	0.19
440	0.2
441	0.22
442	0.23
443	0.23
444	0.26
445	0.3
446	0.29
447	0.27
448	0.26
449	0.23
450	0.22
451	0.21
452	0.14
453	0.09
454	0.08
455	0.06
456	0.07
457	0.07
458	0.07
459	0.09
460	0.1
461	0.11
462	0.16
463	0.25
464	0.3
465	0.36
466	0.43
467	0.45
468	0.46
469	0.5
470	0.51
471	0.51
472	0.5
473	0.47
474	0.46
475	0.43
476	0.43
477	0.41
478	0.33
479	0.26
480	0.22
481	0.18
482	0.15
483	0.15
484	0.15
485	0.13
486	0.13
487	0.11
488	0.14
489	0.16
490	0.14
491	0.14
492	0.14
493	0.15
494	0.16
495	0.16
496	0.12
497	0.1
498	0.11
499	0.1
500	0.1
501	0.15
502	0.19
503	0.22
504	0.24
505	0.3
506	0.29
507	0.3
508	0.31
509	0.27
510	0.32
511	0.36
512	0.34
513	0.29
514	0.28
515	0.27
516	0.28
517	0.26
518	0.19
519	0.13
520	0.13
521	0.14
522	0.14
523	0.14
524	0.13
525	0.12
526	0.11
527	0.1
528	0.1
529	0.09
530	0.09
531	0.09
532	0.09
533	0.1
534	0.11
535	0.1
536	0.09
537	0.09
538	0.09
539	0.11
540	0.12
541	0.11
542	0.1
543	0.1
544	0.14
545	0.18
546	0.22
547	0.22
548	0.29
549	0.35
550	0.38
551	0.42
552	0.47
553	0.49
554	0.55
555	0.59
556	0.56
557	0.54
558	0.54
559	0.52
560	0.45
561	0.41
562	0.33
563	0.28
564	0.23
565	0.19
566	0.16
567	0.13
568	0.11
569	0.08
570	0.07
571	0.04
572	0.04
573	0.04
574	0.04
575	0.04
576	0.04
577	0.04
578	0.03
579	0.05
580	0.08
581	0.11
582	0.16
583	0.18
584	0.24
585	0.24
586	0.27
587	0.31
588	0.3
589	0.31
590	0.28
591	0.28
592	0.25
593	0.25
594	0.24
595	0.21
596	0.2
597	0.15
598	0.14
599	0.12
600	0.1
601	0.1
602	0.14
603	0.12
604	0.12
605	0.13
606	0.12
607	0.12
608	0.11
609	0.11
610	0.09
611	0.09
612	0.11
613	0.11
614	0.13
615	0.13
616	0.13
617	0.13
618	0.13
619	0.14
620	0.11
621	0.1
622	0.09
623	0.11
624	0.14
625	0.13
626	0.11
627	0.12
628	0.12
629	0.11
630	0.12
631	0.11
632	0.08
633	0.08
634	0.09
635	0.08
636	0.09
637	0.1
638	0.09
639	0.09
640	0.09
641	0.1
642	0.09
643	0.09
644	0.07
645	0.07
646	0.1
647	0.12
648	0.15
649	0.14
650	0.14
651	0.15
652	0.15
653	0.2
654	0.17
655	0.17
656	0.16
657	0.17
658	0.16
659	0.16
660	0.16
661	0.11
662	0.11
663	0.1
664	0.08
665	0.07
666	0.08
667	0.07
668	0.07
669	0.09
670	0.09
671	0.09
672	0.09
673	0.09
674	0.09
675	0.12
676	0.18
677	0.19
678	0.21
679	0.24
680	0.24
681	0.28
682	0.28
683	0.26
684	0.21
685	0.2
686	0.19
687	0.18
688	0.2
689	0.16
690	0.16
691	0.16
692	0.15
693	0.14
694	0.12
695	0.1
696	0.09
697	0.09
698	0.11
699	0.09
700	0.08
701	0.08
702	0.09
703	0.1
704	0.11
705	0.11
706	0.13
707	0.13
708	0.14
709	0.16
710	0.18
711	0.22
712	0.24
713	0.26
714	0.25
715	0.27
716	0.3
717	0.31
718	0.3
719	0.26
720	0.26
721	0.26
722	0.28
723	0.28
724	0.27
725	0.25
726	0.25
727	0.23
728	0.27
729	0.36
730	0.35
731	0.34
732	0.34
733	0.35
734	0.35
735	0.35
736	0.28
737	0.2
