Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4V3XDN4

Protein Details
Accession A0A4V3XDN4    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
19-45DKDTPHPPSPPEKKKRKLPPLASQLTVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
29-35PEKKKRK
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto_nucl 13.333, cyto 7.5, cyto_mito 5.666
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027521  Usb1  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0016829  F:lyase activity  
GO:0004518  F:nuclease activity  
GO:0034477  P:U6 snRNA 3'-end processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF09749  HVSL  
Amino Acid Sequences MKRSFTPLVAYAGSDDDEDKDTPHPPSPPEKKKRKLPPLASQLTVPIPVDDPSRHQGRSRSTPHVEGQWAAYVYVPVSVGGRERRGLRRLVRRVVDRARERVPSLRVVETGASVERKEEEASEELHISLSRPIFIRSHQREDVKRAVKAIAKAHPPIAPRAVKTRTRFTASFAALAELINDERTRTFLCMEVGAGHDQLRALSDALSPLLRSLRQKPYYEHPRFHGSLAWALLDPSTPQAQASHDAKVASPSPPSPSLAVDTDTPSSEWPPESSSQSKSPSLAAPGPPFPTIPGFPPDLVASLNAEFGNEIASGVGVFEVEEIQVRIGKEVFGWNIGV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.14
3 0.12
4 0.15
5 0.15
6 0.15
7 0.16
8 0.18
9 0.21
10 0.25
11 0.27
12 0.28
13 0.39
14 0.48
15 0.57
16 0.65
17 0.72
18 0.77
19 0.84
20 0.91
21 0.91
22 0.91
23 0.89
24 0.89
25 0.89
26 0.85
27 0.76
28 0.65
29 0.57
30 0.48
31 0.4
32 0.3
33 0.2
34 0.16
35 0.16
36 0.18
37 0.16
38 0.2
39 0.24
40 0.29
41 0.29
42 0.32
43 0.37
44 0.42
45 0.51
46 0.52
47 0.55
48 0.55
49 0.58
50 0.57
51 0.56
52 0.49
53 0.4
54 0.35
55 0.3
56 0.26
57 0.21
58 0.19
59 0.14
60 0.12
61 0.12
62 0.1
63 0.06
64 0.07
65 0.07
66 0.11
67 0.14
68 0.16
69 0.19
70 0.24
71 0.31
72 0.34
73 0.4
74 0.45
75 0.52
76 0.58
77 0.63
78 0.64
79 0.62
80 0.67
81 0.67
82 0.68
83 0.63
84 0.6
85 0.56
86 0.53
87 0.51
88 0.48
89 0.43
90 0.39
91 0.37
92 0.33
93 0.29
94 0.27
95 0.25
96 0.2
97 0.18
98 0.14
99 0.12
100 0.1
101 0.1
102 0.1
103 0.11
104 0.11
105 0.1
106 0.11
107 0.12
108 0.13
109 0.14
110 0.13
111 0.12
112 0.12
113 0.12
114 0.09
115 0.11
116 0.1
117 0.1
118 0.1
119 0.12
120 0.12
121 0.15
122 0.26
123 0.28
124 0.35
125 0.38
126 0.44
127 0.45
128 0.5
129 0.56
130 0.49
131 0.45
132 0.39
133 0.37
134 0.34
135 0.35
136 0.34
137 0.3
138 0.29
139 0.3
140 0.3
141 0.29
142 0.27
143 0.26
144 0.27
145 0.24
146 0.21
147 0.27
148 0.31
149 0.35
150 0.38
151 0.42
152 0.39
153 0.43
154 0.42
155 0.39
156 0.4
157 0.35
158 0.32
159 0.25
160 0.23
161 0.18
162 0.17
163 0.13
164 0.07
165 0.06
166 0.05
167 0.05
168 0.05
169 0.05
170 0.07
171 0.07
172 0.08
173 0.08
174 0.09
175 0.1
176 0.1
177 0.1
178 0.09
179 0.1
180 0.09
181 0.09
182 0.08
183 0.08
184 0.07
185 0.07
186 0.07
187 0.07
188 0.06
189 0.06
190 0.06
191 0.06
192 0.07
193 0.07
194 0.06
195 0.07
196 0.08
197 0.09
198 0.13
199 0.19
200 0.29
201 0.34
202 0.36
203 0.39
204 0.48
205 0.57
206 0.6
207 0.56
208 0.5
209 0.52
210 0.51
211 0.48
212 0.41
213 0.31
214 0.28
215 0.25
216 0.22
217 0.15
218 0.14
219 0.13
220 0.1
221 0.09
222 0.08
223 0.09
224 0.08
225 0.08
226 0.09
227 0.11
228 0.18
229 0.19
230 0.19
231 0.19
232 0.2
233 0.2
234 0.22
235 0.22
236 0.16
237 0.17
238 0.16
239 0.19
240 0.2
241 0.21
242 0.19
243 0.19
244 0.21
245 0.2
246 0.21
247 0.18
248 0.18
249 0.18
250 0.18
251 0.17
252 0.15
253 0.15
254 0.15
255 0.15
256 0.13
257 0.16
258 0.18
259 0.23
260 0.26
261 0.29
262 0.33
263 0.36
264 0.37
265 0.34
266 0.34
267 0.31
268 0.32
269 0.32
270 0.31
271 0.3
272 0.32
273 0.33
274 0.32
275 0.3
276 0.26
277 0.26
278 0.23
279 0.22
280 0.22
281 0.22
282 0.21
283 0.23
284 0.22
285 0.19
286 0.18
287 0.15
288 0.14
289 0.12
290 0.14
291 0.12
292 0.11
293 0.1
294 0.1
295 0.1
296 0.08
297 0.07
298 0.05
299 0.06
300 0.05
301 0.06
302 0.05
303 0.04
304 0.04
305 0.04
306 0.04
307 0.05
308 0.06
309 0.07
310 0.08
311 0.11
312 0.12
313 0.14
314 0.14
315 0.14
316 0.14
317 0.19
318 0.19