738	0.16
739	0.14
740	0.12
741	0.12
742	0.14
743	0.14
744	0.17
745	0.21
746	0.24
747	0.25
748	0.28
749	0.27
750	0.27
751	0.36
752	0.38
753	0.36
754	0.35
755	0.38
756	0.34
757	0.35
758	0.31
759	0.21
760	0.16
761	0.13
762	0.12
763	0.09
764	0.1
765	0.1
766	0.13
767	0.14
768	0.14
769	0.17
770	0.23
771	0.31
772	0.34
773	0.37
774	0.41
775	0.42
776	0.46
777	0.46
778	0.45
779	0.36
780	0.34
781	0.3
782	0.24
783	0.26
784	0.22
785	0.18
786	0.13
787	0.13
788	0.11
789	0.11
790	0.16
791	0.11
792	0.11
793	0.12
794	0.13
795	0.12
796	0.12
797	0.14
798	0.09
799	0.11
800	0.12
801	0.12
802	0.13
803	0.16
804	0.18
805	0.18
806	0.18
807	0.19
808	0.19
809	0.18
810	0.17
811	0.16
812	0.15
813	0.12
814	0.13
815	0.12
816	0.1
817	0.12
818	0.15
819	0.13
820	0.15
821	0.17
822	0.18
823	0.18
824	0.21
825	0.24
826	0.21
827	0.21
828	0.21
829	0.23
830	0.23
831	0.27
832	0.27
833	0.25
834	0.28
835	0.31
836	0.31
837	0.37
838	0.45
839	0.47
840	0.5
841	0.52
842	0.57
843	0.58
844	0.59
845	0.5
846	0.42
847	0.38
848	0.32
849	0.28
850	0.21
851	0.17
852	0.13
853	0.13
854	0.13
855	0.11
856	0.12
857	0.12
858	0.12
859	0.11
860	0.14
861	0.17
862	0.17
863	0.17
864	0.15
865	0.15
866	0.14
867	0.15
868	0.12
869	0.09
870	0.15
871	0.21
872	0.28
873	0.29
874	0.29
875	0.33
876	0.36
877	0.41
878	0.38
879	0.36
880	0.29
881	0.29
882	0.31
883	0.29
884	0.26
885	0.21
886	0.19
887	0.18
888	0.18
889	0.19
890	0.16
891	0.16
892	0.16
893	0.17
894	0.18
895	0.15
896	0.16
897	0.18
898	0.2
899	0.18
900	0.18
901	0.17
902	0.16
903	0.18
904	0.17
905	0.15
906	0.13
907	0.14
908	0.15
909	0.16
910	0.16
911	0.13
912	0.13
913	0.11
914	0.11
915	0.1
916	0.07
917	0.05
918	0.06
919	0.06
920	0.05
921	0.05
922	0.06
923	0.06
924	0.07
925	0.08
926	0.09
927	0.12
928	0.12
929	0.14
930	0.16
931	0.19
932	0.22
933	0.24
934	0.23
935	0.21
936	0.24
937	0.23
938	0.21
939	0.18
940	0.16
941	0.14
942	0.14
943	0.13
944	0.12
945	0.11
946	0.12
947	0.12
948	0.11
949	0.11
950	0.1
951	0.1
952	0.1
953	0.09
954	0.08
955	0.08
956	0.11
957	0.16
958	0.21
959	0.22
960	0.22
961	0.22
962	0.25
963	0.29
964	0.33
965	0.33
966	0.33
967	0.36
968	0.43
969	0.46
970	0.49
971	0.51
972	0.53
973	0.52
974	0.48
975	0.48
976	0.46
977	0.46
978	0.46
979	0.51
980	0.44
981	0.49
982	0.49
983	0.53
984	0.52
985	0.51
986	0.46
987	0.45
988	0.45
989	0.38
990	0.4
991	0.4
992	0.41
993	0.47
994	0.49
995	0.44
996	0.43
997	0.46
998	0.43
999	0.38
1000	0.31
1001	0.25
1002	0.24
1003	0.23
1004	0.23
1005	0.17
1006	0.16
1007	0.17
1008	0.18
1009	0.17
1010	0.15
1011	0.13
1012	0.13
1013	0.12
1014	0.14
1015	0.16
1016	0.17
1017	0.19
1018	0.22
1019	0.25
1020	0.25
1021	0.25
1022	0.25
1023	0.22
1024	0.22
1025	0.18
1026	0.17
1027	0.14
1028	0.14
1029	0.13
1030	0.11
1031	0.1
1032	0.09
1033	0.1
1034	0.1
1035	0.12
1036	0.13
1037	0.17
1038	0.19
1039	0.19
1040	0.18
1041	0.17
1042	0.17
1043	0.15
1044	0.16
1045	0.11
1046	0.11
1047	0.11
1048	0.11
1049	0.11
1050	0.1
1051	0.09
1052	0.08
1053	0.08
1054	0.07
1055	0.07
1056	0.07
1057	0.07
1058	0.09
1059	0.09
1060	0.08
1061	0.1
1062	0.1
1063	0.11
1064	0.12
1065	0.13
1066	0.12
1067	0.19
1068	0.19
1069	0.18
1070	0.23
1071	0.24
1072	0.26
1073	0.28
1074	0.31
1075	0.3
1076	0.37
1077	0.38
1078	0.33
1079	0.35
1080	0.33
1081	0.38
1082	0.44
1083	0.45
1084	0.41
1085	0.42
1086	0.45
1087	0.43
1088	0.43
1089	0.36
1090	0.27
1091	0.21
1092	0.23
1093	0.21
1094	0.19
1095	0.17
1096	0.16
1097	0.16
1098	0.15
1099	0.16
1100	0.13
1101	0.14
1102	0.15
1103	0.16
1104	0.18
1105	0.19
1106	0.21
1107	0.22
1108	0.21
1109	0.26
1110	0.26
1111	0.28
1112	0.27
1113	0.27
1114	0.26
1115	0.29
1116	0.3
1117	0.25
1118	0.24
1119	0.2
1120	0.2
1121	0.19
1122	0.19
1123	0.14
1124	0.12
1125	0.09
1126	0.08
1127	0.08
1128	0.1
1129	0.11
1130	0.1
1131	0.12
1132	0.14
1133	0.16
1134	0.21
1135	0.22
1136	0.22
1137	0.23
1138	0.23
1139	0.22
1140	0.23
1141	0.24
1142	0.19
1143	0.18
1144	0.17
1145	0.15
1146	0.14
1147	0.12
1148	0.09
1149	0.06
1150	0.06
1151	0.06
1152	0.05
1153	0.08
1154	0.08
1155	0.09
1156	0.11
1157	0.12
1158	0.13
1159	0.14
1160	0.15
1161	0.16
1162	0.18
1163	0.18
1164	0.19
1165	0.18
1166	0.17
1167	0.16
1168	0.15
1169	0.12
1170	0.09
1171	0.08
1172	0.07
1173	0.1
1174	0.11
1175	0.1
1176	0.1
1177	0.1
1178	0.14
1179	0.15
1180	0.16
1181	0.14
1182	0.15
1183	0.17
1184	0.18
1185	0.18
1186	0.15
1187	0.16
1188	0.16
1189	0.2
1190	0.19
1191	0.18
1192	0.23
1193	0.26
1194	0.27
1195	0.3
1196	0.32
1197	0.27
1198	0.27
1199	0.34
1200	0.31
1201	0.27
1202	0.26
1203	0.23
1204	0.2
1205	0.2
1206	0.21
1207	0.14
1208	0.14
1209	0.17
1210	0.19
1211	0.2
1212	0.19
1213	0.21
1214	0.19
1215	0.2
1216	0.19
1217	0.15
1218	0.14
1219	0.11
1220	0.11
1221	0.09
1222	0.08
1223	0.08
1224	0.1
1225	0.1
1226	0.11
1227	0.13
1228	0.13
1229	0.16
1230	0.17
1231	0.19
1232	0.2
1233	0.22
1234	0.26
1235	0.25
1236	0.26
1237	0.26
1238	0.26
1239	0.25
1240	0.24
1241	0.28
1242	0.23
1243	0.27
1244	0.29
1245	0.3
1246	0.3
1247	0.28
1248	0.35
1249	0.38
1250	0.43
1251	0.45
1252	0.48
1253	0.52
1254	0.57
1255	0.62
1256	0.62
1257	0.62
1258	0.6
1259	0.54
1260	0.54
1261	0.48
1262	0.42
1263	0.41
1264	0.32
1265	0.23
1266	0.22
1267	0.23
1268	0.17
1269	0.16
1270	0.15
1271	0.11
1272	0.11
1273	0.09
1274	0.1
1275	0.09
1276	0.09
1277	0.11
1278	0.11
1279	0.13
1280	0.14
1281	0.14
1282	0.12
1283	0.13
1284	0.13
1285	0.14
1286	0.19
1287	0.2
1288	0.2
1289	0.21
1290	0.21
1291	0.24
1292	0.26
1293	0.26

A0A4S4L1U5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer